拉齐布汗 •17年2011月XNUMX日 •800字
更新:John Hawks 的实验室也在同一领域工作,他不同意此处提供的具体结果。 时刻提醒大家注意发布会上呈现的性感效果! (有人应该做一项研究!)彼得·帕勒姆上周在皇家学会会议上声称,遗传学揭示的人类进化、迁移和历史,......
了解更多拉齐布汗 •16年2011月XNUMX日 •1,000字
开普有色人种 我之前在这个博客上提到过南非开普色人种。 在文化上,他们在语言上是南非荷兰语,在宗教上是荷兰改革宗(可能相关的开普马来族群是穆斯林,尽管传统上也是南非荷兰语)。 但在种族上,他们是一个非常多样化的群体。 通过这种方式,它们可以被类比为黑色......
了解更多拉齐布汗 •10年2011月XNUMX日 •1,600字
在昨天的帖子中,我报道了人们对非洲之角的普遍了解,它的人口在遗传上似乎介于撒哈拉以南非洲和欧亚大陆之间。 这作为地理的函数是完全合理的,但也有建议认为这不仅仅是距离隔离的函数(即...
了解更多拉齐布汗 •9年2011月XNUMX日 •1,600字
伊曼,索马里模特 自从我开始非洲血统项目以来,主要的兴趣来源之一就是来自东北非家庭冰雹的个人。 更具体地说,非洲之角、埃塞俄比亚、厄立特里亚和索马里。 问题似乎是23andMe的“祖先绘画”算法使用西非约鲁巴语作为...
了解更多拉齐布汗 •30年2011月XNUMX日 •100字
阵亡将士纪念日快乐,如果你是美国人! Dienekes 在 Dodecad 上发表了一些非常有趣的帖子,如何从 ADMIXTURE 等创建僵尸,以及更多僵尸:祖先北印度人和祖先南印度人重生。 如果您正在使用 ADMIXTURE,这在未来将非常有用。
拉齐布汗 •2年2011月XNUMX日 •1,000字
我已经在 Facebook 上运行了一段时间的非洲祖先项目。 但它变得笨拙,所以我终于建立了网站。 我启动它的主要原因是一段时间以来一直有人抱怨 23andMe“祖先绘画”存在问题,有些人...
了解更多拉齐布汗 •27年2011月XNUMX日 •2,100字
去年夏天,当读者问到一个问题时,我在人类人口历史模型方面犯了一个轻率而愚蠢的错误:“哪个人口与非洲人的亲缘关系最远?” 我认为所有非非洲人口的距离都相同。 如果你看一下,这从表面上看显然是错误的......
了解更多拉齐布汗 •7年2011月XNUMX日 •500字
ADMIXTURE 的一大优点是人口元素通过程序的逻辑从数据中剔除。 最糟糕的是,然后由您来理解这些元素。 使用 ADMIXTURE 并避免过度解释模糊的一种有用方法是计算...
了解更多拉齐布汗 •2年2011月XNUMX日 •200字
在昨天关于非洲遗传学的帖子中,我尝试与大量人群合作,但将 SNP 缩小到约 40,000。 今天我想我会走另一条路,专注于拥有更丰富的市场,但人口更少。 所以我用 400,000 个 SNP 进行了大量运行。 这是 K = 8. 请...
了解更多拉齐布汗 •26年2011月XNUMX日 •100字
读者“第欧根尼”,手里拿着 ADMIXTURE,以及比我能理解的更多的考古知识,现在有一个博客。 我为什么要写博客……:他的兴趣似乎是欧洲的新石器时代革命/进化。
拉齐布汗 •22年2011月XNUMX日 •100字
Dienekes、David 和 Zack 现在整合了 Reconstructing Indian History 中的见解,即推断人口结构的程序,如 STRUCTURE、frappe 和 ADMIXTURE,可以产生祖先成分,而这些成分本身实际上是稳定的杂交种。 特别是许多这些分析中的“南亚”成分可能是欧洲式……
了解更多拉齐布汗 •21年2011月XNUMX日 •300字
我发布关于如何运行 ADMIXTURE 的原因之一是为了让更多的读者自己熟悉该程序的偏见。 这样他们就会对过度阅读一组特定的结果持谨慎态度(使用 PCA 来可视化遗传关系也是如此)。 Dienekes 详细阐述了这一点,...
了解更多拉齐布汗 •16年2011月XNUMX日 •900字
在昨天的帖子之后,我认为看看在不同模式下运行 ADMIXTURE 会如何影响结果可能会很有用。 我希望更多人使用这个软件的主要原因可能是他们会看到这个程序只是一个程序,不再假设它的输出是神圣的。 在...
了解更多拉齐布汗 •14年2011月XNUMX日 •2,600字
在过去的几个月里,我希望更多的人能够开始做 Zack Ajmal、Dienekes 和 David 一直在做的事情。 有公共数据集和开源软件,因此任何有书呆子倾向的人都可以出于好奇探索自己的问题。 这样你就可以看到力量和局限性......
了解更多拉齐布汗 •22年2011月XNUMX日 •500字
图片来源:Wikimol 在过去的几个月里,我一直在鼓励人们取消 ADMIXTURE,并通过它推送公共数据集。 此外,您还可以非常轻松地将 23andMe 原始文件转换为系谱格式,并使用 PLINK 将其集成到公共数据集中。 我一直在关注扎克的哈拉帕祖先项目......
了解更多拉齐布汗 •16年2011月XNUMX日 •200字
我现在很忙,这周不会发布太多内容。 但是,我想我会转储我拥有的一些 ADMIXTURE 运行。 这是一个有 80,000 个标记和欧亚人口、巴布亚人和莫扎比特人的人。 我删除了新世界和非洲以限制方差空间。 这次我给祖先贴上了标签……
了解更多拉齐布汗 •13年2011月XNUMX日 •800字
如果您已经阅读此博客一段时间了,您会看到许多类似上面的图片。 它来自 2008 年的论文 Worldwide Human Relations Inferred from Genome-Wide Patterns of Variation。 该数据集来自人类基因组多样性项目。 它由来自世界各地的 52 个团体组成,针对代表性进行策划,但也...
了解更多拉齐布汗 •10年2011月XNUMX日 •400字
关于我最近的几篇文章,纽约时报有一篇有趣的文章,按种族计数可以抛出一些数字。 基本上它概述了在一个更加多样化和种族混合的美国为不同目的列举不同种族和族裔群体的困难。 在分配资源时,数字很重要,...
了解更多拉齐布汗 •26年2011月XNUMX日 •1,000字
在 2010 年我们对现代人类起源的理解发生了翻天覆地的革命之后,欧亚古人类与新非洲人的混合,我认为对结果会有修正主义的看法,这似乎指向过去十年不同人类血统之间的混合. Dienekes 链接到一个恰当的例子,一篇关于……的新论文。
了解更多拉齐布汗 •18年2011月XNUMX日 •600字
Dienekes 在 K = 64 的情况下再次运行了他的数据。他发布了一个具有两个最大变化维度的巨大图。 他还发布了随附的电子表格,其中包含 Dodecad 样本所在位置的坐标。 所以我很快就找到了自己的位置。 在那之前,我想我会重新发布一个...
了解更多拉齐布汗 •10年2011月XNUMX日 •1,000字
在公开的帖子中,有人问:“关于埃塞俄比亚人遗传学的最新内容。” 这促使我环顾四周,因为我也很好奇。 翻遍维基百科,我找不到最近的任何东西。 许多研究都是基于单亲谱系的较旧的作品(NRY 和 mtDNA)。 埃塞俄比亚很有趣,因为与几乎所有其他撒哈拉以南地区不同......
了解更多拉齐布汗 •10年2011月XNUMX日 •1,100字
非洲侨民对新基因组学及其与祖先的关系特别感兴趣。 与其他后哥伦布时期的侨民不同,他们充其量只是粗略地了解他们的祖先所来自的地区。 这可能解释了 Roots 和 Henry Louis Gates Jr. 的各种谱系项目的受欢迎程度,这些项目利用了……
了解更多拉齐布汗 •23年2010月XNUMX日 •6,400字
线粒体 DNA 和人类进化:因此在 1987 年发表的论文在公众心目中确立了线粒体夏娃的想法,并在新闻周刊上引起了著名的封面照片。 这也导致了 PBS 纪录片 NOVA 中的夏娃之子一集。 总结如下:作为...
了解更多拉齐布汗 •23年2010月XNUMX日 •900字
由于我一直在宣传 Dodecad Ancestry 项目,因此提请您注意 Eurogenes 500K SNP BioGeographicAncestry 项目似乎是公平的。 样本总体与 Dodecad 略有不同,但 ADMIXTURE 仍是主要工具。 但作者也求助于其他方法来探索不仅仅是人口水平......
了解更多拉齐布汗 •17年2010月XNUMX日 •300字
Dienekes Pontikos 一直在努力,并从 ADMIXTURE 程序中绘制了一个新的条形图,其中包含 15 个假定的祖先组件。 他有“69个种群,总共1,189个人”。 其中大部分是从公共数据中收集的,但其中一些是 Dodecad Ancestry 项目所特有的。 他认为:不仅...
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