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Eurogenes博客正在筹款。 我主要是为了支持他继续撰写博客。 我不同意他发布的所有内容,但是该网站是很好的宝贵资源。 “基因组博客”的发展还没有达到我在2010年的预期,主要是因为最初的热情并未爆发…… 了解更多
今天早上听了一个有趣的采访,采访了一本新书《亚洲的拉丁美洲人:菲律宾裔美国人如何打破种族规则》的作者。 我有很多同意和不同意的地方,但是对我来说,这在很多方面都是正确的,因为我有相当多的学生... 了解更多
您想知道婴儿基因中隐藏的秘密吗? 事实证明,大多数人没有。 本文介绍了BabySeq项目以及整个外显子组测序的提供(外显子组是基因组中编码蛋白质的部分)。 从某些方面来说,结果令人沮丧:剩下6%。 那不是... 了解更多
媒体上有几则报道涉及除丹尼索瓦人和尼安德特人以外的第三类人参素,以及它们对美拉尼西亚人的贡献。 《科学新闻》对此有清醒的总结。 有几个人在电子邮件和Twitter上问过我这个问题,我告诉他们不要理会。 我说这的原因是... 了解更多
由于各种社会文化原因,古埃及人很重要。 吉萨金字塔距奥古斯都时代的距离与古典罗马离我们的距离差不多。 金字塔升起时,世界大部分是史前时期。 非洲和东南亚大部分地区一样,以狩猎采集者为主。 我们... 了解更多
我真的很佩服23andMe所做的一切。 在很大程度上,它们是DTC个人基因组学的“优步”。 FamilyTree DNA确实在2000年代初率先成为该领域的先驱,而The Genographic Project则在2000年代中期大规模扩大了规模。 但是在2000年代后期,23andMe将硅谷的“颠覆性”带入了游戏,推动了... 了解更多
人类经历的最不可思议的旅程之一是过去4,000年的南岛扩张。 这些海上民族似乎是从台湾群岛中崛起的,并向南,向西和向东推进,因此他们的扩张推向了东非和南美边缘。 那里... 了解更多
一位朋友问我有关人口结构的信息,以及对人口结构进行分类和分类的方法。 因此,这里是我不时使用/熟悉的主要方法的快速调查。 我将按时间顺序大致去。 首先,你有树。 从宏观进化关系来看,这些是很流行的,但是在群体遗传学规模上... 了解更多
考古学家戴维·安东尼(David Anthony)在《马,轮和语言:来自欧亚草原的青铜时代的骑手如何塑造现代世界》中概述了一个论点,即青铜时代从西欧亚草原迁移来的移民重塑了北欧文化。 安东尼出版这本书时,如果您确实应该阅读该书... 了解更多
大约五年前的某个时候,我们认识了所有被测序的人。 或至少其中大多数。 但是现在我们进入了任何给定物种的第一个测序动物开始死亡的时期。 上面是肉桂,第一只排序的猫不再... 了解更多
爱沙尼亚生物中心一直是人类基因组学中最好的资源之一,因为在梅特·梅斯帕卢(Mait Metspalu)的领导下,他们的政策似乎是一旦发布数据就将其发布。 今天,我去检查了该地点,并注意到他们的《自然》杂志上有一个博客,基因组分析为人们迁徙期间的迁徙事件提供了信息。 了解更多
以上结果来自祖先。 您可以在这里看到4%美拉尼西亚语。 这在南亚人中很常见。 这不是方法中的错误。 相反,这是用于生成掺混物分布图的方法的自然结果。 基本上,这是怎么回事:1)您有数据。 在这种情况下,数据... 了解更多
在PNAS上发表的一篇新论文《古蛋白质组学证据》确定了与Grotte du Renne的Châtelperronian有关的古人类,并质疑Châtelperronian文化是否是尼安德特人,在这种情况下肯定地回答:关于地层学的细节超出了我的范围。 但是蛋白质和线粒体DNA
我们生活在一个拥有大量人群的大量 SNP 数据的时代。 这允许在分析方面具有非常精细的粒度级别。 为了说明这一点,遗传学最近在丹麦发表的全国基因组研究揭示了显着的人口同质性,该研究分析了数百名丹麦人与数十万... 了解更多
Ewen Callaway 在英国的一次会议上报道,古代基因组改写了大象的历史:现代大象分为三个物种:亚洲象 (Elephas maximus) 和两只非洲象——森林居民 (Loxodonta cyclotis) 和生活在森林中的大象大草原(非洲象牙属)。 非洲象的划分,最初被认为是一个单一的物种,... 了解更多
Jonathan Novembre 和 Benjamin Peter 发布了一篇评论的预印本,《人类精细规模人口结构研究的最新进展》,读者会发现这些评论很有用。 特别是,对于任何试图浏览这些文献的人来说,这些引文都是一座金矿。 上图来自他们的预印本,说明了…… 了解更多
大约十三年前,我表达了这样的观点,即一旦我们对特征的遗传基础有了更好的了解,对人口结构的了解将成为智力好奇的问题。 一位曾经是统计遗传学家的朋友告诉我,这不太可能。 我们不太可能获得预测的能力。 了解更多
2011 年,我和一位在英特尔担任工程师的老朋友共进晚餐。 他还拥有博士学位。 来自麻省理工学院。 聪明的人。 但是当我随口提到我们都是百分之几的尼安德特人(非洲以外)时,他感到很惊讶。 我有点震惊,因为我解释说这... 了解更多
Joe Pickrell 和 Yaniv Erlich 昨天在 Reddit 上做了一个 AMA。 我建议你检查一下。 他们推广他们的新项目,seeq。 它看起来非常漂亮,我很高兴能成为这批 Beta 测试人员的一员。
古代古代混合物进入安达曼故事的后续行动,没有证据表明南亚有未知的古代祖先:最后我听说他们没有发布 bam 文件。 犯了错误,这就是科学的方式,其他人会在纠正过程中提供帮助。 但是,它开始变得令人担忧…… 了解更多
在《自然遗传学》上的一篇新论文《增强中东地区疾病遗传变异的特征以增强疾病基因的发现》既有趣又重要。 但是,就像关于安达曼岛民基因组的论文一样,它开始于对基于模型的聚类的幼稚和误导性利用,以构筑后来的结果。 这是一个重大违法行为... 了解更多
更新:如果 Pontus Skoglund 未能复制您的结果,这不是最佳结果....@razibkhan 我试图复制古老的混合信号(使用 4 个具有类似功率的其他数据集)但失败了 — Pontus Skoglund (@pontus_skoglund) 26 月2016 年 XNUMX 月 XNUMX 日结束更新 一篇关于安达曼岛民古老外加剂的新论文来了…… 了解更多
德系犹太人历史中欧洲混血的时间和地点:德系犹太人 (AJ) 人口在医学遗传学中很重要,因为其孟德尔疾病发生率高和其他独特的遗传特征。 德系犹太人在 10 世纪出现在欧洲,他们的血统被认为是... 了解更多
一个人可以在两个层面上欣赏一件艺术品。 当人们看到古典希腊人的雕刻作品时,在2,000多年的距离中,我们可以内心地感觉到它们触及到了美丽的东西,并使其成为石头。 为了将其简化为生物学,我们的感知映射到... 了解更多
该图表来自 Nature 上的一篇文章。 但来源是NHGRI。 它说明了在 2008 年到 2012 年间,基因组学作为一个领域打破了摩尔定律。 然后在 2012 年和 2015 年年中之间趋于平稳。 Illumina 在那个时期处于准垄断地位,测序成本并没有下降太多...... 了解更多
多年前,我与一位记者进行了长时间的电话交谈,了解红狼的起源和自然历史。 原因是我随口提到,有遗传证据表明,红狼是灰狼和郊狼的稳定杂交种。 那是2007年,如果我没记错的话...... 了解更多
几年前,当我注意到特定的群体基因组估计时,我向一位朋友询问了置信区间,以及对其中的值的信任程度。 他随口提到的一件事是,基于连锁不平衡的时间估计,因为混合通常似乎给出的代数相对较低。 当它... 了解更多
当我写更新世是人类的西伯利亚时代时,我的意思是人类。 由于偶然的原因,古代 DNA 的新遗传科学首先阐明了欧亚大陆西北部的历史。 但在大分流之前,欧洲并不是那么特殊。 事实上,历史学家维克多·利伯曼(Victor Lieberman)写了《奇异的平行线》(Strange Parallels),他对欧亚大陆的宏观史…… 了解更多
没时间评论。 是的,SNP 的命中很酷。 但是看看本文中所有的功能关联和分析! 一些严肃的生物学在这。 左侧论文中的图显示了与该 SNP 命中相关的基因如何在不同的组织/类型和器官中表达。 这些都是... 了解更多
看哪,社会科学基因组学暑期研究所:未来不再是未来。
选择是人口遗传学家研究的主要参数之一。 研究选择的最简单方法是完全了解等位基因频率随时间的变化。 如果您是果蝇遗传学家,那么这是可行的,因为您可以在实验室中控制模型生物的繁殖。 显然很多... 了解更多
以上是我从首次推出该方法的原始论文中轻率地称为“您总是看到的标准 PSMC 图”。 基本上,PSMC 使用优质全基因组的变异模式来推断该个体家谱的种群历史。 所有使用独特的雪花毕竟反映... 了解更多
Dienekes 争辩说:我不确定这是主要部分,尽管这是一个主要原因。 这里有另外两个原因:1)解剖学上的现代人类首先出现在非洲。 2) mtDNA、Y 染色体和常染色体中最深的差异都在非洲发现(特别是在狩猎采集的非洲人群和每个人之间...... 了解更多
埃文·卡拉威 (Ewen Callaway) 在《自然》(Nature) 上的文章“古代人类物种杂交富矿的证据不断增加”中的人物,很好地传达了我们对由古代 DNA 提供信息的不同人类谱系之间混合的了解。 但这就是全部吗? 在大量古代 DNA 上线之前,有人试图推断...... 了解更多
大约十年前,现代人类理解世界人口的标准模型是,大约 50,000 年前,东非的大规模人口膨胀压倒了所有其他人口,以至消灭了所有其他人口。 除了少数例外,例如新世界,这些现代非洲人很快就安定下来,并且…… 了解更多
去年秋天,这篇论文在 ASHG 发表时,古代埃塞俄比亚基因组揭示了整个非洲大陆广泛的欧亚混合体:结果是存在生物信息学错误,否定了这些结果的重要性。 Gallego Llorente 等人的勘误表。 2015 年:报告中的结果“古代埃塞俄比亚基因组揭示了广泛的欧亚混合物...... 了解更多
我不会说人类色素沉着的基因组已经解决。 可以说,这是GWAS早期的主要成就之一。 2005年,《突变:关于遗传多样性和人体》的后记暗示了人类色素沉着的遗传结构相对神秘的事实……。 了解更多
几年前,我读了著名考古学家JP Mallory的书《爱尔兰的起源》。 不幸的是,我几乎记不清这项工作,并回想起它出版得为时过早,因为考古学显然将彻底改变我们对北欧史前时代的理解。 了解更多
人类基因组散落着来自不同血统的许多基因。 就是说,任何给定的人类都有来自不同世系的群体,这些群体与我们祖先的主要人口统计学元素有很大的不同,后者与大约200,000年前蓬勃发展的非洲人口不同,在非非洲人当中,东北非洲的人口大约为50,000。年... 了解更多
一位朋友给我发了一个链接,指向《新共和国》中这篇长篇文章,到底什么是物种? 它的副标题是“对红狼起源的探索使科学家们提出了一种关于进化实际上如何运作的新理论。” 这是错误的。 事实上,文章本身承认这里没有任何革命性的东西。 你刚才... 了解更多
由于各种原因,意大利人口遗传结构的问题经常出现。 自从阅读《意大利的血缘关系,近亲繁殖和遗传漂移》一书以来,我就没有对这个主题进行过详细的介绍,这是一本非常古老的书,使用了经典的遗传技术。 LL卡瓦利-斯福尔扎(LL Cavalli-Sforza)当时在意大利找不到太多结构,但事实证明…… 了解更多
进化的速度有多快? 更准确地说,适应的速度有多快? 粗略的答案是相当快的。 对于人类而言,当您阅读诸如 10,000 年大爆炸之类的书或在论文中查看古代 DNA 的结果时,这一点很清楚,对变异的选择(~1% 系数)可以驱动等位基因频率快速变化(~0% 到 ~100%)。 ... 了解更多
在过去的几年中,当上一个冰河时代结束后,谈到欧洲的古历史时,我们已经看到古代DNA研究人员“在自然界中刻画了自然”。 关于这个历史重建,我们还没有走到尽头,但我确实认为终点在... 了解更多
今年在 ASHG 上最引人入胜的演讲之一是 Po-Ru Loh 的演讲,他回顾了 BOLT-REML 方法。 它在论文《使用快速方差分量分析对比精神分裂症和其他复杂疾病的遗传结构》中进行了介绍。 正如您可能知道的那样,精神分裂症等许多疾病表现为复杂的特征; 也就是说,它们基本上是定量的...... 了解更多
Nathan Taylor 指出测序成本再次暴跌。 从我听说 Illumina 等公司的发展方向来看,这并不奇怪。 在不久的将来,测序成本不会成为限速步骤。 这是过去一年的一些原始数据:每个基因组的成本 14 月 XNUMX 日... 了解更多
-Rig Veda五年前,我发现我的朋友Daniel MacArthur和我是同一Y染色体单倍体R1a的成员。 我们两个人都认为这很酷,大约5,000年前,有一个男人是直接在父系上对我们俩都祖先的。 五年了... 了解更多
伊恩·马西森 (Iain Matheison) 是《欧洲八千年自然选择》一书的第一作者,在他的网站上有一个简短的笔记,《欧洲身高选择》。 他的结论是:华北人也比华南人高。 人类有许多数量性状。 我们生活在人类系统发育分析的黄金时代…… 了解更多
几年来,一些实验室一直在争论测序与基因分型(更准确地说,是通过测序进行基因分型还是使用阵列)。 有很多优点和缺点。 如果您正在研究非模式生物,则可能没有适合您的 SNP 阵列,因此已做出决定。 如果你... 了解更多
如果您不是睡在岩石下,您就会知道今天 23andMe 已经推出了提供政府 (FDA) 批准的医疗结果的计划。 一般来说,我知道这是即将到来的。 我询问了公司内部的联系人,他们几乎暗示这是迫在眉睫的,尽管他们没有详细说明细节。 这... 了解更多
媒体正为有关家犬的种系和系统发育的新故事而鼓吹。*《纽约时报》写得很好,我喜欢它的标题:中亚可能成为现代犬的出生地(标题已更改)到“大约15,000年,可能在亚洲,那只狗在... 了解更多
拉齐布汗
关于拉齐卜·汗

“我拥有生物学和生物化学学位,对遗传学,历史和哲学充满热情,虾是我最喜欢的食物。如果您想了解更多信息,请访问http://www.razib.com上的链接”