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色素沉着是后基因组时代为数不多的复杂特征之一,几乎可以完全表征。 事后看来,这样做的原因很清楚。 早在 1950 年代(参见人类种群的遗传学),就有使用人类谱系的推论表明,正常的人类变异... 了解更多
上图来自 PLoS GENETICS, Analysis of the Genetic Basis of Disease in the Context of Worldwide Human Relations and Migration。 作者综合了人类基因组学的两个不同领域。 首先,有以生物医学为重点的全基因组关联研究等,它们试图确定特定疾病的风险等位基因...... 了解更多
几天前,我在浏览 Haldane 的 Sieve 时,偶然发现了一个有趣的讨论,该讨论出现在它的“关于”页面上。 这个“棒球内部”的玩笑让我开始思考我自己的智力进化。 在过去的几年里,由于基因组学的兴起,我一直在更深入地研究系统发育学和系统地理学,... 了解更多
上图显示了 Genographic Project 推出的 Geno 2.0 SNP 芯片的人口覆盖率。 他们的论文概述了芯片的实用性和基本原理,现已在 arXiv 上发布。 去年夏天我看到了这张地图,当时 Spencer Wells 主持了一个关于 Geno 2.0 发布的网络研讨会,它是…… 了解更多
要了解自然界的所有复杂性,我们必须将纷繁复杂的变化缩小到一定程度。 为了便于理解,我们用数学形式化,用类比表达,用表示法形象化。 这些对现实的近似并不是现实,但是当我们透过黑暗的玻璃看时,它们会给我们提供基本洞察力的细丝...... 了解更多
当我在 ASHG 看 Spencer Wells 的海报时,我主要对条形图感到好奇。 他的空间覆盖范围非常好,所以我对这篇论文感到有些兴奋(尽管我没有看到对系统发育假设进行太多明确的测试,我认为这种论文现在必须这样做;我们已经超越了 PCA 和 bar。 .. 了解更多
大多数读者都知道我参加了 ASHG 2012。我将把这篇文章分成两半。 第一,会议概况。 其次,特定海报等。 概括: - Life Technologies/Ion Torrent 显然聘请 d-bag 兄弟代表他们出席会议。 海报上的人很好,但是操作 Ion Torrent Bus 的人…… 了解更多
好吧,也许我可以帮忙。 Coop 博士谈到了他和 Joseph Pickrell 博士之间的合作,Haldane's Sieve,我几天前添加到我的 RSS 中(你可以看到我把它推到我的 Pinboard 上)。 来自“关于”:如果其他进化/遗传学博主转发此博客可能会有所帮助,这样我们就可以…… 了解更多
昨天我指出,David Reich 对 PNAS 上的新论文“古代种群结构对现代人类与古代人类之间共享的多态性程度的影响”持适度不屑一顾的态度。 这是 Reich 所说的:这是 Reich 的同事 Nick Patterson 通过电子邮件告诉我的:非洲的古代建筑是...... 了解更多
Dienekes 总结了 Society for Molecular Biology & Evolution 2012 与人类相关的摘要。1) 记住这些不是论文,有些摘要可能永远不会成为论文,至少以可识别的形式 2) 说到这一点,估计日期祖先南亚人群的混合:语言和遗传研究表明...... 了解更多
多年来,在人类进化遗传学和古人类学(或者更准确地说,媒体对这些话题的流行论述)中反复出现的一个问题是“人口 X 是最古老的 Y 人口”的想法。 X 将始终指代更大集合 Y 中的一个群体,Y 被定义为... 了解更多
《美国人类遗传学杂志》上的新文章“哥白尼式”从根部重新评估人类线粒体 DNA 树是开放获取的,因此您应该查看一下。 讨论触及了问题的核心:得到了许多同事的一致支持,经过几年的犹豫,我们... 了解更多
面部是我们表型的一个重要方面。 如此重要以至于面部识别是许多与生俱来的反射性认知能力之一。 我的意思是,您可以以完形方式识别一张脸,就像您可以识别一组三个弹珠一样。 你不必考虑在一个... 了解更多
优秀的 io9 网站今天发布了一篇文章,它是科普出版物作为滞后指标的一个引人入胜的指标。 这是去年 XNUMX 月发表的一篇文章的重新发布,线粒体夏娃如何连接全人类并重写人类进化。 在其中你有一个特定时期的封装...... 了解更多
我以前写过关于海拔适应遗传学的博客。 世界上似乎有三个种群受到了非常强烈的自然选择,导致生理差异,以应对人类缺氧的趋势。 其中有两个比较有名,藏族和原住民…… 了解更多
Dienekes 和 Maju 都评论了一篇新论文,该论文研究了西班牙新石器时代遗骸中乳糖酶持续存在的可能性,但我想我也会对此发表评论。 该论文是:新石器时代西南部欧洲乳糖酶持久性的低流行率。 该位置位于现代巴斯克地区的边缘...... 了解更多
在不久的将来,我将分析一个个体的基因型,其中所有四个祖父母都被分型。 但这让我开始思考我自己的情况:有没有办法“重建”我自己的祖父母? 他们都没有活着。 输入它们的最简单方法是获取组织... 了解更多
Zinedine Zidane, a Kabyle PLoS Genetics 发表了一篇新论文,旨在更详细地描述北非人口的祖先特征。 这个很重要。 HGDP 数据集确实有北非人口莫扎比特人,但代表数亿人并不理想…… 了解更多
古人类颅骨容量增加,由 Luke Jostins 提供 几年前,剑桥桑格研究所的统计遗传学家 Luke Jostins 使用来自古人类(人类谱系)颅骨容量化石的数据发布了上图。 正如您所看到的,直到大约 250,000 年前,颅骨容量才逐渐增加…… 了解更多
在过去十年的中期,发表了许多论文,报告了许多重塑人类基因组的“硬”选择性扫描。 我的意思是,你在遗传背景下出现了一个新的突变,正选择迅速增加了该突变的频率。 由于权力和... 了解更多
去年八月我发表了一篇文章,使人类产生的点突变,这表明将尼安德特人与大约 35,000 年前吸收并取代他们的非洲人之间的差异视为特定的极端差异问题可能是错误的基因。 我被提示到这一行... 了解更多
一位朋友向我指出了这篇文章在《自然》中的热烈评论部分,重建隐藏种族的基因组。 问题是大自然最初声明波多黎各的土著泰诺人已经灭绝。 这导致了大量愤怒的评论,其中一名研究人员卡洛斯·布斯塔曼特 (Carlos Bustamante) 感到…… 了解更多
引人入胜的轨道周期、澳大利亚湖泊水位和原住民的到来:如果您阅读了一些关于火生态学的学术文献,您很难不得出现代人类改变地球的结论! 现代智人的标志似乎是大型生物的灭绝,倾向于…… 了解更多
才意识到。 科学论文有一些有趣的日期,这使我们能够做出上述推断。 - 25-38 千年前欧洲人和东亚人的分离。 - 原始东亚人和原始澳大利亚人之间的基因流动,在美洲原住民与现在之前的前一万五千年不同之前。 - 保守的第一... 了解更多
今天有两篇有趣且相关的论文,我想快速回顾一下,特别是关于结果(而不是方法的本质)。 总的来说,它们确实改变了我们对解剖学上的现代人类如何解决世界的看法,如果发现这些发现...... 了解更多
BBC 有一篇新闻报道收集了对一篇新的 PLoS ONE 论文的反应,来自尼日利亚硫磺岛的晚石器时代 Calvaria:形态学和年代学。 本文报告了在尼日利亚发现的可追溯到大约 13,000 年 BP 的遗迹,这些遗迹表现出非常古老的形态。 换句话说,它们可能不是解剖学上的...... 了解更多
几天来,我一直在咀嚼现代人类将范围扩展到尼安德特人的领土纸上。 但我一直无法让自己多说。 有两个原因。 首先,这是一篇模拟论文,除了怀疑某些人的合理性之外,我不知道我还能说什么…… 了解更多
我将在这篇文章中解决两点。 获得欠采样人口的下一个可能目标,以及马达加斯加的结果。 首先,关于样本不足的人群有很多很好的提交。 其中一些实际上已经在数据集中。 例如,Burusho 和 Kalash 就在 HGDP 中。 那里... 了解更多
Ed Yong 对 PNAS 中一篇新的尼安德特人基因渗入/混合论文进行了很好的评论。 它还没有出现在网络上,所以让我引用 Ed:从我在评论中收集的信息来看,这是因为如果有一波推进,每单位的外加剂水平非常低...... 了解更多
克里希纳与挤奶女工 与某些亚洲社会不同,乳制品在南亚相对知名。 显然,在某个时候,我外祖母的家人经营着一家牛奶生产企业。 这一点值得注意,因为孟加拉并不是牧民之地。 在北印度的大部分地区,牛奶和奶制品显得更大,尤其是酥油…… 了解更多
2008 年末出现的一件事是,人们担心一直非常松懈的金融监管制度现在更加意识到前一个时代的过度行为。 问题是人们不一定为下一次危机做好准备。 同样,恐怖活动,例如…… 了解更多
“当那些日子,地上有巨人;之后,当上帝的儿子们与人类的女儿们交合,为她们生 [孩子] 时,这些 [成为] 强大的人 [是]老,有名望的人。” - 创世记 6:4 髓:俾格米人和科伊桑人混合了... 了解更多
去年在讨论尼安德特人可能与现代非非洲人的祖先混合时,我开玩笑说撒哈拉以南非洲人是“纯人类”。 这在一定程度上是半开玩笑的,因为尼安德特人基因组的结果也改变了我对非洲古代混合物可能性的评估。 换句话说,可能永远没有... 了解更多
Paul Kagame 与 Barack 和 Michelle Obama 我第一次听说卢旺达是在 1980 年代,是关于 Dian Fossey 与山地大猩猩的工作。 围绕这件事的细节已经够悲惨了,但显然 1994 年发生的事情在规模和规模上冲刷了《迷雾中的大猩猩》中戏剧化的事件。 那... 了解更多
The Pith: Evolution 是一个草率的艺术家。 在创造性能量适应的焦点区域上可以精确雕刻,但在遗传景观的边缘,可能会由于注意力不集中而爆发可怕的现象。 换句话说,适应往往有不利之处。 几周前,我审阅了一篇论文,该论文表明克罗恩的... 了解更多
人类或智人类是指一组个体。 从宏观上看,它真的不是那么清晰和独特。 “古代”人类什么时候变成“现代”人类? 考虑到人类的变异,什么是“人类普遍性”? 一组有机体被赋予一个名称,表示它们... 了解更多
早在 1990 年代,围绕人类基因组多样性计划就有很多争议。 事实上,有整本书籍专门介绍该项目的社会学。 尽管该项目的批评者在某些细节上可能有道理,但他们拖延该领域科学调查的总体目标失败了…… 了解更多
在约翰·法雷尔 (John Farrell) 下方发表了一条有趣的评论:左图说明了在过去几百万年中,不同的人类谱系同时发生脑化。 当我第一次看到这个结果时,它有点让我震惊。 我知道尼安德特人在地球上行走的人类中颅骨容量最大,但是…… 了解更多
Steve Hsu 向我推荐了《纽约客》中关于 Svante Pääbo 的科学和个性的一篇文章。 个性部分包括对 Pääbo 的双性恋的引用,在我看来,这似乎是字面意义上的散文,以增添情趣。 当然,这是我觉得有趣的科学。 有许多... 了解更多
要点:自然选择是一个快速而肮脏的操作符。 当受到新环境的影响时,它可以迅速做出反应,带来好的和坏的。 成功适应的关键不是完美,而是比替代方案更好。 这可能意味着许多当代疾病是过去进化遗传妥协的副作用...... 了解更多
Ewen Callaway 在 Nature 上对过去一年古代人类基因组学的发展进行了很好的调查,古代 DNA 揭示了人类历史的秘密。 它不是付费墙,所以请阅读整篇文章。 对于这个博客的密切读者来说,大部分内容不会太令人惊讶,但这一部分是新的:记住... 了解更多
一些人向我指出了最近发表在《科学》上的论文,《尼安德特人向现代人类过渡时期西欧人口增长十倍》。 基本结果是显而易见的,而不是完全革命性的:解剖学上的现代人类可能只是在人口统计学上吸收了尼安德特人(“吸收”这个词在这里显然有很多含义)。 结果很明显... 了解更多
核心:人类 X 染色体受到来自自然选择的更多压力,导致遗传多样性减少。 但是,人类种群中 X 染色体多样性的差异似乎更多地是种群历史的函数,而不是这些种群之间自然选择能力的差异。 在过去的几年里... 了解更多
图片来源 The Pith:在这篇文章中,我回顾了一篇涵盖人类分娩进化维度的论文。 具体来说,我们物种特有的特征和倾向,可能支持这些特征和倾向的基因,以及它们如何与更广泛的公共卫生考虑相关。 人类婴儿是特别的。 不像……的后代 了解更多
约翰·霍克斯(John Hawks)举例说明了在旧数据和分析以及新知识的交汇中可以得到的东西,Quote:新世界色素沉着症的博伊德:回顾几代人对色素沉着的看法是有意思的,因为它是我们在许多方面都拥有的一个特质钉住。 参见人类色素沉着多样性的分子遗传学。 了解更多
拉齐布汗
关于拉齐卜·汗

“我拥有生物学和生物化学学位,对遗传学,历史和哲学充满热情,虾是我最喜欢的食物。如果您想了解更多信息,请访问http://www.razib.com上的链接”