拉齐布汗 •9年2014月XNUMX日 •700字
大卫·赖希 (David Reich) 在 SMBE 2014 上的演讲来来去去,从 Twitter 上的报道看来,这似乎是他们去年秋天 bioRxiv 预印本结果的综合,古代人类基因组表明现代欧洲人的三个祖先群体,以及来自俄罗斯萨马拉的古代 DNA 样本。 专业...
了解更多拉齐布汗 •22年2014月XNUMX日 •900字
那时,地球上有巨人。 此后,当上帝的儿子们来到人类的女儿那里,又给孩子们抚养孩子时,同样变成了有力的男人,这些男人是古老的,有名望的。 -创世记6:4乔·皮克瑞尔和大卫·赖希提出了...
了解更多拉齐布汗 •1年2013月XNUMX日 •1,500字
通常,历史学科似乎在真实和琐碎(或者更准确地说,picayune)和强调几乎虚构故事的宏大叙事之间摇摆不定。 在某些方面,这并不完全是一个问题。 在向幼儿教授美国历史时,一丝不苟地遵守事实是……
了解更多拉齐布汗 •24年2013月XNUMX日 •1,400字
更新:原来“玛丽亚”也是罗姆人。 最近在爱尔兰有一个案例,一名金发蓝眼睛的年轻罗姆女孩被从她的家中带走,因为她怀疑她实际上不是推定父母的亲生孩子(据报道,他们与大多数罗姆人一样...
了解更多拉齐布汗 •17年2013月XNUMX日 •700字
色素沉着是后基因组时代为数不多的复杂特征之一,几乎可以完全表征。 事后看来,这样做的原因很清楚。 早在 1950 年代(参见人类种群的遗传学),就有使用人类谱系的推论表明,正常的人类变异...
了解更多拉齐布汗 •17年2013月XNUMX日 •1,700字
“不要以为我是来给人间和平的:我来不是要去送和平,而是一把剑。” - 马太福音 10:34 “当那些日子,地上有巨人……当神的儿子们与人的女子交合,为她们生孩子时,她们就变成了勇士……
了解更多拉齐布汗 •3年2013月XNUMX日 •600字
埃里卡·查克·海登 (Erika Check Hayden) 的作品伦理:禁忌遗传学引起了很多关注,至少从人们在我的 Facebook 提要上的评论来看是这样。 在某些方面,这并不是一个令人难以置信的基于经验的论点,因为复杂性状的生物学基础将很难在逐个基因的基础上解开......
了解更多拉齐布汗 •7年2013月XNUMX日 •1,200字
存在进化的事实。 然后,关于它如何进行的争论由来已久。 前者是一个已解决的问题,只剩下很少的智力。 后者是进化遗传学和进化生物学的重点。 辩论是一个古老的辩论,可以追溯到第19届...
了解更多拉齐布汗 •8年2013月XNUMX日 •1,600字
精髓:5,000 年前的印度有狩猎采集者。 然后是达罗毗荼农民。 终于来了印度-雅利安牧民。 Reich 实验室发表了一篇新论文《印度近期人口混合的遗传证据》,该论文是他们 2009 年开创性工作《重建印度人口历史》的后续文章。 我没时间...
了解更多拉齐布汗 •7年2013月XNUMX日 •200字
由于各种原因,线粒体夏娃和 Y 染色体亚当的想法引起了公众的想象。 这让很多人感到沮丧,包括我。 我已经进入了这个话题的疲劳阶段,但对恶性模因进行某种反击是必要的。 即使是通常不研究人群的遗传学家也会对其中的含义感到困惑……
了解更多拉齐布汗 •31年2013月XNUMX日 •1,800字
独一无二的 Joe Pickrell 将他的 Khoisan-are-part-Italian 预印本放到了非洲南部和东部的古代西欧亚血统 arXiv 上。 我对论文的核心结论的描述很油腔滑调,但有这样一个反常的反应是有原因的:他似乎从基因数据中得出的推论让我觉得接近……
了解更多拉齐布汗 •30年2013月XNUMX日 •300字
众所周知,亚历山大大帝入侵印度河流域。 巧合的是,在覆盖该地区的山脉中有一些孤立的部落群体,他们的外貌与南亚人不同。 特别是,他们的皮肤要浅得多,而且通常是金发或蓝眼睛。 自然地,这导致了第 19 次和……
了解更多拉齐布汗 •20年2013月XNUMX日 •1,300字
几天前,Dienekes 指出了一篇论文,该论文报道了距现在 80-100,000 年解剖学上的现代人类在中国的存在。 我说“解剖学上的现代”是因为在总体形态上类似于现代人的人群之间可能存在区别,这些人群首先出现在非洲南部和东部 100 到 200 年......
了解更多拉齐布汗 •5年2013月XNUMX日 •1,600字
去年,AJHG 发表了一篇论文,报告称埃塞俄比亚人口似乎是西欧亚人和撒哈拉以南非洲人的混合体。 由于多种原因,这个结果本身并不太令人惊讶。 首先,埃塞俄比亚人和非洲之角的其他人口在西欧亚人和撒哈拉以南地区之间的物理距离相等......
了解更多拉齐布汗 •5年2013月XNUMX日 •1,000字
就在我睡觉之前,一位读者给我发了一封电子邮件,其中提到了尼克韦德在纽约时报的一篇文章,基因侦探发现一些人如何自然抵抗霍乱。 它是关于在来自霍乱流行的恒河三角洲的孟加拉国人群中进行的科学转化医学、自然选择方面的新研究。 作者使用...
了解更多拉齐布汗 •5年2013月XNUMX日 •1,000字
人们普遍认为,近亲繁殖对复杂动物有一些负面的生物学后果。 隐性疾病是最直接的。 隐性疾病越罕见,该疾病患者的亲属比例就会越来越高(原因很简单,因为表达...的极其罕见的等位基因...
了解更多拉齐布汗 •24年2013月XNUMX日 •800字
Razib 的女儿的祖先组成 全基因组关联在方法论哲学中相当简单。 您选取具有相同遗传背景(即种族同质)的病例(受影响)和对照(未受影响),并寻找在两个汇总种群之间差异很大的等位基因。 在视觉上,风险等位基因表现出更高的优势比,通过曼哈顿图表示。 但...
了解更多拉齐布汗 •13年2013月XNUMX日 •700字
Noah Rosenberg 的实验室发表了所有微卫星论文之母,即人类微卫星变异综合基因组数据集中的种群结构。 在我看来,这是他实验室在过去十年中使用微卫星标记进行的所有工作的高潮,应用了各种......
了解更多拉齐布汗 •12年2013月XNUMX日 •1,500字
现代进化遗传学起源于 20 世纪初的一系列学术争论。 Will Provines 的 The Origins of Theoretical Population Genetics 概述了其中的大部分内容,尽管 Francis Galton 的传记也同样如此。 简而言之,在此期间发生的事情是……
了解更多拉齐布汗 •9年2013月XNUMX日 •1,700字
几年前,当一些进化基因组学家报告说,他们通过重新组装保存在当代人群中长期混合的片段,重建了波多黎各已灭绝的泰诺人的基因组时,引起了一场小争议。 争议与今天有些人声称自己是泰诺的事实有关,并且……
了解更多拉齐布汗 •1年2013月XNUMX日 •200字
由于上一篇关于基因组工具的帖子有点狭隘,我认为在 8 月 3 日的湾区人口基因组学会议上发布此通知是可以接受的。 注册将于 XNUMX 月 XNUMX 日(即星期一)截止。 这是公告:
拉齐布汗 •29年2013月XNUMX日 •800字
上图来自 PLoS GENETICS, Analysis of the Genetic Basis of Disease in the Context of Worldwide Human Relations and Migration。 作者综合了人类基因组学的两个不同领域。 首先,有以生物医学为重点的全基因组关联研究等,它们试图确定特定疾病的风险等位基因......
了解更多拉齐布汗 •22年2013月XNUMX日 •400字
在过去一年左右的时间里,我一直在询问我对 Eran Elhaik 关于欧洲犹太人遗传特征的预印本的看法。 坦率地说,我发现某些结论有些奇怪,但是我认为事情会被清理以供发表。 好吧,它已经出来一段时间了:...
了解更多拉齐布汗 •15年2013月XNUMX日 •200字
因为安吉丽娜·朱莉的爆料,万千遗传学案再次成为新闻。 如果你不知道我在说什么,请查一下。 由于专利,Myriad 可以为一项测试收取数千美元的费用,否则会便宜得多(并且使许多没有健康保险的人无法承受)......
了解更多拉齐布汗 •9年2013月XNUMX日 •900字
标准的道歉,我没有太多的时间来写博客,但我认为重要的是我最不注意彼得拉尔夫博士和格雷厄姆库普博士关于血统身份和欧洲人口和历史的论文在它在 PLoS 生物学中的最终形式,最近遗传祖先的地理学......
了解更多拉齐布汗 •4年2013月XNUMX日 •1,400字
几年前,我相当关注母胎健康问题。 我特别担心与我妻子有关的妊娠糖尿病,因为我来自一个种族群体,这些问题的风险较高,当你处于混血婚姻中时,影响似乎是……
了解更多拉齐布汗 •23年2013月XNUMX日 •1,100字
昨天我指出了一篇足够有趣的论文,但没有通过与我们拥有的其他证据相关的气味测试(至少在我看来!)。 一个主要问题是,与常染色体遗传变异相比,单亲(雄性和雌性谱系)表现出一种特殊的变异分布(即,巨大的……
了解更多拉齐布汗 •27年2013月XNUMX日 •900字
理查德·道金斯时不时地通过提出优生学的话题来引发争议。 就道金斯的智力血统而言,这并不奇怪。 在道金斯之前那一代最有影响力的英国进化生物学家,RA Fisher,是一位优生学家。 可以说是道金斯这一代最杰出的进化论者,WD……
了解更多拉齐布汗 •6年2013月XNUMX日 •400字
就在 10 年前,人们还可以合理地谈论 mtDNA 夏娃和 Y 染色体亚当。 然后,“人类故事”可能会被风格化为从大约 100,000 年前繁荣的小型东非核心人口快速扩张,并越狱席卷非洲和其他地区……
了解更多拉齐布汗 •19年2013月XNUMX日 •2,600字
拉齐布汗 •14年2013月XNUMX日 •100字
昨天我用更窄的偏向欧洲的数据集重新运行了 Plink,并生成了一些 MDS 图。 我只有少数亚洲和非洲人口,主要是为了我可以复制标准尺寸 1 和 2,产生您以前见过的经典“v 形”。 但更有趣的是较低的坐标。 他们可能不会捕获...
了解更多拉齐布汗 •13年2013月XNUMX日 •200字
这是我昨天帖子的后续。 如果你关心技术细节(在我清理完这些东西之后我会把它放在 GitHub 上),我正在使用 R 的 adehabitat 包在用内核密度平滑后创建 95% 的分布曲线。 目标是给你一个更好的直觉......
了解更多拉齐布汗 •5年2013月XNUMX日 •300字
一位读者指给我看 David Reich 在 2013 年人类遗传研究中心 Retreat 的一次演讲。 Reich 提出的问题之一是陈旧的,但也许值得再次强调:由于同族通婚,许多南亚人患有更多的隐性疾病。 这不是由于最近的近亲繁殖(这是...
了解更多拉齐布汗 •30年2013月XNUMX日 •400字
随着关于乔治·丘奇和一位冒险的年轻女性密谋带回尼安德特人的疯狂言论,我认为重要的是要记住,我们可以用一种非常老式的方式带回一个以尼安德特人为主的基因组:控制繁殖. 最人道和可行的方式...
了解更多拉齐布汗 •29年2013月XNUMX日 •800字
南亚的大多数人讲两种语言中的一种,即印度-雅利安语和德拉威语。 这两者并不是特别密切相关。 Indo-Aryan 是一种印欧语言,这在与其他印欧方言的众多明显同源词中很明显。 我对孟加拉语(印欧语言的最东端)的流利程度很低,而且相当......
了解更多拉齐布汗 •24年2013月XNUMX日 •600字
在下面的链接中,我提到了关于“神经多样性运动”的争议。 基本问题是,患有阿斯伯格综合症和高功能自闭症的人被指责将他们的担忧置于大量智障孤独症患者(其中一些是非语言的,并且表现出严重的认知......
了解更多拉齐布汗 •23年2013月XNUMX日 •500字
上图是使用 TreeMix 包说明系统发育关系的图表。 这是我昨天提到的那篇论文。 这篇论文,中国天元洞一个早期现代人的DNA分析,是开放获取的,所以每个人都应该可以阅读。 其mtDNA分析显示,天元样本来自...
了解更多拉齐布汗 •15年2013月XNUMX日 •700字
上图来自一篇让我有些困惑的论文,全基因组数据证实了从印度到澳大利亚的全新世基因流。 作者通过 treemix 运行了数十万个 SNP,并生成了上图,由此得出的结论是,从印度人群到澳大利亚的基因流动非常显着。 更多的...
了解更多拉齐布汗 •13年2013月XNUMX日 •300字
在我之前的帖子中,我简要介绍了 Plink 的使用,我分发了一个名为 PHLYO 的数据集。 我没有提到的一件事是我也在 Admixture 上运行它。 但这里有一个重要的点:我从 K = 10 到 K = 2 运行了 15 次数据集......
了解更多拉齐布汗 •5年2013月XNUMX日 •900字
在阅读《进化遗传学的创始人》时,我遇到了已故的 James F. Crow 承认每次重读 RA Fisher 的《自然选择的遗传理论》时都会有新见解的一章。 这促使我在完成 Crow 的章节后放下了进化遗传学的创始人并拿起......
了解更多拉齐布汗 •4年2013月XNUMX日 •1,500字
上面的图片和左边的图片是我父亲 23andMe 个人资料的截图。 有趣的是,他的 mtDNA 单倍群在孟加拉人中并不是特别常见,他们在 M 的一个分支上占 80% 以上。这个现实在上面的地图中很清楚,它说明了我父亲的 mtDNA 谱系的中亚分布......
了解更多拉齐布汗 •18年2012月XNUMX日 •500字
上图显示了 Genographic Project 推出的 Geno 2.0 SNP 芯片的人口覆盖率。 他们的论文概述了芯片的实用性和基本原理,现已在 arXiv 上发布。 去年夏天我看到了这张地图,当时 Spencer Wells 主持了一个关于 Geno 2.0 发布的网络研讨会,它是……
了解更多拉齐布汗 •18年2012月XNUMX日 •600字
要了解自然界的所有复杂性,我们必须将纷繁复杂的变化缩小到一定程度。 为了便于理解,我们用数学形式化,用类比表达,用表示法形象化。 这些对现实的近似并不是现实,但是当我们透过黑暗的玻璃看时,它们会给我们提供基本洞察力的细丝......
了解更多拉齐布汗 •13年2012月XNUMX日 •600字
Slate 中有一篇有趣的文章,环境运动中的大分裂,这似乎是现代环保运动中已经冒泡了一代人的趋势的提炼(我已经以类似的方式阅读了早期的宣言)。 我无法评估转变的幅度,但这是最重要的:让我们......
了解更多拉齐布汗 •12年2012月XNUMX日 •300字
在下面的帖子中,我提出了我的假设,即丹麦克阿瑟的血统不太可能是西北印度人,这排除了他的南亚血统的罗姆人血统。 事实上,这几乎可以肯定是这样,Dienekes Pontikos 对我的粗略分析进行了 IBD 共享计算(IBD = '血统身份',这基本上就是你......
了解更多拉齐布汗 •12年2012月XNUMX日 •1,300字
几天前我建议丹尼尔麦克阿瑟博士可能有南亚血统。 现在,当遇到意外时,最好的选择是坚持您先前的假设,除非该意外足以让您“更新”您的模型。 经过几天的进一步分析,我会更新:我确实认为......
了解更多拉齐布汗 •12年2012月XNUMX日 •800字
新共和国有一篇文章,《年长的父母身份将如何颠覆美国社会》,对于这个博客的读者来说,它不会有令人惊讶的数据。 但很高兴看到这种事情成为“主流”。 我女儿出生时她的父母都 30 多岁,所以我知道所有的统计数据。 他们不好...
了解更多拉齐布汗 •11年2012月XNUMX日 •700字
大多数人都知道海拔高度限制了个人的表现和功能。 其中大部分是灵活的; 在高海拔地区训练的运动员可能会获得性能优势。 但从长远来看,成本是有代价的,就像“超频”的计算机一样。 这是您进行过渡的点...
了解更多拉齐布汗 •10年2012月XNUMX日 •1,000字
我在这篇文章中的最初倾向是讨论最近的订购混乱,这导致我的许多朋友对 23andMe 非常不满。 但是浏览他们新的“祖先组成”功能时,我认为我必须先讨论它,因为有些书呆子级别的阴谋。 尽管我同意 Dienekes 的许多担忧……
了解更多拉齐布汗 •9年2012月XNUMX日 •1,600字
在许多情况下,存在着历史和民族志性质的问题会引起争议和辩论。 学术上的论点被提出,进一步的争论随之而来。 几十年来,进展似乎转瞬即逝,因为一种假设被接受,只会在以后进行修改。 这种模式为最愤世嫉俗的人提供了帮助......
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