每秒测序 243 个完整的人类基因组
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科技创业 有一篇关于已完全测序的人数呈指数增长的文章。 这部作品没有什么特别之处。 您确实必须谨慎对待 10 年的预测，尤其是当它们呈指数增长时。 但这部分引起了我的注意：“以这种指数级的速度，到 2020 年，至少从数学上来说，可能是可行的 在 12 个月内解码人类每个成员的 DNA。=
这意味着什么？ 采取 联合国 估计 2020 年世界人口，我得到以下数字：
– 每小时 874,087 个基因组
– 每分钟 14,568 个基因组
– 每秒 243 个基因组
当然，大部分测序工作是同时进行的，因此生产率不会是恒定的。 但这仍然很棒。 我认为保守一点的话，至少会有数十万人（甚至数百万人）被完全测序。 我不知道这对我个人来说是否有效，但是有一个 数据压缩论文 它声称将原始序列输出的大小减少到约 4 MB 是可行的。 这可能会有所帮助，因为即使在这样的大小下，您仍然需要存储 30 万 TB 的信息（我假设任何给定的基因组都将在各个数据中心中复制数千次）。
（从重新发布 探索/ GNXP 经作者或代表的许可）
关注@razibkhan 
在某个时刻，实际的测序机将不再是瓶颈。 有些人已经争辩说，数据分析开始接管这一角色，随着我们进一步发展，我们还必须考虑样品制备阶段。 您需要雇用大量实验室技术人员来每秒制备 243 个样本，而且实验室技术人员的工资并没有呈指数级下降。
“有一篇关于数据压缩的论文，声称将原始序列输出的大小减少到约 4 MB 是可行的”
从表面上看，这篇论文似乎是正确的，但更准确的说法是，他们声称将任意基因组和人类参考基因组之间的差异集编码在 4 MB 的数据中。 直接压缩将需要接近 500 MB 的空间。
还有谁读过谁曾经花时间在实验室倒凝胶和操作移液器并手动分析（相对较短的）DNA 序列？ 这项技术的进步确实令我难以置信。 在我短暂的实验室猴子经历中，这才刚刚开始，但是哇。
我非常同意这会很棒。 迫不及待地想阅读拉齐布可以与我们分享和解释的所有有趣结果。
由于基因组高度相关，应该有办法有效地将它们压缩在一起，这样压缩 1000 个基因组所占用的空间就不会是压缩其中一个基因组的 1000 倍。
十年可能有点太快了，但我认为世界上每个人——或者至少是发达国家的每个人——最终完成他们的基因组并不是什么难以置信的事情。 最大的问题是这是否会带来任何显着的医疗益处。 如果有的话，它将创建一个产业，测序仪可能会像 X 射线机一样普遍。
医疗福利？ 会有人找到社会福利……
” “阿尔法孩子穿的是灰色的。 他们比我们更努力地工作，因为他们非常聪明。 我真的非常高兴我是一名 Beta，因为我工作不那么努力。 然后我们比 Gamma 和 Delta 好得多。 伽马是愚蠢的。 他们都穿绿色的衣服，三角洲的孩子穿卡其色的衣服。 哦不，我不想和三角洲的孩子们一起玩。 而埃普西隆则更糟。 他们太蠢了，不可能……”
想知道市场将如何发展。 2020 年代每个婴儿出生时都会接受基因组测序吗？ 美国每年约有 4 万新生儿。 欧盟约有5万。 这是一个规模很大的市场。
我想完整的基因组序列将成为强制性生育保险的一部分。
我还认为，一旦基因组测序在上层阶级中变得无处不在（以目前的速度，在十年之内），就会有强大的政治压力让大众能够使用它，也许是以补贴的价格。 我们会看到很多关于基因组鸿沟的文章，就像我们在 90 年代看到的关于数字鸿沟的文章一样。
我可以很容易地看到像新加坡这样的小而富裕的技术官僚国家将在 2020 年实施一些通用基因组测序项目。第一个对所有公民进行测序的国家是一种任意的成就，为一个国家赢得了良好的公关，因为它具有未来感和进步导向。
您需要雇用大量实验室技术人员来每秒准备 243 个样本，而实验室技术人员的工资并不会以指数速度下降。
嗯，这将在世界各地的许多实验室中完成。 每秒 243 个，天知道有多少个实验室。 但是，我想知道机器人在这个领域能走多远。
“我想完整的基因组序列将成为强制性生育护理保险的一部分。”
我想象将会有一个庞大的地下产业，涉及从 10 周大的胎儿中提取 DNA 并对其进行测序。 每个发达国家都会正式禁止，但无论如何都会实行。 富人将能够通过创造 100 个胚胎并挑选具有最理想遗传密码的一个来将测序与 IVF 结合起来。
我想知道需要多少空间来编码基因组的_功能_特征，排除沉默突变、非编码RNA中不相关的突变等，并考虑SNP之间的相关性。 可能只有 10-20 KB。
您能给我指出一个可以找到多个完全测序的人类基因组的网站吗？ 我熟悉 UCSC Genome Browser 网站，但我在那里找不到此类信息。
如果取得类似的成功并降低成本，这一成就将：
1. 立即对所有人类（植物和动物）基因序列进行测序。
2. 允许对胎儿是否存在已知的遗传疾病进行筛查（无论是好是坏[优生学]）。
3. 让科学家发现哪些基因决定长寿（我相信使用我们当前的原始技术已经识别出大约 64 个基因。（想想永生及其推论：强制人口控制。）
4. 打开设计师婴儿的潘多拉魔盒（富人已经通过[不精确的]文化和教育选择性做到了这一点）。
5. 人类（和其他）基因工程（想想《银翼杀手》）。
6. 不可预见的后果。
#4
也许只选择一些基因非常平均的个体，然后对于其他人，人们可以简单地获取他的数据，并注明他们的不同之处。 一个反刍者可以通过选择与某人已经密切相关的人来进一步做到这一点。 我可以看到这对于家庭，或许还有人口非常同质的国家是如何运作的。 但话又说回来，随着数据存储产品的增加，原始大小最终可能不再是问题。