安吉丽娜·朱莉（Angelina Jolie），无数遗传学和基因专利
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因为 安吉丽娜·朱莉（Angelina Jolie）的 启示 无数的遗传学 案件再次成为新闻。 如果你不知道我在说什么， 查一下。 由于拥有这项专利，Myriad可以为测试收取数千美元的费用，否则它会便宜很多（而且如果没有健康保险，很多人都无法接受）。 我的问题很简单： 如果您是遗传学家，您认为Myriad的职位是否有效？ 我问的原因是，我认识许多遗传学家，并且我知道许多遗传学家都读过我，而且我在Twitter上关注了许多遗传学家，但是我从未见过有人愿意捍卫Myriad的合理性并通过气味测试。 如果您是这些遗传学家之一，请发表评论，因为我实在很好奇。
我参加了关于ASHG的无数案件的讨论，我必须说这全是法律，没有科学。 科学是令人困惑和可笑的。 小组成员本人翻了个白眼，并对审理此案的法官的乱七八糟的表达表示辞职。 有一个经典的“两种文化”问题。
（从重新发布 探索/ GNXP 经作者或代表的许可）
关注@razibkhan 
不确定我是否有资格成为一名遗传学家，但由于我偶尔会为这个博客做出贡献，我希望你能让我的评论站得住脚。 两种文化，没错，但是临床提供者和研究遗传学家之间缺乏理解是两种文化。
一项研究发现，临床测序测试的价格取决于基因组目标大小，而不取决于专利的排他性。 例如，一项研究 库克-迪根等人。 普遍对基因产业和专利的潜在影响持批评态度，但他们发现在林奇综合症领域（实验室之间存在广泛竞争），每 kb 价格绝对与 BRCA 测试相当（显然，监管、报告，并且 QA 问题使这些价格远高于研究测序的惯例）。 这张表很长，我将把它贴在下面，在提到完全没有保险（因为有公司为未投保人提供的慈善护理）比穷人的保险计划质量差（尽管大多数美国保险公司承保基因检测，国营的医疗补助计划是出了名的抗药性）。 另一个经常被忽视的问题是周转时间：患者需要快速获得结果来指导他们的紧急医疗需求，而且只有工业规模的实验室才能在几天内返回结果。
林奇综合征测序/重排分析价格，来自 Cook-Deegan 等人。 ：
Baylor：每个基因 1,150 美元或 MLH3,200、MSH1 和 MSH2genes 6 美元
波士顿大学：所有三个基因（MLH2,995、MSH1 和 MSH2）6 美元
希望之城：MLH1,771.20 1 美元，MSH1,474.56 2 美元，MSH1,400.40 6 美元
哈佛：所有三个基因（MLH2,700、MSH1 和 MSH2）6 美元37
亨廷顿实验室：两个基因（MLH1,200 和 MSH1）2 美元，MSH600 6 美元（所有三个基因 1,800 美元）
梅奥诊所：两个基因（MLH2,000 和 MSH1）2 美元，MSH1,100 6 美元（所有三个基因 3,100 美元）
宾夕法尼亚大学：MLH1,360 1 美元，MSH740 2 美元和 MSH740 6 美元（所有三个基因 2,840 美元）
Quest Diagnostics：MLH2,940.00 和 MSH1 的完整测序 2 美元和 MSH1820.00 的 6 美元（所有三个基因的 4,760 美元）
在营利性检测实验室中，Myriad 对其 COLARIS® 检测收费 2,950 美元，其中包括 MLH1、MSH2 和 MSH6 基因的全测序以及主要重排检测。 重排测试使情况更加复杂，因为每个实验室都有自己的价格：
Baylor：MLH1 或 MSH2 的重排测试为 625 美元，MSH6 的重排测试不可用
波士顿大学：重排测试包含在 2,995 美元的 MLH1、MSH2 和 MSH6 测序成本中
希望之城：MSH7 中 2 个外显子的重排测试和剂量分析为 $547.56，MSH 6 中所有外显子的重排测试和剂量分析为 $658.80
哈佛：MLH1 或 MSH2 的重排测试为 600 美元，两者的重排测试为 80037 美元
亨廷顿实验室：MLH1 和 MSH2 的重排和基因剂量分析为 600 美元
梅奥：上述价格包含重排测试
Quest Diagnostics：MLH1 和 MSH2 的重排测试为 540.00 美元； MSH6 重排测试不可用
我很想知道这些测试的利润率。 我可以花 100 美元自己对这些基因进行测序。 这包括人工和订购永远不会再次使用的新引物。
回复：@Zachary Williams，@Dmitry Pruss
如果我有来自 23andme 或其他供应商的基因数据文件，我是否可以在不支付 Myriad 的情况下轻松找出我是否有任何有缺陷的 BRCA 基因？ 如何？
23andMe 只有几个 SNP 来识别变体。 最后我听说他们的分析主要有利于德系犹太人。 但还有其他群体有这个变种（朱莉不是犹太人）。
回复：@梅丽莎
回复：@Razib Khan
23andMe 只有几个 SNP 来识别变体。 最后我听说他们的分析主要有利于德系犹太人。 但还有其他群体有这个变种（朱莉不是犹太人）。
你能用插补吗？
回复：@乔治琼斯
23andMe 只有几个 SNP 来识别变体。 最后我听说他们的分析主要有利于德系犹太人。 但还有其他群体有这个变种（朱莉不是犹太人）。
回复：@梅丽莎
你能用插补吗？
梅丽莎……我相信简短的回答是不使用原始 23andme 数据进行估算。 您未能提供有关您家人癌症的任何信息。
即使您“可以”通过输入 23andme 原始数据来“做”某些事情，您仍然会失败，因为您将无法访问 Myriad 数据库……与他们的专利相比，这对他们来说更具竞争优势。
以下是昨天 2andme 网站上 23 张海报的一些评论：
问题（由 HelenKathleen 在 Health 中发表）：
主题：“BRCA 测试对非 AJ 客户的有用性”
我没有 3andMe 测试的 2 个 BRCA 突变或 Chek23 缺失，但我的母亲在 60 岁时死于卵巢癌，几年后她的双胞胎姐姐死于乳腺癌。 有谁知道 23andMe 测试对于像我这样不是德系犹太人的人有多大用处？
答案（mewahl）：
不要 - 我重复一遍，不要 - 使用 23andme 的 BRCA 测试来替代 Myriad 的服务！ 是的，对于那些基因专利使拯救生命的诊断无法掌握在穷人手中的公司来说，地狱里有一个特殊的地方，但正如我将在下面解释的那样，他们的 BRCA 测试确实没有替代品。
BRCA1/2 有许多不同的等位基因使基因失去功能。 其中一些是 SNP，因此可由 23andme 测试。 然而，许多突变是不同长度和位置的缺失（当您考虑它时，这不是比突变单个碱基对更明显的使基因无功能的方法吗？）。 像 23andme 提供的 SNP 阵列不检测这些大的缺失。 因此，我不会对 23andme 未能检测到您基因组中的 BRCA 突变（无论是否有德系犹太人）进行任何评估。
Myriad 提供的测试实际上是将数十个程序打包在一起，将根据数十年来制作的庞大已知突变数据库检查您的 BRCA 基因。 我不同意 Myriad 的道德决定，当然也没有太多钱可以闲置，但如果是我在你的位置，我会用我的车换一袋现金，然后*步行*去医院接受 BRCA测试。
回复：@梅丽莎
一项研究发现，临床测序测试的价格取决于基因组目标大小，而不取决于专利的排他性。 例如，一项研究 库克-迪根等人。 普遍对基因产业和专利的潜在影响持批评态度，但他们发现在林奇综合症领域（实验室之间存在广泛竞争），每 kb 价格绝对与 BRCA 测试相当（显然，监管、报告，并且 QA 问题使这些价格远高于研究测序的惯例）。 这张表很长，我将把它贴在下面，在提到完全没有保险（因为有公司为未投保人提供的慈善护理）比穷人的保险计划质量差（尽管大多数美国保险公司承保基因检测，国营的医疗补助计划是出了名的抗药性）。 另一个经常被忽视的问题是周转时间：患者需要快速获得结果来指导他们的紧急医疗需求，而且只有工业规模的实验室才能在几天内返回结果。
林奇综合征测序/重排分析价格，来自 Cook-Deegan 等人。 ：
Baylor：每个基因 1,150 美元或 MLH3,200、MSH1 和 MSH2genes 6 美元
波士顿大学：所有三个基因（MLH2,995、MSH1 和 MSH2）6 美元
希望之城：MLH1,771.20 1 美元，MSH1,474.56 2 美元，MSH1,400.40 6 美元
哈佛：所有三个基因（MLH2,700、MSH1 和 MSH2）6 美元37
亨廷顿实验室：两个基因（MLH1,200 和 MSH1）2 美元，MSH600 6 美元（所有三个基因 1,800 美元）
梅奥诊所：两个基因（MLH2,000 和 MSH1）2 美元，MSH1,100 6 美元（所有三个基因 3,100 美元）
宾夕法尼亚大学：MLH1,360 1 美元，MSH740 2 美元和 MSH740 6 美元（所有三个基因 2,840 美元）
Quest Diagnostics：MLH2,940.00 和 MSH1 的完整测序 2 美元和 MSH1820.00 的 6 美元（所有三个基因的 4,760 美元）
在营利性检测实验室中，Myriad 对其 COLARIS® 检测收费 2,950 美元，其中包括 MLH1、MSH2 和 MSH6 基因的全测序以及主要重排检测。 重排测试使情况更加复杂，因为每个实验室都有自己的价格：
Baylor：MLH1 或 MSH2 的重排测试为 625 美元，MSH6 的重排测试不可用
波士顿大学：重排测试包含在 2,995 美元的 MLH1、MSH2 和 MSH6 测序成本中
希望之城：MSH7 中 2 个外显子的重排测试和剂量分析为 $547.56，MSH 6 中所有外显子的重排测试和剂量分析为 $658.80
哈佛：MLH1 或 MSH2 的重排测试为 600 美元，两者的重排测试为 80037 美元
亨廷顿实验室：MLH1 和 MSH2 的重排和基因剂量分析为 600 美元
梅奥：上述价格包含重排测试
Quest Diagnostics：MLH1 和 MSH2 的重排测试为 540.00 美元； MSH6 重排测试不可用
回复：@Chad
我很想知道这些测试的利润率。 我可以花 100 美元自己对这些基因进行测序。 这包括人工和订购永远不会再次使用的新引物。
真的吗？ BRCA2 为 10 kb。 说 10 条引物对其进行测序（假设您奇迹般地为每个测序反应获得 1 kb 读数），那一定是 50 美元，对吧？ 5 美元/底漆比我得到的便宜得多。 然后大约 100 个用于测序反应。 假设所有工作都是第一次。 然后您需要收集样本，提取 RNA，进行 RT，然后进行 PCR 并清理产物。 对我来说听起来像是几个小时的工作，也许每小时 20 美元？ 总共70美元，说。 然后是序列分析，你必须寻找很多不同的突变，可能有点自动化，但肯定至少需要一个小时，这是相当熟练的劳动力，所以称之为 40. 260，投入 40 用于试剂和错误和诸如此类，那是 300。不确定要包括多少开销，但我认为大多数赠款会额外获得 50% 的开销，所以假设是 150 美元。 总计 450 美元。 说 BRCA250 总共 1 美元，它要短得多。 加起来 700 美元，我试图保持乐观。 当然，如果你做很多这些，引物将可以忽略不计，所以让我们减去它们并称之为 600 美元。 不是3000美元，但也不便宜。 如果您自动化了很多步骤，可能会更便宜。
回复：@Chad
第一季度净营业利润率为 24%。 你严重低估了
这些基因。 数千个不同的突变，数十个外显子，约 20 kb
cDNA - 100 美元的 rxns 和人工费用？ 让我休息一下。 + 对于临床应用程序，
同样的试剂价格偏高，人员必须有
非常高的正式资格。 设备也很贵
获得诊所认证，因此您也会受到折旧的影响。
那么保险不会涵盖您的测试，因为更敏感的测试是
avl。 （谁在更贵的情况下不再承保乙状结肠镜检查，但更多
敏感的结肠镜检查是 avl.?)。 所以这会让患者付出更多的代价
口袋，胜过万千。 然后你向他们收费，他们不会付款。 然后你
犯了一个错误，使某人错过了癌症或不必要的乳房
删除，他们起诉。 没生意。
这就是为什么 Cook-Deegan 的报告中没有折扣供应商的原因：
它的
即使在便宜的日子里，经营临床实验室也太贵了
引物，因为引物是底线的一小部分。
除了实验室成本之外，还有很多：法规遵从性，
开发和验证成本； 责任和法律； 计费和坏
债务； 市场营销和医师教育； 等等
当然在
美国医疗保健行业，没有市场供求关系。
实验室测试价格由程序代码定义，无法理解
的临床费用。 专利不会使东西明显更贵，
但是专利确实增加了显着的份额和测试量，因此
专利测试的利润可能更高，即使价格
类似。
这个案子似乎已经持续了十年或更长时间。 我发现很难认真对待 Myraid 专利的正当性。 我唯一担心的是如果它被击落可能会产生影响。 我不认为这是研究新疾病遗传学或识别风险变异的主要障碍。 但如果这对基因工程产品的专利申请有任何应用，那么这可能会产生非常负面的影响。
我认为最相关的专家将是药物化学家，而不是遗传学家，因为他们中的大部分人都具有与化学产品相关的专利法方面的经验。 我倾向于忽略任何不熟悉天然产品专利概念的人对 Myriad 案的看法。 在我看来，科学比法律更容易理解，但也许这只是因为我发现遗传学比法律更容易理解。
我不是化学家，我不确定我是否算作遗传学家（尽管我的实验室和其他任何东西一样都是遗传学实验室）。 我认为万千有一个法律条文上的案例，但它可能违反了法律精神。 他们获得专利的分子与自然界中的分子不同——它们是分离的、纯化的和浓缩的，这就是它们作为诊断工具有用的原因。
“分离、纯化和浓缩”的定义有多宽泛/狭隘？ 几乎所有的下一代测序技术都需要首先分离 DNA，将接头连接到片段上，通过几轮 PCR 进行扩增，将引物连接到接头序列，最后进行测序。 特定的 BRCA1/2 序列不会被分离或纯化，但如果我们现在认为发送用于测序的未修饰 PCR 片段在某种程度上不同于自然状态，它将间接地经历相当多的操作。 在人类下一代测序中，外显子组测序非常流行，在这种情况下，首先通过与芯片杂交来富集外显子区域，然后进行测序。 虽然 BRCA1/2 与其他外显子区域相比不会富集，但与整个基因组相比，它将大大富集。
那么在什么时候我们可以说没有分离或纯化 BRCA1/2？ 如果我进行了一个非常长的 PCR 反应或克隆了一个包含 BRCA1 或 2 以及其他基因的数千碱基区域，然后对整个区域进行了测序，我会侵犯专利吗？
仅 PCR 片段就可申请专利的想法对我来说似乎很荒谬。 现在，如果我要修改那个片段，把它放回人类、老鼠、酵母或其他任何东西中，那将是非常不同的东西。
回复：@Zachary Williams
我不是化学家，我不确定我是否算作遗传学家（尽管我的实验室和其他任何东西一样都是遗传学实验室）。 我认为万千有一个法律条文上的案例，但它可能违反了法律精神。 他们获得专利的分子与自然界中的分子不同——它们是分离的、纯化的和浓缩的，这就是它们作为诊断工具有用的原因。
回复：@Chad
“分离、纯化和浓缩”的定义有多宽泛/狭隘？ 几乎所有的下一代测序技术都需要首先分离 DNA，将接头连接到片段上，通过几轮 PCR 进行扩增，将引物连接到接头序列，最后进行测序。 特定的 BRCA1/2 序列不会被分离或纯化，但如果我们现在认为发送用于测序的未修饰 PCR 片段在某种程度上不同于自然状态，它将间接地经历相当多的操作。 在人类下一代测序中，外显子组测序非常流行，在这种情况下，首先通过与芯片杂交来富集外显子区域，然后进行测序。 虽然 BRCA1/2 与其他外显子区域相比不会富集，但与整个基因组相比，它将大大富集。
那么在什么时候我们可以说没有分离或纯化 BRCA1/2？ 如果我进行了一个非常长的 PCR 反应或克隆了一个包含 BRCA1 或 2 以及其他基因的数千碱基区域，然后对整个区域进行了测序，我会侵犯专利吗？
仅 PCR 片段就可申请专利的想法对我来说似乎很荒谬。 现在，如果我要修改那个片段，把它放回人类、老鼠、酵母或其他任何东西中，那将是非常不同的东西。
这是一个很好的问题，美国公民自由联盟声称深度测序必然会侵犯基因专利。 但很容易争辩说，即使使用外显子组测序，您也不是专门针对 BRCA 基因。 当然，它们相对于直接基因组 DNA 是富集的，但它们是否以任何*有用*的方式富集？ 我（非律师）对分离产品规则的解释是，分离产品的效用必须与自然界中存在的分子有很大不同。 与未富集的基因组 DNA 相比，一管富含外显子序列的 DNA 在识别 BRCA 突变方面并没有多大用处。 所以，对于深度测序，我认为不侵权的论据足够强大，可以让深度测序和基因专利共存。
但是你的第二点更难回答。 在过去的一年里，我多次查看 BRCA 专利，但我从来没有找到任何真正定量地定义什么是侵权分子的东西。 现在，BRCA 基因都跨越了大约 100 kb，IIRC，所以你不能对整个事情进行 PCR，而且我认为任何放大编码区有用部分的 PCR 反应显然是侵权的，但是如果你重新克隆一个相邻区域，而你恰好剪掉了几 kb 的 BRCA 区域，这会侵权吗？ 如果您将几百 kb 克隆到 BAC 或 YAC 中，并且其中包含部分或全部 BRCA 基因，这是否侵权？ 我不知道。 我不确定那会有什么实际用途，我怀疑只对整个该死的基因组进行测序会更容易，甚至可能更便宜，但我似乎不清楚。
至于 PCR 片段是否可专利：您认为人胰岛素是否应可专利？ 它在当时获得了专利，没有争议。 是什么让一种分离的人类生物分子可申请专利，而另一种则不能？
回复：@Chad
“分离、纯化和浓缩”的定义有多宽泛/狭隘？ 几乎所有的下一代测序技术都需要首先分离 DNA，将接头连接到片段上，通过几轮 PCR 进行扩增，将引物连接到接头序列，最后进行测序。 特定的 BRCA1/2 序列不会被分离或纯化，但如果我们现在认为发送用于测序的未修饰 PCR 片段在某种程度上不同于自然状态，它将间接地经历相当多的操作。 在人类下一代测序中，外显子组测序非常流行，在这种情况下，首先通过与芯片杂交来富集外显子区域，然后进行测序。 虽然 BRCA1/2 与其他外显子区域相比不会富集，但与整个基因组相比，它将大大富集。
那么在什么时候我们可以说没有分离或纯化 BRCA1/2？ 如果我进行了一个非常长的 PCR 反应或克隆了一个包含 BRCA1 或 2 以及其他基因的数千碱基区域，然后对整个区域进行了测序，我会侵犯专利吗？
仅 PCR 片段就可申请专利的想法对我来说似乎很荒谬。 现在，如果我要修改那个片段，把它放回人类、老鼠、酵母或其他任何东西中，那将是非常不同的东西。
回复：@Zachary Williams
这是一个很好的问题，美国公民自由联盟声称深度测序必然会侵犯基因专利。 但很容易争辩说，即使使用外显子组测序，您也不是专门针对 BRCA 基因。 当然，它们相对于直接基因组 DNA 是富集的，但它们是否富集于任何 *有用* 方法？ 我（非律师）对分离产品规则的解释是，分离产品的效用必须与自然界中存在的分子有很大不同。 与未富集的基因组 DNA 相比，一管富含外显子序列的 DNA 在识别 BRCA 突变方面并没有多大用处。 所以，对于深度测序，我认为不侵权的论据足够强大，可以让深度测序和基因专利共存。
但是你的第二点更难回答。 在过去的一年里，我多次查看 BRCA 专利，但我从来没有找到任何真正定量地定义什么是侵权分子的东西。 现在，BRCA 基因都跨越了大约 100 kb，IIRC，所以你不能对整个事情进行 PCR，而且我认为任何放大编码区有用部分的 PCR 反应显然是侵权的，但是如果你重新克隆一个相邻区域，而你恰好剪掉了几 kb 的 BRCA 区域，这会侵权吗？ 如果您将几百 kb 克隆到 BAC 或 YAC 中，并且其中包含部分或全部 BRCA 基因，这是否侵权？ 我不知道。 我不确定那会有什么实际用途，我怀疑只对整个该死的基因组进行测序会更容易，甚至可能更便宜，但我似乎不清楚。
至于 PCR 片段是否可专利：您认为人胰岛素是否应可专利？ 它在当时获得了专利，没有争议。 是什么让一种分离的人类生物分子可申请专利，而另一种则不能？
我看到了与人胰岛素的关键区别。 在胰岛素生产的情况下，你有一个克隆的基因，它被插入到另一个生物体中生产的载体中。
我看到适用于个人理解自己序列的能力的专利与修改该序列以用于商业生产的专利之间存在明显差异。
了解我在哪里画线。 我将采用我更熟悉的东西，即来自农杆菌的 5-烯醇丙酮酰莽草酸 3-磷酸合成酶，它赋予植物对农达的抗性。 如果我只是出去从农杆菌的野生菌株中对这个基因进行测序，那么我真的不知道我们怎么能从逻辑上认为这是对专利的侵犯。 现在，如果我试图模仿孟山都的技术并修改该基因，将其放入其他生物中等等，那显然是对专利的侵犯。
回复：@Zachary Williams
我不担心极其罕见的突变。 我想知道朱莉是否可以根据廉价 DNA 测试的 SNP 检测到她的问题。
我要说的是大多数突变都非常罕见。 已知有许多不同的有害突变，鉴于这些突变一开始就相当罕见，每个单独的突变必须更加罕见。 我不知道 23andme 测试中包含了多少已知突变，但我怀疑其中很多没有。 特别是因为并非所有这些都是 SNP。
回复：@Zachary Williams
我要说的是大多数突变都非常罕见。 已知有许多不同的有害突变，鉴于这些突变一开始就相当罕见，每个单独的突变必须更加罕见。 我不知道 23andme 测试中包含了多少已知突变，但我怀疑其中很多没有。 特别是因为并非所有这些都是 SNP。
我很想知道这些测试的利润率。 我可以花 100 美元自己对这些基因进行测序。 这包括人工和订购永远不会再次使用的新引物。
回复：@Zachary Williams，@Dmitry Pruss
真的吗？ BRCA2 为 10 kb。 说 10 条引物对其进行测序（假设您奇迹般地为每个测序反应获得 1 kb 读数），那一定是 50 美元，对吧？ 5 美元/底漆比我得到的便宜得多。 然后大约 100 个用于测序反应。 假设所有工作都是第一次。 然后您需要收集样本，提取 RNA，进行 RT，然后进行 PCR 并清理产物。 对我来说听起来像是几个小时的工作，也许每小时 20 美元？ 总共70美元，说。 然后是序列分析，你必须寻找很多不同的突变，可能有点自动化，但肯定至少需要一个小时，这是相当熟练的劳动力，所以称之为 40. 260，投入 40 用于试剂和错误和诸如此类，那是 300。不确定要包括多少开销，但我认为大多数赠款会额外获得 50% 的开销，所以假设是 150 美元。 总计 450 美元。 说 BRCA250 总共 1 美元，它要短得多。 加起来 700 美元，我试图保持乐观。 当然，如果你做很多这些，引物将可以忽略不计，所以让我们减去它们并称之为 600 美元。 不是3000美元，但也不便宜。 如果您自动化了很多步骤，可能会更便宜。
点承认。 我承认对 BRCA 基因相当极端的长度一无所知，特别是当人类基因的平均长度约为 3kb 时，这是我通常使用的更典型的基因。 在这些长度上，成本肯定更便宜。 但是，在我看来，您的成本确实有点偏高。 十个测序 rxns 将花费我 60 美元，而引物成本约为 6-7 美元/引物。 这或许是制度差异的体现。 我也不喜欢“试剂盒生物学”，它确实不会节省太多时间，但肯定会削减试剂成本。 更不用说这里的大部分时间实际上都花在等待 RT 或 PCR 完成上，这些时间最好花在做其他工作上。
回复：@Zachary Williams
你能用插补吗？
回复：@乔治琼斯
梅丽莎……我相信简短的回答是不使用原始 23andme 数据进行估算。 您未能提供有关您家人癌症的任何信息。
即使您“可以”通过输入 23andme 原始数据来做一些事情，您仍然会失败，因为您将无法访问 Myriad 数据库……与他们的专利相比，这对他们来说更具竞争优势。
以下是昨天 2andme 网站上 23 张海报的一些评论：
问题（由 HelenKathleen 在 Health 中发表）：
主题：“BRCA 测试对非 AJ 客户的有用性”
我没有 3andMe 测试的 2 个 BRCA 突变或 Chek23 缺失，但我的母亲在 60 岁时死于卵巢癌，几年后她的双胞胎姐姐死于乳腺癌。 有谁知道 23andMe 测试对于像我这样不是德系犹太人的人有多大用处？
答案（mewahl）：
不要——我重复一遍，不要——使用 23andme 的 BRCA 测试来替代 Myriad 的服务！ 是的，对于那些基因专利使拯救生命的诊断无法掌握在穷人手中的公司来说，地狱里有一个特殊的地方，但正如我将在下面解释的那样，他们的 BRCA 测试确实没有替代品。
BRCA1/2 有许多不同的等位基因使基因失去功能。 其中一些是 SNP，因此可由 23andme 测试。 然而，许多突变是不同长度和位置的缺失（当您考虑它时，这不是比突变单个碱基对更明显的使基因无功能的方法吗？）。 像 23andme 提供的 SNP 阵列不检测这些大的缺失。 因此，我不会对 23andme 未能检测到您基因组中的 BRCA 突变（无论是否有德系犹太人）进行任何评估。
Myriad 提供的测试实际上是将数十个程序打包在一起，将根据数十年来制作的庞大已知突变数据库检查您的 BRCA 基因。 我不同意 Myriad 的道德决定，当然也没有太多的钱，但如果是我在你的位置上，我会用我的车换一袋现金和 *走* 去医院做BRCA测试。
家庭那一方的健康史在很大程度上是未知的。 我的祖父是德系犹太人的源头，他假装自己不是犹太人，并与家人分离。 我很幸运有相当不错的保险，所以我会向我的医生询问测试。
回复：@Dmitry Pruss
这是一个很好的问题，美国公民自由联盟声称深度测序必然会侵犯基因专利。 但很容易争辩说，即使使用外显子组测序，您也不是专门针对 BRCA 基因。 当然，它们相对于直接基因组 DNA 是富集的，但它们是否以任何*有用*的方式富集？ 我（非律师）对分离产品规则的解释是，分离产品的效用必须与自然界中存在的分子有很大不同。 与未富集的基因组 DNA 相比，一管富含外显子序列的 DNA 在识别 BRCA 突变方面并没有多大用处。 所以，对于深度测序，我认为不侵权的论据足够强大，可以让深度测序和基因专利共存。
但是你的第二点更难回答。 在过去的一年里，我多次查看 BRCA 专利，但我从来没有找到任何真正定量地定义什么是侵权分子的东西。 现在，BRCA 基因都跨越了大约 100 kb，IIRC，所以你不能对整个事情进行 PCR，而且我认为任何放大编码区有用部分的 PCR 反应显然是侵权的，但是如果你重新克隆一个相邻区域，而你恰好剪掉了几 kb 的 BRCA 区域，这会侵权吗？ 如果您将几百 kb 克隆到 BAC 或 YAC 中，并且其中包含部分或全部 BRCA 基因，这是否侵权？ 我不知道。 我不确定那会有什么实际用途，我怀疑只对整个该死的基因组进行测序会更容易，甚至可能更便宜，但我似乎不清楚。
至于 PCR 片段是否可专利：您认为人胰岛素是否应可专利？ 它在当时获得了专利，没有争议。 是什么让一种分离的人类生物分子可申请专利，而另一种则不能？
回复：@Chad
我看到了与人胰岛素的关键区别。 在胰岛素生产的情况下，你有一个克隆的基因，它被插入到另一个生物体中生产的载体中。
我看到适用于个人理解自己序列的能力的专利与修改该序列以用于商业生产的专利之间存在明显差异。
了解我在哪里画线。 我将采用我更熟悉的东西，即来自农杆菌的 5-烯醇丙酮酰莽草酸 3-磷酸合成酶，它赋予植物对农达的抗性。 如果我只是出去从农杆菌的野生菌株中对这个基因进行测序，那么我真的不知道我们怎么能从逻辑上认为这是对专利的侵犯。 现在，如果我试图模仿孟山都的技术并修改该基因，将其放入其他生物中等等，那显然是对专利的侵犯。
啊，但是胰岛素早在克隆之前就获得了专利。 早在 1923 年，首次获得专利的是纯化的蛋白质。获得专利的分子与自然界中的分子之间的唯一区别是它是纯化的。
我也看到了主要适用于理解个人序列的专利与适用于直接使用某物的专利之间的差异，但我不同意这种差异是明显的。 以你的例子为例：让我们只谈谈酶 5-enolpyrwhateverase，而不是基因。 让我们假设纯化的酶在某种程度上是有用的。 那应该是可专利的吗？ 如果没有，哪种纯化的天然分子应该是可申请专利的（如果有的话）？ 如果它应该是可专利的，为什么会这样，而不是编码酶的纯化 DNA 分子？
回复：@Chad、@Anthony_A、@Dmitry Pruss
真的吗？ BRCA2 为 10 kb。 说 10 条引物对其进行测序（假设您奇迹般地为每个测序反应获得 1 kb 读数），那一定是 50 美元，对吧？ 5 美元/底漆比我得到的便宜得多。 然后大约 100 个用于测序反应。 假设所有工作都是第一次。 然后您需要收集样本，提取 RNA，进行 RT，然后进行 PCR 并清理产物。 对我来说听起来像是几个小时的工作，也许每小时 20 美元？ 总共70美元，说。 然后是序列分析，你必须寻找很多不同的突变，可能有点自动化，但肯定至少需要一个小时，这是相当熟练的劳动力，所以称之为 40. 260，投入 40 用于试剂和错误和诸如此类，那是 300。不确定要包括多少开销，但我认为大多数赠款会额外获得 50% 的开销，所以假设是 150 美元。 总计 450 美元。 说 BRCA250 总共 1 美元，它要短得多。 加起来 700 美元，我试图保持乐观。 当然，如果你做很多这些，引物将可以忽略不计，所以让我们减去它们并称之为 600 美元。 不是3000美元，但也不便宜。 如果您自动化了很多步骤，可能会更便宜。
回复：@Chad
点承认。 我承认对 BRCA 基因相当极端的长度一无所知，特别是当人类基因的平均长度约为 3kb 时，这是我通常使用的更典型的基因。 在这些长度上，成本肯定更便宜。 但是，在我看来，您的成本确实有点偏高。 十个测序 rxns 将花费我 60 美元，而引物成本约为 6-7 美元/引物。 这或许是制度差异的体现。 我也不喜欢“试剂盒生物学”，它确实不会节省太多时间，但肯定会削减试剂成本。 更不用说这里的大部分时间实际上都花在等待 RT 或 PCR 完成上，这些时间最好花在做其他工作上。
您可能可以稍微缩短准备时间，毕竟您希望同时进行，而不是一次一个。 可能还有其他地方。 OTOH，这只是一个快速而肮脏的序列。 我不知道临床测序的标准是什么，但我很确定它们明显更高。 当然，他们希望每个序列至少完成两到三遍。 我不知道。 你的观点可能仍然适用于利润率，即使花费 1000 美元，他们也会为自己做得很好。
回复：@Chad
我看到了与人胰岛素的关键区别。 在胰岛素生产的情况下，你有一个克隆的基因，它被插入到另一个生物体中生产的载体中。
我看到适用于个人理解自己序列的能力的专利与修改该序列以用于商业生产的专利之间存在明显差异。
了解我在哪里画线。 我将采用我更熟悉的东西，即来自农杆菌的 5-烯醇丙酮酰莽草酸 3-磷酸合成酶，它赋予植物对农达的抗性。 如果我只是出去从农杆菌的野生菌株中对这个基因进行测序，那么我真的不知道我们怎么能从逻辑上认为这是对专利的侵犯。 现在，如果我试图模仿孟山都的技术并修改该基因，将其放入其他生物中等等，那显然是对专利的侵犯。
回复：@Zachary Williams
啊，但是胰岛素早在克隆之前就获得了专利。 早在 1923 年，首次获得专利的是纯化的蛋白质。获得专利的分子与自然界中的分子之间的唯一区别是它是纯化的。
我也看到主要适用于理解个人序列的专利和适用于直接使用的专利之间的差异，但我不同意这种差异是明显的。 以你的例子为例：让我们只谈谈酶 5-enolpyrwhateverase，而不是基因。 让我们假设纯化的酶在某种程度上是有用的。 那应该是可专利的吗？ 如果没有，哪种纯化的天然分子应该是可申请专利的（如果有的话）？ 如果它应该是可专利的，为什么会这样，而不是编码酶的纯化 DNA 分子？
当然，这是一个灰色地带。 我不是律师，但是，我仍然看到明显的差异。
人胰岛素的专利是否适用于我自己身体产生的胰岛素？ 专利持有人是否有权碾碎我并提取胰岛素（我是双曲线的）？ 专利持有人是否有权因我的身体产生胰岛素而向我收费？ 我认为我们可以同意这些必然是荒谬的。
我的基因组不仅仅是我的财产，它是我人格的一部分。 专利权延伸到从植物、细菌或动物中提取的天然产品是一回事。 把它延伸到我个人，延伸到你个人，或者安吉丽娜·朱莉和其他所有人，都是另一回事。
Myraid 的专利所做的，无论是孟山都公司还是人类胰岛素的专利持有人，都否认了我们作为个人对我们自己的身体、我们自己的基因组的权利。
在我看来，一种天然存在的材料不应该申请专利，但合成它的方法，或者提取和纯化它的方法，应该是。 所以人胰岛素，不可申请专利。 合成人胰岛素的方法，可申请专利。 合成中的中间化合物，如果在自然界中没有发现，则可申请专利。 提取和浓缩绵羊胰岛素用于生产人胰岛素的方法，可申请专利。 绵羊胰岛素，不可申请专利。
不幸的是，这不是现行专利法看待这个问题的方式，而且立法或法院判决将制定我认为处理天然材料和专利的明智方式的希望不大。
在胰岛素之前，1911 年第一个进入最高法院的纯化激素是肾上腺素。根据法官 Learned Hand 的决定，这与纯化无关 本身, 这是关于启用 全新的实际用途 这对于化合物的天然形式是不可能的。 在肾上腺素的情况下，天然形式是肾上腺提取物； 净化使其安全 第一次静脉注射.
BRCA1/2 DNA 的纯形式（如合成的引物和探针、PCR 扩增子、克隆的 DNA 等）可用于测序、表达分析、拷贝数分析等实际用途。
点承认。 我承认对 BRCA 基因相当极端的长度一无所知，特别是当人类基因的平均长度约为 3kb 时，这是我通常使用的更典型的基因。 在这些长度上，成本肯定更便宜。 但是，在我看来，您的成本确实有点偏高。 十个测序 rxns 将花费我 60 美元，而引物成本约为 6-7 美元/引物。 这或许是制度差异的体现。 我也不喜欢“试剂盒生物学”，它确实不会节省太多时间，但肯定会削减试剂成本。 更不用说这里的大部分时间实际上都花在等待 RT 或 PCR 完成上，这些时间最好花在做其他工作上。
回复：@Zachary Williams
您可能可以稍微缩短准备时间，毕竟您希望同时进行，而不是一次一个。 可能还有其他地方。 OTOH，这只是一个快速而肮脏的序列。 我不知道临床测序的标准是什么，但我很确定它们明显更高。 当然，他们希望每个序列至少完成两到三遍。 我不知道。 你的观点可能仍然适用于利润率，即使花费 1000 美元，他们也会为自己做得很好。
好吧，根据研究与临床的标准，我最初的估计是愚蠢的。
啊，但是胰岛素早在克隆之前就获得了专利。 早在 1923 年，首次获得专利的是纯化的蛋白质。获得专利的分子与自然界中的分子之间的唯一区别是它是纯化的。
我也看到了主要适用于理解个人序列的专利与适用于直接使用某物的专利之间的差异，但我不同意这种差异是明显的。 以你的例子为例：让我们只谈谈酶 5-enolpyrwhateverase，而不是基因。 让我们假设纯化的酶在某种程度上是有用的。 那应该是可专利的吗？ 如果没有，哪种纯化的天然分子应该是可申请专利的（如果有的话）？ 如果它应该是可专利的，为什么会这样，而不是编码酶的纯化 DNA 分子？
回复：@Chad、@Anthony_A、@Dmitry Pruss
当然，这是一个灰色地带。 我不是律师，但是，我仍然看到明显的差异。
人胰岛素的专利是否适用于我自己身体产生的胰岛素？ 专利持有人是否有权碾碎我并提取胰岛素（我是双曲线的）？ 专利持有人是否有权因我的身体产生胰岛素而向我收费？ 我认为我们可以同意这些必然是荒谬的。
我的基因组不仅仅是我的财产，它是我人格的一部分。 专利权延伸到从植物、细菌或动物中提取的天然产品是一回事。 把它延伸到我个人，延伸到你个人，或者安吉丽娜·朱莉和其他所有人，都是另一回事。
Myraid 的专利所做的，无论是孟山都公司还是人类胰岛素的专利持有人，都否认了我们作为个人对我们自己的身体、我们自己的基因组的权利。
您可能可以稍微缩短准备时间，毕竟您希望同时进行，而不是一次一个。 可能还有其他地方。 OTOH，这只是一个快速而肮脏的序列。 我不知道临床测序的标准是什么，但我很确定它们明显更高。 当然，他们希望每个序列至少完成两到三遍。 我不知道。 你的观点可能仍然适用于利润率，即使花费 1000 美元，他们也会为自己做得很好。
回复：@Chad
好吧，根据研究与临床的标准，我最初的估计是愚蠢的。
我很想知道这些测试的利润率。 我可以花 100 美元自己对这些基因进行测序。 这包括人工和订购永远不会再次使用的新引物。
回复：@Zachary Williams，@Dmitry Pruss
第一季度净营业利润率为 24%。 你严重低估了
这些基因。 数千个不同的突变，数十个外显子，约 20 kb
cDNA——100 美元的 rxns 和人工费用？ 让我休息一下。 + 对于临床应用程序，
同样的试剂价格偏高，人员必须有
非常高的正式资格。 设备也很贵
获得诊所认证，因此您也会受到折旧的影响。
那么保险不会涵盖您的测试，因为更敏感的测试是
avl。 （谁在更贵的情况下不再承保乙状结肠镜检查，但更多
敏感的结肠镜检查是 avl.?)。 所以这会让患者付出更多的代价
口袋，胜过万千。 然后你向他们收费，他们不会付款。 然后你
犯了一个错误，使某人错过了癌症或不必要的乳房
删除，他们起诉。 没生意。
这就是为什么 Cook-Deegan 的报告中没有折扣供应商的原因：
这是
即使在便宜的日子里，经营临床实验室也太贵了
引物，因为引物是底线的一小部分。
除了实验室成本之外，还有很多：法规遵从性，
开发和验证成本； 责任和法律； 计费和坏
债务； 市场营销和医师教育； 等等
当然在
美国医疗保健行业，没有市场供求关系。
实验室测试价格由程序代码定义，无法理解
的临床费用。 专利不会使东西明显更贵，
但是专利确实增加了显着的份额和测试量，因此
专利测试的利润可能更高，即使价格
类似。
梅丽莎……我相信简短的回答是不使用原始 23andme 数据进行估算。 您未能提供有关您家人癌症的任何信息。
即使您“可以”通过输入 23andme 原始数据来“做”某些事情，您仍然会失败，因为您将无法访问 Myriad 数据库……与他们的专利相比，这对他们来说更具竞争优势。
以下是昨天 2andme 网站上 23 张海报的一些评论：
问题（由 HelenKathleen 在 Health 中发表）：
主题：“BRCA 测试对非 AJ 客户的有用性”
我没有 3andMe 测试的 2 个 BRCA 突变或 Chek23 缺失，但我的母亲在 60 岁时死于卵巢癌，几年后她的双胞胎姐姐死于乳腺癌。 有谁知道 23andMe 测试对于像我这样不是德系犹太人的人有多大用处？
答案（mewahl）：
不要 - 我重复一遍，不要 - 使用 23andme 的 BRCA 测试来替代 Myriad 的服务！ 是的，对于那些基因专利使拯救生命的诊断无法掌握在穷人手中的公司来说，地狱里有一个特殊的地方，但正如我将在下面解释的那样，他们的 BRCA 测试确实没有替代品。
BRCA1/2 有许多不同的等位基因使基因失去功能。 其中一些是 SNP，因此可由 23andme 测试。 然而，许多突变是不同长度和位置的缺失（当您考虑它时，这不是比突变单个碱基对更明显的使基因无功能的方法吗？）。 像 23andme 提供的 SNP 阵列不检测这些大的缺失。 因此，我不会对 23andme 未能检测到您基因组中的 BRCA 突变（无论是否有德系犹太人）进行任何评估。
Myriad 提供的测试实际上是将数十个程序打包在一起，将根据数十年来制作的庞大已知突变数据库检查您的 BRCA 基因。 我不同意 Myriad 的道德决定，当然也没有太多钱可以闲置，但如果是我在你的位置，我会用我的车换一袋现金，然后*步行*去医院接受 BRCA测试。
回复：@梅丽莎
家庭那一方的健康史在很大程度上是未知的。 我的祖父是德系犹太人的源头，他假装自己不是犹太人，并与家人分离。 我很幸运有相当不错的保险，所以我会向我的医生询问测试。
梅丽莎，如果对家族史知之甚少，即使是好的保险公司通常也会犹豫不决。 然后，如果您声称德系血统，那么覆盖将更容易获得，但仅限于德系 BRCA 突变。 您可能想与您所在地区的认证遗传顾问交谈，以了解如何在这些水域航行，并祝您好运。
当家族史模糊不清时……啊。 对于像我这样的人，他们的家族中有很多癌症，但没有像众所周知的遗传性癌症综合征那样，并且整个家族的分支都在战争和动荡中被摧毁和迷失，即使是今天的外显子组也可能是最好的答案。 我通过 23andMe / BGI 得到了我的，但是花了 1000 美元和无数小时的搜索和分析，没有魔法。
朱莉可能是从她母亲那里得到了突变
并且她也会接受在她母亲身上发现的突变的检测。 特定部位的临床测试价格低廉（约 300 美元）、快速、超级敏感，并且被保险公司广泛覆盖。 由于 BRCA 突变在家庭中发生，在第一个昂贵的阳性结果到处寻找之后，其余的亲属已经知道去哪里寻找。
如果你对你的外显子组进行了测序，你可以测试每个蛋白质的移码和无义突变，而不仅仅是 BRCA。 这未能涵盖 Myriad 无缘无故测序的一些内含子
临床外显子组很昂贵，由于覆盖不均匀而存在空白，如您已经指出的那样遗漏了内含子（发现了数百种致病突变——听说过剪接吗？），通常误认为移码，看不到基因组重排，以及大多数重要的是，无法理解错义突变（一些最常见的癌症突变是错义突变）。 此外，BRCA 基因中存在一些根本不会导致癌症的无义突变。 您可能需要更好的覆盖率、更好的 indel 调用、内含子和 UTR、重排以及良好的突变效应数据库才能获得高质量的测试结果。
外显子组也非常缓慢。 如果您有乳房肿瘤并且计划在下周进行手术，并且您必须在乳房切除术或乳房切除术之间做出决定，那么您现在需要一个答案，而不是几个月后。
当然，随着时间的推移，一些“外显子组加”方法可能会成为“方法”。 对于许多神秘情况，例如无法解释的儿童发育异常，它已经成为标准。 当然，它缓慢、乏味、昂贵，并且错过了很多答案——但在某些情况下，没有比这更好的了。 但是对于像遗传性乳腺癌和卵巢癌这样经过充分研究的疾病，特定基因的靶向测序在相当长的一段时间内仍有待解决。
这是一个很好的点，成本是每个家庭 3000 美元，而不是每个人。 不过，我能得到的单一站点 brca 的唯一报价是 600 美元。
我认为你的任何其他观点都不相关。
家庭那一方的健康史在很大程度上是未知的。 我的祖父是德系犹太人的源头，他假装自己不是犹太人，并与家人分离。 我很幸运有相当不错的保险，所以我会向我的医生询问测试。
回复：@Dmitry Pruss
梅丽莎，如果对家族史知之甚少，即使是好的保险公司通常也会犹豫不决。 然后，如果您声称德系血统，那么覆盖将更容易获得，但仅限于德系 BRCA 突变。 您可能想与您所在地区的认证遗传顾问交谈，以了解如何在这些水域航行，并祝您好运。
当家族史模糊不清时……啊。 对于像我这样的人，他们的家族中有很多癌症，但没有像众所周知的遗传性癌症综合征那样，并且整个家族的分支都在战争和动荡中被摧毁和迷失，即使是今天的外显子组也可能是最好的答案。 我通过 23andMe / BGI 得到了我的，但是花了 1000 美元和无数小时的搜索和分析，没有魔法。
并且她也会接受在她母亲身上发现的突变的检测。 特定部位的临床测试价格低廉（约 300 美元）、快速、超级敏感，并且被保险公司广泛覆盖。 由于 BRCA 突变在家庭中发生，在第一个昂贵的阳性结果到处寻找之后，其余的亲属已经知道去哪里寻找。
如果你对你的外显子组进行了测序，你可以测试每个蛋白质的移码和无义突变，而不仅仅是 BRCA。 这未能涵盖 Myriad 无缘无故测序的一些内含子
临床外显子组很昂贵，由于覆盖不均匀而存在间隙，如您已经指出的那样遗漏了内含子（发现了数百种致病突变 - 听说过剪接吗？），通常误称移码，看不到基因组重排，以及大多数重要的是，无法理解错义突变（一些最常见的癌症突变是错义突变）。 此外，BRCA 基因中存在一些根本不会导致癌症的无义突变。 您可能需要更好的覆盖率、更好的 indel 调用、内含子和 UTR、重排以及良好的突变效应数据库才能获得高质量的测试结果。
外显子组也非常缓慢。 如果您有乳房肿瘤并且计划在下周进行手术，并且您必须在乳房切除术或乳房切除术之间做出决定，那么您现在需要一个答案，而不是几个月后。
当然，随着时间的推移，一些“外显子组加”方法可能会成为“方法”。 对于许多神秘情况，例如无法解释的儿童发育异常，它已经成为标准。 当然，它很慢、乏味、昂贵，并且错过了很多答案——但在某些情况下，没有比这更好的了。 但是对于像遗传性乳腺癌和卵巢癌这样经过充分研究的疾病，特定基因的靶向测序在相当长的一段时间内仍有待解决。
回复：@Douglas Knight
这是一个很好的点，成本是每个家庭 3000 美元，而不是每个人。 不过，我能得到的单一站点 brca 的唯一报价是 600 美元。
我认为你的任何其他观点都不相关。
我本身不是遗传学家，但我的研究涉及遗传关联，我对万事万物的科学和法律非常熟悉。
在不深入了解案例法的细节的情况下，我认为这些年来发生了一系列错误的转变，我总体上支持 Myriad 的立场——而不是它在当前诉讼中的具体法律立场（我认为这已经把它们描绘成一个站不住脚的角落），但其作为有权获得受保护的报酬机会的发明人的广泛道德地位。 当然，我也认为 Mayo v Promotheus 的判决是错误的： http://cen.acs.org/articles/90/i14/Patent-Ruling-Dismays-Biotech.html?h=-1802238606
在我看来，这个问题上的许多敌意来自左派（包括大多数学者/遗传学家），他们对有人试图从他人的健康中获利感到生气。 “专利基因”的概念引发的 GATTACA 恐慌在公众心目中进一步放大了这一点。 （Razib，我知道你既不是左派，也不是 GATTACA 恐慌意义上的基因例外论者，但我是在笼统地说）。
我完全清楚，在政策问题上，我是学术科学的异类。 新技术使任何此类专利几乎无法执行也可能是真的。 但是，作为一个相信个性化医疗承诺的人，我感到沮丧的是，法律制度似乎有意告诉风险资本像瘟疫一样避开这个领域。
梅奥VS普罗米修斯？ 真的吗？ 虽然我更倾向于支持专利，但这似乎很荒谬。 一般来说，我会将我的推理外包给更精通专利的人，并且可能比我更同情专利：
“普罗米修斯专利包括以下步骤：
1. 告诉医生给病人用药。
2. 告诉医生在给药后测量他们血液中的代谢物水平。
3. 描述这些代谢物的可接受上限和下限，并告诉医生这些表明需要提高或降低剂量。
那里！ 现在不是那么好，是吗？ 我当时反对这种荒谬的想法，这无异于一步步为整个医学实践申请专利。”
http://pipeline.corante.com/archives/2012/03/21/the_supreme_court_makes_me_smile.php
附录：几年前，我有一个初步的发现，我认为有可能导致IP。 我可以向你保证，那一年我工作得比我一生中任何时候都努力。 最后得到了几篇不错的论文，但没有获得专利，唉。 尽管如此，我坚信知识产权保护的激励作用； 也许更重要的是，我的院长也是！
在不深入了解判例法的细节的情况下，我认为这些年来发生了一系列错误的转变，我总体上支持 Myriad 的立场——而不是它在当前诉讼中的具体法律立场（我认为这已经将它们描绘成一个站不住脚的角落），但它作为发明人的广泛道德地位，有权获得受保护的报酬机会。 当然，我也认为 Mayo v Promotheus 的判决是错误的：http://cen.acs.org/articles/90/i14/Patent-Ruling-Dismays-Biotech.html?h=-1802238606
在我看来，这个问题上的许多敌意来自左派（包括大多数学者/遗传学家），他们对有人试图从他人的健康中获利感到生气。 “专利基因”的概念引发的 GATTACA 恐慌在公众心目中进一步放大了这一点。 （Razib，我知道你既不是左派，也不是 GATTACA 恐慌意义上的基因例外论者，但我是在笼统地说）。
我完全清楚，在政策问题上，我是学术科学的异类。 新技术使任何此类专利几乎无法执行也可能是真的。 但是，作为一个相信个性化医疗承诺的人，我感到沮丧的是，法律制度似乎有意告诉风险资本像瘟疫一样避开这个领域。
回复：@Zachary Williams
梅奥VS普罗米修斯？ 真的吗？ 虽然我更倾向于支持专利，但这似乎很荒谬。 一般来说，我会将我的推理外包给更精通专利的人，并且可能比我更同情专利：
“普罗米修斯专利包括以下步骤：
1. 告诉医生给病人用药。
2. 告诉医生在给药后测量他们血液中的代谢物水平。
3. 描述这些代谢物的可接受上限和下限，并告诉医生这些表明需要提高或降低剂量。
那里！ 现在不是那么好，是吗？ 当时我反对这种荒谬的想法，这无异于一步步为整个医学实践申请专利。”
http://pipeline.corante.com/archives/2012/03/21/the_supreme_court_makes_me_smile.php
在无数专利挑战的数十年（！）中，受害方保持不变，但他们推翻 BRCA 专利的“理由”不断变化！ 首先——“其他人对这项发现的贡献如此之大，以至于专利是他们的，而不是 Myriad 的”； 然后——“这是一个微不足道的观察，而不是一个发现”； 然后——“DNA 是文本，必须受到第一修正案权利的保护”，现在“你可以为其他分子申请专利，但对分离的 DNA 做一个特殊的例外”。
这是 1 年代竞相发现 BRCA2 和 BRCA1990 的团体之间激烈冲突的产物，而失败的一方从未停止过法庭上的斗争。 可一战又一败，又一次次改变剧情，现在怎么能显得诚恳呢？ 如果它的主旨已经发生了如此多次的根本变化，那么反对专利的论点是否有那么大的有效性？
BRCA1/2 未获得专利可能会（也可能不会）引起可怕的公众健康，但美国政府已经可以这样做，根据 Bayh-Doyle 法案行使其进军权利。 基本上，这一发现是由一所公立大学做出的，并由美联储拨款支付； 大学被要求为其发现申请专利并将其商业化，以收回纳税人的钱； 但如果公众需要，美联储保留进军并接管专利的权利。 因此，如果取消专利的原因是由公共卫生决定的，那么就没有必要去最高法院； 解决方案已经在手。
啊，但是胰岛素早在克隆之前就获得了专利。 早在 1923 年，首次获得专利的是纯化的蛋白质。获得专利的分子与自然界中的分子之间的唯一区别是它是纯化的。
我也看到了主要适用于理解个人序列的专利与适用于直接使用某物的专利之间的差异，但我不同意这种差异是明显的。 以你的例子为例：让我们只谈谈酶 5-enolpyrwhateverase，而不是基因。 让我们假设纯化的酶在某种程度上是有用的。 那应该是可专利的吗？ 如果没有，哪种纯化的天然分子应该是可申请专利的（如果有的话）？ 如果它应该是可专利的，为什么会这样，而不是编码酶的纯化 DNA 分子？
回复：@Chad、@Anthony_A、@Dmitry Pruss
在我看来，一种天然存在的材料不应该申请专利，但合成它的方法，或者提取和纯化它的方法，应该是。 所以人胰岛素，不可申请专利。 合成人胰岛素的方法，可申请专利。 合成中的中间化合物，如果在自然界中没有发现，则可申请专利。 提取和浓缩绵羊胰岛素用于生产人胰岛素的方法，可申请专利。 绵羊胰岛素，不可申请专利。
不幸的是，这不是现行专利法看待这个问题的方式，而且立法或法院判决将制定我认为处理天然材料和专利的明智方式的希望不大。
“你能给太阳申请专利吗？”
啊，但是胰岛素早在克隆之前就获得了专利。 早在 1923 年，首次获得专利的是纯化的蛋白质。获得专利的分子与自然界中的分子之间的唯一区别是它是纯化的。
我也看到了主要适用于理解个人序列的专利与适用于直接使用某物的专利之间的差异，但我不同意这种差异是明显的。 以你的例子为例：让我们只谈谈酶 5-enolpyrwhateverase，而不是基因。 让我们假设纯化的酶在某种程度上是有用的。 那应该是可专利的吗？ 如果没有，哪种纯化的天然分子应该是可申请专利的（如果有的话）？ 如果它应该是可专利的，为什么会这样，而不是编码酶的纯化 DNA 分子？
回复：@Chad、@Anthony_A、@Dmitry Pruss
在胰岛素之前，1911 年第一个进入最高法院的纯化激素是肾上腺素。根据法官 Learned Hand 的决定，这与纯化无关 本身, 这是关于启用 全新的实际用途 这对于化合物的天然形式是不可能的。 在肾上腺素的情况下，天然形式是肾上腺提取物； 净化使其安全 第一次静脉注射.
BRCA1/2 DNA 的纯形式（如合成的引物和探针、PCR 扩增子、克隆的 DNA 等）可用于测序、表达分析、拷贝数分析等实际用途。
这是今天纽约时报上关于Myriad的，有一些相关的观点和信息。
http://www.nytimes.com/2013/05/21/opinion/the-outrageous-cost-of-a-gene-test.html?ref=opinion&_r=0
David Agus 是 Navigenics 的创始人之一。 他说：
“没有竞争，Myriad 可以有效地收取任何费用。 今年晚些时候，该公司表示将开始将 BRCA 测试纳入 25 基因癌症风险评估，并在 2015 年之前逐步淘汰单点 BRCA 测试。对于更广泛的测试，它预计毛利率为 87%。 ”
“我完全支持创新和保护知识产权的权利，但是当存在明显的垄断和人命攸关的情况时，我们需要采取立法行动来进行合理和适当的定价。 我们不会让疫苗过于昂贵，因此只有富人才能保护自己。 我们也不应该让其他可以挽救数千人生命的预防措施的定价远高于正常“市场条件”所暗示的水平。”
最高法院将支持无数的可能性很大……请参阅最近的案例，那里支持孟山都。
然后由国会来解决问题。
对 Eric Lander 提交的“兰德简报”法庭之友简报有何想法？
http://prawfsblawg.blogs.com/prawfsblawg/2013/04/impact-of-the-lander-brief-in-the-myriad-gene-patent-case-and-an-answer-to-justice-alitos-question.html （包含指向实际简报的链接）
关于侵权的定量标准，15 个连续匹配的碱基对标准似乎非常广泛（正如 PTO 在批准它时的想法）： http://www.economist.com/news/science-and-technology/21576377-americas-supreme-court-rule-patenting-genes-natural-justice
为那些想要深入挖掘的人提交了相当多的法庭之友简报。 例如： http://www.americanbar.org/content/dam/aba/publications/supreme_court_preview/briefs-v2/12-398_pet_amcu_genformatic.authcheckdam.pdf