西班牙哈布斯堡王朝（1516-1700）的国王经常与近亲结婚，其方式是使伯伯侄女，第一堂兄弟和其他近亲血统在该王朝盛行。 在历史文献中，有人指出，近亲交往是导致王朝灭绝的主要原因，当时查理二世因身体和精神上的残疾而去世，1700年去世，两婚中均未生下任何孩子，但这一假说具有尚未从遗传学角度进行检查。 在本文中，通过计算西班牙哈布斯堡王朝的近亲繁殖系数（F），从一个扩展的谱系直至多达16代，涉及3,000多个个体，对这一假设进行了检验。 西班牙哈布斯堡王朝的近亲繁殖系数随着世代的增长从王朝的创建者菲利普一世国王0.025上升到查理二世的0.254，而该朝代的几个近亲繁殖系数都高于0.20。 除了由于近亲之间的结合而进行近交外，来自多个遥远祖先的祖先近交对大多数国王的近交系数做出了重大贡献。 在西班牙哈布斯堡王朝的后代中，检测到可以生存到10年的具有统计学意义的近交抑郁症。 结果表明，近亲近亲繁殖（F = 0.0625）的水平对存活率有17.8％612.3的不利影响。 据推测，在查尔斯二世（F = 0.254）中同时发生的两种不同的遗传性疾病：合并的垂体激素缺乏症和远端肾小管性酸中毒，这是由两个未连锁位点的隐性等位基因决定的，这可以解释该现象的大部分复杂临床特征。国王，包括他的阳imp /不育，最终导致王朝灭绝。

为了 近交系数，在这里至关重要。 查尔斯二世不仅是表弟的初婚后代，而且是婚姻的顶峰。 几代人的表亲婚姻屡屡发生。 以下是查尔斯从卡斯提尔的菲利普和乔安娜那里继承的血统书（后者分别是著名的费迪南德和阿拉贡和卡斯蒂利亚的伊莎贝拉的女儿）。 我已经强调了那些从外部进入血统的祖先，也就是说，他们正在引入相对“新鲜的血液”。

如您所见，Charles的家谱经常循环回去！ 菲利普（Philip＆Joanna）是查尔斯（Charles）的前辈。 这是个问题。 要了解如何操作，请考虑菲利普（Philip）或乔安娜（Joanna）是否携带有害的突变，这种突变的表达方式是隐性的。 大概他们的孩子不会受到影响，因为他们中只有一个应该携带罕见的有害突变，从而产生互补作用，这样一个完整的功能拷贝就足够了。 但是在查尔斯的情况下 他的父母都是Philip＆Joanna的后代，因此他从父母双方那里继承相同的有缺陷等位基因的可能性增加了。 F的公式，近交系数为：
F _I =Σ（0.5）ⁱ X（1 + F _A )
您在这里所做的就是总结通向共同祖先的所有不同途径。 您可以根据共同祖先与您要计算其近交系数的个体之间的个体数量来对此加权（请注意，例如，查尔斯的某些世系直到他的祖先具有不同的世代数）。 最后，您必须将那个共同祖先的近亲繁殖系数包括在内。
让我们为兄弟姐妹交配玩一下。 假设只有两个的祖父母没有关系。 所以F _A =0。然后，它简化为：
F _I =（0.5）³ X（1）+（0.5）³ X（1）= 0.25
换句话说，查尔斯二世的近亲繁殖程度比其兄弟姐妹交配的后代平均繁殖程度高！
随着时间的流逝，这种过程将导致近亲繁殖系数的急剧增加。 左侧的图表显示了一段时间内孤立的人口中兄弟姐妹交配的过程。 近交系数自然收敛于1。在某些方面，近交可以被认为是缩小长期有效种群规模并增加基因库内随机过程能力的一种方法。 如果漂移变得足够强大，它将导致整个种群灭绝 突变融解。 突变融解可以被认为是滚雪球效应，即小种群可以固定有害突变体，从而降低适应性，进一步压低种群并增加固定有害突变的可能性。 就哈普斯堡一家而言，则无需 从头 突变，所有人类中都携带着许多有害的等位基因，这些等位基因由于仅隐性表达而被掩盖。 在近交世代中，这些等位基因可能会慢慢被揭露，以查尔斯二世为结尾。
在西班牙Hapsburgs的数据集中，研究人员发现了近亲抑郁的有力证据，其定义是由于种群平均适应度降低了后代的适应度：

从1527年到1661年，菲利普二世和查尔斯二世分别出生时，西班牙王室有34个孩子，其中10个（29.4％）在1岁之前死亡，其中17个（50.0％）在10岁之前死亡…这些数字显然高于当代西班牙村庄的死亡率 其中包括属于各种社会阶层的家庭，例如婴儿死亡率约为20％。

西班牙哈普斯堡犬的婴儿死亡率高于西班牙平民。 这是极有启发性的。 但是，这里的数据集足够大，只有几步之遥。 这是一个多元回归（最小二乘），它显示了近交系数对死亡率的影响（取自表4）：

用简单的英语来说，近交系数越高，死亡率越高。 从质量上讲，这都不是令人惊讶的，历史学家的印象派假设一直是由于近亲繁殖导致西班牙哈布斯堡王朝的堕落（请参阅亨利·卡门的著作） 帝国：西班牙如何成为世界强国，1492-1763年。 但是很高兴看到它以精确的方式进行布局。 西班牙哈普斯堡犬不仅婴儿死亡率很高，而且随着近亲繁殖的发展，其死亡率也越来越高。 关联不是因果关系，但是关联是推断因果关系所必需的。
作者最后对Charles II可能患有的特定疾病和遗传异常做了一些详细的推测。 由于本文是“开放获取”，因此我建议您直接阅读。 相反，我想指出一些有趣的东西：

近亲繁殖的最高水平发生在邦迪切里市区（印度南部）和巴基斯坦的军人家庭中，其中近亲结婚分别为54.9％和77.1％…在旁迪切里，近亲结婚的有20.2％是un父，近亲结婚的是31.3％。堂兄，而在巴基斯坦的研究中，有62.5％的婚姻是堂兄之间的。

尽管在许多文化中，表亲结婚是出于各种原因而被优先考虑的，但直到最近，它以比今天更低的频率存在。 为什么？ 考虑一下 在现代社会中，婴儿的道德水平较低，而在许多发达社会中，大家庭是其规范。 这增加了许多大家庭中可能的伴侣。 正如您在上面看到的，近代的近交迭代往往会导致一些严重的问题。 以色列的撒玛利亚人甚至参与一项旨在减少高发性先天缺陷的计划。 话虽这么说，在不久的将来，许多发达国家的家庭规模较小，这可能意味着堂兄结婚的做法自然而然地遭到了社会破坏。 考虑一下您是否有XNUMX个堂兄供您选择，而不是XNUMX个。 无论是否有配偶，这都可能有很大的不同。
相关新闻： 另见 Ed Yong的帖子，他将重点更多地放在了查尔斯二世的具体病理上。