上周我 乞求马达加斯加人的基因型。 我还不太明白,但是我得到了第二好的东西: 马达加斯加人基因型的一部分。 我决定试一试。
但是首先是一些预备。 这是我们对此人的了解(或该人所知道的):
– 25%的法国人(祖父)
– 18.75%的西非? 6.25%法国人? (祖母法属安的列斯)
–来自孟买的19%印度穆斯林Bohras + 6.25%马拉加斯,Sakalava部落,玛哈真加王室(外祖父)
– 25%马达加斯加(Sakalava,外婆mtDNA单倍体M23)
就祖先而言,这是一个非常混杂的人。 至于马达加斯加人,我们对他们了解很多。 他们或多或少是南澳大利亚人的杂种人群,与 到婆罗洲南部的达雅克人。 我假设这些南洋人是环印度洋贸易网络的一部分,该网络在第一千年的下半叶被伊斯兰教的崛起所边缘化。 这么早就可以解释为什么马达加斯加人似乎只受到印度文化影响的影响,更不用说伊斯兰教的影响了。 他们的祖先还有非洲部分,在马达加斯加岛以西的低地人口中更为突出。 这 萨卡拉瓦 是一些非洲人(相对于东部高地的梅里纳(Merina)而言,他们更像是南方人)。
以下是使用EIGENSOFT生成的ADMIXTURE和PCA的一些结果。 大多数PCA地块都不太有用,因为我没有提前太多时间微调人口(这是第一遍),所以我没有发布它们。 ADMIXTURE的运行对我来说似乎很有帮助。 我合并了部分疯子个人的三个数据集:
–#1,一个以东南亚为重点的人群,主要使用泛亚财团人口
–#2,使用HGDP的亚洲重点数据集
–#3,使用Henn等人的非洲重点数据集。 人口以及一些HGDP
#1受到薄标记集的困扰。 东南亚的群体有〜56,000个标记,但有部分疟疾的人只与他们共享〜22,000个标记。 尽管如此,我还是成功了。 我可能在#2中补偿过度,因为我使用了约590,000个标记(HGDP与23andMe原始数据有很好的重叠)。 最后,#3拥有约180,000个标记,对于这种探索性工作,我觉得这已经足够了。
菌群数 | K1 | K2 | K3 | K4 | K5 | K6 | K7 | K8 | K9 | K10 | K11 | K12 | K13 |
台湾原住民 | 0% | 0% | 0% | 2% | 0% | 0% | 5% | 23% | 69% | 0% | 0% | 0% | 0% |
苗族 | 0% | 0% | 3% | 78% | 0% | 0% | 7% | 4% | 3% | 2% | 0% | 0% | 2% |
吉国 | 0% | 0% | 73% | 2% | 0% | 0% | 9% | 1% | 1% | 3% | 1% | 0% | 9% |
Wa | 0% | 0% | 5% | 4% | 0% | 0% | 17% | 2% | 1% | 7% | 0% | 0% | 63% |
马尔加什 | 31% | 0% | 2% | 0% | 6% | 26% | 0% | 0% | 0% | 2% | 31% | 0% | 3% |
亚罗语 | 0% | 83% | 0% | 0% | 1% | 2% | 0% | 3% | 2% | 0% | 0% | 8% | 0% |
爪哇 | 0% | 4% | 1% | 1% | 0% | 0% | 1% | 25% | 8% | 22% | 1% | 5% | 32% |
拉马霍洛特 | 0% | 61% | 0% | 1% | 1% | 3% | 1% | 13% | 7% | 2% | 0% | 8% | 2% |
明打威 | 0% | 0% | 0% | 0% | 0% | 0% | 0% | 98% | 0% | 1% | 0% | 0% | 0% |
西爪哇省 | 0% | 4% | 1% | 1% | 0% | 2% | 0% | 26% | 9% | 22% | 1% | 4% | 31% |
托拉雅 | 0% | 13% | 0% | 1% | 1% | 1% | 3% | 44% | 21% | 7% | 0% | 2% | 5% |
印度 | 1% | 1% | 0% | 0% | 2% | 59% | 0% | 0% | 0% | 1% | 25% | 1% | 11% |
日文 | 1% | 1% | 2% | 3% | 0% | 1% | 87% | 1% | 1% | 1% | 0% | 0% | 1% |
肯修·内格里托(Kensiu Negrito) | 0% | 0% | 0% | 0% | 0% | 0% | 1% | 1% | 1% | 2% | 0% | 90% | 4% |
犹他州,白色 | 1% | 0% | 0% | 0% | 2% | 20% | 0% | 0% | 0% | 0% | 74% | 0% | 3% |
露雅 | 78% | 0% | 1% | 0% | 2% | 18% | 0% | 0% | 0% | 0% | 1% | 0% | 0% |
玛曼瓦 | 0% | 1% | 0% | 0% | 83% | 0% | 0% | 9% | 3% | 0% | 0% | 2% | 0% |
西棉兰老岛 | 0% | 6% | 1% | 4% | 3% | 3% | 11% | 36% | 24% | 5% | 2% | 1% | 4% |
西吕宋 | 0% | 4% | 1% | 5% | 2% | 2% | 16% | 36% | 24% | 4% | 1% | 1% | 4% |
卡伦 | 9% | 1% | 6% | 6% | 0% | 0% | 18% | 2% | 1% | 8% | 0% | 1% | 50% |
计画 | 1% | 1% | 8% | 5% | 0% | 0% | 12% | 6% | 2% | 18% | 1% | 2% | 43% |
羟色胺 | 1% | 0% | 1% | 1% | 0% | 0% | 0% | 2% | 0% | 84% | 1% | 0% | 10% |
汉台 | 0% | 0% | 6% | 16% | 0% | 0% | 45% | 10% | 13% | 3% | 0% | 0% | 7% |
菌群数 | K1 | K2 | K3 | K4 | K5 | K6 | K7 | K8 | K9 | K10 |
姆布蒂P格米人 | 0% | 100% | 0% | 0% | 0% | 0% | 0% | 0% | 0% | 0% |
比亚卡P格米人 | 0% | 9% | 6% | 0% | 0% | 0% | 0% | 59% | 0% | 25% |
法语 | 0% | 0% | 100% | 0% | 0% | 0% | 0% | 0% | 0% | 0% |
巴布亚 | 1% | 0% | 0% | 99% | 0% | 0% | 0% | 0% | 0% | 0% |
柬埔寨人 | 75% | 0% | 0% | 2% | 10% | 5% | 8% | 0% | 1% | 0% |
日文 | 0% | 0% | 0% | 0% | 0% | 0% | 98% | 0% | 1% | 0% |
有 | 28% | 0% | 0% | 0% | 0% | 1% | 70% | 0% | 1% | 0% |
曼登卡 | 0% | 0% | 0% | 0% | 0% | 0% | 0% | 0% | 0% | 100% |
红宝石 | 0% | 0% | 3% | 0% | 0% | 0% | 1% | 0% | 95% | 0% |
圣 | 0% | 0% | 0% | 0% | 0% | 0% | 0% | 100% | 0% | 0% |
Bant S非洲 | 0% | 4% | 0% | 0% | 0% | 0% | 0% | 23% | 0% | 73% |
土家族 | 34% | 0% | 0% | 0% | 0% | 3% | 63% | 0% | 0% | 0% |
izu津 | 12% | 1% | 0% | 1% | 0% | 9% | 78% | 0% | 0% | 0% |
苗族 | 48% | 0% | 0% | 0% | 0% | 1% | 51% | 0% | 0% | 0% |
赫镇 | 1% | 0% | 0% | 0% | 0% | 1% | 69% | 0% | 29% | 0% |
锡伯 | 4% | 0% | 2% | 0% | 1% | 2% | 73% | 0% | 18% | 0% |
通过 | 88% | 0% | 0% | 0% | 0% | 2% | 10% | 0% | 0% | 0% |
拉hu | 11% | 0% | 0% | 0% | 0% | 82% | 7% | 0% | 0% | 0% |
她 | 49% | 0% | 0% | 0% | 0% | 0% | 51% | 0% | 0% | 0% |
纳西 | 4% | 0% | 0% | 1% | 0% | 9% | 85% | 0% | 1% | 0% |
Tu | 8% | 0% | 4% | 0% | 3% | 3% | 74% | 0% | 7% | 0% |
班图肯尼亚 | 0% | 5% | 2% | 0% | 1% | 0% | 0% | 7% | 0% | 84% |
马尔加什 | 5% | 1% | 37% | 0% | 11% | 3% | 0% | 4% | 4% | 36% |
印度 | 0% | 0% | 0% | 0% | 99% | 0% | 0% | 0% | 0% | 0% |
菌群数 | K1 | K2 | K3 | K4 | K5 | K6 | K7 | K8 | K9 | K10 |
哈扎 | 16% | 0% | 76% | 1% | 5% | 1% | 1% | 1% | 0% | 0% |
也门犹太人 | 0% | 0% | 0% | 84% | 0% | 0% | 0% | 0% | 0% | 15% |
埃塞俄比亚 | 19% | 0% | 4% | 52% | 25% | 0% | 1% | 0% | 0% | 0% |
桑达威 | 6% | 0% | 1% | 2% | 90% | 1% | 0% | 1% | 0% | 0% |
比亚卡P格米人 | 0% | 0% | 0% | 0% | 0% | 100% | 0% | 0% | 0% | 0% |
姆布蒂P格米人 | 0% | 0% | 0% | 0% | 0% | 0% | 100% | 0% | 0% | 0% |
法语 | 0% | 0% | 0% | 20% | 0% | 0% | 0% | 0% | 1% | 80% |
柬埔寨人 | 0% | 100% | 0% | 0% | 0% | 0% | 0% | 0% | 0% | 0% |
曼登卡 | 98% | 0% | 0% | 0% | 0% | 1% | 0% | 0% | 0% | 0% |
约鲁巴语 | 96% | 0% | 0% | 0% | 0% | 4% | 0% | 0% | 0% | 0% |
Bant S非洲 | 72% | 0% | 0% | 0% | 0% | 9% | 1% | 17% | 0% | 0% |
班图肯尼亚 | 77% | 0% | 1% | 2% | 12% | 5% | 2% | 0% | 0% | 0% |
马尔加什 | 32% | 13% | 0% | 3% | 5% | 4% | 1% | 0% | 7% | 36% |
露雅 | 77% | 0% | 2% | 1% | 12% | 5% | 3% | 0% | 0% | 0% |
印度 | 0% | 1% | 0% | 0% | 0% | 0% | 0% | 0% | 99% | 0% |
圣 | 8% | 2% | 0% | 1% | 0% | 1% | 0% | 79% | 3% | 6% |
我不太相信泛亚重点数据集所占的比例。 但是我认为我应该报告他们。 不知道为什么马达加斯加人显示了这么多雅库特。 可能是杂交的产物吗? 至于其余的人,对于东非班图人来说,这个人的非洲血统似乎并不是很典型。