好的，现在让我们修剪一些“纯”和无关的人群。 此外，我将删除一些K。 因此，将使用新的基数重新计算比例。 因此，请记住，南非Bantus显示出西非地区较高，部分原因是Khoisan比例被删除，从而夸大了其他所有元素的百分比。

现在，让我们看一下推断总体之间的成对Fst值。 记住这一点 测量可归因于遗传变异的比例 之间 人口差异。 值越大，遗传距离越大。 我会给推断的人口标签，但不要太在意。

这是 非非洲群体与非洲群体之间的遗传距离 在条形图上 .

一些一致的趋势：

– Mbuti和Khoisan与非非洲人的距离最大。

–下一个是比亚卡（Biaka）。 同样，这可能是由于Biaka与邻近群体之间的混合，或者是Biaka y格米人与非Khoisan / Mbuti非洲群体之间的紧密联系（参考了最后的共同祖先）。

–班图斯人与西非人的距离大致相等。

–尼罗河星团和非非洲人之间的距离略小。

– 最后，一个 非非洲人与Sandawe群体之间的差异始终较小。

一如既往，我们需要记住，这些人可能不是真正的真正祖先群体。 我毫不犹豫地假设，随着时间的推移，在莫扎比人所属于的西地中海群体与中北部非洲的一些尼罗河种群之间会有一些低水平一致的基因流动。 基因频率的这种平衡自然会降低Fst值。 第二， 相对的 最初，当我查看非洲数据时，Sandawe群集的紧密程度突然跳到我的头上。 奇怪的是，它给我留下了深刻的印象。

这是维基百科的 桑达威:

桑达威（Sandawe）是位于坦桑尼亚中部多多玛（Dodoma）地区科多（Kondoa）区的一个农业族裔。 在2000年，桑达威人口估计为40,000。

桑达威（Sandawe）语言是一种带有喀哒声的音调语言，显然与南部非洲的K族语言有关。 最近的研究表明，hoe族的祖先是牧民，并从东北（也许从现代桑达维地区）迁移到南部非洲。

但是，桑达维（Sandawe）似乎离南非丛林人样本还不算近。 以下是选定的推断祖先非洲群体的Fst关系的多维标度（对x轴的权重更高）：

PCA图的一个方面是 时刻 跳出来的是非洲群体和非非洲群体之间的鸿沟，这些鸿沟经常被最近可能混和在一起的人群所覆盖。 一种解释这一现象的假说是，自“非洲以外”事件以来，非洲与世界其他地区之间几乎没有基因交流。 可能是由于生态（撒哈拉沙漠）。 但这是另一个解释： 班图人的扩张消除了中部和东部非洲的大部分遗传变异，这种变异可能部分跨越了非洲与非非洲之间的鸿沟。 考古学和人类学表明，目前在东非大部分地区和南部直至南部的班图族和尼罗河族这两个族群都在过去3,000年的规模上具有侵略性。 因此，像哈德扎（Hadza）和桑达维（Sandawe）这样的团体被认为是较古老的文化和遗传变异的遗物。 这就是为什么一旦您控制了明确的可能掺混物（例如富拉尼）后，桑达威就比其他非洲群体更接近欧亚人的原因。 或者，可能是由于来自欧亚大陆的反向迁移，桑达威本身也经历了更长时间的混合事件。

最后，让我留下一堆MDS图，这些图可视化Fst差异。

K4，深绿色成分， 似乎与班图斯和班图人的邻居有关 所有 整个非洲。 缺乏与地理的对应关系显然暗示了人口的跨越式发展。 迁移后非班图人的存在（例如东北非洲的尼罗河人，the格米人和桑达威人）可能表明班图工具包中的任何一种生态约束（因此，移民只是迁徙而已） 围绕 或非侵入区域（后来通常被认为是将马赛人带到坦桑尼亚的事件）。 这里没有非洲之角的样本，但是我有一些23andMe文件，我可以告诉您，这似乎是 观察到的二烯, 埃塞俄比亚和索马里人民中的撒哈拉以南地区似乎完全缺乏班图人。 为什么？ 我自己的怀疑是，该地区有其自己的农业（或牧民）生活方式，这使他们在面对班图人时在人口结构上更加稳健，而班图人一旦到达严重的文化抵抗区，便会向南走。

但是还有更多。 当然，这些“祖先”群体之间存在Fst遗传距离。 您可以在一个 我上传的Excel文件。 但是，让我们看一下MDS图上的总体如何相互关联，该图可以在二维平面上可视化成对的距离。 这次我添加了标签。 关于它们对应的K，它们应该很清楚。

嘿

对于它的价值， 桑达威 被认为是坦桑尼亚的原住民，至少与他们周围的主要班图人有关。

大量单核苷酸多态性 (SNP) 数据的研究已被证明是分析人类遗传结构的有力工具。 在这项工作中，我们分析了 2841 个撒哈拉以南非洲人群的 12 个 SNP 的基因分型数据，其中包括之前未采样的非洲东南部地区（莫桑比克）。 我们表明，仅分析 1000 个 SNP 即可获得全球范围内的可靠结果。 我们的主要结果既证实了先前的研究结果，又显示了撒哈拉以南非洲遗传复杂性的新的有趣特征。 尼罗-撒哈拉人存在着强烈的分化，远远超出了地理的预期。 狩猎采集人群（科伊桑人和俾格米人）表现出明显的独特性，具有非常内在的俾格米人（不仅仅是科伊桑人）遗传特征。 西非的人口之间呈现出意想不到的相似性，这可能是人口扩张的结果。 最后，我们发现东南部班图族群与莫桑比克族群存在显着差异，这表明该地区班图语使用者对前班图族群的同化。

这项研究的主要增值是来自莫桑比克的 279 名个体，他们将这些人插入到以前的数据集（例如 HGDP、HapMap3）中。 还必须指出的是，他们将基因调查限制在约 2800 个 SNP。这对于他们的目的来说已经足够了。 以下是论文中有趣的数据。 请立即注意第一张图像中莫桑比克如何在 K = 4 处分离出来。 后续数据来自PCA。 轴代表变化的分量。 最后一个面板显示了转换到地图上的 PCA 图。 在本例中，PC 1 和 PC3.t

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第一个数字很重要 因为它表明了我们在班图扩张中不知道的人口结构。 这并不意味着它应该令人惊讶。 以非洲目前的遗传变异水平，班图文化的携带者不可能在前进的浪潮中同化其他群体，这似乎令人难以置信。 事实上，随着文化运动通过积极的反馈循环获得动力，不同的社会可能会被纳入其中，并依次传播文化。 作为一个美国的例子，我将举出爱尔兰裔美国天主教统治集团在 19 世纪反对德语教会学校教学的运动。 除了古英语之外，爱尔兰人的语言最初不是英语，但到了 19 世纪初，英语显然已经成为英语 优势 爱尔兰的罗马天主教农民。 因此，他们将英语而不是盖尔语带到了美国。 同样，伊斯兰教在印度的传播主要是在土耳其人和阿富汗人的统治下进行的，而不是在阿拉伯人的统治下，而伊斯兰教在东南亚的传播则是由南亚穆斯林商人推动的。 因此，印度尼西亚东部有阿拉伯文化形式，这要归功于距原始阿拉伯源头两次的文化扩张（事实上，可以说土耳其人和阿富汗人也通过波斯中间人实现了伊斯兰化）。

但我更感兴趣的是 PCA 图。 他们注意到 它是变化的第三个组成部分，可以很好地映射到地理距离。 他们在论文中说：

这是主要与地理相关的 PC……事实上，它是第三个组成部分，而不是第一个组成部分，如果距离隔离是塑造遗传多样性的主导力量，那么这是可以预料的……意味着定向种群移动（例如班图扩张）和基因流动的障碍（例如食品生产者和狩猎采集者之间的障碍）比地理距离更适合了解撒哈拉以南非洲的遗传景观……。

非洲曾有过民间迁徙。 他们可能根本不是我们所认识的人，至少在我们最保守的观念中是这样。 这些民间迁徙是在最近约 2,000 年前发生的。 这就是为什么语言和基因之间的独特相关性持续存在，特别是在南部非洲前进浪潮的外缘（相比之下，刚果的俾格米人已经失去了他们的母语，而西部的俾格米人与他们的邻居高度混合） ）。

引文： 基因组分析确定了撒哈拉以南非洲人口遗传结构中的一个新成分

附录： 的生活 沙卡 可能会给我们提供一些线索，因为骚乱将班图人不断向外推。