Li，Jun Z.，等。 “从人类基因组范围内的变异模式推断出世界范围内的人类关系。” 科学319.5866（2008）：1100-1104。

终于把我带到了 假定 文化传播主义。 印度的影响 文化 东南亚是不可否认的。 但这并不一定意味着印第安人作为人口从事移民。 这 乔拉入侵苏门答腊 在1025年，这被看作是一个有点奇异的事件。 尽管有关于高棉国王的印度血统的传说，但这些传说很容易被归类为某种基础神话，这对于许多文化都是正常的（例如，大卫之家或特洛伊人的血统在欧洲贵族中很常见） 。 尽管有很多关于祖先的历史参考 土生华人 中国回去 郑和 在航行中，对印第安人的提及较少，必须通过他们的达摩和伊斯兰文化影响力加以收集。 毕竟，基督教不是通过移民而是通过conversion依在欧洲传播。 同样，伊斯兰教也通过撒哈拉以南非洲以及中亚和东南亚的精英转变而传播。

我不再认为文化传播是 仅由 解释为什么印度教和印度文明扎根于柬埔寨如此深厚的根基。 相反，我认为很明显，有一些移民的最终起源是南亚。 南印度人图案的到来伴随着南印度人的到来，在某些地区，南印度人很多（或至少足以使他们对人口的巨大影响留下自己的印记）。 我们需要超越文化传播主义过强的无效假设。 移居 可以代代相传，跨越大洲。 几千年前，由于农民从近东扩张而引发的农牧业最终蔓延到南非的开普敦， 遗传信号 这些欧亚人存在于the族人民中（几乎可以肯定是由从东非赶来的尼罗河牧民介导的）。

近十年来，印度在柬埔寨遗传烙印的证据一直盯着我们。 上方是来自 纸 这将HGDP-CEPH小组带入了后基因组时代。 他们获取了650,000个SNP，并允许STRUCTURE将特定数量的K种群的祖先量子分配给每个个体。 柬埔寨人对南亚人的亲和力立即引起了我的注意。 条形图生成了淡蓝色的成分，该成分在来自巴基斯坦的南亚人中是模态的。 柬埔寨人对此的重视程度很低。 其他东南亚群体未显示出任何有关祖先成分的信号。

当乔·皮克雷尔（Joe Pickrell）与 混合树 他看到了：

两个推断的边缘出乎意料。 首先，也许最令人惊讶的推断是柬埔寨人追踪了大约16％的祖先 与欧洲人和其他东亚人同等相关的人口 （而其余84％的祖先与其他东南亚人有关）。 这与聚类分析部分相符，聚类分析表明柬埔寨人和中亚人口之间有着共同的血统。为了确认柬埔寨人是混杂的，我们转向参数化程度较低的模型。 预测的混合事件表明，柬埔寨的等位基因频率与非洲人群的等位基因频率相比，基于其东亚血统的预期更为相似。

我问乔，他是否认为这种混合物与“南印第安祖先”（ASI）有关。 他说这是合理的。 但是我当时没有跟进。

最近，一个朋友要我将他的基因型投射到东南亚和东北亚人群的PCA上。 为了踢球，我决定抛弃那些非东亚血统的人。 我本人和一些主要是欧洲人的朋友。 我所做的是 将个别基因型放在目标人群的变异之上。 如果我不这样做的话，那么我的白人朋友和我本人将以非东亚vs东亚的方式购置第一台PC。 出乎我的意料 我们所有的非东亚人都降落在柬埔寨集群的顶端 （不过，我转向了其他东南亚国家，考虑到我的遗传背景，这是合理的）。 我天真地以为，除了我之外，我们只会降落在（0,0）位置上，因为有些人会与所有这些东亚国家对称地联系在一起，但我会有所偏离。

尽管发生了什么事，但柬埔寨人的某些情况正在捕获具有西欧亚血统的个体的遗传变异。 我们现在知道，结构图中高于“ 100％”的群体实际上偏向于“南亚”群体。 “祖先北印第安人” （ANI），这是西欧亚的一个群体。 柬埔寨发出的信号似乎完全是由于印度西北部和东北部的农业入侵之前从印度河到南中国海存在的类似ASI的祖先，这似乎是令人难以置信的。

最初的假设是，这些人与欧洲殖民主义时期抵达的印度人混在一起。 但这有问题。 历史上有很多印度人到达缅甸和马来西亚。 但在东南亚东部大陆，则要少得多。 此外，观察到柬埔寨样本中的印度混合物在所有个体中的分数相对相似。 这主要说明该混合料的陈旧程度足以使其在人群中分布。

正如我上面暗示的 我有一个柬埔寨人的私人数据集，其样本量大于HGDP。 我也有菲律宾人和越南人。 我将它们与1000个基因组数据集结合在一起，得出了下面的图：

单击该图以查看发生了什么，但这非常简单。 PC1从东到西将欧亚大陆分开。 我的北印度旁遮普邦人口在右上方。 然后在最左边是挤满了日本人，韩国人和华北人的人。 底部是来自HGDP的巴布亚人。 对我而言，有趣的是，柬埔寨人是东欧亚人口中迁移至西欧亚大陆的最多人。 菲律宾人也有血统，但他们向巴布亚人转移。 如您所知，菲律宾有“内格里托人”，他们的非南斯拉夫血统与美拉尼西亚人有着相似的血统。 按照考古学的惯例，我将内格里托人称为“奥美拉尼西亚人”。

在一个 2011纸 戴维·赖希（David Reich）的小组认为，奥兰多有两大类。 一个分支由安达曼岛民和内陆马来亚的内格里托人组成，另一部分在菲律宾内格里托斯人和大洋洲附近的人民，美拉尼西亚人和澳大利亚原住民中发现。 这些结果不是共识。 但是，他们认为东南亚农业前的历史可能很复杂.

当然，我在数据上运行了TreeMix（170,000个标记，缺失很少）：

首先，要点。 我纳入了1000个孟加拉语基因组数据集，主要是作为阳性对照。 我想确保TreeMix表现正确。 好吧，我想我发现了一些新东西，可以推动我得出的结论 之前的帖子，孟加拉国的东亚血统不仅是由于古老的奥亚混血。 我没有在原始分析中添加任何中国样本，因为在我看来，它们似乎无关紧要。 好吧，如果您查看这些TreeMix结果，您会发现基因流动边缘实际上经常在东南亚人群和中国南方人群之间！ 我认为这表明掺混料具有复合性质。 这可能是一个藏缅部落，在此过程中吸收了奥亚文化元素。

第二个问题是 柬埔寨人始终有一条来自与印第安人有关的人口的基因流箭头。 我特别添加了巴布亚人，以拾取奥兰多-梅拉尼西亚信号。 考古学和mtDNA强烈表明，东南亚人的祖先中有相当一部分来自农业前的奥兰-梅拉尼西亚人。 南亚人是最早到达的人，因此，如果他们拥有最高的奥兰-美拉尼西亚血统，这是有道理的。 刻板印象是，柬埔寨人比泰国和越南邻国的皮肤深色，头发卷曲。

话虽这么说，我们如何排除这种基因流不是由于印第安人和柬埔寨人之间共享的ASI类血统的可能性？ 毕竟，基因流动的边缘来自印度和巴布亚进化枝分歧所在的根附近。 我决定增加另一个人口，我将其标记为“ ASI丰富的印度人”。 我基本上是从爱沙尼亚生物中心获取数据的，并剔除了没有东亚血统但比我的中产阶级南印度数据集拥有更多ASI的个人。 这些人口大多数位于南印度达利特人或部落。 也许这些人口更适合柬埔寨人的捐助者群体？

好吧，这没有帮助！ 现在，柬埔寨人通常只是印度基础人口，那里有很多Dai族混血。 添加富含ASI的组只会使树更加以印度为中心，因此将柬埔寨人带入了印度分支。 让我们缩小正在考虑的总体范围。

好，那更好两件事情：

1）印度样的基因流向柬埔寨人很明显。 印度人比巴布亚人要多。

2）菲律宾人现在有了类似巴布亚的基因流。 这可能是由于这两个群体之间的奥美关系。 请记住，上面的Reich论文指出他们有着共同的血统，这与为内地群体（以及遥远的印度人）的血统做出贡献的奥兰多-奥兰尼人有着独特的血统。

接下来，我决定将澳大利亚原住民和台湾原住民加入分析中。 这些是与数据集中已有人口有关的人口。

好了，模式再次出现，姐妹进化枝之间的关系正是我们所期望的。 尽管TreeMix没有告诉我们时间，但是该基因从大洋洲流入菲律宾的事实是在巴布亚人和澳大利亚人分歧的节点以下，这可能表明东南亚海洋奥兰尼人在10,000多年前就已经分歧了。 如果您遵循自然历史，那是非常合理的。

最后，我要删除印第安人，并输入一个真正的西欧亚人口： 亚美尼亚人。 我之所以选择亚美尼亚人，是因为我认为亚美尼亚人与祖先的ANI接近，这导致了印度南部（大部分印度北部）的非婆罗门人口。 我认为，印度－雅利安人是次要移民，对上等种姓和西北部地区产生了影响。 由于东南亚印度文化的文化联系是在印度南部而不是北部，因此西欧亚大陆的亲和力最终将来自该地区。 我在大多数柬埔寨样本中都没有Y或mtDNA数据，但在其中三个样本中却有Y。 其中之一是 Y染色体谱系J2。 这在西亚以及南亚的某些人群中很常见。 此外，Y haplogroup组 H 在高棉人中被发现。 这种单倍群是低种姓和印度南部人口中的模态。

这是不一致的， 但看起来流入柬埔寨人的基因具有西欧亚亲和力。 记住，我上面提到的PCA已经暗示了这一点。 ASI是安达曼岛民的近亲，与欧洲人相比，东亚人与欧洲人之间的距离不远。 与西欧亚人相比，东亚人和南欧亚人似乎形成了非常深厚的分支。 亲和力在更新世中很深，但是它们在那里（例如mtDNA单倍群M实例）。 这就是为什么那些拥有更多ASI血统的南亚人沿着PCA飞机被“推向东方”的原因。 提醒您，我认为确实有两个快速混合事件。 首先，奥古斯丁农民在三到四千年前遍布东南亚，并与奥美拉尼西亚人混为一谈。 这些是ASI和安达曼岛民的姐妹血统。 然后，在一到两千年前，您发生了由大量南印度人介导的基因流动事件。 该混合物的量级可能小于奥兰-梅拉尼西亚人的混合物。 这可能就是基因流动边缘不断被拖向巴布亚人的原因：您看到了依次发生的两个混合事件的复合边缘。

这真是很奇怪，我希望那些对东南亚历史有所了解的人不能接受新证据，并想知道它如何影响以前的解释。 那些在高棉神话中的印度军阀毕竟可能不是那么神话！

在论证基督教在晚期古代的公共场所中的垄断地位时，圣安布罗斯向异教徒参议员Symmachus著名地宣布：“传递给更好的事物没有耻辱。” 圣安布罗斯更广泛地为宗教不容忍虚假开创先例，并从头开始独家颁布一个单一的真理。 那个时期的基督徒正在清除异教上古的有机积累的机构和风俗，扫除碎屑并将其清理干净。 他们认为历史站在他们一边，他们没有向后看。 时间如何变化。 正如最有信心的新无神论者宣布人类的童年即将结束，对上帝的需求也即将结束一样，古代基督徒也相信，在他们的宗教中，先知的启示和哲学家的见识已经成熟。 是时候将幼稚的事物抛在身后了。

从某种意义上说，Thor Heyerdahl是那些“幼稚的事物”之一。 海耶达尔在我的童年时期很活跃。 尽管是个老人，他的想象力仍然很丰富。 我记得读过他的一些书，甚至那时都在笑。 令我惊讶的是，他的怪异理论并不比关于 利莫里亚。 这是一个 布拉瓦斯基夫人 为了我们的年龄！

在某种程度上，我对海耶达尔不公平。 他的某些想法真是太疯狂了，但他一直在推动投机活动 可能性。 他是一个思想家，在19世纪后期可能会更多地呆在家里，尽管毫无疑问，他的生命将受到威胁，因为他几乎可以肯定会尝试在非洲心脏地带发现“迷失的文明”。 海耶达尔被地图上的“空白处”所吸引，到了成年时，这些区域就被填满了。卫星的眼睛成为了索伦的无所不能的眼睛。 因此，他逃到了过去，摆脱了他无定形的扩散主义的猜测。 他提出了奇怪而令人难以置信的联系，导致了不同民族之间的综合。

好吧，他有一点。 我相信也许是时候倒退了。 就像圣安布罗斯基督现在正在从西方文明的公共场所退缩，成为邪教中的另一个邪教一样，第二次世界大战后对考古学和史前史的清晰单一的看法也需要进行改革。 这是一个问题： 我们是否会相信如果马达加斯加人不存在，马达加斯加人将会存在吗？ 也就是说，我们是否认为，一小批来自婆罗洲南部的南岛人可能会以某种方式成为第一个在非洲东南沿海定居大岛的人？ 太神奇了，我对此表示怀疑。 马来语-波利尼西亚人对东非的明显文化影响仅是合理的，因为存在马达加斯加人。 否则，它们会被解释掉。 另外，现在有 暗示的证据 of 前哥伦比亚波利尼西亚人与南美的接触.

在历史的边缘，在文本与我们对话的地方之间，存在着使我们惊讶的事件。 遗传学发出了明确的信号，即即使在伟大的农业文明出现之后，我们的冒险家和旅行者种族仍继续交往并找到互动的方式。我们一直在地图上寻找“空白”，并将其填充在我们的想象中。

后记： 好吧，这篇文章花了我一半的时间。 大约有一半运行分析并生成输入数据集。 和另一半写作。 我们生活在一个非常奇怪的世界里！ 特别感谢Chris Chang，他的新版本 砰砰 速度如此之快，并具有令人难以置信的功能。 它确实加快了数据探索的过程。 同样，向乔·皮克雷尔（Joe Pickrell）喊叫，他的 混合树 真正上瘾。