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比较基因组学

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引文:海洋哺乳动物基因组的趋同进化

引文: 海洋哺乳动物基因组的趋同进化


440px-鱼龙 你们大多数人都听说过 趋同进化。 在某种程度上,它通常是最清晰可见的形态特征,这些特征由我们周围宇宙的基本物理参数决定。 物理是可以很好预测的。 蝙蝠和鸟类的细微差别是不同的,但是粗略的一致性可以证明它的身体计划是显而易见的。 更引人注目的是海豚,金枪鱼和长期灭绝之间的相似之处 鱼龙。 如果您希望在我们星球的粘性水域中禁食,有几种方式可以使您理想地塑造成脊椎动物。 活的鱼雷需要模仿鱼雷的圆滑线条。 当您在孩提时代阅读的插图进化书中阅读此书时,这可能就是您想知道对此有什么有趣的地方。 出色地, “自然遗传学 有一份精巧的新的比较基因组学论文, 海洋哺乳动物基因组的趋同进化,它在基因组水平上探索了肉眼可见的宏观进化在形态上的相似性。

这是一种开放获取的论文,而且简短明了,因此我邀请读者进行检查。 这些方法很简单,他们对​​上面用红色突出显示的海洋哺乳动物谱系进行了测序,并将它们与未带入海洋的姐妹谱系以及彼此之间进行了比较。 比较基因组区域后,他们发现了五个基因,这些基因在所有平行谱系中都有选择的证据,这些谱系是从非常不同的哺乳动物进化而来的。 这些基因中的一些就其与海洋生物的功能相关而言是有意义的。 在某些情况下,基因内的取代是不同的。 由于基因很大,这在某种程度上是可以预期的,并且可能有几种方法可以给猫剥皮。 相反,在其他基因中,它是完全相同的取代,表明有很强的约束力。 都好。 但是到最后,他们添加了以下代码:

我们对海洋哺乳动物基因组的比较突出了在正选择作用下进化的基因中的平行分子变化,并推测与独立进化的,适应性表型趋同有关。 据推测,适应性进化可能偏向于可用替代的偏向子集,以最大化表型变化……而这一假设可能解释了我们在海洋哺乳动物中聚合分子进化的一些发现。 但是,我们还发现陆地姊妹类群之间存在广泛的分子趋同,这表明平行取代可能通常不会导致表型趋同。 大多数突变的多效性和通常有害的性质可能会导致置换在有限数量的位点上长期存活,从而在某些编码基因内留下了分子融合的特征。 在这项研究中鉴定出的15个阳性选择基因中的平行替代可能仅代表海洋哺乳动物适应性和趋同表型进化的分子变化的一小部分。 因此,我们的数据表明,尽管趋同表型进化可能源于趋同分子进化,但这些情况很少见,进化更加频繁地利用不同的分子途径来达到相同的表型结果。

基本上,这里的期望是明显的趋同进化将推动基因组水平上的某些相似性。 当您注意到像 霍克斯 一遍又一遍地出现在许多分类单元中。 但是作者还发现很多 基因组 陆地沿袭之间的趋同。 这让他们感到惊讶,因为在我们的肉眼中,没有任何形式的平行性等于您在海洋生物中看到的形式。 我认为也许我们需要考虑的一个方面是 情人眼中有一些趋同的演变。 这组作者似乎是在隐晦地指出基因型空间受到遗传相关矩阵的约束,由于多效性效应,无法进行替代。 但是,在血统形态之间没有显着的总体形态相似性的可能性又如何呢? 例如,社会结构和人口密度在血统之间变化,没有特别的押韵和理由(我夸大了一些,但是当您想到正常社会的痣鼠和正常社会的膜翅目动物时,您会明白这一点)。

最终,我认为这篇论文本身并没有它本身重要,而是它揭示了在不久的将来我们将对生命树的基因组形状有很好的了解,并且我们将有追索权的可能性。到整个系统发育树尖端的许多高质量基因组。 本文中使用的各种比较方法还具有在种群基因组学论文中经常见到的相当透明和不太深刻的优点。

 
• 类别: 科学 •标签: 比较基因组学 
拉齐布汗
关于拉齐卜·汗

“我拥有生物学和生物化学学位,对遗传学,历史和哲学充满热情,虾是我最喜欢的食物。如果您想了解更多信息,请访问http://www.razib.com上的链接”