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欧洲遗传学

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二烯 有一个 长帖子,其主旨如下所示:

如果我不得不猜测, 我建议大多数现存的欧洲人将被发现是西亚/祖先欧洲的两元混合体,就像大多数南亚人是简单的西亚/祖先南印度人的混合体一样。 在这两种情况下,都不再存在土著成分,并且在ADMIXTURE分析中出现的South Asian / Atlantic_Baltic成分代表了 综合 引入了西亚一词的原住民部分。 而且,像印度一样,通过混合使用不同的元素也会发现某些人“离线”:在欧洲,这些人将是古地中海人,例如“冰人”,这是现代撒丁岛人和东亚欧亚人中最大程度保留的元素。大陆东北侧受影响的人口。

从表面上看,这似乎并非完全令人难以置信。 但是似乎任何“西亚”成分在基因上都将比“祖先南印度人”更接近“祖先欧洲”,因为前两个因素可能是更广泛的西亚欧亚多元化的一部分。将这些族群与南部和东部欧亚人分开的日期较晚。 换句话说, 提取欧洲人的独特元素可能是一项更艰巨的任务,因为与“北印第安人祖先”与“南印第安人祖先”相比,混合物的成分彼此非常相似。


尽管这突出了一个更大的问题,但实际上,许多聚类方法在时间上都是敏感的。 如果有足够的时间,“混合”人口将不再是杂种,而是新的独特人口,其本身可以是“父母”。 重组打破了长期的遗传物理联系,这是基因组规模上独特的混合血统的标志。 这就是为什么聚类方法可以轻松生成纯“南亚”成分的原因。 经过至少约3-4,000年的连续混合后,合成的粗度现在大大降低了,而元素更多了 事实上的 混溶的。 但是,通过其他聚类技术(例如主成分分析),您可以获得不同的结果。 欧洲人和东亚人之间的“南亚人”在其种姓和地区出身中所占的特殊地位,高度表明了某种混合事件的发生,其比例随地理和社会背景的变化而变化。 这 技术 in 重建印度人口史 通过筛选变化并提取祖先成分,可以解决这个悖论。 这 最近的论文 在澳大利亚原住民遗传学上得出的结论与之类似,在某种程度上使发现的结果令人费解 从中生成推论时 骨料 基因组变异。

想象一下,如果祖先的组成部分距离更近,那么这项任务将要困难得多! 我怀疑这就是欧洲正在发生的事情。 我不知道任何重大秘密,但是我听说有一些研究小组在窃窃私语,他们使用撒丁岛作为“纯粹的”外部群体,以模拟自农业到来以来欧洲不断变化的人口统计数据。 鉴于这种可能性,戴维·赖希(David Reich)在会议上所说的话并不令我感到特别惊讶。 在许多分析中,撒丁岛经常以怪异的异常出现。 一个简单的可能性是,这只是一个事实,即它是一个岛屿,因此由于与传统的村对村互助隔离,因此与大陆人口背道而驰。 Dienekes提出的另一种可能性是,它可能是欧洲早期遗传变异的资料库,相对不受人口变化引起的后来扰动的影响。 我可以归功于Dienekes的论文的主要原因与撒丁岛的关系比巴斯克人的关系少。 在人均生产总值方面,法国巴斯克人不如撒丁岛人少,但在某些情况下,他们确实缺少最明显归类为“西亚人”的部分,而其他法国人也有。 在Dienekes自己对各种各样的伊比利亚人口的考察中,也出现了同样的区别。

所有这些都提醒我们 聚类方法使我们能够深入了解总体之间的相互关系,但是它们并没有告诉我们这种相互关系如何形成的细节。 如果某个因素是相对较近的(<10,000年)杂交事件的结果,而不是具有更深的根源,那么它将产生很大的不同。 例如,波利尼西亚人和美拉尼西亚人之间的混合将两个组成部分放在一起,而不论它们先前的起源如何,在现在之前大约有50,000年的分歧。 但是如果 两组 前面提到的观点是正确的,因为美拉尼西亚分量本身必须分解成两个部分,其中之一比波利尼西亚人更接近另一部分,这是我们对过去变化的理解。

就像我 今天早些时候暗示 我认为过去一万年来在欧洲定居地区产生野性假设的时代即将结束。 更强大的分析技术与古老的DNA样本的结合使用,可以用来校准,固定和检查这些技术的推论,这可能会在很大程度上澄清我们对过去的理解。

图片来源: 读米955

 

研究博客网站 严重的是,有时历史与小说的匹配比我们期望或希望的要多得多。 在2000年代初,牛津遗传学家布莱恩·赛克斯(Bryan Sykes)观察到,男性介导的非重组Y染色体(NRY)的空间分布与女性介导的线粒体DNA(mtDNA)的空间分布之间存在差异。 为了解释这一点,他向新闻界提供了一种耸人听闻的叙事方式,讲述了男性种族灭绝对在冲突中丧生的宗族可能重复发生的情况。

这是圣经中数字书的一部分:

15 –摩西对他们说:你们救了所有妇女还活着吗?

16 –看哪,这些事使以色列人通过巴兰的旨意,在皮尔的事上对耶和华发了罪,耶和华的会众中有灾祸。

17 - 因此,现在杀死小男孩中的每个男性,并与他说谎的男人杀死所有认识男人的女人。

18 - 但是,所有的女性孩子,虽然还不认识一个男人,却一直活着。

那就是了 萨宾妇女的强奸。 新世界的混血儿和混血儿的民族起源主要是非欧洲女性和欧洲男性之间的结合。 这些都是艰难的残酷神话和艰难的事实。 但是,它们是否反映了塑造我们物种过去的动力学的重要方面?

我还不太愿意为这种可能性增加信心,但这似乎至少是图片的一部分。 您会发现男性和女性血统之间存在重大脱节 南亚人 例如。 中的新论文 PNAS 尽管只是逐步地增加了权重,但这种可能性增加了。 古代DNA揭示了男性通过新石器时代的地中海路线的扩散:

新石器时代是欧洲殖民史上的关键时期。 尽管考古学和当今的遗传数据提出了关于这一时期人类迁徙模式的几种假设,但是利用古代遗传数据对这些假设的验证受到了限制。 在这种情况下,我们研究了从53年前法国当地社区使用的埋在墓地中的5,000个人提取的DNA。 样品相对良好的DNA保存使我们能够获得所研究的29个样品中53个的常染色体,Y染色体和/或mtDNA数据。 从这些数据集中,我们在墓地中建立了亲密的父母关系,并确定了母系和父系,以及缺乏与乳糖酶持久性相关的等位基因,这可能是中欧新石器时代的文化所携带的。 我们的研究提供了新石器时代晚期法国南部的遗传过去的综合观点。 此外,Y-单倍体谱系的特征以及对它们当前在欧洲人群中的重新分配的研究证实,在新石器时代过渡时期,地中海比中欧路线对南欧人种的影响更大。

首先,简单的东西。 这是另一个数据,应该使我们怀疑新石器时代化是一个压倒性的土著进程,它是通过文化模仿传播的。 在这里测序的Y染色体谱系非常均质,似乎属于父系血统。 相比之下,告诉我们有关女性血统的mtDNA谱系则要多样化得多。 它们涵盖了当代欧洲遗传多样性的更好范围。 作者指出,少数mtDNA谱系 ,那恭喜你, 属于中东血统,但大多数血统被认为具有较旧的旧石器时代的根源,并受其较大差异的支持。 我认为即使是这样的解释,我们也应该保持谨慎,但在这方面似乎确实存在显着差异 一个社区 在男性和女性之间可能表示特定的社会和文化体系。

左侧的地图显示了mtDNA和Y谱系与欧洲遗传变异的现代模式的关系。 阴影越深,共有的谱系比例就越高。 上图显示了女性mtDNA,您可以看到法国西南部古代样本与现代群体之间的广泛对应。 但是请注意第二个图中的大差异,它显示了男性分布。 这更多地局限于伊比利亚和土耳其的特定地区。 墓地中绝大多数的单倍群是 G2a-P15,这在当今的欧洲以及该地区非常罕见。 这些人怎么了? 遗传漂移或种群替代。 如果假设一个长期的男性有效种群较小的模型,那么Y染色体谱系将比mtDNA遭受更多的随机灭绝和固定事件。 我不确定我是否会相信这一点,但这是一个不一定涉及常规替换男性血统的模型 柯南

但是,G2a-P15在地中海低频率的散布也与在历史弧线上反复替换雄性谱系的可能性相一致。 这有历史的先例,沿着地中海边缘的希腊殖民地是由人建立的,有时被明确地从他们的家中流放 城邦。 他们常常不得不“获取”当地妇女以使自己永存。 这不是假设或推测,而是在一些记录了殖民地在古代前古典时期如何建立的文本中进行了概述。 当然,我们确实知道,这类移植也可能涉及妇女,在伊特鲁里亚人看来似乎也是如此。

另外,这也可能是男性“跳蛙”迁移模式的一种情况,这种迁移模式打破了通过按距离隔离建模的遗传变异的无效模型。 该论点是,地中海东部的农业扩张不是通过土地的大规模扩散而发生的,而是通过海上移植的过程,随后又从新生的核中扩展而实现的。 同样,我们可以看看海上希腊人的扩张。 在希腊南部和意大利南部和西西里岛的“ Magna Graecia”之间,没有希腊居住区的毗连区域。 连接是通过海路进行的,因为远距离海上运输在能源方面比陆上迁移便宜得多。 我看不出为什么这些古老的农业流浪汉几个世纪以来无法通过仪式或通过海上定期接触而保持某种文化上的连续性。

本文的第二点是,该人群似乎总体上缺乏等位基因,该等位基因可诊断当今欧洲大部分地区的乳糖酶持久性。 作者观察到,在现代法国人口中,等位基因的发生频率约为43%(占主导地位,这意味着约35%的法国人患有乳糖不耐症)。 我会对法国南部的频率感到好奇,因为传统上法国北部是黄油的领土,而法国南部则更多的是橄榄油(历史上法国南部见证了加洛罗马贵族制的保存,它在5世纪明确采用了法兰克式的着装方式,以吸收到梅洛芬基君主制的非文书行政机构中,但保持了其文化差异)。 作者从缺乏LP等位基因得出的结论是,埋葬在公墓中的个体来自不同于建立墓地的个体。 LBK 中欧的社会,可能有 发明了乳制品文化.

我认为正在形成的“大局”是,史前的欧洲发生了多次入侵,爆发,置换和同化的情况,就像世界上许多地区的情况一样。 总的来说,我怀疑男性在这一过程中所起的作用要比女性大,尽管我不确定我们是否会在给定地区看到一贯的女性血统模式作为旧石器时代人口的标志。 可能发生了太多的转变和分层,以致最早的人,即最古老的人,只能通过古老的DNA来访问。 说到这些,谢天谢地,我们终于进入了古代DNA的黄金时代! 毫无疑问,许多问题将最终得到解决。

迪内克斯·庞蒂科斯(Dienekes Pontikos) 也有很多话要说。 我敢肯定,有些精通mtDNA和NRY单倍型的人也会给您2美分!

引文: 玛丽·拉坎(Marie Lacan),克里斯汀·凯瑟(Christine Keyser),弗朗索瓦·萨维尔·里卡特(François-XavierRicaut),尼古拉斯·布鲁卡托(Nicolas Brucato),弗朗西斯·杜兰顿(Francis Duranthon),让·吉兰恩(Jean Guilaine),埃里克·克鲁贝齐(EricCrubézy)和贝特朗·卢德斯(Bertrand Ludes)(2011年)。 古代DNA通过新石器时代的地中海路线PNAS揭示了雄性扩散: 10.1073 / pnas.1100723108

 
拉齐布汗
关于拉齐卜·汗

“我拥有生物学和生物化学学位,对遗传学,历史和哲学充满热情,虾是我最喜欢的食物。如果您想了解更多信息,请访问http://www.razib.com上的链接”