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星号1

战前 几年前 蒙古人的遗传遗产 已出版。 本文说明了历史人口统计事件可能产生的令人惊讶的遗传效应。 作者发现,一个特定的Y染色体谱系在欧亚大陆中部极为普遍,并且该谱系在过去1,000年中呈现爆炸性增长。 特别是结合喀尔喀蒙古人的高频率,自然得出的推论是,这种血统反映了成吉思汗派生的一群战士精英的生殖成功。

一些人对此关系持怀疑态度。 部分原因是由于一些学者对人们从遗传学中学到的东西一无所知或持怀疑态度。 在与文化人类学家约翰·霍根(John Horgan)的讨论中 布莱恩·弗格森(R. Brian Ferguson) 排除了诸如成吉思汗模态单倍型之类的可能性。 这是有道理的。 这是乔治·奥威尔(George Orwell)的话 1984:

一切皆有可能。 所谓的自然法则是胡说八道。 引力定律是胡说八道。 奥布莱恩说:“如果我愿意的话,我可以像肥皂泡一样漂浮在地板上。” 温斯顿解决了这个问题。 “如果他认为他漂浮在地板上,并且如果我同时认为我看到他这样做,那么事情就发生了。” 突然间,就像一团淹没的残骸打破了水面一样,这个念头突然涌入他的脑海:“这真的没有发生。 我们可以想象。 这是幻觉。 他立刻把想法推到了脑海。 谬论是显而易见的。 它假定在​​自己之外的某个地方或其他地方,存在着一个“真实”世界,其中发生了“真实”事物。 但是怎么会有这样的世界呢? 通过自己的思想,我们对什么都有什么知识? 所有的事情都在脑海中。 不管发生在所有人心中的是什么,都是真实的。

甚至那些拒绝美国在该领域普遍存在的“后现代”倾向的文化人类学家也常常生活在某个远离企业的地方, 数据决定了关于世界的一系列合理模型。 如果科幻小说是基于当下优先事项的未来愿景,那么文化人类学就是当下的民族志,而过去的历史则是根据当下的意识形态价值而定。

In 1984 现在的命令决定了过去。 阅读劳伦斯·基利(Lawrence Keeley)的著作之所以有用的原因之一 文明前的战争:和平野蛮人的神话 就是它记录了许多文化人类学家所陈述的立场,以及这些年来根据新的证据如何演变, 没有任何承认他们过去的职位显然是错误的。 在渐进式的科学概念中,随着时间的流逝,对于领域逐渐收敛于现实而言,错误是必不可少的。 但是必须承认一个人犯了错误,并且正在改变自己的观点以符合事实。 文化人类学家经常摆出一个姿势:“我们一直都知道/相信这一点。” 许多文化人类学家毫不掩饰地认为,了解外面的世界是可能的,甚至是有功的。

结论 蒙古人的遗传遗产 根据去年发表的一篇论文,这似乎更合理, Y染色体多样性的最新瓶颈与文化的全球变化相吻合。 在论文中,作者表明,一个巨大的瓶颈以及随后出现的非常常见的Y染色体谱系(如R1b和R1a)的爆炸似乎发生在5,000年前。 星形系统发育不仅仅是成吉思汗的遗产。

这种情况是怎么发生的? 阅读安德鲁·库里(Andrew Currey)的 在桥屠杀 in 科学。 令人着迷。 以下是一些有趣的段落:

DAI的汉森(Hansen)说,在1990年代之前,“很长一段时间以来,我们都不真正相信史前战争。” 这些重物被解释为是威信或权力的象征,而不是实际的武器。 “大多数人认为古代社会是和平的,青铜时代的男性关注贸易等问题,”丹麦奥尔胡斯大学的考古学家赫勒·范德基尔德说。 “很少有人谈论战争。”

...

牙齿的DNA表明,有些战士与现代南欧人有关,而另一些与生活在现代波兰和斯堪的纳维亚半岛的人有关

准确:3,200年前,成千上万的人在波罗的海附近的德国东北部狭窄山谷中的一座桥上发生了冲突。 这些人中有数百人死亡。 他们的骨骼产生了这样的事实,即他们只有20多岁,经常在激烈的战斗中被残酷地杀死,而且同位素分析表明,它们中的大多数都来自数百公里之外。 脱氧核糖核酸和对骨骼进行推断以推断饮食的分析均表明,其中一些与现代南欧人相似,就其出身而言可能与南欧人相似,尽管我不否认有很多与后裔相似的人坚持到那个时期的欧洲欧洲农民(EEF)的一部分。

这告诉我们什么? 在 古代思想的形态,其中大多数是几十年前写的,人们对思想从文明(如美索不达米亚)向非文明(如古希腊人和吠陀雅利安人)的传播性质进行了推定。 但是这些结果是什么,以及诸如 文明前的战争,提醒我们 写作和读写能力只是复杂的人类组织的各个方面之一。 复杂的社会似乎对于识字是必要的,但是对于社会的复杂性(例如,印加语领域)而言,识字不是必需的。 基利(Keeley)提供的暗示性证据表明,在桥梁被屠杀之前的数千年,首批到达中欧的农民与沿海沿海沿岸的海洋觅食者之间发生了大规模冲突。 我怀疑这不是新事物的开始,而是在托勒斯(Tollense)发生的是基督教在基督教时期一直存在的,传统的冲突和竞争传统的后期。

 
• 类别: 创办缘起, 科学 •标签: 欧洲, 基因 

200px-拉斯科2中的新文章 Horizon, 在灭绝的边缘,冰河时代的欧洲人以不到30条的小条带漫游 (通过 欧洲基因),基本上在标题中就放弃了游戏。 但是请记住我的 之前的帖子,因为较低的有效人口数量可能无法长时间准确地传达实际的人口普查规模。 这些结果并不特别令人惊讶,因为与现代种群相比,我们从猎人和采集者那里获得的古代基因组往往表明近交水平很高。 这里的主要区别是,似乎他们从不同的地方采样了越来越多的古代基因组,以增加对原始推测的信心:

Pinhasi教授的团队发现,在14至000年前,来自匈牙利和瑞士的狩猎采集者的基因组序列 非常接近 在同一时期从丹麦或瑞典采集标本。

这些发现表明,冰河时期之后,西欧和中欧大部分地区的居民之间的遗传多样性非常有限,这表明在冰河时期,人类的孤立和灭绝引发了主要的人口瓶颈。

“非常接近”一词含糊不清。 我确定他会考虑一些量化指标(例如,按血统来识别身份)。 在尼安德特人中看到相同的动态可能并非巧合。 令人惊讶的是,来自欧洲的那些与来自阿尔泰的那些相似。 为什么是同质的? 可能在人类居住的广阔北方广阔地区 人口迁移 以幸存者血统的灭绝和重新安置为特征的动力学非常普遍。 狼有间接证据表明狼也有同样情况。 为什么? 这可能只是生物地理学上的一种趋势 古生代 种在更新世。 冰河时代艰难,冰川反复无常,变暖可能是短暂的(请参阅 年轻的树妖).

当然,我将在标题中使用欧洲引号。 欧洲人像现代波多黎各人一样, 三杂种。 它们只是在大约5,000年左右的时间里以目前的形式出现的。 那么,南欧杂合性增加的南北梯度可能不是更新世避难所的扩展所产生的一系列创始人效应的函数,而是北欧人中较高的猎人-采集祖先比例,这些人表现出的遗传多样性降低了瓶颈。

 
• 类别: 科学 •标签: 欧洲, 基因 

星球钱 最近,有一篇关于意大利南部维持高经济生产率困难的报告。 我不会重新讲故事的细节,但是, 我认为重要的是要视觉上看意大利南部和北部之间的对比度有多大。 我们经常谈论民族国家。 民族国家是真实的,而且很重要,但它们往往不可比。 就像将美国与瑞典进行比较仅能提供些许信息一样,因此将爱尔兰这样的小国与意大利这样的大国进行比较也具有欺骗性。 这是一张2008年地区性GDP分布图,其中包括次国家级细分。 尽管现在某些价值肯定较低(基本上是德国和瑞典以外的所有地区),但这种关系仍然存在。

西班牙和英格兰的北部和南部之间以及德国的西部和东部之间都存在差距,但是这些差距都没有您在意大利看到的那么大(其中一个,意大利南部人口众多比德国东部)。 西西里岛和南部省份是西欧最贫穷的地区。 相反,米兰和博洛尼亚之间的北部地区是最富裕的地区。

这是失业率的地图:

 

 

 
• 类别: 经济学, 科学 •标签: 文化塑造, 欧洲, 地理 

今年年初,我收到了一封来自 彼得·拉尔夫博士,询问我是否可以从POPRES数据集的分析中讨论一些有趣的统计遗传结果,这些结果可能具有历史意义。 我一直在激动地等待预印本被公开,以便它可以引发更广泛的讨论。 我相信,本文概述的方法可能会向我们显示出一条通往不久的将来的道路,在此道路上,我们可以对最近的过去有更敏锐的见解。 终于出来了 您可以完整阅读它。 拉尔夫(Ralph)和格雷厄姆·库普(Graham Coop)博士将其张贴在 arXiv, 欧洲近代遗传起源的地理。 本文使用了来自POPRES数据集的约500,000个SNP,并研究了 血统身份 作为地理的功能。 通过世代相传的身份,我们正在谈论的是源自共同祖先的基因组片段。 由于重组,这些片段的长度可以使我们了解最后一个共同祖先的日期。 长段表示最近的血统,因为较少的重组事件减少了序列。

这是本文的主要内容:…共有遗传祖先的数量存在很大的区域差异: 特别是许多东部人口之间的大量祖先,很可能追溯到斯拉夫和/或匈奴人的扩张, 而在意大利和伊比利亚半岛,共同祖先的水平要低得多,这可能表明日耳曼人向这些地区和/或更稳定的人口扩张所产生的人口影响较弱。 现代欧洲人的近代血统无处不在,并且清楚地表明了小规模移民和重大历史事件的影响……。


当我第一次看到上面的面板时,它们说明了人群之间IBD共享的比例,其中以星标人群为重点人群,我立刻想到了中世纪早期的斯拉夫式扩张。 遗传数据中已有证据。 二烯 他指出,现代希腊人似乎具有“北方”血统的重要组成部分,在土耳其人中被削弱,而在希族塞人中几乎不存在。 这些结果表明,在过去的1,500年中,东欧各国人民有许多共同的祖先,而不论其地理距离如何(请注意,很难观察到圆圈大小的衰减,这在其他国家中更为明显。面板)。

另一个令我惊讶的模式是 意大利人口的深层结构。 这些结果表明,与意大利的关联度比其他欧洲民族国家的关联度要深得多。 我在这里引用作者: 这表明,意大利内部显着的下部结构和庞大的人口规模,足够强大,足以使意大利内部的不同群体与其他明显的,现代的国家相比,在迁移期间未得到同质化的下部结构,与其他不同的现代国家所拥有的近代血统相去甚远。 这些模式也可能在一定程度上反映了来自各种来源的意大利定居的历史,包括:意大利南部的希腊人定居,意大利东部的伊利里亚人定居以及整个罗马帝国的人口涌入,包括来自非洲的基因流……但不太可能完全是由于这些影响。 西班牙似乎在欧洲其他地区表现出与意大利相同的区别,但是其IBD模式更为正常,与共同祖先的时间深度较浅。

一个人可以做出许多其他可能的推论。 例如,与德国和爱尔兰有联系的英国血统的个体中的IBD谱系之间的负相关是否是可追溯至黑暗时代的凯尔特人和日耳曼血统的差异的函数,或者仅仅是由于英国已经是19世纪爱尔兰血统的最近一波热潮,还是仅仅是地理连续性和距离隔离的自然结果? 最后是一个将来需要解决的问题。 作者认为,由于IBD方法的强大功能,人们可以在没有更精细的地理粒度的情况下进行推断,但是对于统计遗传学而言足够的不足对历史人口统计推断而言是足够的。 POPRES数据集是在伦敦和洛桑收集的,可以从中提取多少地理信息是有限制的。 我认为在不久的将来,这种推断IBD道的方法将得到广泛应用,因此这里只是为了激发食欲。

本文取得了丰硕的成果。 您可以创建许多故事。 但是要创建可信的故事,您需要“丰富”和“深刻”的知识。 因此,我邀请读者仔细研究结果,看看结果如何。 这对您来说没有任何成本,而且我认为追求这种材料所花费的时间不会浪费时间。

 
• 类别: 创办缘起, 科学 •标签: 人口统计, 欧洲 

一份新的论文 科学 刚刚出版,其概述已在会议介绍中进行了描述。 当检查猎人-采集者的三个个体的常染色体遗传变异时 去斑文化 (PWC),也是一位农业专家 漏斗烧杯文化 (TRB), 作者发现,两组之间有明显的区别。 如果我正确阅读方法,SNP的数量大约为10,000。 对于研究欧洲人口差异内的当代人(大约100,000或更多似乎是安全的),这尤其困难,特别是使用基于假设的聚类算法(对于PCA而言似乎更易于管理)。 但是研究结果足够强大,我认为我们不应该轻视它们。 结果最令人着迷的是,尽管普华永道似乎表现出与北欧和东北欧的相似性,但TRB个人似乎更像现存的南欧!

其它 已可以选用 已经评论 广泛地关注结果。 考虑到样本量小,比较的局限性和相对较薄的标记集, 我认为我们可以从这些发现中获得的主要结果是,纯文化和人口统计学的旧模型 扩散 是假的。 我的意思是说,先前的辩论以“古石与新石器时代”对现代欧洲人的贡献的早期结果为高潮,从根本上以人口扩散动态为前提,在这种扩散中,基因和思想在整个社会中不断涌现。无特色的景观。 相反,我们在这里看到的基本轮廓是人类的过去表现出时空的不连续性。 为什么这会让我们感到惊讶? 欧亚大陆的西班牙语和汉语之间没有方言连续体。 而是,广泛的语言族在接触区域之间彼此明显地区别开来。 尽管有理论上的理由说明基因的变异应该更加渐进,但现实仍然是文化参数将塑造遗传变异的轮廓,而这些参数是不连续的。

有两个框架问题使本文的结果易于理解。 首先是一般性的。 农业可能不会仅仅通过小规模农民的“自下而上”扩张到一个空旷的边境而在欧洲蔓延。。 相反,这些人口几乎肯定是在某个超家族政治级别上组织的,并利用其组织资源在扩展前规划出适当的定居区。 早期的结果是一种“跨越式”的点对点迁移模式,重点是内陆河谷和土地要素投入丰富且居住环境发达的沿海地区。 这种交错的定居模式很容易解释同居种群之间的明显遗传差异,随着最后的狩猎者和采集者的适应,它们才随着时间的推移而混杂在一起。 第二个问题特定于斯堪的纳维亚半岛: 看来,由于其生态条件,农业晚到了欧洲这一地区,并且依靠海洋生物的狩猎和采集人口在人口统计学上特别强大。 在斯堪的纳维亚半岛,农业在生态边界上的不连续扩张和停滞无疑是近一千年的历史,因为随着农业发展的停止,狩猎者和采集者仍在继续。

图1很好地总结了本文中的大多数信息,为说明主要发现,我对其进行了相当多的编辑。 请注意 相对的 LBK和PWC个人的亲和力。 PCA中的LBK个人位于西南欧的巴斯克人和撒丁岛人附近,而PWC个人不在HGDP北欧人的分布范围内。 在另一个PCA中,它们似乎聚集在东波罗的海人口中,例如拉脱维亚人。 这与早期的mtDNA工作是一致的。

还要注意ADMIXTURE中的模式:再次,它与LBK的撒丁岛和巴斯克样本紧密对应。 特别令人感兴趣的是在所有约4年历史的样本中相对缺乏黄色成分(K = 5,000)。 比例上的差异也是法国人与法国巴斯克人的区别,托斯卡纳人与撒丁岛人的区别(K = 2,后者是蓝色分量)。 我已经截断了芬兰人的样本,但不幸的是,我怀疑我们在这里看到的东西与卡拉什(Kalash)类似,卡拉什(Kalash)是一个非常同质且相对自交的种群,其自身构成了一部分。 因此,我不相信紫色的K = 1特别有用。 东北欧最有可能的芬兰人民族发展的模型似乎涉及外来的西伯利亚元素。 通过阅读补充资料,我在PWC中看不到这种亲和力。 这样一来,芬兰人的扩张就可能成为西方欧亚大陆的一个两极分化的种族群体。

正如Dienekes所指出的,无论如何,我怀疑本文概述的模型所缺少的是在北部土著人和南部LBK最初接触之后欧洲随后的人口迁移。 这可能就是为什么某些PCA分析中的PWC个人似乎被置于当代分布之外的原因,就像 冰人奥兹.

使用双向混合模型,作者构建了一个框架,在该框架下,西北欧洲人约占农场主的50%,而狩猎和采集者占50%。 即50%的LBK和50%的PWC。 但是正如Maju所警告的那样,我们需要谨慎地用这些古老的人口来代替 所有 古代人口。 此外,双向混合模型估计撒丁岛的农民占95%,而瑞典人的农民占40%,农民被理解为LBK的后裔。 正如我之前所说,我认为这里的问题以及Dienekes也建议过, 是几乎可以肯定的是,欧洲内部有许多农业学家的浪潮。 撒丁岛人似乎是早期农民人口膨胀的相对纯朴的后裔,欧洲大部分地区对此进行了补充。 我对他们的新石器时代农民祖传有以下估计:

图片来源: 奥斯卡·卡林(Oskar Karlin)

 
• 类别: 科学 •标签: 农产品, 人类学, 欧洲 

上图来自 约翰·霍克斯 博客。 自从 末次盛冰期。 很明显,北欧直到北欧才开始有人居住, after 冰河时代。 那些可居住的地区往往处于边缘。 但是,欧洲南部仍有一些地区 相对 克莱门特。 欧洲变暖后如何定居的一种模式是,狩猎采集者从这些南部避难所向北扩展。 这可以解释北部人群较低的杂合性(见左图)。 他们可能由于人口瓶颈而在某种程度上丧失了遗传多样性,或者只是随人口增长而漂移。 但是,在此地图上突然出现了一些变化:葡萄牙的西南部分据说是欧洲大陆上非洲混合气含量最高的区域(出于历史原因)。 杂合性可能只是由于以下事实而引起的:由于地理上的邻近性,南欧与世界其他地区的联系越来越紧密。

还有第二种模式总是引起我的好奇心:为什么 遗传变异的最大组成部分 在欧洲,北与南之间是相对的,与东与西之间是相对的? 这似乎与南部避难所的扩张模式相吻合。 面对苔原和冰原的冰河时代欧洲人的东西方遗传变异,是否应该在他们同时向北扩展范围的同时,在现代人群中得到代表? 模型出了点问题。

首先,很明显,自上次冰河世纪以来,发生了很多变化。 直到最近的风吹草动 作者声称 在大约 20,000 年前,我们在我们周围看到的遗传变异的一般形状已经确定。 我愿意打赌 \$5,000 美元那是错误的。 在欧洲的特定情况下,我们看到的一组模式可能有很多解释。 可能是避难所的原始人口后来被替换了。 北欧人可能是这些群体的合法后裔,但由于来自安纳托利亚的新石器时代人口的淹没,南欧的原始遗传变异模式被冲刷掉了。 或者,可能是欧洲北部的现代人来自一个横向移动的群体,取代并同化了该大陆的原始居民。

有许多可能的模型,以及模型的组合。 从我读过的人中 帝国实验室 现在正试图为欧洲人的民族形成构建一个类似于欧洲人的民族形成的场景。 南亚人。 换句话说,现代欧洲人是人口众多的旧石器时代狩猎采集者的后代。 同一个实验室似乎对印欧语系持肯定态度 做了 对南亚人的遗传学有重大影响。 如果是这样,那么我认为没有理由在欧洲不会如此。

无论如何,有趣的时刻。 我们将尽快足够详细地了解更多细节(我也愿意在这上面下注!)。

 
• 类别: 科学 •标签: 人类学, 欧洲, 旧石器时代的欧洲人 

二烯 有一个 长帖子,其主旨如下所示:

如果我不得不猜测, 我建议大多数现存的欧洲人将被发现是西亚/祖先欧洲的两元混合体,就像大多数南亚人是简单的西亚/祖先南印度人的混合体一样。 在这两种情况下,都不再存在土著成分,并且在ADMIXTURE分析中出现的South Asian / Atlantic_Baltic成分代表了 综合 引入了西亚一词的原住民部分。 而且,像印度一样,通过混合使用不同的元素也会发现某些人“离线”:在欧洲,这些人将是古地中海人,例如“冰人”,这是现代撒丁岛人和东亚欧亚人中最大程度保留的元素。大陆东北侧受影响的人口。

从表面上看,这似乎并非完全令人难以置信。 但是似乎任何“西亚”成分在基因上都将比“祖先南印度人”更接近“祖先欧洲”,因为前两个因素可能是更广泛的西亚欧亚多元化的一部分。将这些族群与南部和东部欧亚人分开的日期较晚。 换句话说, 提取欧洲人的独特元素可能是一项更艰巨的任务,因为与“北印第安人祖先”与“南印第安人祖先”相比,混合物的成分彼此非常相似。


尽管这突出了一个更大的问题,但实际上,许多聚类方法在时间上都是敏感的。 如果有足够的时间,“混合”人口将不再是杂种,而是新的独特人口,其本身可以是“父母”。 重组打破了长期的遗传物理联系,这是基因组规模上独特的混合血统的标志。 这就是为什么聚类方法可以轻松生成纯“南亚”成分的原因。 经过至少约3-4,000年的连续混合后,合成的粗度现在大大降低了,而元素更多了 事实上的 混溶的。 但是,通过其他聚类技术(例如主成分分析),您可以获得不同的结果。 欧洲人和东亚人之间的“南亚人”在其种姓和地区出身中所占的特殊地位,高度表明了某种混合事件的发生,其比例随地理和社会背景的变化而变化。 这 技术 in 重建印度人口史 通过筛选变化并提取祖先成分,可以解决这个悖论。 这 最近的论文 在澳大利亚原住民遗传学上得出的结论与之类似,在某种程度上使发现的结果令人费解 从中生成推论时 骨料 基因组变异。

想象一下,如果祖先的组成部分距离更近,那么这项任务将要困难得多! 我怀疑这就是欧洲正在发生的事情。 我不知道任何重大秘密,但是我听说有一些研究小组在窃窃私语,他们使用撒丁岛作为“纯粹的”外部群体,以模拟自农业到来以来欧洲不断变化的人口统计数据。 鉴于这种可能性,戴维·赖希(David Reich)在会议上所说的话并不令我感到特别惊讶。 在许多分析中,撒丁岛经常以怪异的异常出现。 一个简单的可能性是,这只是一个事实,即它是一个岛屿,因此由于与传统的村对村互助隔离,因此与大陆人口背道而驰。 Dienekes提出的另一种可能性是,它可能是欧洲早期遗传变异的资料库,相对不受人口变化引起的后来扰动的影响。 我可以归功于Dienekes的论文的主要原因与撒丁岛的关系比巴斯克人的关系少。 在人均生产总值方面,法国巴斯克人不如撒丁岛人少,但在某些情况下,他们确实缺少最明显归类为“西亚人”的部分,而其他法国人也有。 在Dienekes自己对各种各样的伊比利亚人口的考察中,也出现了同样的区别。

所有这些都提醒我们 聚类方法使我们能够深入了解总体之间的相互关系,但是它们并没有告诉我们这种相互关系如何形成的细节。 如果某个因素是相对较近的(<10,000年)杂交事件的结果,而不是具有更深的根源,那么它将产生很大的不同。 例如,波利尼西亚人和美拉尼西亚人之间的混合将两个组成部分放在一起,而不论它们先前的起源如何,在现在之前大约有50,000年的分歧。 但是如果 两组 前面提到的观点是正确的,因为美拉尼西亚分量本身必须分解成两个部分,其中之一比波利尼西亚人更接近另一部分,这是我们对过去变化的理解。

就像我 今天早些时候暗示 我认为过去一万年来在欧洲定居地区产生野性假设的时代即将结束。 更强大的分析技术与古老的DNA样本的结合使用,可以用来校准,固定和检查这些技术的推论,这可能会在很大程度上澄清我们对过去的理解。

图片来源: 读米955

 

我决定 拿多德卡 ADMIXTURE在K = 10时得出的结果,并重做一些条形图,以及一些与人口有关的不同祖先成分的散点图。 不要试图挑选出细粒度的细节,而要看看 完形 时尚。 我删除了大多数非欧洲人口,将注意力集中在西欧人身上,并提供了一些小组供参考。

这是相关性的表格(我以粗体显示了我认为很有趣的相关性):

W亚洲 西北非洲 S欧洲 NE亚洲 亚洲西南 E亚洲 N欧洲 W非洲 非洲人 亚洲人
W亚洲 * -0.01 -0.18 0.04 0.81 0.59 -0.64 0.39 0.2 0.04
西北非洲 * * 0.19 -0.16 0.23 -0.09 -0.19 0.26 0.67 -0.11
S欧洲 * * * -0.38 -0.03 -0.27 -0.42 -0.11 -0.02 -0.36
NE亚洲 * * * * -0.06 0.5 0.26 -0.04 -0.1 -0.07
亚洲西南 * * * * * 0.21 -0.62 0.74 0.59 -0.13
E亚洲 * * * * * * -0.27 0.08 0 0.14
N欧洲 * * * * * * * -0.34 -0.28 -0.31
W非洲 * * * * * * * * 0.86 -0.04
非洲人 * * * * * * * * * -0.07
多德诺斯Dodsouth陶德斯瓦人韦斯特韦斯特西北偏西散布西南散射西南偏西

 

444px-Ole_Henrik_Magga_特写
挪威政客Ole Magga

研究博客网站 在此博客上,我经常收到有关萨米语(Lapp *)的问题。 那是因为我经常谈论 芬兰遗传学,拥有诸如 克拉克 他们是部分萨米人的起源,而萨米人的出身和性格则引发了关于萨米人的出现的更广泛的问题 欧洲现代基因库。 更确切地说,关于萨米人的问题与欧洲芬兰人的广泛性及其与其他波罗的海和北部人口的关系有关。 这些人是欧洲的“原住民”,还是相对较新的人(史前的马盖尔人或土耳其人)? 这些问题是由他们的语言的特殊性(以及某些萨米人的外表)引起的。 在巴斯克语中,它们是唯一的起源于史前的非印欧语种现存的欧洲语言(Magyar和土耳其语是最近1,000年来的到来语言)。**

由于与其他人的关系 乌拉尔 在西伯利亚中部发现的各种语言经常被认为是芬兰人,萨米人和爱沙尼亚人是该地区相对较新的北欧人。 这有一些 模棱两可的 来自Y染色体谱系的支持。 另一方面,有些人则认为,在印欧语系人士(通常是芬兰民族主义者)到来之前,北欧人就已经出现在欧洲北部。 这得到了一些支持 母系血统。 自然地,有些人倾向于合成这两种遗传证据线和语言亲和力,以争辩说 芬兰人是亚洲男性和旧石器时代的欧洲女性的混合人口! 但是,我们需要比单亲标记(男性和女性祖先的直接线条)走得更远。 我们需要研究更广泛的基因组范围。 碰巧的是 新文 发表于 欧洲人类遗传学杂志 在常染色体Sami与其他人群的亲和力上, 芬兰萨米族人种群结构的全基因组分析,对遗传关联研究具有重要意义:

了解人群内部和人群之间的遗传变异模式是成功进行复杂疾病和特征的遗传关联作图研究的先决条件。 有些人群比其他人群更适合进行关联映射研究。 来自北欧斯堪的纳维亚半岛和科拉半岛的萨米族人代表着一种孤立的种群,尽管在早期有兴趣进行关联作图研究,但在欧洲人群中的采样却较少。 在本文中,我们报告了芬兰萨米族人第一个基于全基因组范围内基于SNP的遗传种群结构研究的结果。 利用HapMap和人类基因组多样性计划(HGDP-CEPH)的数据以及最近开发的统计方法,我们研究了个体遗传祖先。 我们通过计算成对的FST统计数据和表征成对人口比较的按状态共享特征来量化萨米族和HGDP-CEPH人口之间的遗传分化。 这项研究肯定了东亚地区对欧洲起源的萨米族基因库的贡献。 使用基于模型的个人血统分析,具有东亚血统的基因组的估计中值百分比为6%(第一和第三四分位数:分别为5和8%)。 我们发现人口对之间的遗传相似性与地理距离大致相关。 在欧洲HGDP-CEPH人口中,与俄罗斯人相比FST最小(FST = 0.0098),其他人群比较的估计值范围为0.0129至0.0263。 我们的分析还揭示了芬兰萨米族人内部细小的亚结构,并警告人们不要对隐藏的人口结构和孤立人群的遗传关联研究中未记录的相关性造成混杂影响。

他们有352个Sami样本,查看了约38,000个SNP。 对于这些问题,他们专注于38 K SNP似乎很好。 这足以消除人群间的差异。 他们在论文中使用标准技术将萨米人与HGDP人口进行了比较。 假设数据集中有7个祖先种群,则ADMIXTURE会弹出以下内容:

ejhg2010179f2

萨米人之间有一定的“东方”亲和力。 有趣的是,它分为主要部分和次要部分。 主要的是在汉族中发现的东西,而未成年人的类似于美国原住民。 对此的自然解释是,人们所看到的是横跨东欧到西伯利亚的北极欧亚大陆的极极阴影。 与其他欧洲人口相比,萨米人与俄罗斯人的亲和力很明显,尽管有趣的是,他们缺乏“蓝色”成分,该成分在俄罗斯人所拥有的南亚西北部西北部人口中见顶,而撒丁岛人和法国巴斯克人则缺乏。

萨米根在左侧,您会看到一个PCA,该PCA打破了数据集遗传变异的前两个组成部分。 这两个轴似乎大致在东西方,南北之间。 无论萨米人通过mtDNA单倍群U5与南欧人有什么古老的亲戚关系,在总基因组含量上都不是显而易见的。 萨米人在俄罗斯人和奥卡迪人之间的地位(来自苏格兰北部)可能归因于这一事实,即萨米人与其他斯堪的纳维亚人在遗传上共享很多,而斯堪的纳维亚人比俄罗斯人更接近英国人口。

我不确定这些分析是否真的能说明我前面提到的问题。 作者们自己注意到,萨米人的祖先的“东方”部分可能很古老,因此他们可能是古代稳定的杂居人口,大多数是土著人,具有非平凡的外生元素。 这并不能告诉我们芬兰语言是否是欧洲本土语言,还是它们是中西伯利亚地区本土语言(这里指的是印度欧洲语言)。 此外,还有一个问题是,对于此类细粒度的问题,HGDP样本作为参考种群是次优的。 迪内克斯·庞蒂科斯(Dienekes Pontikos) 指出这一点:

不幸的是,他们包括了美洲原住民的HGDP人口,但没有包括我最初用来在这里,这里和这里研究整个欧亚大陆北部人口结构的西伯利亚人最相关的公开数据。

因此,他们在萨米族人中发现了类似“美国原住民”的成分,很可能可以利用Rasmussen等人进一步将其分解为西伯利亚特定成分。 数据集。

在HGDP面板中,最接近Saami的东亚欧亚成分的是雅库特,但更精细的分析(请参阅我以前的文章)显示,雅库特几乎完全是由阿尔泰特有的成分组成,将它们与突厥语联系在一起,蒙古族和通古斯族,而欧洲芬兰人,沃洛格达语俄国人和楚瓦什人的东部部分与中西伯利亚人(如Kets,Selkups和Nganasans)有联系,但本文均未提及。

以下是Dienekes重新编辑过的ADMIXTURE图:

添加剂15

请注意: 有许多拼写萨米语的方法。 他们使用了两个a,但我感到困惑,所以我只在文本中使用了一个。

引文: Maki-Torkko,Elina,Aikio,Pekka,Sorri,Martti,Huentelman,Matthew J和Camp,Guy Van(2010)。 芬兰萨米族人种群结构的全基因组分析,对遗传关联研究具有重要意义《欧洲人类遗传学杂志》: 10.1038 / ejhg.2010.179

*尽管芬兰萨米人称自己为“拉普”,但在挪威人看来,“拉普”是贬义词 拉帕莱宁。 我将使用萨米语来避免激怒挪威的术语警察。

**我暗中排除了大部分欧洲俄罗斯 西 乌拉尔,但是就这样吧。

 
拉齐布汗
关于拉齐卜·汗

“我拥有生物学和生物化学学位,对遗传学,历史和哲学充满热情,虾是我最喜欢的食物。如果您想了解更多信息,请访问http://www.razib.com上的链接”