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马达加斯加人的遗传学

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上周我 乞求马达加斯加人的基因型。 我还不太明白,但是我得到了第二好的东西: 马达加斯加人基因型的一部分。 我决定试一试。

但是首先是一些预备。 这是我们对此人的了解(或该人所知道的):

– 25%的法国人(祖父)
– 18.75%的西非? 6.25%法国人? (祖母法属安的列斯)
–来自孟买的19%印度穆斯林Bohras + 6.25%马拉加斯,Sakalava部落,玛哈真加王室(外祖父)
– 25%马达加斯加(Sakalava,外婆mtDNA单倍体M23)

就祖先而言,这是一个非常混杂的人。 至于马达加斯加人,我们对他们了解很多。 他们或多或少是南澳大利亚人的杂种人群,与 到婆罗洲南部的达雅克人。 我假设这些南洋人是环印度洋贸易网络的一部分,该网络在第一千年的下半叶被伊斯兰教的崛起所边缘化。 这么早就可以解释为什么马达加斯加人似乎只受到印度文化影响的影响,更不用说伊斯兰教的影响了。 他们的祖先还有非洲部分,在马达加斯加岛以西的低地人口中更为突出。 这 萨卡拉瓦 是一些非洲人(相对于东部高地的梅里纳(Merina)而言,他们更像是南方人)。

以下是使用EIGENSOFT生成的ADMIXTURE和PCA的一些结果。 大多数PCA地块都不太有用,因为我没有提前太多时间微调人口(这是第一遍),所以我没有发布它们。 ADMIXTURE的运行对我来说似乎很有帮助。 我合并了部分疯子个人的三个数据集:

–#1,一个以东南亚为重点的人群,主要使用泛亚财团人口

–#2,使用HGDP的亚洲重点数据集

–#3,使用Henn等人的非洲重点数据集。 人口以及一些HGDP


#1受到薄标记集的困扰。 东南亚的群体有〜56,000个标记,但有部分疟疾的人只与他们共享〜22,000个标记。 尽管如此,我还是成功了。 我可能在#2中补偿过度,因为我使用了约590,000个标记(HGDP与23andMe原始数据有很好的重叠)。 最后,#3拥有约180,000个标记,对于这种探索性工作,我觉得这已经足够了。

菌群数 K1 K2 K3 K4 K5 K6 K7 K8 K9 K10 K11 K12 K13
台湾原住民 0% 0% 0% 2% 0% 0% 5% 23% 69% 0% 0% 0% 0%
苗族 0% 0% 3% 78% 0% 0% 7% 4% 3% 2% 0% 0% 2%
吉国 0% 0% 73% 2% 0% 0% 9% 1% 1% 3% 1% 0% 9%
Wa 0% 0% 5% 4% 0% 0% 17% 2% 1% 7% 0% 0% 63%
马尔加什 31% 0% 2% 0% 6% 26% 0% 0% 0% 2% 31% 0% 3%
亚罗语 0% 83% 0% 0% 1% 2% 0% 3% 2% 0% 0% 8% 0%
爪哇 0% 4% 1% 1% 0% 0% 1% 25% 8% 22% 1% 5% 32%
拉马霍洛特 0% 61% 0% 1% 1% 3% 1% 13% 7% 2% 0% 8% 2%
明打威 0% 0% 0% 0% 0% 0% 0% 98% 0% 1% 0% 0% 0%
西爪哇省 0% 4% 1% 1% 0% 2% 0% 26% 9% 22% 1% 4% 31%
托拉雅 0% 13% 0% 1% 1% 1% 3% 44% 21% 7% 0% 2% 5%
印度 1% 1% 0% 0% 2% 59% 0% 0% 0% 1% 25% 1% 11%
日文 1% 1% 2% 3% 0% 1% 87% 1% 1% 1% 0% 0% 1%
肯修·内格里托(Kensiu Negrito) 0% 0% 0% 0% 0% 0% 1% 1% 1% 2% 0% 90% 4%
犹他州,白色 1% 0% 0% 0% 2% 20% 0% 0% 0% 0% 74% 0% 3%
露雅 78% 0% 1% 0% 2% 18% 0% 0% 0% 0% 1% 0% 0%
玛曼瓦 0% 1% 0% 0% 83% 0% 0% 9% 3% 0% 0% 2% 0%
西棉兰老岛 0% 6% 1% 4% 3% 3% 11% 36% 24% 5% 2% 1% 4%
西吕宋 0% 4% 1% 5% 2% 2% 16% 36% 24% 4% 1% 1% 4%
卡伦 9% 1% 6% 6% 0% 0% 18% 2% 1% 8% 0% 1% 50%
计画 1% 1% 8% 5% 0% 0% 12% 6% 2% 18% 1% 2% 43%
羟色胺 1% 0% 1% 1% 0% 0% 0% 2% 0% 84% 1% 0% 10%
汉台 0% 0% 6% 16% 0% 0% 45% 10% 13% 3% 0% 0% 7%

菌群数 K1 K2 K3 K4 K5 K6 K7 K8 K9 K10
姆布蒂P格米人 0% 100% 0% 0% 0% 0% 0% 0% 0% 0%
比亚卡P格米人 0% 9% 6% 0% 0% 0% 0% 59% 0% 25%
法语 0% 0% 100% 0% 0% 0% 0% 0% 0% 0%
巴布亚 1% 0% 0% 99% 0% 0% 0% 0% 0% 0%
柬埔寨人 75% 0% 0% 2% 10% 5% 8% 0% 1% 0%
日文 0% 0% 0% 0% 0% 0% 98% 0% 1% 0%
28% 0% 0% 0% 0% 1% 70% 0% 1% 0%
曼登卡 0% 0% 0% 0% 0% 0% 0% 0% 0% 100%
红宝石 0% 0% 3% 0% 0% 0% 1% 0% 95% 0%
0% 0% 0% 0% 0% 0% 0% 100% 0% 0%
Bant S非洲 0% 4% 0% 0% 0% 0% 0% 23% 0% 73%
土家族 34% 0% 0% 0% 0% 3% 63% 0% 0% 0%
izu津 12% 1% 0% 1% 0% 9% 78% 0% 0% 0%
苗族 48% 0% 0% 0% 0% 1% 51% 0% 0% 0%
赫镇 1% 0% 0% 0% 0% 1% 69% 0% 29% 0%
锡伯 4% 0% 2% 0% 1% 2% 73% 0% 18% 0%
通过 88% 0% 0% 0% 0% 2% 10% 0% 0% 0%
拉hu 11% 0% 0% 0% 0% 82% 7% 0% 0% 0%
49% 0% 0% 0% 0% 0% 51% 0% 0% 0%
纳西 4% 0% 0% 1% 0% 9% 85% 0% 1% 0%
Tu 8% 0% 4% 0% 3% 3% 74% 0% 7% 0%
班图肯尼亚 0% 5% 2% 0% 1% 0% 0% 7% 0% 84%
马尔加什 5% 1% 37% 0% 11% 3% 0% 4% 4% 36%
印度 0% 0% 0% 0% 99% 0% 0% 0% 0% 0%

菌群数 K1 K2 K3 K4 K5 K6 K7 K8 K9 K10
哈扎 16% 0% 76% 1% 5% 1% 1% 1% 0% 0%
也门犹太人 0% 0% 0% 84% 0% 0% 0% 0% 0% 15%
埃塞俄比亚 19% 0% 4% 52% 25% 0% 1% 0% 0% 0%
桑达威 6% 0% 1% 2% 90% 1% 0% 1% 0% 0%
比亚卡P格米人 0% 0% 0% 0% 0% 100% 0% 0% 0% 0%
姆布蒂P格米人 0% 0% 0% 0% 0% 0% 100% 0% 0% 0%
法语 0% 0% 0% 20% 0% 0% 0% 0% 1% 80%
柬埔寨人 0% 100% 0% 0% 0% 0% 0% 0% 0% 0%
曼登卡 98% 0% 0% 0% 0% 1% 0% 0% 0% 0%
约鲁巴语 96% 0% 0% 0% 0% 4% 0% 0% 0% 0%
Bant S非洲 72% 0% 0% 0% 0% 9% 1% 17% 0% 0%
班图肯尼亚 77% 0% 1% 2% 12% 5% 2% 0% 0% 0%
马尔加什 32% 13% 0% 3% 5% 4% 1% 0% 7% 36%
露雅 77% 0% 2% 1% 12% 5% 3% 0% 0% 0%
印度 0% 1% 0% 0% 0% 0% 0% 0% 99% 0%
8% 2% 0% 1% 0% 1% 0% 79% 3% 6%

我不太相信泛亚重点数据集所占的比例。 但是我认为我应该报告他们。 不知道为什么马达加斯加人显示了这么多雅库特。 可能是杂交的产物吗? 至于其余的人,对于东非班图人来说,这个人的非洲血统似乎并不是很典型。

 

我想丢掉那个词 我正在寻找一个具有马达加斯加血统的人 非洲祖先计划. 据我所知,还没有针对马达加斯加人的粗分子常染色体分析。 我最近之后 东南亚遗传学探索 我想即使是一个人 内容丰富。

像往常一样,我保证这些数据是完全私有的,并且 我不与任何人分享。 但在这种情况下,我想作一个例外并规定 约瑟夫·皮克雷尔,是芝加哥大学的研究生,出于研究目的,他也对获得马达加斯加(Malagasy)基因型非常感兴趣。 由于这是一个抽样不足的人群,因此,马达加斯加人基因型的边际回报对于科学来说将是巨大的, 公共利益,而不只是私人利益。

另外,我仍在寻找Tutsi基因型,以便确定该人群的起源。

请与我联系 Africaancestryproject -at- gmail -dot- com.

法兰西人:

杰拉什人和马尔加什丹斯勒干部项目获得“非洲祖先计划”。

一个流传于世的数学家,分析人们对马尔加什人的自治体的看法。 南部的阿西迪·阿·格里森特探索博物馆为您提供了具有启发性的人文建议。daccess-ods.un.org daccess-ods.un.org

杰里安蒂斯·凯斯·唐斯(Jar garantis que ces ces dons)不再有自信,反而在约瑟夫·K·皮克雷尔(Joseph K. Pickrell)例外,芝加哥大学的学士学位,加盖尔·特雷斯·德·加莱尔·皮尔加勒(Gérès)校长Fins de Recherche。

养蜂场人口数量少,男女住户数量少,而科学和déintêrétgénéral的马尔加什山脉。

人口统计上的图尔西人,原始人中的人种。

Merci de bien联络我àafricanancestryproject-at-gmail-point-com。

 
拉齐布汗
关于拉齐卜·汗

“我拥有生物学和生物化学学位,对遗传学,历史和哲学充满热情,虾是我最喜欢的食物。如果您想了解更多信息,请访问http://www.razib.com上的链接”