尼安德特人和解剖学上现代人类（AMH）化石的直接放射性碳测年技术的发展以及考古地层学年代的发展，现在可以使尼安德特人-AMH共存的区域模型得以完善。 此外，它们使我们能够探索位于AMH扩张初期路线（例如高加索地区）西部欧亚大陆地区尼安德特人晚期生存的问题。 在这里，我们报告了高加索北部Mezmaiskaya洞穴中晚期旧石器时代（LMP）层中的尼安德特人晚期标本的直接放射性碳（14C）年代。 此外，我们通过一系列来自LMP层的16种超滤骨胶原放射性碳数据，并使用贝叶斯模型生成与LMP末端相对应的边界概率分布函数，为该地区的尼安德特人灭绝的时间提供了更准确的时间顺序。 Mezmaiskaya。 化石的直接年代（39,700±1,100 14C BP）与概率分布函数很好地吻合，这表明尼安德特人在39 ka cal BP（千日龄）之后在Mezmaiskaya Cave没有幸存的可能性很高。之前，基于IntCal09校准曲线）。 这挑战了先前关于北高加索地区尼安德特人晚期生存的主张。 我们看到在Mezmaiskaya的LMP结束的贝叶斯年龄模型与在高加索南部的LMP结束的Ortvale Klde的计时数据之间存在惊人的且大致同步的计时相似性。 我们的结果证实，在包括高加索在内的西欧亚大陆任何其他地区，都缺少年龄小于40 ka cal BP的年代可靠的尼安德特人化石。

尼克·韦德 从校长那里得到一些报价 in 纽约时报。 我发现这部分很有趣：

斯坦福大学的古人类学家理查德·克莱因（Richard Klein）说，海厄姆博士的约会是“令人信服的”，并且符合他自己的观点，即“现代人类在技术和智力上都比尼安德特人优越得多。” 他说，“这将使它们迅速传播，并在接触后立即使尼安德特人灭绝。”

克莱恩 将 认为是这样，他在 PNAS!

无论如何，替代方案如何？ 对mtDNA和Y染色体谱系可能存在某种选择性偏倚。 这可能是直接生物学的。 想象一下，尼安德特人的mtDNA与某些疾病相关，且身体不适。 作者提到了这类问题。 但这可能是社交的。 在整个拉丁美洲，混合种族人群中的美洲印第安人Y染色体谱系已经被批发替代。 实际上，您在欧洲Y染色体谱系+非欧洲mtDNA谱系的许多社会中都有复制，并且常染色体有所不同（例如，在墨西哥，常染色体是平衡的，在阿根廷它主要是欧洲的）。 还有一个问题是，由于与常染色体相比有效种群规模较小，因此mtDNA和Y染色体谱系受到更剧烈的随机动力学影响。 常染色体是父母双方共同贡献的组合，但单亲世系仅从一个传承。 相对于mtDNA谱系的传播，雄性是完全死胡同，因为它们没有传递，而雌性自然没有Y染色体。 尼安德特人的mtDNA和Y谱系可能已经灭绝，如果它们是目前人口中约30,000年的一小部分人（这是“固定”并替换所有其他谱系的概率与它的比例成正比的话）时间频率 t 0）。

但是，对我而言，真正的主要问题确实是尼安德特人与非尼安德特人之间混合不相容的合理性。 在尼安德特人-非尼安德特人掺和物的证据出现之前，这是一个普遍的想法，基于与其他哺乳动物的比较，我开始对此表示怀疑。 但是现在我们有了更详尽的遗传数据。 左边是补充表 西伯利亚Denisova洞穴中一个古人类素族的遗传历史。 它显示了自成对种群之间最后一个共同祖先以来的时间（F =法语，其余各行与各列相同）。 我不会约会 这 严重地。 我要指出的是，尼安德特人和其他人口之间的最后共同祖先甚至没有比非洲人和非非洲人之间的相乘因子大。 这些特定的估计值在其幅度的细节上可能是错误的，但是我认为在我们同意混合不兼容的可能性之前，我们需要考虑极高的可能性，即尼安德特人几乎没有我们所想像或曾经想像的差不多。

以下视频仅用于娱乐目的：

……在1970年代，我比大多数人更不愿意接受威尔逊和萨里奇的遗传学证据，支持最近（五百万年前）的原始人种，所以我认为这将是一个弥补这种平衡的机会。 在我的演讲过程中，我提到了线粒体DNA证据，并指出“我准备被它说服。” 我被分子生物学家和遗传学家所包围，我认为这样做是明智的选择，而且在科学上也是正确的。

因此，当我在演讲结束后的酒吧里，包括会议组织者Stepehen O'Brien在内的几位参与者弯腰对我说：“您不必吞下线粒体夏娃线时，我感到非常惊讶。 我们没有。” 史蒂夫和他的朋友们继续告诉我为什么他们认为夏娃的假设是不正确的……威尔森可能错误地估计了线粒体钟的频率，老年的线粒体可能是偶然丢失的，可能是由于局部化脓性疾病偶发性崩溃而引起的，自然选择可能已经支持了一些最近进化的线粒体变体，这消除了较旧的血统。 这些可能性中的任何一个都可能会误以为是最近出现的种群的印象……。

…1990年XNUMX月，米尔福德（Milford）和六名志同道合的同事在新奥尔良举行的美国科学发展协会年度聚会上组织了一次会议，其目的是“钉住这种线粒体夏娃废话”。 一位又一位的发言者为支持区域连续性和反对局部物种形成争辩提供了证据。 关于替代性解释……这是一次有力的演讲，并引起了很多媒体的关注，其标题为“科学家攻击人类进化的“夏娃”理论”和“最新发现说，人不欠夏娃一切”。 在会议的另一场会议上发言的克里斯·斯金格（Chris Stringer）将反夏娃研讨会描述为“强大的销售技巧”。 米尔福德的突击队之一，堪萨斯大学的戴维·弗雷耶（David Frayer）总结了对威尔逊工作的深刻反应：“化石是真实的证据。”

在1990年代，沃尔普夫（Wolpoff）出了一本书， 种族与人类进化：致命的吸引力。 它概述了现代人类起源的多区域主义框架，并提出了对过去人类古人类学的广泛回顾，而且在我看来，这种多区域主义者处于“历史的右侧”。 我曾经是，而且仍然是一个自然历史的书呆子。 特别是人类的自然历史书呆子。 我在1980年代和1990年代吞噬了有关该主题的书籍，看到科学记者从正统观念从多区域主义向非非洲模式的缓慢转变。 由于我没有参加比赛，所以这对我来说都不是一件值得关注的事情，但是，我确实注意到分歧是个人的，有时会被政治化。 种族与人类进化 似乎是为了部分驳斥多区域主义助长种族主义的观点而写的。 相反，沃尔普夫（Wolpoff）颠倒了叙事，将“非洲以外”的模型描述为种族灭绝和灭绝主义者，与之相反，他的人类模型却通过基因流共同向智者滑行。

当然，另一面是许多人把“非洲以外”表现为卓越的反种族主义。 从解剖学上讲，现代人类被描绘成人类世界的尤利乌斯·凯撒（Julius Caesar）的第二天。 他们来了，他们看到了，他们战胜了。 人类与非人类之间的鸿沟可能已经很大，但“走出非洲”模式更吸引人的方面是我们是新兴的孩子。 所有非非洲人都来自非洲人，是我们物种遗传多样性的储存库。 该模型的含义与当时的平均主义精神相吻合是很自然的。 这是 帕特·希普曼 在2003， 我们都是非洲人:

我不希望多区域假设的用户挥舞白旗，尽管他们已经失去了绝大多数支持者。 至少，该理论最热心的支持者之一沃尔普夫（Wolpoff）坚定不移地捍卫了他长期以来所拥护的假设。 尽管新的发现仍然有可能改变平衡，以支持多区域观点，但这种证据的一致性创造了有力的证明。 重塑这一知识领域需要许多新的化石和新的遗传研究。

总体来说，希普曼提出的论点对像我这样对骨头和石头不太了解的人很有说服力。 即使我 知道一些可能的连续性实例，mtDNA，Y染色体谱系和常染色体结果似乎大致符合要求。 在看到人类化石具有连续性的古人类学家之间的斗争中，当时给那些产生与“非洲以外”相符的推论的遗传学家“压倒性的决定”似乎是合理的。

格伦德尔

综上所述，必须指出，克里斯托·斯金格（Chris Stringer）等古人类学家并不认为 一定 至 总 更换非非洲人。 完全可以更换，但很多时候他们确实认为与前现代底材可能存在某种混合和同化作用。 但是，指向遥远世系之间的杂交的遗传数据很少（与最近的唯一共同血统相对），特别是一旦尼安德特人的mtDNA被证明是一个外群，似乎就把人们推向了现代人类成为人类的模型。完全不同的野兽，根本不会与过去的生物发生性关系。 在 人类文化的曙光 古人类学家理查德·克莱因（Richard Klein）为现代新非洲人类的独特性和独特性提出了一个学术上和可衡量的论点：

……“黎明”的最简单，最经济的解释是，它源于偶然的突变，促进了全人类的大脑……。早先人们一直认为解剖学与行为之间的遗传联系一直存在，直到完全现代的人们出现为止。 50,000年前假定的遗传变化促进了独特的现代能力，可以在几乎没有生理变化的情况下适应各种自然和社会环境。

可以说，最后一个关键的神经变化提升了现代人对快速口音语言或人类学家杜安·奎特（Duane Quiatt）和理查德·米洛（Richard Milo）所说的“一种完全发声的语言，具有语音化，句法性和无限开放性和生产性的能力”的能力。

沃尔普夫（Wolpoff）出事了。 即使最初的“走出非洲”倡议者并不打算这样做，也有一种趋势是从进化的“死胡同”的能力中删除“更高的才能”。 我们曾经 智人。 如果我们打算允许尼安德特人成为我们自己物种的一个分支，那么它们的亚种就很独特。 在现代人类非凡而普遍的方式上，它们比我们少。

这种正统观念可能会为受过良好教育的公众带来积极的反馈循环，其中包括我自己。 新非洲人类例外主义的“走出非洲”模式越是深入人心，就会使尼安德特人和其他人类血统变得更加动物化。 自然，多区域主义的连续性模型变得令人反感，因为连续性暗示了现代人类与次人类之间的联系。 整个人类血统中最大的颅骨运动是由 尼安德特人成为违反直觉的事实，这只是表明它是质量，而不是数量。

当我在大学一年级时，我修了生物学人类学课程。 老师向全班提出了一个问题。 他指出，一些古人类学家观察到澳大利亚原住民的头骨与一些东南亚的直立种群之间的连续性。 澳大利亚原住民是一个非常有朝气的人，过去近一万年来对大多数人口而言，这种习惯已成为习惯，而迁徙趋势受到的影响较小。 无论如何，讲师都要求举手，是否应该公开讨论这种可能性。 全班多数人拒绝公开讨论。 当被教练问到为什么时，许多拒绝论文研究的学生都认为这种可能性为非人性化，压迫和政治上过于敏感开辟了道路。 米尔福德·沃尔普夫（Milford Wolpoff）显然输掉了宣传战。 这些学生没有考虑到所有人口都表现出连续性的多区域主义的可能性，而是假设澳大利亚原住民所假设的连续性是特定于他们的，因此会将这种人口与人文树的人为较少的分支联系起来。

科学是人类的文化事业。 这是真实的东西，是客观的东西，但我们确实透过玻璃有些暗。 模型的接受或拒绝取决于与现实和预测精度的对应关系。 但是，模型的兴衰以及其兴衰的速度可能会受到文化动力的影响。 在 利他主义的代价 奥伦·哈曼（Oren Harman）展示了俄罗斯和英国的文化如何塑造他们如何看待进化生物学的社会含义。 同样，由于语言和民族沙文主义的原因，牛顿力学和达尔文进化论在法国最初的接受可能受到了阻碍。

科学理论不仅必须在整个社会的怀疑和不理解之水中游swim，而且还必须克服自然推论与规范推论不可避免的混淆。 牛顿力学，相对论和量子力学都对下游社会产生了许多奇特而令人惊讶的后果。 这些物理理论和模型之间的界线 社会学, 认识论及 灵性，可能会使他们的创建者感到惊讶（好吧，也许不是 艾萨克·牛顿）。 但是人类的想象力丰富，许多认知人类学家认为 联系和类比 我们所做的，除了我们的 混杂模式识别，产生了巴洛克式和令人困惑的复杂性，即 文化.

到2000年代中期，“非洲以外”的范式已经明确，以至于化石据称也背叛了多区域主义者。 在 骨头，石头和分子：“走出非洲”与人类起源 作者认为，化石记录及其变异模式可以补充分子记录。 也就是说，克里斯·斯金格（Chris Stringer）是对的。 据报道，对形态变异的其他更多计算密集型分析倾向于支持“非洲以外”模型。

然而，就在非洲以外地区似乎已经清除了领域之外，从基因组学和遗传学中又出现了另一个方向的指点。 2006年，芝加哥大学的布鲁斯·拉恩（Bruce Lahn）发表了 大脑大小基因microcephalin的适应性等位基因从古老的同源系渗入智人的证据。 然而，几年后，似乎对该假设没有广泛的支持。 例如 没有证据表明尼安德特人对现代人类的多样性做出了贡献。 但是仍然有其他论文。 Xp21.1的深度单倍型散度和远程连锁不平衡提供了人类从结构祖先族群中下降的证据. 基因组学驳斥了非洲唯一的人类起源。 当然，这是一个 少数派观点。 在最初的几年中，尼安德特人的基因组计划似乎也不支持任何混合物。 我看到Svante Paabo在20008年末发表讲话，他绝对是毫不含糊的。 没有混合的迹象。 时期。

但是，科学正统的平衡对于外部的伪造冲击并没有永远持久。 是的，面对压倒性的证据，一些科学家仍然固执己见。 有人可能会认为米尔福德·沃尔普夫（Milford Wolpoff）可能是其中之一。 弗雷德·霍伊尔 当然是。 但是潮流开始了。 在秋天 2009 斯万特·帕博（Svante Paabo）在掺混物问题上似乎并没有那么明确。 然后，在春天 2010:

新墨西哥小组的建议可能很快就会受到考验。 去年年初，德国莱比锡马克斯·普朗克进化人类学研究所的SvantePääbo及其同事宣布，他们已经完成了尼安德特人基因组初稿的测序工作，有望在不久的将来发表他们的工作。 Pääbo对尼安德特人基因组组成的早期研究在很大程度上排除了杂交的可能性，但它们并非基于对完整基因组的更全面分析。

普朗克研究所的人类学家Linda Vigilant， 发现乔伊斯的讲话为太平洋地区遗传变异中发现的“细微偏差”提供了令人信服的答案。

“这些信息确实很有帮助，” Vigilant说。 “而且很酷。”

至此，2010年XNUMX月，一些未参与该项目本身的研究生已经看到了该项目的纸质稿。 尼安德特外加剂纸。 消息在传播。 我已经知道它的可能性，这使我打开了Google警报（这使我陷入了对“我从来都不知道”的一项禁运的“破坏禁运”的麻烦）。 在2010年，针对古老的，正统的正统观念的锤击正在逐渐成熟，许多人对此“一无所知”。 在透明的时代，有趣的是，科学自然地具有某种保密的文化。 谁想被挖出来？ 但是，从长期来看，这到底有多可持续？

用某些人可能会感到反感的宗教类比，这是一个异端曾经是信仰的大祭司的例子。 去年春天的媒体报道清楚地表明，参与其中的大多数校长 最初并不认为已经发生了混合。 相反，他们认为得到的结果是异常的。 科学受文化影响，但最终自然还是最终的仲裁者。 事实是事实，诚实的男人和女人应有的应有。

至此，您大概知道了分数。 古代DNA是强大的法官和陪审团。 看来尼安德特人掺和物的证据已经存在 修改传统的《非洲以外》的叙述。 但是，必须承认 走出非洲 is 主要是正确的。 在过去约100,000年内，我们总基因组含量的绝大多数似乎可以追溯到非洲人口。 较深的根深蒂固的血统模型只能通过选择性扫描周期性地打断，以保持物种的凝聚力，这是站不住脚的。 渐进主义 鉴于遗传证据，这似乎是难以置信的。 这是Wolpoff（和他的妻子Rachel Caspari）在 种族与人类进化:

我们同意，一种标点符号化的进化模式最能描述许多种系的进化历史，包括人类仅是另一种非洲灵长类物种的人类史前时期和更长的时期。 但是我们认为，标点符号式的平衡并不能反映出人类进化成为成功的殖民者时以及在没有宏观进化变化时人类所发生的事情。 当我们阅读化石记录时，没有证据表明最近发生了物种形成事件。 实际上，有强有力的证据反对他们。 但是夏娃的解释答应支持为后来的人类进化建立一个标点符号的模型，但该模型被诸如我们这样的化石证据的解释所否定。

我知识不足，不知道什么才算是“宏观进化的变革”。 但是 '大跃进' 似乎是一个合理的候选人。 无论什么细节，在200到10万年前之间，似乎确实出现了人类范围和创新能力的一系列快速扩展。 有时空气中有不同。 我不知道米尔福德·沃尔普夫（Milford Wolpoff）的思想的细微差别。 最新的数据似乎确实驳斥了所有观点，即“非洲以外的人”是微不足道的。 但是，它们似乎也大致上与过去200,000万年来人类血统变化的特殊性，几乎是革命性的特征相吻合。 形态学和遗传学变异的趋同模式似乎可以追溯到非洲基础，这表明克里斯·斯金格和艾伦·威尔逊正确地表征了近代人类史前的主要一阶动力学。 但是现在我们进入第二和第三阶。 当根据自然的多样性和独特性来判断时，粗略的范式将被雕刻成更具真实感的事物。

让我们跳到纸上。 主菜。 西伯利亚Denisova洞穴中一个古人类素族的遗传历史:

使用从西伯利亚南部Denisova洞穴中发现的手指骨头提取的DNA，我们已将古人类蛋白的基因组测序到大约1.9倍的覆盖率。 此人来自与尼安德特人有共同血统的群体。 该种群不参与从尼安德特人到欧亚大陆的假定基因流动； 但是，数据表明它为当今美拉尼西亚人的基因组贡献了其遗传物质的4–6％。 我们将这一人种命名为“ Denisovans”，并建议在更新世晚期期间它可能已经在亚洲广泛传播。 Denisova洞穴中发现的一颗牙齿携带着一个与手指骨骼高度相似的线粒体基因组。 这颗牙齿没有与尼安德特人或现代人类共享任何派生的形态学特征，进一步表明丹尼索瓦人具有与尼安德特人和现代人类不同的进化历史。

约翰·霍克斯（John Hawks） 在他的常见问题解答中介绍了很多内容。 特别是他有一个 完形 了解化石记录，以便他可以对他们的某些断言进行“快速而肮脏的”检查。 他指出：

这篇论文没有指出的是，有旧石器时代的标本等于或超过了这颗牙齿的大小。 例如，来自罗马尼亚Oase的上部第二颗臼齿的测量长度和宽度比该样本大，而该样本的第三颗臼齿（在隐窝中）更大。 来自土耳其的上旧石器时代的臼齿也非常大。

我不认为这是该标本与早期旧石器时代人民之间关系的迹象，即使这些是最早的。 这是这颗牙齿实际上无法诊断的另一个迹象。 我要说的是，在没有遗传信息的情况下，我们将这些遗骸视为早期旧石器时代的人们，并强调了这些相似之处。

人们根据他们的信息来解释信息 背景先验。 既然我们知道了我们所不知道的，也许我们应该回过头来仔细检查一下我们曾经被解雇的情况。 考虑一下2006年的这篇论文， 人类基因组中的古老混合物:

人类进化过程中永恒的问题之一是人类的“古老”形式的命运。 尼安德特人是在25万至40万年前没有与现代人类杂交的情况下灭绝的，还是他们的基因存在于当今的欧洲人中？ 最近的工作表明，尼安德特人和一个尚未被确认的古非洲人口促成了 至少占现代欧洲的5％ 和西非基因库。 尼安德特人和其他古老人类核DNA的广泛测序有可能在未来几年内最终回答这个问题。

5％是一个不错的整数。 他们本来可以幸运的，但是 第一作者 继续在2009年暴跌，生成了古老的混合物模型。 这将有多丰硕的成果？ 这是 莎拉·提斯科夫（Sarah Tishkoff） 在2009年XNUMX月：

…宾夕法尼亚大学的遗传学家萨拉·提斯科夫（Sarah Tishkoff）表示同意，并补充说，毕竟，每个人都有强大的智力选择压力，因此在各自的环境中取得成功就越好。 至于与尼安德特人的搭配， 提什科夫（Tishkoff）否定了这个想法，只是认为它是纯粹的猜测：“我不知道有什么证据。”

我怀疑莎拉·提斯科夫（Sarah Tishkoff）的观点在2009年底的大多数人类进化学者中都是普遍的（尽管我怀疑那些曾与Facebook交往过的人与斯万特·帕博（Svante Paabo）实验室的人是不一样的）。 坦白说，对提斯科夫（Tishkoff）来说，六个月后当她得到证据时，她接受纳安德塔尔掺合料并没有感到沮丧。 她甚至补充说：“……杂交有可能将特质引入少数人群。”

关于本文，在文章中的三个数字中，最上面一行很清楚。 我在下面对它们进行了重新格式化：

左上角： 系统发育树，显示了各种人类谱系的总基因组关系。 现存的现代人类代表了一个进化论。 丹尼索瓦人和尼安德特人另一个。 换句话说，Denisovans和Neandertals的最后一个共同祖先在时间上比新非洲人以及Denisovans和Neandertals的最后一个共同祖先在时间上更浅。 所有尼安德特人（Neandertals）也都息息相关，至少在这条曲线上评分时是如此。 Denisovans对他们而言是群体，就像San对其他人而言是群体。 法国人在汉人和巴布亚人中是一个外来群体，尽管只是勉强。 这种关系自然是我对法国人和汉人共同血统的论点持怀疑态度的原因。 20,000年前 当我们知道巴布亚人在45,000年前定居他们的岛屿时。

右上： 在PCA中，将HGDP人口投影到变异的两个最大成分上，这两个成分摆脱了黑猩猩，Denisovan和Neandertal的数据集。 换句话说，决定游戏规则的是黑猩猩和两个古老的欧亚人口。 人类被限制在非人类/前人类的遗传变异空间中。 因此，人类的位置告诉您它们与Denisovans，尼安德特人和黑猩猩的遗传变异有何关系。 除非洲人外，欧亚人，欧亚人+美国人组成了一个相对紧密的群体。 如果非非洲人有一些尼安德特人掺混物，这是合理的。 但有趣的是 他的美拉尼西亚人团体也脱颖而出。 而且，巴布亚人和九重葛岛民也很独特。 后者转向欧亚大陆。 为什么？ 可能是因为他们的年龄较小但很重要， 南方祖先成分 巴布亚人缺乏的。

他们估计，欧亚大陆人和大洋洲人的基因中有2.5％来自尼安德特人。 并且，美拉尼西亚人的另外5％的基因组是Denisovan起源的。 因此，美拉尼西亚人是92.5％的新非洲人。 欧亚人是新非洲人，占97.25％。 最多。

底部： 最后一个显示了程式化的人口统计模型。 步骤1，人类离开非洲。 新非洲人与西南亚的尼安德特人杂交。 步骤2，古欧亚人向东推进，有的遇到了Denisovans，最终到达了大约45,000年前的Sahul。

有人问我有关波利尼西亚人和澳大利亚原住民的丹尼索瓦人的情况。 由于波利尼西亚人约为美拉尼西亚人的20％，因此应适当稀释一部分。 至于澳大利亚人，如果他们是 直到最近才与巴布亚人民区分开 由于海平面上升，我认为它们应该承载相同数量的Denisovan。 布干维尔 一直 分离自巴布亚 从我所知道的水。 最后一个问题是关于安达曼岛民和其他偏远的亚洲人，他们似乎是狩猎采集者的遗物，例如阿伊努人。 由于巴基斯坦的HGDP人口与安达曼岛民在祖先中占有很大的比例，因此我认为他们应该略微偏向巴布亚人。 由于人口没有标签，我不知道这些群体是否朝着巴布亚人的方向倾斜。 在补编中，汉人和法国人的个人结局有所不同，尽管微不足道，但汉人似乎有些转向布干维尔岛民。 此外，本文的一些作者参与了 重建印度历史，因此我假设可以访问Andaman Islander数据。 如果他们进行一些快速检查并决定坚持使用HGDP，我会很好奇，因为那里不可能有任何东西。

的主体 纸 严谨优美地写着。 但是，还有更多 补品。 我已经阅读了至少一次，但是我不能说我非常了解。 尽管它的篇幅长达90页，但在数学上精打细算，却写着精疲力尽。 但其中很多都暗示着“ D统计”，实际上它可以追溯到更早的时期。 尼安德特外加剂纸，及其补充。 因此，让我们回到这一点，至少粗略地检查一下D统计量。 在我的经验中，可能不会获得很深的知识，但是即使是对这类论文的技术奥秘的肤浅知识也常常是有用的。 至第130页：

为了测试尼安德特人与某些现代人相比是否共享更多的等位基因，我们比较了所产生的尼安德特人序列与当今来自不同祖先的人类样品的序列。 具体而言，我们通过比较来自不同个体（H1和H2）的两条染色体发现了单核苷酸多态性（SNP）。 然后，我们评估了受试个体（H3，例如尼安德特人）是否倾向于在H1具有相对于黑猩猩的衍生等位基因的位点更频繁地匹配H2或H3。 在H3属于一个外来群体的原假设下，它应与H1和H2相等地匹配。 相反，如果已经发生基因流动，则H3可能比另一个更匹配。

这是一个图形说明：

黑猩猩（未显示为H4）可能具有的祖先状态是A。 B表示派生状态。 这意味着它已经通过从祖先状态的突变而发生了变化，该变化是在最后一个祖先与外群体之间的某个时刻发生的。 要计算D统计量，您需要查看H3为B而H4自然为A的情况。因此，您有两组：BABA和ABBA。 您正在比较这两个组合之间的计数。 如果H3是H1H2进化枝的干净外群，则D将为〜0，因为BABA和ABBA计数将大致相等。 相反，如果有基因从H1流向H2或H3，则D将偏离〜0。 这 Z分数 是偏离〜0的标准偏差。 下表来自正在研究的当前论文。 我强调并重新格式化了：

D统计量可以使您口头上了解。 从尼安德特人到Eurisicans +大洋洲人都有一些混合体。 因此，当彼此配对为H1和H2时，与从非洲人配对时，它们的偏离不会比从0偏离那么大。 偏离相等比例的ABBA和BABA是因为存在从H3到H1或H2的假定基因流。 注意Denisovans。 因为它们就像尼安德特人，所以与D的偏差较高，尽管幅度不大。 有趣的是，在比较Denisovans，Melanesian和非洲人时，会出现最大的Z分数。 最后，美拉尼西亚人和欧亚人在H0位置与Denisovans配对时，也会导致偏离3。

快速补充说明古代人口结构。 二烯 他认为欧亚大陆人和大洋洲人之间不一定存在尼安德特人混合气。 据我所知，他认为非洲内部存在着人口结构，这一结构在非非洲人口中得到了保留。 与其说是最近才见过的地理上分离的宗族之间的外来混杂，不如说是在这里争论的是，非洲更为紧密的人口之间存在着长期的障碍。 尽管他们不能完全没有根据地拒绝它，但作者并没有发现它是同等的。 下面是它们的两个模型的图形表示：

那么，这会把我们留在哪里呢？ 昨天，当我说一些大事要下降的时候 埃德·布雷顿 对古人类学家倾向于过多地夸大故事感到沮丧。 现实是一切都不会改变。 这 霍比特人是， 达尔文尼乌斯 惨败，以及关于 艾达，可以使任何适合人类进化的疲劳。 但是这里有所不同。 您无需为此全力以赴。 在某个时候，您将能够进入UCSC基因组浏览器 在你自己周围戳。 或者，您可以使用 SNP和插入缺失.

如果您是原始自然史的书呆子，那么这是一个活着的好时机。 您永远都不知道早上醒来会给您带来什么惊喜。 您永远不会知道您将如何重新布置您的世界观念。 在文章的较早部分，我提到一位讲师曾问过一个班级，我是一名学生，如果他们认为存在原住民的勃起功能，是否应该允许科学家讨论这些特征。 您可能不会感到惊讶，我说过这样的事情如果看起来是真的不应该超出限制。 显然，科学具有政治意义。 说它没有价值是理想主义的，并且在哲学上是一致的，但它也是幼稚的。 相反，我们需要思考 努力思考我们的价值观如何与我们周围的世界联系起来。 或者至少我们中的一些人需要认真考虑这种事情。

我们不应该认为我们所有人都有完全相同的道德直觉。 但是，从某种程度上说，我认为我们有些担心过度了。 我认识一个人，坦率地承认自己是“白手起家”的极简主义者，因为他们不知道如果许多特征具有某种遗传成分，他们将如何入睡或生活。 同样，我遇到了许多保守的基督徒和穆斯林，他们承认，如果他们不相信上帝，他们将会强奸，谋杀和偷窃。 换句话说，如果上帝不存在，他们将成为精神病患者，因为“为什么不存在”。 这太可笑了。 上帝不存在，而且他们不是精神病患者。 他们可能会认为自己没有对妹妹进行鸡奸，因为上帝从安高（On High）宣告该行为是被禁止的，但我认为从表面上看这是很荒谬的（在边际上，对上帝的信仰可能会产生某种影响顺便说一句，但这显然不是我要讲的内容）。 一切皆有可能，但一切都不尽如人意。 至于人与人之间，群体与群体之间存在很大差异的可能性，如果您承认这一天，那么您当然会举起手来 健康？ 如果是这样，的确，人类在道德观念上存在巨大差异，因为我无法理解这种行为。

因此，巴布亚人，以及可能的原住民，大概是非新非洲人的〜7.5％。 那有关系吗他们今天流血吗？昨天没有流血吗？ 在深层实质问题上，这一刻与以前没有什么不同。 让我引用约翰·霍克斯：

我们人类的共同血统可以追溯到早更新世和中期更新世。 由于这个共同的祖先，（现在有多个）尼安德特人基因组和杰尼索娃基因组与一些人而不是其他人共享基因。

此外，一些有生命的人携带更多来自尼安德特人的基因，因为他们有相当一部分尼安德特人的血统。 这使得谈论“尼安德特人和现代人类的祖先”变得毫无意义。 尼安德特人是现代人类的祖先。

Denisova也是如此。 谈论尼安德特人，杰尼索娃和现代人类之间的三分分裂是毫无意义的。 我们可以谈论一个人口模型，其中有一个进化枝将祖先的尼安德特人-德尼索娃人口与当代非洲人分开。

当我与人们谈论这些问题时，我不得不一次又一次地提醒自己，“现代人类祖先”并不是一个排斥这些更新世民族的群体。

一旦我们进入了引用人口模型的模式，重要的是要认识到这些模型的局限性。 例如，我们目前不能排除这些更新世种群之间的多种基因流。 我们可以理解基因流水平的一些限制-这些种群结构高度，不是更新世的panmixia。 但是，谈论隔离而不承认我们测试这些总体模型的能力为时过早。

术语上的困难告诉我们一些非常重要的事情。 人类起源科学的大规模重组正在我们身上。 我们习惯使用的术语将变得过时。 一些晦涩难懂的术语将变得非常重要。

我们所知道的善良与真实仍然是善良与真实。 这是一个小小的灵魂，对于术语问题如此感动，我们应该谨慎地允许这种情况发生在我们自己身上。 我现在认为罗马人和穆斯林都讨厌国王的想法。 罗马人推翻了君主专制，建立了共和国，并以专制取代了专制，这几乎就是君主制。 穆斯林有哈里发，是上帝的副vice，苏丹和酋长国是哈里发的副。 尽管将荣耀归给了他们的上帝，穆斯林的专制却是人间的事。 一人一人的统治是实质问题，而不是风格问题。 人的尊严不应视祖先的细节而定。 这不是很明显吗？ 我认为这就是20世纪在某种程度上的意义。

回到科学。 我从一个漫长的历史速写开始，用我自己的个人视角观察，因为概率总是通过一杯有先验的先验来过滤的。 我对侵略性和混合性的想法并不感到震惊，因为 格雷格·科克伦（Greg Cochran）, 亨利·哈彭丁及 约翰·霍克斯 已经使我不得不考虑这种现象的合理性。 此外，我一直对保护遗传学以及建模感兴趣 文化进化。 在这些领域中，这种侧向流动并不是未知的。 去年春天，当我与奥伦·哈曼（Oren Harman）首次讨论尼安德特人掺混料的结果时，他提醒我应该谨慎对待此类事情。 许多引人入胜的科学故事通常不会成功。 然而，在充分尊重奥伦的情况下，在这种情况下，我们确实需要观察到，确实有一群真正的学者涌入这些数据。 此外，这是旧的东西，而不是新的东西。

这些结果将不会仅是狭och的相关性而仍然是孤立的发现。 我相信这两篇论文可能会将平衡正统观念向一个新的方向转移。 旧模型和遗传研究将以新的视角出现。 未考虑到的异常将再次出现。 在 纽约时报 斯坦福大学遗传学家Carlos Bustamante 似乎表明 卡尔·齐默（Carl Zimmer）表示狩猎正在进行。 也许人类基因组比我们想象的要复杂得多？

最后，一个人想知道这是怎么错过的。 7.5％并非微不足道。 然而，一代人的mtDNA和NRY研究似乎没有做到这一点。 我认为这种古老的混合物没有出现在结构中，因为它是欧亚大陆人和大洋洲人遗传背景的稳定组成部分。 它使我们想起了解释的局限性。 我们知道我们所知道的取决于我们已经知道的。 由于我们了解更多，现在可能会生成一组不同的推断。 虽然谦虚。 还没有时间来强化新的正统。

个人说明： 圣诞节快乐！ 显然现在是我休息的时候了。 致以最良好的祝愿，让我们在2011年提供更多信息和更多数据。 希望我们不必等待太久 奥齐的基因组.

引文： Reich，David，Green，Richard E.，Kircher，Martin，Krause，Johannes，Patterson，Nick，Durand，Eric Y.，Viola，Bence，Briggs，Adrian W.，Stenzel，Udo，Johnson，Philip LF，Maricic，Tomislav ，好，Jeffrey M.，马克斯·博内特，托马斯，阿尔坎，坎，傅，乔梅，马利克，斯瓦潘，李，亨，迈耶，马提亚斯，艾希勒，埃文·E，斯通金，马克，理查兹，迈克尔，塔拉莫，萨赫拉，Shunkov，Michael V.，Derevianko，Anatoli P.，Hublin，Jean-Jacques，Kelso，Janet，Slatkin，Montgomery和Paabo，Svante（2010）。 西伯利亚自然界Denisova洞穴中一个古人类素的族群的遗传史： 10.1038 / nature09710

新墨西哥小组的建议可能很快就会受到考验。 去年年初，德国莱比锡马克斯·普朗克进化人类学研究所的SvantePääbo及其同事宣布，他们已经完成了尼安德特人基因组初稿的测序工作，有望在不久的将来发表他们的工作。 Pääbo对尼安德特人基因组组成的早期研究在很大程度上排除了杂交的可能性，但它们并非基于对完整基因组的更全面分析。

普朗克研究所的人类学家琳达·维吉兰特（Linda Vigilant）发现，乔伊斯的演讲令人信服地回答了太平洋地区遗传变异中发现的“细微偏差”。

“这些信息确实很有帮助，” Vigilant说。 “而且很酷。”

试图搜集Paabo将要获得的结果就像阅读茶叶一样，但是值得注意的是，Max Planck的一位同事对这项研究的结果似乎感到兴奋。 我不认为这些结果中的任何一个都会否定非非洲人祖先的压倒信号是非洲的模型。 有一个原因是mtDNA，后来对经典标记的分析以及最后的现代基因组学（以及骨骼特征的分类分析）都暗示有非洲以外的事件，解剖学上的现代人类由此进入了大规模人口统计学和范围扩展的时期来自一小群祖先。 但这并不排除沿途其他群体的同化，并且存在 旁证 他人与现代人类之间的性别差异（相对于其他各种仍能产生可育杂交幼体的其他类群而言，不同的人类素谱系之间的分离时间偏低）。

最后一点是，如果这些结果持续下去，人们可能会期待非洲本身进行其他杂交活动。 可能现代非洲人保留了远古人类基因的遗传变异，因为 智人 进入了该大陆的扩张期。 这些信号目前可能被遮盖了，因为非洲的古生物在基因上比非洲以外的古生物更相似，并且非洲的基因组在多样性方面还不如其他种群那样好（请记住新的SNP的发现）在里面 关于布什人的最新论文).

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