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尼安德特人

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gr2 一份新的论文 美国人类遗传学杂志, 尼安德特人和现代人Y染色体的差异,报道了为什么我们无法从这个古老的血统中看到现代人的Y染色体的可能原因,尽管它们显示出可检测到的常染色体混合物水平。 您可能还记得,长期以来,显然缺乏深分支的Y和mtDNA谱系一直是为什么尼安德特人和现代人类之间的基因流动可能不是很重要的主要遗传原理之一。 尽管有来自以下方面的暗示性证据, 形态分析 以及 推论 来自常染色体数据。 问题在于,通过利用常染色体数据的聚结模型(相对于Y和mtDNA重组,而不是针对目标区域的重组),很难进行干净的系统发育重建,因此 古代的基因组序列确实是必需的 用这些标记来说服大多数人。

这使我们问: 为什么在现代人中没有发现尼安德特人Y和mtDNA谱系,这些谱系显示出其他人参谱系的基因流征兆? 毕竟,缺少这些确实使许多人多年来走在错误的道路上。 我记得在2008年Svante Paabo的一次演讲中,他报道了他所测序的尼安德特人mtDNA绝对不同于当前针对我们物种的数据库中的任何东西,这证实了他的假设,即不存在与现代种群的混合体(Paabo改变了他的显然是由于整个基因组测序后不久就进行了调整)。 一种简单的解释是 因为Y和mtDNA的有效种群大小小于基因组的常染色体区域,所以它们更容易受到漂移的影响,并显示出更高的灭绝率。 换句话说,所有尼安德特人Y和mtDNA在混合后就灭绝了并不奇怪,因为它们是少数人,而且大多数世系在任何情况下都灭绝了。 特别是依靠mtDNA从事非人类系统地理学研究的研究人员可以通过查看一个信息源来讲述许多被误入歧途的故事。

但是机会可能不在这里起作用。 埋头于本文的讨论中:

…来自几个Y染色体基因的多肽充当男性特定的次要组织相容性(HY)抗原,可在妊娠期间引发母体免疫反应。 此类效应可能是继发性反复流产的重要驱动因素30,并且可能在男性性取向的兄弟出生顺序效应中起作用。31有趣的是,尼安德特人和现代人类序列之间具有潜在功能错义差异的三个基因都是HY基因,包括KDM5D。 ,第一个表征为HY的基因……很容易推测这些突变中的某些可能导致了现代人与尼安德特人之间的遗传不相容性,并因此导致了现代人中尼安德特人Y染色体的丧失。 实际上,具有尼安德特人Y染色体的杂交后代的生育力或生存力降低与哈尔丹定律完全一致,该定律指出:“在两个不同动物种族的[第一代]后代中,一种性别不存在,罕见或不育,这种性别是(异性恋)性。”

物种的起源显然是随着进化生物学的出现而提出的创始问题之一。 霍尔丹定律 可以追溯到1920年代。 在哺乳动物中,异配子性是雄性,因此这些杂种会被选为针对的(或者,它们可能是不育的)。 最近有很多关于尼安德特人灭绝的原因以及我们两个血统之间是否存在与生物物种概念保持一致的物种形成障碍的研究。 这一结果表明,在不久的将来,人类古人类的基因组学将会出现有趣的现象。

 
• 类别: 科学 •标签: 基因, 尼安德特人 

445px-尼安德特人2D-MJC里面有一篇新论文 联合会 (开放访问), 尼安德特人和现代人Y染色体的差异。 从讨论中:

我们描述的尼安德特人Y染色体谱系从未在现代人类中观察到,这表明该谱系很可能已经灭绝。 尽管尼安德特人的Y染色体(和mtDNA)可能已经从现代人类基因库中移出了……但是,遗传上的不兼容性也可能导致了它们的丧失。 在将尼安德特人血统与现代人类的血统进行比较时,我们确定了四种具有预测功能影响的编码差异,三种错义和一种废话……。

出于显而易见的原因,媒体发现了功能差异的论点令人信服。 例如,安妮·吉本斯(Anne Gibbons)在 科学, 现代人类的女性和男性的尼安德特人在生婴儿方面遇到了麻烦。 这就是为什么。 没关系。 但我认为重要的是要注意对于许多人 古代Y染色体的丢失实际上是一个相当强的无效模型。 基本上,Y和mtDNA是树的系统发育树(无网状结构),当您遍历树时,您会注意到,随着尚存谱系的融合,基因会持续丢失。 此外,由于单亲世系中的漂移较大(Y和mtDNA有效种群的大小仅限于一种性别),因此灭绝的速率会更高。

早在2000年代中期 约翰·霍克斯 在争论 缺乏 高度散布的mtDNA和Y谱系表明存在古老的混合物,但由于灭绝的可能性很高,因此没有证据表明缺乏混合物。 换句话说, 在这种情况下,缺乏证据比证据本身告诉我们的要少得多。

 
• 类别: 科学 •标签: 尼安德特人 

这样的 新纸出, 尼安德特人的部分遗传更新:东部的连续性和西部的人口置换。 主要结果在上面。 基本上,使用13个mtDNA样本,作者得出的结论是,它似乎在大约50万年前在西欧出现了尼安德特人的奠基人效应,在现代人类到来之前为该特定人群产生了非常均一的遗传背景。 也许只有我一个人,但新闻稿带有标题,例如 “即使在现代人类到来之前,欧洲尼安德特人也濒临灭绝” 打我为夸张。 我也对以下引号感到困惑:

“事实上,欧洲的尼安德特人已经灭绝,但随后又恢复了,这一切发生在他们与现代人类接触之前很久。 令我们感到完全惊讶。 斯德哥尔摩瑞典自然历史博物馆副教授洛夫·达伦(LoveDalén)说,这表明尼安德特人可能对上一个冰河时代发生的剧烈气候变化比以前想象的要敏感。

从具体到一般,我想到了几点。 首先,根据我的收集 与继承人类的现代人类相比,尼安德特人实际上在扩展人参范围的北部界限方面没有那么宽泛。 因此,许多人认为,尽管尼安德特人的体质具有生物学适应性,但他们缺乏推动可动范围的文化可塑性(例如,现代人被迫进入西伯利亚,从而使他们能够穿越白令海峡)。 可以由此推断,尼安德特人对气候变化的敏感程度要高于而不是后来的人口。 其次,有一个事实是,由于周期性的气候变化,在更新世期间,尼安德特人将比南部的表亲遭受更大的人口规模变化。 这不仅对尼安德特人来说是一个问题,而且对于一般的慢速繁殖或移动生物来说也是一个问题。 现代人类的瓶颈在某些方面更加令人惊讶,因为现代人类源自温暖的气候。 最后,还有一个“大图”问题,尽管我们将这些北方适应的人类作为“尼安德特人”扔进了锅中,但如果它们表现出结构和变异,也不要感到惊讶。 非非洲人在不到100,000年的时间里就实现了多样化,至少我们标记为尼安德特人的血统是从西欧到中亚的约200,000年的居民。 不会一个 期望 这段时间有很多自然历史?

大概作者集中在mtDNA上,因为相对于常染色体DNA而言,mtDNA丰富,使得古代DNA提取更加容易。 我很好奇它如何与来自 Denisovan纸 Vindija和Mezmaiskaya Neandertals都使用常染色体标记物经历了人口瓶颈。 尽管似乎有可能对他们的样本进行了抽样,但文迪亚人口可能已经迁居到这里,但我对本文补编中的日期还是不清楚的。 如果能够很好地了解尼安德特人混合物的基因组历史,我们也许可以在某个时候更好地了解自己的基因组中的尼安德特人混合物的来源。

 
• 类别: 科学 •标签: 人类进化, 尼安德特人, 古生物学 


人的颅骨能力增加,礼貌 卢克·乔斯汀(Luke Jostins)


几年前,剑桥大学桑格研究所(Sanger Institute)的一位统计遗传学家, 卢克·乔斯汀(Luke Jostins),发布了 上图 使用化石的人源颅骨能力数据( 人类血统)。 如您所见,直到现在为止〜250,000年之前,颅骨容量都在逐渐增加,然后迅速增加。 我还应该指出,根据我对经验数据的了解, 人的平均颅骨容量达到峰值 末次盛冰期. 我们的全球洞察力 大脑一直在萎缩,甚至相对于我们的体型(我们不像冰河时代那样大)。 但这既不是这里也不是那里。 在评论乔斯汀斯 观察:

上面的数据包括所有已知的Homo头骨,但是如果排除24个尼安德特人,结果不会改变。 实际上,如果排除智人但保留尼安德特人,您会看到相同的结果。 趋势是泛人的,并不局限于特定的血统……。


换句话说: 世俗 我们沿袭的颅骨能力的增长可以追溯到过去的数百万年,并且也横向转移到“侧支”(使用我们的特定末端节点, 智人,作为参考)。 这就是为什么我经常争辩说 人类在某种程度上是不可避免的。 就人类而言,我不是说 智人,是非洲人种的一部分的后代,它们在现在之前已经发展了大约100,000年,但是聪明而有文化的人种不可避免地会构成技术文明。 卢克·乔斯汀斯(Luke Jostins)观察到,人参家族树不同分支上的平行趋势向我表明,我们的血统不是 特别,但简单地 第一。 就是说,如果非洲人的行为在距今约100,000年之前被外星人灭绝,那么在某些时候类似于 智人 文化生产的创造力和快速性最终将出现(很可能以后,但可能更早!)。

这并不意味着我认为人类在地球上是不可避免的。 对于大多数 这个星球生命的历史是单细胞的。 我并不认为地球上的生命可能由于复杂生物出现之前的天文学事件而达到其“出售”日期的说法是不可信的(实际上,据我所知生命即将结束〜未来十亿年 由于Sol的能源产量持续增长,而不是在Sol变成红色巨人的将来约4亿年。 但是,一旦出现复杂的生物 看来,进一步的复杂性是不可避免的。 这是理查德·道金斯(Richard Dawkins)在 祖先的故事 仅基于描述性记录。 但是,复杂生物的出现是否必然带来了技术物种的进化? 我不这么认为。 它花费了500亿年的时间(似乎没有形成煤炭资源) 亿万年前 在人类之前被窃听)。 如果有足够的时间,显然一个技术物种将会进化(例如,将评估时间延长至1万亿年),但请注意,地球只有约5亿年。 智人 在该间隔的最后20%到达现场。

在这里,我假设至少要在5亿年的时间跨度内发生两个不太可能或不可避免的事件,这些事件将导致一种高科技和文化物种:

–多细胞生命的出现

–血统倾向的出现 智人

一个 智人 在非洲以外的地区发展和壮大我怀疑,在这个星球上,某种技术文明的形式变得不可避免。 我们在自己更新后的短时期中看到了并行性。 在过去的10,000年中,多个人类社会从狩猎采集者转变为农业主义者。 新世界文明的经验尤其表明,人类的普遍趋势是真实的。 不仅是“改变游戏规则”的文化形式,例如农业和 文化 在全新世期间独立发明,但它们是 不能 是在较早的间冰期之间发明的(至少有可能)。


胡夫,尼古丁,奥古斯都和拿破仑

为什么不? 好吧,考虑一下 旧石器时代的文化风度,这可能会持续数十万年! 我怀疑其中有些是由于生物学。 但是,即使在全新世时期,我们也确实意识到随着时间的流逝,文化变革的发展速度越来越快(即,至少文化变革一直在加速,加速的速度本身可能还在增加!)。 考虑到古埃及的文明至少跨越了2,000年。 尽管存在明显的差异,但古王国埃及与亚述和波斯征服之前的最后一个王朝之间的连续性对我们来说非常明显,而对古埃及人来说也很明显。 相比之下,距奥古斯都罗马有2,000年的历史。 这里的连续性也很清楚(例如罗马字母),但是文化上的变化也很清楚(如果您想说早期和现代时期是 自成一格,从奥古斯都罗马到新古典文艺复兴时期的1,500年时间与古代埃及参考文献*相比仍然形成了鲜明的对比,尽管后者采用了前者的形式。

到目前为止,我专注于时间的垂直维度。 但是在人参家族树的各个分支上也有横向施肥。 这 穴居人元素的混合物 进入非非洲国家已经开始 最近被广泛接受得益于考古学和基因组学在古代DNA领域的融合。 即使人们拒绝了尼安德特人掺和物的可行性,仍然必须解决这些结果之谜。 需要脱离一个简单的模型 来自少数非洲人口的人类最近的独家血统。 也有与其他混合的提示 太平洋边缘的古风非洲内部.

直到最近,人们普遍认为现代人类是我们自己的血统, 有一些特殊的天才 这使它可以扫地并熄灭我们的堂兄。 卢克·乔斯汀斯(Luke Jostins)的情节的定性结果是已知的。 其他人参家族谱系也表现出脑病。 实际上,一个奇怪的事实是,尼安德特人平均具有比解剖学上现代的人更大的颅骨能力。 但是现实仍然是 我们更换了它们, ERGO,我们必须有一个特殊的天才。 直到尼安德特人与现代人类之间没有区别 在涉及必要的基因座上 (如果还不够的话)这种特质是使“我们”与众不同的主要原因的语言能力。 但是现在我把“我们”放在引号中。 数据确实表明,在过去的100,000年中,非洲或近非洲人口中非非洲人的血统急剧下降。 但是,“古老的混合物”并非微不足道。 什么是 他们 ,那恭喜你, uswe 变成了什么 他们 可能已经。

两个多世纪以来,西方一直在争论 单基因和多基因。 前者是人类从一对或一对人口中衍生的地位(前者是标准亚伯拉罕模型的直接概括)。 后者的立场是,不同种族的人类起源于不同的原始人类,或者,对于基督教多元论者来说,只有欧洲人从亚当和夏娃世袭而来(其他种族是“非Adamic”的)。 这种冲突的回响一直持续到现在。 “走出非洲”的许多早期游击队员声称,多区域主义的拥护者是后来的多基因主义者(并非没有充分的正当理由)。 一些案例).

但是,一元论与多元论之间的冲突并不是现实在我们眼前揭露的恰当框架。 在现代人类的创造中,我们看到的是一种具有多元遗传学风味的单基因基础。 在过去的200,000年中,现代人类从很大程度上从非洲人口的增长而来。 但是在边缘,还有其他的祖先线和细丝,它们将不同的种群与谱系联系起来,这些谱系从主干中分离出的时间很早。 在我们自己的年龄之前,至少有几十万年,也许是一百万年。 今天,基因组学使我们能够利用统计能力从不稳定的“走出非洲”的叙述中提取出这些不一致的信号,但是如果在不久的将来我们偶然发现越来越多的“长分支”,而引人注目的数量较少,我将不会感到惊讶。 掺混物可能是人参家族中一个古老而持久的故事,此时只有最近的大量分离和杂交才引起人们的注意和好奇。

这是什么意思呢? 为何我将近代自然历史与相对较近的古人类学相提并论呢? 让我们从两个命题开始:

–尽管有一定的前提条件,技术文明是不可避免的,但它是不可避免的,极端复杂的情感的外在表现。 智人 在合理的时间内将其概率提高到了约1.0)

–极端复杂的情感并非是特定排他性的垄断,而该排他性是来自特定前辈的天才

约翰法雷尔 指出罗马天主教会在人类起源的新模式中可能存在的问题。 但是天主教只是一种更普遍的人类思想的反映。 世俗的或虚构的后裔群体在人类的想象中占了很大比重。 这 进化论 因为这不是很难解释的,但是我们在许多不同的领域中选择了亲属关系的重要性。 像进化一样,人类的文化形式只是简单地利用已经存在的东西,并对其进行改造和修改以使其具有品味。

那人类为什么如此特别? 人类为什么拥有不可剥夺的权利? 我们中的许多人可能不同意我们是亚当夏娃的后裔的主张,因此我们被赋予了永恒灵魂的神圣恩典。 但是,在许多不同意罗马天主教会主张的思想家的假设中可以找到这种逻辑的暗示。 最近我听了 雪莉特克 反对依赖“机器人同伴”,这些同伴可以向那些缺乏同伴关系的人(例如年老体弱的人)展现人类情感的真实性。 尽管Turkles的论点并非没有根据,但她的某些论点的形式是“他们不是我们,他们不是真实的,我们是真实的。 那很重要。” 确实是这样 现在,但是会永远这样吗? 这个“他们”和这个“我们”是谁? “真实”是什么意思? 情绪是一种神秘的人类特质,会被那些从亚当,字面或隐喻中脱颖而出的人所掌握吗?

If 出现了非人类情感成为现实的情况,它们是否具有与我们相同的权利? 尽管从数量上来说,差异是根本的,但我认为我们知道答案: 他们 ,那恭喜你, 他们的方式人类 ,那恭喜你,,而不是他们祖先的方式。 在当今人类生命之树中,具有不同血统的混合物的“污点”并没有导致 更新我们对人权的理解。 那是因为我们都是亚当的孩子,或是亚当的后裔 线粒体前夕,是我们理解人类权利以及人类是什么之后的事实依据。 这是一种特殊的生态位,是一种存在的方式,而不是谁从某个特定的人或某些人的生物学关系中堕落而来。

*可以追溯到公元6世纪,古王国埃及的文化基础一直以活化石的形式存在于Philae的神庙中! 因此,有3,500年的文献连续性。

图片来源:来自的所有公共领域图片 Wikpedia

 

去年八月,我发了一个帖子, 点突变造就了人类,这表明将尼安德特人与大约 35,000 年前吸收并取代他们的非洲人类之间的差异视为特定基因的极端差异可能是错误的。 我被提示这种思路 斯万特·派博(SvantePääbo)承认他和他的同事正在寻找现代人类基因组中与尼安德特人有很大不同的位置,以此作为我们可以了解是什么使我们与众不同的方式。 这种方法源远流长。 过去一代黑猩猩遗传学和现在的基因组学的大部分内容都专注于寻找将我们与最亲近的亲戚区分开来的神奇本质。 因为我们对两者之间的巨大表型差异的看法 智人平底锅穴居人 有些人认为 95-99% 的序列水平同一性令人困惑。 因此,出现了一些模型,这些模型吸引了基因调控和表达,或者可能是其他形式的变异,例如拷贝数,以阐明黑猩猩和人类为何如此不同。 撇开这一点不谈 知觉 差异可能有一些以人类为中心的偏见(即,一个外星人是否会认为黑猩猩和人类实际上在系统发育相似性方面存在惊人的不同?我不太确定),从表面上看似乎并没有不合理探寻基因组的深度 原始人 以确定它们的表型分化的来源。

但是这个模型能否用于区分不同的 人族 血统? 显然会有数量上的差异。 黑猩猩和现代人类之间的距离大约是 5 万年。 尼安德特人与现代人类(或至少现代人类的非洲祖先约 50,000 年前)之间的距离约为 500,000 年。 我认为,一个数量级的差异应该让我们重新考虑两个群体之间固定差异解释表型差异的合理性。

 

回顾一下,为什么我们认为尼安德特人和现代人之间可能存在固定的差异? 论点,如书中所述 人类文化的曙光, 就是它 智人 是一个非常特殊的血统,其多变的文化灵活性使其能够席卷所有其他人类姐妹血统的领域。 一些可能性 混合物 撇开这些“死胡同”的血统不谈,这个粗略的模型似乎经受住了时间的考验。 考虑到 穆斯特里安 技术持续了近 300,000 万年,而 Oldowan 坚持了1万! 相比之下,我们自己的物种似乎转变和改进文化风格的速度要快得多。 行为现代性 确实指向了一个真实的现象。 许多学者的假设是,存在一种遗传差异,这使得现代人类能够表现出我们所理解的语言的多样性和灵活性。 由于现代人和尼安德特人拥有相同的 福克斯2,该基因座似乎与许多脊椎动物谱系的声音和听觉能力的提高有关。 而且,如果欧亚大陆约 2.5% 左右的现代人类血统和巴布亚近 10% 的现代人类血统来自“古老”血统是正确的,那么我认为这应该减少我们对这些人类与现代人类有多么不同的估计。非洲人。

因此,您可以假设尼安德特人/现代人类和黑猩猩/现代人类之间的两种程式化对比场景。 在一个模型中,两种比较之间的差异基本上是程度。 尼安德特人和黑猩猩仍然与现代人类脱节。 也就是说,特征没有重叠。 但是,尼安德特人更接近现代人类,正如从系统发育关系中所预料的那样。 另一个模型是尼安德特人和现代人确实不同,但有很多重叠之处。 这是一个与黑猩猩与人类有质的差异的模型。 如果第二个模型是正确的,而且我认为根据我们从尼安德特人基因组计划中了解到的一切,应该更加认真地对待它, 然后寻找等位基因频率的不相交的成对差异并不是理解两个人类谱系如何在表型上分歧的方法。

在有大量重叠的第二个模型中, 分布的尾部仍然存在差异。 在我之前的帖子中,我的想法是,当谈到文化差异时,尼安德特人和现代人之间的差异就在这些尾巴上。 我想人们可能想知道米开朗基罗或尼安德特人的巴赫在哪里, 但随后必须观察到,绝大多数现代人不是米开朗基罗或巴赫! 向行为现代性过渡的主要迹象之一是象征主义的扩散。 但是,我们是否可以假定旧石器时代部落的每个成员都同样具有创造性的精湛技艺? 我认为可能不会。 可能事实上绝大多数“现代人”与所有尼安德特人在我们可能期望在这两个谱系中有所不同的事情上并没有什么不同。 相反,可能是一小部分现代人在表型分布的边缘跨越了一个特定的阈值,当这种转变发生时,世界就不再一样了。


朱利叶斯·凯撒

我在这里并不是说大约 50,000 年前非洲人类的胜利归功于艺术家。 我的提议是,在某个时候出现了大量的杰出人士。 这些人具有特殊的特征,但这些特征并没有使他们被抛弃,他们所拥有的品质被他们的人类同胞视为伟大的标志。 简而言之,他们是人类中的神之子。

或者也许是恶魔。 亚历山大、拿破仑和希特勒等人都具有独特的魅力,但他们是好是坏是一个争论和观点的问题。 关键不是他们取得了伟大成就,而是他们是许多事件的催化剂。 作为具有超凡魅力的领导者,他们收集了人类的集合,并将它们用于他们的目的。 个人变得不仅仅是他们各部分的总和,并且有一段时间表现出几乎有机水平的凝聚力。 尽管在前现代世界中谁赢得战争的首要预测变量是简单的数字之一,但组织和结构也很重要。 罗马军团在一个 睾丸形成 由于该单位表现出协同作用,并将凝聚力转化为有效的收集行动,因此可以击败更多的野蛮人的攻击,这些野蛮人的人均身体更强壮。 这不是自下而上发生的,而是需要一种人格类型,一个天才,作为纽带或轨迹。

我当时想到的模式是非洲人类面对他们的近亲,而不是一对一的模式。 相反,在具有超凡魅力的领导人的指导下,旧石器时代的自大狂被狂热的噩梦和非理性的梦想所驱使,他们战胜了许多敌人,这些敌人作为一个有凝聚力的社会机器作为单一的总和而战斗。 这不是因为他们在单位基础上优越,而是因为他们在每个部落基础上都优越,由将许多人转向自己的野心的个人驱动。 凭借优越的社会组织的杠杆作用,少数人推动了世界,横扫了它。 他们的东方在地平线上经历了多少次疯狂的航行 巽他大陆 在一个部落最终登陆之前 Sahul? 有多少部落在极北的冰层中丧生,最后一些部落最终到达了白令大陆? 为什么人类要越过地平线,冒险越过黑色的水域? 也许只是因为他们可以。 这个答案可能让今天的许多活着的人感到困惑和不安,也许这让更理性和头脑冷静的“古代人”感到不安,他们面对着所有反对的非洲人类的狂热组织精神错乱。 但这些疯狂的人今天仍然在我们中间活动,他们仍然是好奇、恐惧和崇拜的对象。

这是一个疯狂的模型吗? 是的,有点。 但是,它真的比模型更疯狂吗?有一个突变可以概括人与兽人的所有区别? 我想不是。

 

埃德勇 有一个好 好评 尼安德特人新的渗入/混合纸在 PNAS。 它还没有发布在网络上,所以让我引用Ed:

即使成功杂交的几率只有5%,尼安德特人的基因仍将构成当今人类基因组的大部分。 事实是,缺乏可行的性行为解释了为何尼安德特人的线粒体DNA都没有进入现代人类,以及为何其主要基因组如此之少。

Currat和Excoffier建议,现代人和尼安德特人都不经常发生性行为,或者他们的杂种并不十分适合。 他们赞成第一个想法。 根据他们的模型,古代人类和尼安德特人之间只需进行197至430个联络,就可以用尼安德特人的DNA填补现代欧亚基因组的1-3%。 考虑到两组可能相互作用一万年左右,一个人每隔10,000至23年就睡一个尼安德特人就足够了。

从我在评论中收集到的信息,这是由于以下事实:如果出现一波预付款,则每预付款单位中很少的掺混物会相当快地积聚。 我认为这很容易表达 而非 空间的 条款。

例如,让我们想象一下现代人类的人口膨胀为尼安德特人的人口。 最初的推送之后,原始源种群不再有任何贡献,因此随着时间的推移,您将发生一系列混合事件。 假设每代混合5%,这是30代或750年后发生的“原始血统”的稀释:


不过,需要仔细检查Ed Yong帖子中概述的模型。 毫无疑问,各种假设都可以引起争议。 尽管我认为我接受最终结果完全合理。

 

史蒂夫·许 为我指明了方向 “纽约客” 关于科学和人格 斯万特·派博(SvantePääbo)。 个性部分包括对帕波的双性恋的引用,在我看来,这似乎是从字面上落入了散文中来为其增添趣味。 当然,这是我发现有趣的科学。 双性恋比异性恋科学家多得多。 然而,就像以往的许多研究人员一样,按照我们的理解,Pääbo似乎正在寻找使人类与众不同的基因(如果报告是准确的,我不认为这是给定的)。 有一些有趣的诱人线索。 一些与自闭症有关的基因似乎表现出尼安德特人与现代人类的差异(尼安德特人携带自闭症相关的变异体)。


但这是一个考虑因素: 如果尼安德特人和现代人类之间存在一系列不相交的特征的前提是错误的,那该怎么办呢? 我在这里说的是,一个物种内具有固定的和普遍的特征,并且完全区分物种 x 来自物种 y。 从解剖学和行为上看,现代人类似乎都是格外奇怪的生物。 如中所述 “纽约客” 这一血统是造成许多大型动物灭绝以及推向大洋洲和新世界的原因之一。 但是我们是否必须假定,在行为上现代人类与其他人类谱系之间的区别所具有的任何特征在所有前者中都是普遍的而在后者中却是完全不存在的? 差异可能不是质量/种类之一,而是数量/程度。 换句话说,一种特别新颖的人格类型可能已在约50,000年以前转变为新非洲人的临界质量,但这种人格类型可能并不普遍,甚至在其他人中的出现频率也较低。人类的分支。

如果假设上述主张,那么寻找“造就人类的基因”的探索将变得更加困难。 您不仅可以将几个尼安德特人与人类进行比较,还需要更多尼安德特人的样本。 那是因为可能没有一个人类基因,而是许多遗传和文化变化的微妙复合体,这些变化已在临界点过渡。 还请记住,这可能是统计遗传学的本质 一些 尼安德特人与现代人类在总体上存在差异的基因座,但是只有当您假定某些基因使所有现代人类成为人类,而所有尼安德特人都不完全是人类时,这些基因才是“使我们成为人类的基因”。

具体来说,如果具有远见卓识的神秘领袖的原型对现代人类的独特性负有责任,该怎么办? 这不是一个普通的人,但并非罕见。 大多数人不是特别有远见的人,也不容易产生神秘主义。 尼安德特人与行为现代的人之间的差异也许在个体水平特质的群体差异之间的差别不大,而事实比尼安德特人根本没有行为现代人所拥有的领导干部要重要。 在这种情况下 大多数现代人就像尼安德特人一样,缺乏远见,动力和近乎疯狂的精神。 尼安德特人不会拥有亚历山大大帝,但也许他们不会拥有阿道夫·希特勒。

 

埃文·卡拉威(Ewen Callaway)对过去一年中古代人类基因组学的发展趋势进行了很好的调查 自然, 古代DNA揭示了人类历史的秘密。 它不是收费的,所以请阅读全文。 对于本博客的密切阅读者而言,大多数内容都不会太令人惊讶,但是这部分是新的:

通过比较多个现代人类基因组中的单个DNA字母与尼安德特人基因组中的字母, 现在,将这种杂交的日期定为65,000–90,000年前。 来自加利福尼亚大学伯克利分校的理论遗传学家Montgomery Slatkin和Anna-Sapfo Malaspinas在26月30日至XNUMX日于日本京都举行的分子生物学与进化学会会议上介绍了这一发现。

斯拉特金说,他们的结果与会议上提出的另一项研究结果相符,该研究来自马萨诸塞州波士顿哈佛医学院的遗传学家戴维·赖希(David Reich),他参与了对尼安德特人和丹尼索娃基因组的测序。 这些日期还与考古发现相吻合,记载着人类早期从非洲迁徙到大约50,000到100,000年前。 Reich的团队现在正在开发工具,以寻找人类抵达亚洲和欧洲后可能发生的新近杂交的迹象。

请记住,尼安德特人混合物似乎存在于 所有非非洲人。 在现代人口多样化之前,这很早就钉住了混合事件。 在具有较大置信区间的会议上,我不会为任何一个值分配太多的存货。 据我所知,明年将有更多关于混合时间的统计遗传推论,但是如果有一件事情表明,由古代DNA构建的基因组的巨大产量使我相信,我们应该对结果保持谨慎的态度。由于时间紧迫,因此无法轻松进行交叉核对。 在2010年之前,我阅读了许多高级团队的论文,这些论文涉及基因组证据如何暗示现代人类谱系与古老谱系之间没有混杂,并赋予了它们很大的分量。 从现在回到过去,只有这么大的力量。

 

一些人向我指出了最近的一篇论文 科学, 从尼安德特人到现代人的过渡,西欧人口增长了十倍。 基本结果是显而易见的,而不是完全革命性的: 解剖学上的现代人类可能只是从人口统计学上吸收了尼安德特人 (“吸收”一词在这里显然有很多含义)。 该结果在此图中很清楚:

这并不奇怪,尽管我对古生物学的胆识只有一眼的了解,但我知道,有很多推断性的证据表明,尼安德特人从任何给定领土上提取资源的效率都不如现代人类。 在 人类文化的曙光 古人类学家理查德·克莱因(Richard Klein)提供了直接的生物学解释,解释了为何新非洲人口如此迅速地边缘化尼安德特人: 某种允许语言的宏观变异,以及人类文化的蛋白质灵活性。


隐含地,这是传统的观念,直到 尼安德特人混合的可能性 被发现,更早的事实是尼安德特人似乎分享了 福克斯2 变体(“语言基因”)。 早期使用mtDNA进行人类人口统计学的推论,以及后来从mtDNA进行古代DNA提取,似乎也与以下观点相吻合:现代人口在其整个范围内对尼安德特人进行了干净的替代(Y和常染色体结果支持了这一点)。型号)。

事后看来,这些早期的遗传学方法可能根本就没有能力抽出少量水平的常染色体混合物。 单亲世系有波动和迅速灭绝的趋势,因此现代人口中尼安德特人世系的缺乏可能是更广泛的趋势的一个具体实例,从而使绝大多数远古的祖先世系被消灭。

那么,新非洲人拥有什么样的吸烟枪,可以使他们富有成果并繁衍呢? 在世界各地,大量的人口同化是显而易见的。 出于某种原因,“非洲以外”模型在形态学和遗传学上都得到了广泛的支持。 新非洲人不仅在其他人族血统占主导的北部和东部景观上蜂拥而至,而且正在向其他领土迁移。 这是相当卑鄙的壮举。

但是今天,我认为我们需要重新审视尼安德特人在深度物种层面上与我们在质上有别于我们的观点,并且需要有一支吸烟枪来解释这一切。 那是因为我认为我们有很多情况下发生了与尼安德特人规模更大的更新和同化。 在新世界中,欧洲人和非洲人取代并吸收了许多生态上合适的地区的土著人口。 在多米尼加共和国这样的地方,土著血统确实维持在较低的水平,尤其是在mtDNA中,但在具体(相对于象征)意义上,不再具有显着性或与文化相关。 这些旧世界人口与土著人口之间存在重大的生物学差异,主要与疾病易感性有关。 尽管如此,我们仍无法将新人群的生物学优势与其文化背景区分开。 只有随着农业的发展,非洲人对疟疾的抵抗才开始盛行,因为广阔的荒野被清除并变成了农田,这对于传播病原体的蚊子来说是一个优越的环境。 同样,欧洲人被保住的各种传染病也通过远距离接触传播,由于出现了真正的病原,在新大陆上,欧亚病的规模可能达到新世界无与伦比的水平。 紫丁烯.

哥伦比亚交易所 隐约可见的部分原因是它有充分的文献记载并涉及欧洲人,但来自西班牙的遗传,语言和考古数据 东南亚 强烈暗示,大陆和海域的古代狩猎采集者已经被中国南部边缘的连串农业潮所吸收。 现在也有证据表明, 欧洲印度 由于农民的传播。 如果外星考古学家检查了数据,我认为他们可能认为这是生物物种形成的事件,这可能可以解释这一点,因为出现了新特征,使农业人口得以扩大并取代了狩猎采集者。 其中一些实际上是直接可行的。 考虑 乳糖酶持续性的扩散 或农业人口消化的能力 直链淀粉。 但是我们也不应该忽视 生物行为随时间的变化。 去年,我读了有关澳大利亚原住民文化史的文章,由于传教士对波利尼西亚,美拉尼西亚和澳大利亚的不同经历而感到震惊。 在前两个案例中,共同的策略是had依“大个子”,从而立即占领了整个人口。 这在澳大利亚根本没有产生,在澳大利亚,传教士们不得不针对更细粒度的目标,因为单个乐队的成员很容易以为他们的领袖如果converted依基督教就发疯了。 这些乐队的领导者没有社会资本来强制进行集团层面的文化变革。 相比之下,波利尼西亚和美拉尼西亚的人口在数千年来的结构和组织(例如农业)上有很大的不同,这比澳大利亚的自上而下的要多得多。 可能不仅是深层的价值观有所不同,而且由于性格的现存变化,由于文化选择,平均人格也可能发生了变化。

如果有一个 大跃进 要追溯到大约40,000年前的行为现代性,那么我认为应该从逻辑上断言,大约10,000年前,中东有了第一批农民,这是另一个“巨大的飞跃”。 大约5,000年前,随着发明的发明,还有另一个“巨大的飞跃”。 大约300年前,随着真正的科学共同体的结晶,西欧出现了另一次“大跃进”。

我并不是在暗示一万年前发生的是物种形成事件。 我的建议是 过去的过去可能比我们想像的更遥远的过去。 这使得近距离的过去更具异国情调,而远距离的过去则具有异国情调。

 


图片来源:ICHTO

最近,有关“尼安德特人与人的交往”的消息突然出现在我的Google新闻提要中。 如果您是普通读者,您会知道我很喜欢这种“荒诞事物”的特殊组合。 但是快速浏览 新闻稿 告诉我这是一篇论文 我已经审查了它在网上发布的时间 一月。 我什至用纸上的结果 确认 尼安德特人外加剂 在我自己的家庭中(我们都有基因型)。 我的兄弟姐妹之一实际上是 半合子 在有关地点的尼安德特人等位基因上! 我想这表明了新闻稿对媒体的影响。 我要提供的解释是,这只是表明更受人尊敬的新闻界不希望接触没有印刷的纸张,但是当他们愿意大肆宣传甚至在会议上展示的东西时,这并不是一个很好的解释。较早的阶段。

我注意到的第二个方面是,除了 罗恩·贝利(Ron Bailey) at 原因 所有 文章 使用彩色爆头的照片使用深色重建,例如这里的史密森尼模型。 但最新的研究(可追溯至2007年)似乎表明, 尼安德特人的色素沉着程度可能很高。 当人们认为他们在北半球的气候中居住了数十万年时,这并不奇怪。

但是,来自研究领域的研究人员有一些新的花絮:

麻省理工学院和哈佛大学博德学院的尼克·帕特森说:“毫无疑问,由于与我们的祖先和尼安德特人交配,所以存在这种单倍型。” Patterson没有参加最新研究。 他补充说:“这是一个非常不错的结果,进一步的分析可能有助于确定更多细节。”

哈佛医学院遗传学家戴维·赖希(David Reich)补充说:“ 拉布达(Labuda)和他的同事们是第一个发现非非洲人遗传变异的人,这种遗传变异很可能来自古人口。 这完全没有尼安德特人的基因组序列,但是根据尼安德特人的序列,现在很明显他们是绝对正确的!”

现代的人类/尼安德特人组合很可能使我们的物种受益,使其能够在尼安德特人以前适应的严酷寒冷地区生存。

Labuda总结说:“变异性对于一个物种的长期生存非常重要。” “除了基因组外,其他任何东西都可以丰富。”

自从Nick有时在这里发表评论以来,我可能应该问他一月份他对这些结果的看法,但这表明我并不像新闻记者那样思考。 然而。

 

更新: 约翰·霍克斯(John Hawks)的实验室在同一地区工作,并且 他不同意这里提出的具体结果。 始终提醒您注意会议上的性感表演! (有人应该学习!)

如此宣称 彼得·帕勒姆(Peter Parham)英国皇家学会 上周开会 遗传,免疫力和感染揭示了人类的进化,迁徙和历史。 您实际上可以听 通过下拉mp3文件进行交谈。 要了解有关人类进化和基因渗入的部分,请跳至24分钟。

这是一般的草图: 看起来欧洲人中约有50%的HLA I类等位基因来自尼安德特人,东亚人中约有70-80%的HLA I类等位基因来自Denisovans,而巴布亚人中约有90-95%的HLA I类等位基因来自Denisovans。 如果你记得, 非非洲人的〜2.5%的总基因组含量似乎是尼安德特人,而 巴布亚人的总基因组含量的约5%似乎是Denisovan。 总基因组含量的比例是粗略估计,其中可能会有一些回旋余地。 但是您可以看到,根据这些古老的欧亚血统的HLA等位基因混合估计值要大一个数量级。 为什么?


帕拉姆(Parham)竭尽全力指出,等位基因谱系的本质上存在重大区别,这些等位基因通常受到中性动力学的影响,而那些已经被选择。 这 HLA 该区域是人类基因组中最多态的区域,这是由于这样一个事实,即平衡选择可保持多样性(长期来看,很可能是通过负频率依赖性实现的)。 大概这是一个人想到的选择目标 红皇后假说 就病原体-宿主免疫系统的协同进化而言。

在演示文稿中,很明显,这些研究人员分析过的某些HLA单倍型似乎有些偏离。 他们“看起来”好像在冒犯。 已经有 证据 在其他基因上。 但是,借助古代尼安德特人和丹尼索瓦人的初稿序列,学者们可以检查一下,通过将它们与实际测序的古代DNA进行比对,是否可以证明古代和新非洲血统之间的混合推理。 在某些情况下,他们做到了。 在其他情况下,推论是错误的(或者,古老的基因渗入来自尚未排序的世系)。 在这种情况下,帕拉姆(Parham)报告说,他的研究人员发现,在欧亚大陆东部和大洋洲以较高频率发现的等位基因似乎来自与丹尼索瓦人相同的血统。 有趣的是,他还补充说,欧洲人在HLA I类场所混合了约50%的燃料。 如果我正确地听取了帕拉姆的话,那么与人类进化史有关的要点有两个:

–东亚人有 德尼索万 等位基因,当他们没有Denisovan血统时

–他们没有 尼安德特人等位基因,当他们有尼安德特人血统时

–巴布亚人对于Denisovan等位基因几乎是固定的,并且缺少尼安德特人之一

这就是为什么“渗入”是关键的原因。 我们不是在说简单的混合物。 相反,混合后是选择,是清除引入等位基因的负选择,还是增加等位基因频率的正选择。 我们已经看到了最近可能发生的与基因渗入有关的情况 肌营养不良蛋白等位基因。 这更加令人兴奋,因为HLA等位基因具有明确的功能相关性,并且已知是自然选择的目标。 如果通过渗入进行适应,这将是关键候选区域之一 先验。 此外,由混合估算值推断出的与预期的偏差是如此之大,以至于您不得不怀疑选择是否是造成这种功能相关基因座差异的原因。 在东亚情况下,如果这些结果成立(而且我正确地听到了帕尔曼的话,那么东亚人将 德尼索万 变体),您会看到一种情况,即混合物的水平太低以至于无法检测到,但是自然选择会通过扩增渗入的等位基因的频率来保留混合物的特征。

在他的演讲总结中,帕尔曼就尼安德特人和德尼索瓦人的变种可能对新非洲人的有用性提出了许多很好的观点。 首先,如果遇到瓶颈,则可能缺少大量的HLA等位基因。 由于在该场所需要多样性来对抗病原体,因此混合可能就像注入突变一样,这些突变已经被预先选择以具有高度的实用性。 其次,欧亚人类的素可能很好地适应了当地的欧亚病原体。 东亚人的尼安德特人血统(〜2.5%)比德尼索万(〜0.0%)要快得多,但在这些人群中,丹尼索万HLA I类等位基因更为明显。 尼安德特人和Deninsovan变体适应欧亚大陆地区特有的不同病原体!

最后,特别鸣叫 格雷格·科克伦(Greg Cochran)约翰·霍克斯。 自2005年以来,他们就一直在与我谈论渗入作为与人类进化相关的概念,因此其中许多发现都不足为奇。

 

詹姆斯·温特斯先生在 复制错字 为我指出了一个简短的假设文件, 尼安德特人与人类的杂种。 本文认为,尼安德特人的雄性与最近离开非洲的人口中的雌性进行选择性交配,结合 霍尔丹定律,解释了三个事实:

–现代人缺乏尼安德特人Y染色体谱系。

–现代人缺乏尼安德特人的mtDNA谱系。

–尼安德特人常染色体祖先在现代人类中可能存在。

如果您不知道,Haldane的规则基本上表明, 异配性。 在人类中,雌性是同配子,XX,雄性是杂配子,XY。 故障不一定是死亡(或自然流产)。 可能是不育的(例如,导致精子鞭毛功能失调的某种突变或遗传不相容会导致这种情况)。

所以你有一个场景 仅由 尼安德特人的雄性与南方的入侵群体杂交。 这些配对中的杂种将缺乏尼安德特人的mtDNA,因为mtDNA仅从母体传出。 但是雄性后代将具有尼安德特人的Y染色体。 这就是霍尔丹的规则所在: 这些雄性依次繁殖。 因此,只有雌性杂种会遗传它们的基因。 这些雌性显然不通过Y染色体。 并且,他们将传承其非尼安德特人母亲的mtDNA。


显然,这使得 逻辑意义上。 我如何判断呢? 这取决于其他选项以及上述模型的移动部分的概率。 关于霍尔丹规则在尼安德特人与非尼安德特人的配对中有效的想法,我的主要问题是: 这两个血统都没有分开很长时间。 作者为最近的共同祖先付出了约250,000万年的时间。 让我们加倍。 那仍然不是很大的分歧。 几年前,我读了一些关于哺乳动物杂交的文章。 有很多直接的原因与妊娠有关,为什么这是我们的血统而不是鸟类的问题,例如,在您的最后一个共同祖先生活过的物种之间存在可行的杂交实例 数千万 过去的几年。 但这并不一定说明霍尔丹的统治问题。 生育问题往往在数百万年而不是数十万年左右出现。

无论如何,替代方案如何? 对mtDNA和Y染色体谱系可能存在某种选择性偏倚。 这可能是直接生物学的。 想象一下,尼安德特人的mtDNA与某些疾病相关,且身体不适。 作者提到了这类问题。 但这可能是社交的。 在整个拉丁美洲,混合种族人群中的美洲印第安人Y染色体谱系已经被批发替代。 实际上,您在欧洲Y染色体谱系+非欧洲mtDNA谱系的许多社会中都有复制,并且常染色体有所不同(例如,在墨西哥,常染色体是平衡的,在阿根廷它主要是欧洲的)。 还有一个问题是,由于与常染色体相比有效种群规模较小,因此mtDNA和Y染色体谱系受到更剧烈的随机动力学影响。 常染色体是父母双方共同贡献的组合,但单亲世系仅从一个传承。 相对于mtDNA谱系的传播,雄性是完全死胡同,因为它们没有传递,而雌性自然没有Y染色体。 尼安德特人的mtDNA和Y谱系可能已经灭绝,如果它们是目前人口中约30,000年的一小部分人(这是“固定”并替换所有其他谱系的概率与它的比例成正比的话)时间频率 t 0)。

但是,对我而言,真正的主要问题确实是尼安德特人与非尼安德特人之间混合不相容的合理性。 在尼安德特人-非尼安德特人掺和物的证据出现之前,这是一个普遍的想法,基于与其他哺乳动物的比较,我开始对此表示怀疑。 但是现在我们有了更详尽的遗传数据。 左边是补充表 西伯利亚Denisova洞穴中一个古人类素族的遗传历史。 它显示了自成对种群之间最后一个共同祖先以来的时间(F =法语,其余各行与各列相同)。 我不会约会 严重地。 我要指出的是,尼安德特人和其他人口之间的最后共同祖先甚至没有比非洲人和非非洲人之间的相乘因子大。 这些特定的估计值在其幅度的细节上可能是错误的,但是我认为在我们同意混合不兼容的可能性之前,我们需要考虑极高的可能性,即尼安德特人几乎没有我们所想像或曾经想像的差不多。

以下视频仅用于娱乐目的:

 

线粒体DNA与人类进化:

通过限制酶切图谱分析了来自五个地理种群的147人的线粒体DNA。 所有这些线粒体DMA都来自一名女性,该女性被假定在7年前住了很久,可能在非洲。 除非洲人口外,所有接受调查的人口都有多个起源,这意味着每个地区都被反复殖民

因此,1987年发表的这篇论文在公众心目中确立了 线粒体前夕,这引起了一个著名的 封面照片 in “新闻周刊”。 这也导致了 夏娃之子 PBS纪录片NOVA中的情节。 这是摘要:

NOVA研究了一个有争议的理论,该理论将我们的血统追溯到300,000万年前生活在非洲的一小部分妇女。

As 米尔福德·沃尔夫夫(Milford Wolpoff) 曾抱怨将纪录片描述为并非特别“公平和平衡”可能是正确的。 线粒体夏娃可能一直是有争议的,随后受到分子时钟校准问题以及对枝状图的虚假解释的困扰,但历史的潮流已经到了这一步,PBS正在讲述这个故事。 这个故事不仅是一门主要的科学,而且还必须根据辩论来理解这一争议。 其中 古生物学家和 之间 古生物学家和分子生物学家。 一群研究人员,由 克里斯·斯金格 仅仅基于化石就主张了现代人类最近来自非洲的起源。 他们受到一所既有学校的挑战 多地区主义者 他主张建立现代人类的更深层次的根源,这种根源来自当地人参。 H。 直立人 非洲以外。 多地区主义者的观点是 选择性扫荡 我们所知道的,在整个人类的整个范围内逐渐形成了现代人类,这是特定的古代地方特征和跨种族特征的复合体,将我们统一成一个更广阔的整体。 斯金格(Stringer)和他的公司提出了一个更简单的模型,该模型在大约200,000年前的非洲出现了解剖学上的现代人类,随后扩展到世界其他地区,并在很大程度上取代了当地的人类素族。 在多区域主义中,尼安德特人成为人类,而走出非洲意味着尼安德特人被人类取代。


研究博客网站 分子生物学家步入了这片骨头的风光。 这里的关键数字是 艾伦·威尔逊,在1970年代,他从分子钟的证据中有力地争论了人类和猿类谱系的分离是古生物学家所不赞成的。 到1980年代,古生物学家普遍承认威尔逊等人的观点。 是正确的。 这次胜利后,他与他的学生丽贝卡·坎恩(Rebecca Cann)提出了线粒体夏娃理论。 威尔逊在这里卷入了有关古生物学的争论。 从我读过的所有材料中,威尔逊和坎恩都确信他们的技术优于老式的化石分析,这是沃尔普夫(Wolpoff)在NOVA上大声辩护的一种方法。 那些没有投资于最近人类起源的人常常不知道该如何辩论。 为了让您了解1980年代后期的情况,这里是Richard Leakey 重新考虑起源:寻找使我们成为人类的东西:

……在1970年代,我比大多数人更不愿意接受威尔逊和萨里奇的遗传学证据,支持最近(五百万年前)的原始人种,所以我认为这将是一个弥补这种平衡的机会。 在我的演讲过程中,我提到了线粒体DNA证据,并指出“我准备被它说服。” 我被分子生物学家和遗传学家所包围,我认为这样做是明智的选择,而且在科学上也是正确的。

因此,当我在演讲结束后的酒吧里,包括会议组织者Stepehen O'Brien在内的几位参与者弯腰对我说:“您不必吞下线粒体夏娃线时,我感到非常惊讶。 我们没有。” 史蒂夫和他的朋友们继续告诉我为什么他们认为夏娃的假设是不正确的……威尔森可能错误地估计了线粒体钟的频率,老年的线粒体可能是偶然丢失的,可能是由于局部化脓性疾病偶发性崩溃而引起的,自然选择可能已经支持了一些最近进化的线粒体变体,这消除了较旧的血统。 这些可能性中的任何一个都可能会误以为是最近出现的种群的印象……。

…1990年XNUMX月,米尔福德(Milford)和六名志同道合的同事在新奥尔良举行的美国科学发展协会年度聚会上组织了一次会议,其目的是“钉住这种线粒体夏娃废话”。 一位又一位的发言者为支持区域连续性和反对局部物种形成争辩提供了证据。 关于替代性解释……这是一次有力的演讲,并引起了很多媒体的关注,其标题为“科学家攻击人类进化的“夏娃”理论”和“最新发现说,人不欠夏娃一切”。 在会议的另一场会议上发言的克里斯·斯金格(Chris Stringer)将反夏娃研讨会描述为“强大的销售技巧”。 米尔福德的突击队之一,堪萨斯大学的戴维·弗雷耶(David Frayer)总结了对威尔逊工作的深刻反应:“化石是真实的证据。”

在1990年代,沃尔普夫(Wolpoff)出了一本书, 种族与人类进化:致命的吸引力。 它概述了现代人类起源的多区域主义框架,并提出了对过去人类古人类学的广泛回顾,而且在我看来,这种多区域主义者处于“历史的右侧”。 我曾经是,而且仍然是一个自然历史的书呆子。 特别是人类的自然历史书呆子。 我在1980年代和1990年代吞噬了有关该主题的书籍,看到科学记者从正统观念从多区域主义向非非洲模式的缓慢转变。 由于我没有参加比赛,所以这对我来说都不是一件值得关注的事情,但是,我确实注意到分歧是个人的,有时会被政治化。 种族与人类进化 似乎是为了部分驳斥多区域主义助长种族主义的观点而写的。 相反,沃尔普夫(Wolpoff)颠倒了叙事,将“非洲以外”的模型描述为种族灭绝和灭绝主义者,与之相反,他的人类模型却通过基因流共同向智者滑行。

当然,另一面是许多人把“非洲以外”表现为卓越的反种族主义。 从解剖学上讲,现代人类被描绘成人类世界的尤利乌斯·凯撒(Julius Caesar)的第二天。 他们来了,他们看到了,他们战胜了。 人类与非人类之间的鸿沟可能已经很大,但“走出非洲”模式更吸引人的方面是我们是新兴的孩子。 所有非非洲人都来自非洲人,是我们物种遗传多样性的储存库。 该模型的含义与当时的平均主义精神相吻合是很自然的。 这是 帕特·希普曼 在2003, 我们都是非洲人:

我不希望多区域假设的用户挥舞白旗,尽管他们已经失去了绝大多数支持者。 至少,该理论最热心的支持者之一沃尔普夫(Wolpoff)坚定不移地捍卫了他长期以来所拥护的假设。 尽管新的发现仍然有可能改变平衡,以支持多区域观点,但这种证据的一致性创造了有力的证明。 重塑这一知识领域需要许多新的化石和新的遗传研究。

总体来说,希普曼提出的论点对像我这样对骨头和石头不太了解的人很有说服力。 即使我 知道一些可能的连续性实例,mtDNA,Y染色体谱系和常染色体结果似乎大致符合要求。 在看到人类化石具有连续性的古人类学家之间的斗争中,当时给那些产生与“非洲以外”相符的推论的遗传学家“压倒性的决定”似乎是合理的。


格伦德尔

综上所述,必须指出,克里斯托·斯金格(Chris Stringer)等古人类学家并不认为 一定 更换非非洲人。 完全可以更换,但很多时候他们确实认为与前现代底材可能存在某种混合和同化作用。 但是,指向遥远世系之间的杂交的遗传数据很少(与最近的唯一共同血统相对),特别是一旦尼安德特人的mtDNA被证明是一个外群,似乎就把人们推向了现代人类成为人类的模型。完全不同的野兽,根本不会与过去的生物发生性关系。 在 人类文化的曙光 古人类学家理查德·克莱因(Richard Klein)为现代新非洲人类的独特性和独特性提出了一个学术上和可衡量的论点:

……“黎明”的最简单,最经济的解释是,它源于偶然的突变,促进了全人类的大脑……。早先人们一直认为解剖学与行为之间的遗传联系一直存在,直到完全现代的人们出现为止。 50,000年前假定的遗传变化促进了独特的现代能力,可以在几乎没有生理变化的情况下适应各种自然和社会环境。

可以说,最后一个关键的神经变化提升了现代人对快速口音语言或人类学家杜安·奎特(Duane Quiatt)和理查德·米洛(Richard Milo)所说的“一种完全发声的语言,具有语音化,句法性和无限开放性和生产性的能力”的能力。

沃尔普夫(Wolpoff)出事了。 即使最初的“走出非洲”倡议者并不打算这样做,也有一种趋势是从进化的“死胡同”的能力中删除“更高的才能”。 我们曾经 智人。 如果我们打算允许尼安德特人成为我们自己物种的一个分支,那么它们的亚种就很独特。 在现代人类非凡而普遍的方式上,它们比我们少。

这种正统观念可能会为受过良好教育的公众带来积极的反馈循环,其中包括我自己。 新非洲人类例外主义的“走出非洲”模式越是深入人心,就会使尼安德特人和其他人类血统变得更加动物化。 自然,多区域主义的连续性模型变得令人反感,因为连续性暗示了现代人类与次人类之间的联系。 整个人类血统中最大的颅骨运动是由 尼安德特人成为违反直觉的事实,这只是表明它是质量,而不是数量。

当我在大学一年级时,我修了生物学人类学课程。 老师向全班提出了一个问题。 他指出,一些古人类学家观察到澳大利亚原住民的头骨与一些东南亚的直立种群之间的连续性。 澳大利亚原住民是一个非常有朝气的人,过去近一万年来对大多数人口而言,这种习惯已成为习惯,而迁徙趋势受到的影响较小。 无论如何,讲师都要求举手,是否应该公开讨论这种可能性。 全班多数人拒绝公开讨论。 当被教练问到为什么时,许多拒绝论文研究的学生都认为这种可能性为非人性化,压迫和政治上过于敏感开辟了道路。 米尔福德·沃尔普夫(Milford Wolpoff)显然输掉了宣传战。 这些学生没有考虑到所有人口都表现出连续性的多区域主义的可能性,而是假设澳大利亚原住民所假设的连续性是特定于他们的,因此会将这种人口与人文树的人为较少的分支联系起来。

科学是人类的文化事业。 这是真实的东西,是客观的东西,但我们确实透过玻璃有些暗。 模型的接受或拒绝取决于与现实和预测精度的对应关系。 但是,模型的兴衰以及其兴衰的速度可能会受到文化动力的影响。 在 利他主义的代价 奥伦·哈曼(Oren Harman)展示了俄罗斯和英国的文化如何塑造他们如何看待进化生物学的社会含义。 同样,由于语言和民族沙文主义的原因,牛顿力学和达尔文进化论在法国最初的接受可能受到了阻碍。

科学理论不仅必须在整个社会的怀疑和不理解之水中游swim,而且还必须克服自然推论与规范推论不可避免的混淆。 牛顿力学,相对论和量子力学都对下游社会产生了许多奇特而令人惊讶的后果。 这些物理理论和模型之间的界线 社会学, 认识论灵性,可能会使他们的创建者感到惊讶(好吧,也许不是 艾萨克·牛顿)。 但是人类的想象力丰富,许多认知人类学家认为 联系和类比 我们所做的,除了我们的 混杂模式识别,产生了巴洛克式和令人困惑的复杂性,即 文化.

到2000年代中期,“非洲以外”的范式已经明确,以至于化石据称也背叛了多区域主义者。 在 骨头,石头和分子:“走出非洲”与人类起源 作者认为,化石记录及其变异模式可以补充分子记录。 也就是说,克里斯·斯金格(Chris Stringer)是对的。 据报道,对形态变异的其他更多计算密集型分析倾向于支持“非洲以外”模型。

然而,就在非洲以外地区似乎已经清除了领域之外,从基因组学和遗传学中又出现了另一个方向的指点。 2006年,芝加哥大学的布鲁斯·拉恩(Bruce Lahn)发表了 大脑大小基因microcephalin的适应性等位基因从古老的同源系渗入智人的证据。 然而,几年后,似乎对该假设没有广泛的支持。 例如 没有证据表明尼安德特人对现代人类的多样性做出了贡献。 但是仍然有其他论文。 Xp21.1的深度单倍型散度和远程连锁不平衡提供了人类从结构祖先族群中下降的证据. 基因组学驳斥了非洲唯一的人类起源。 当然,这是一个 少数派观点。 在最初的几年中,尼安德特人的基因组计划似乎也不支持任何混合物。 我看到Svante Paabo在20008年末发表讲话,他绝对是毫不含糊的。 没有混合的迹象。 时期。

但是,科学正统的平衡对于外部的伪造冲击并没有永远持久。 是的,面对压倒性的证据,一些科学家仍然固执己见。 有人可能会认为米尔福德·沃尔普夫(Milford Wolpoff)可能是其中之一。 弗雷德·霍伊尔 当然是。 但是潮流开始了。 在秋天 2009 斯万特·帕博(Svante Paabo)在掺混物问题上似乎并没有那么明确。 然后,在春天 2010:

新墨西哥小组的建议可能很快就会受到考验。 去年年初,德国莱比锡马克斯·普朗克进化人类学研究所的SvantePääbo及其同事宣布,他们已经完成了尼安德特人基因组初稿的测序工作,有望在不久的将来发表他们的工作。 Pääbo对尼安德特人基因组组成的早期研究在很大程度上排除了杂交的可能性,但它们并非基于对完整基因组的更全面分析。

普朗克研究所的人类学家Linda Vigilant, 发现乔伊斯的讲话为太平洋地区遗传变异中发现的“细微偏差”提供了令人信服的答案。

“这些信息确实很有帮助,” Vigilant说。 “而且很酷。”

至此,2010年XNUMX月,一些未参与该项目本身的研究生已经看到了该项目的纸质稿。 尼安德特外加剂纸。 消息在传播。 我已经知道它的可能性,这使我打开了Google警报(这使我陷入了对“我从来都不知道”的一项禁运的“破坏禁运”的麻烦)。 在2010年,针对古老的,正统的正统观念的锤击正在逐渐成熟,许多人对此“一无所知”。 在透明的时代,有趣的是,科学自然地具有某种保密的文化。 谁想被挖出来? 但是,从长期来看,这到底有多可持续?

用某些人可能会感到反感的宗教类比,这是一个异端曾经是信仰的大祭司的例子。 去年春天的媒体报道清楚地表明,参与其中的大多数校长 最初并不认为已经发生了混合。 相反,他们认为得到的结果是异常的。 科学受文化影响,但最终自然还是最终的仲裁者。 事实是事实,诚实的男人和女人应有的应有。

至此,您大概知道了分数。 古代DNA是强大的法官和陪审团。 看来尼安德特人掺和物的证据已经存在 修改传统的《非洲以外》的叙述。 但是,必须承认 走出非洲 is 主要是正确的。 在过去约100,000年内,我们总基因组含量的绝大多数似乎可以追溯到非洲人口。 较深的根深蒂固的血统模型只能通过选择性扫描周期性地打断,以保持物种的凝聚力,这是站不住脚的。 渐进主义 鉴于遗传证据,这似乎是难以置信的。 这是Wolpoff(和他的妻子Rachel Caspari)在 种族与人类进化:

我们同意,一种标点符号化的进化模式最能描述许多种系的进化历史,包括人类仅是另一种非洲灵长类物种的人类史前时期和更长的时期。 但是我们认为,标点符号式的平衡并不能反映出人类进化成为成功的殖民者时以及在没有宏观进化变化时人类所发生的事情。 当我们阅读化石记录时,没有证据表明最近发生了物种形成事件。 实际上,有强有力的证据反对他们。 但是夏娃的解释答应支持为后来的人类进化建立一个标点符号的模型,但该模型被诸如我们这样的化石证据的解释所否定。

我知识不足,不知道什么才算是“宏观进化的变革”。 但是 '大跃进' 似乎是一个合理的候选人。 无论什么细节,在200到10万年前之间,似乎确实出现了人类范围和创新能力的一系列快速扩展。 有时空气中有不同。 我不知道米尔福德·沃尔普夫(Milford Wolpoff)的思想的细微差别。 最新的数据似乎确实驳斥了所有观点,即“非洲以外的人”是微不足道的。 但是,它们似乎也大致上与过去200,000万年来人类血统变化的特殊性,几乎是革命性的特征相吻合。 形态学和遗传学变异的趋同模式似乎可以追溯到非洲基础,这表明克里斯·斯金格和艾伦·威尔逊正确地表征了近代人类史前的主要一阶动力学。 但是现在我们进入第二和第三阶。 当根据自然的多样性和独特性来判断时,粗略的范式将被雕刻成更具真实感的事物。

让我们跳到纸上。 主菜。 西伯利亚Denisova洞穴中一个古人类素族的遗传历史:

使用从西伯利亚南部Denisova洞穴中发现的手指骨头提取的DNA,我们已将古人类蛋白的基因组测序到大约1.9倍的覆盖率。 此人来自与尼安德特人有共同血统的群体。 该种群不参与从尼安德特人到欧亚大陆的假定基因流动; 但是,数据表明它为当今美拉尼西亚人的基因组贡献了其遗传物质的4–6%。 我们将这一人种命名为“ Denisovans”,并建议在更新世晚期期间它可能已经在亚洲广泛传播。 Denisova洞穴中发现的一颗牙齿携带着一个与手指骨骼高度相似的线粒体基因组。 这颗牙齿没有与尼安德特人或现代人类共享任何派生的形态学特征,进一步表明丹尼索瓦人具有与尼安德特人和现代人类不同的进化历史。

约翰·霍克斯(John Hawks) 在他的常见问题解答中介绍了很多内容。 特别是他有一个 完形 了解化石记录,以便他可以对他们的某些断言进行“快速而肮脏的”检查。 他指出:

这篇论文没有指出的是,有旧石器时代的标本等于或超过了这颗牙齿的大小。 例如,来自罗马尼亚Oase的上部第二颗臼齿的测量长度和宽度比该样本大,而该样本的第三颗臼齿(在隐窝中)更大。 来自土耳其的上旧石器时代的臼齿也非常大。

我不认为这是该标本与早期旧石器时代人民之间关系的迹象,即使这些是最早的。 这是这颗牙齿实际上无法诊断的另一个迹象。 我要说的是,在没有遗传信息的情况下,我们将这些遗骸视为早期旧石器时代的人们,并强调了这些相似之处。

人们根据他们的信息来解释信息 背景先验。 既然我们知道了我们所不知道的,也许我们应该回过头来仔细检查一下我们曾经被解雇的情况。 考虑一下2006年的这篇论文, 人类基因组中的古老混合物:

人类进化过程中永恒的问题之一是人类的“古老”形式的命运。 尼安德特人是在25万至40万年前没有与现代人类杂交的情况下灭绝的,还是他们的基因存在于当今的欧洲人中? 最近的工作表明,尼安德特人和一个尚未被确认的古非洲人口促成了 至少占现代欧洲的5% 和西非基因库。 尼安德特人和其他古老人类核DNA的广泛测序有可能在未来几年内最终回答这个问题。

5%是一个不错的整数。 他们本来可以幸运的,但是 第一作者 继续在2009年暴跌,生成了古老的混合物模型。 这将有多丰硕的成果? 这是 莎拉·提斯科夫(Sarah Tishkoff) 在2009年XNUMX月:

…宾夕法尼亚大学的遗传学家萨拉·提斯科夫(Sarah Tishkoff)表示同意,并补充说,毕竟,每个人都有强大的智力选择压力,因此在各自的环境中取得成功就越好。 至于与尼安德特人的搭配, 提什科夫(Tishkoff)否定了这个想法,只是认为它是纯粹的猜测:“我不知道有什么证据。”

我怀疑莎拉·提斯科夫(Sarah Tishkoff)的观点在2009年底的大多数人类进化学者中都是普遍的(尽管我怀疑那些曾与Facebook交往过的人与斯万特·帕博(Svante Paabo)实验室的人是不一样的)。 坦白说,对提斯科夫(Tishkoff)来说,六个月后当她得到证据时,她接受纳安德塔尔掺合料并没有感到沮丧。 她甚至补充说:“……杂交有可能将特质引入少数人群。”

关于本文,在文章中的三个数字中,最上面一行很清楚。 我在下面对它们进行了重新格式化:

左上角: 系统发育树,显示了各种人类谱系的总基因组关系。 现存的现代人类代表了一个进化论。 丹尼索瓦人和尼安德特人另一个。 换句话说,Denisovans和Neandertals的最后一个共同祖先在时间上比新非洲人以及Denisovans和Neandertals的最后一个共同祖先在时间上更浅。 所有尼安德特人(Neandertals)也都息息相关,至少在这条曲线上评分时是如此。 Denisovans对他们而言是群体,就像San对其他人而言是群体。 法国人在汉人和巴布亚人中是一个外来群体,尽管只是勉强。 这种关系自然是我对法国人和汉人共同血统的论点持怀疑态度的原因。 20,000年前 当我们知道巴布亚人在45,000年前定居他们的岛屿时。

右上: 在PCA中,将HGDP人口投影到变异的两个最大成分上,这两个成分摆脱了黑猩猩,Denisovan和Neandertal的数据集。 换句话说,决定游戏规则的是黑猩猩和两个古老的欧亚人口。 人类被限制在非人类/前人类的遗传变异空间中。 因此,人类的位置告诉您它们与Denisovans,尼安德特人和黑猩猩的遗传变异有何关系。 除非洲人外,欧亚人,欧亚人+美国人组成了一个相对紧密的群体。 如果非非洲人有一些尼安德特人掺混物,这是合理的。 但有趣的是 他的美拉尼西亚人团体也脱颖而出。 而且,巴布亚人和九重葛岛民也很独特。 后者转向欧亚大陆。 为什么? 可能是因为他们的年龄较小但很重要, 南方祖先成分 巴布亚人缺乏的。

他们估计,欧亚大陆人和大洋洲人的基因中有2.5%来自尼安德特人。 并且,美拉尼西亚人的另外5%的基因组是Denisovan起源的。 因此,美拉尼西亚人是92.5%的新非洲人。 欧亚人是新非洲人,占97.25%。 最多。

底部: 最后一个显示了程式化的人口统计模型。 步骤1,人类离开非洲。 新非洲人与西南亚的尼安德特人杂交。 步骤2,古欧亚人向东推进,有的遇到了Denisovans,最终到达了大约45,000年前的Sahul。

有人问我有关波利尼西亚人和澳大利亚原住民的丹尼索瓦人的情况。 由于波利尼西亚人约为美拉尼西亚人的20%,因此应适当稀释一部分。 至于澳大利亚人,如果他们是 直到最近才与巴布亚人民区分开 由于海平面上升,我认为它们应该承载相同数量的Denisovan。 布干维尔 一直 分离自巴布亚 从我所知道的水。 最后一个问题是关于安达曼岛民和其他偏远的亚洲人,他们似乎是狩猎采集者的遗物,例如阿伊努人。 由于巴基斯坦的HGDP人口与安达曼岛民在祖先中占有很大的比例,因此我认为他们应该略微偏向巴布亚人。 由于人口没有标签,我不知道这些群体是否朝着巴布亚人的方向倾斜。 在补编中,汉人和法国人的个人结局有所不同,尽管微不足道,但汉人似乎有些转向布干维尔岛民。 此外,本文的一些作者参与了 重建印度历史,因此我假设可以访问Andaman Islander数据。 如果他们进行一些快速检查并决定坚持使用HGDP,我会很好奇,因为那里不可能有任何东西。

的主体 严谨优美地写着。 但是,还有更多 补品。 我已经阅读了至少一次,但是我不能说我非常了解。 尽管它的篇幅长达90页,但在数学上精打细算,却写着精疲力尽。 但其中很多都暗示着“ D统计”,实际上它可以追溯到更早的时期。 尼安德特外加剂纸,及其补充。 因此,让我们回到这一点,至少粗略地检查一下D统计量。 在我的经验中,可能不会获得很深的知识,但是即使是对这类论文的技术奥秘的肤浅知识也常常是有用的。 至第130页:

为了测试尼安德特人与某些现代人相比是否共享更多的等位基因,我们比较了所产生的尼安德特人序列与当今来自不同祖先的人类样品的序列。 具体而言,我们通过比较来自不同个体(H1和H2)的两条染色体发现了单核苷酸多态性(SNP)。 然后,我们评估了受试个体(H3,例如尼安德特人)是否倾向于在H1具有相对于黑猩猩的衍生等位基因的位点更频繁地匹配H2或H3。 在H3属于一个外来群体的原假设下,它应与H1和H2相等地匹配。 相反,如果已经发生基因流动,则H3可能比另一个更匹配。

这是一个图形说明:

黑猩猩(未显示为H4)可能具有的祖先状态是A。 B表示派生状态。 这意味着它已经通过从祖先状态的突变而发生了变化,该变化是在最后一个祖先与外群体之间的某个时刻发生的。 要计算D统计量,您需要查看H3为B而H4自然为A的情况。因此,您有两组:BABA和ABBA。 您正在比较这两个组合之间的计数。 如果H3是H1H2进化枝的干净外群,则D将为〜0,因为BABA和ABBA计数将大致相等。 相反,如果有基因从H1流向H2或H3,则D将偏离〜0。 这 Z分数 是偏离〜0的标准偏差。 下表来自正在研究的当前论文。 我强调并重新格式化了:

D统计量可以使您口头上了解。 从尼安德特人到Eurisicans +大洋洲人都有一些混合体。 因此,当彼此配对为H1和H2时,与从非洲人配对时,它们的偏离不会比从0偏离那么大。 偏离相等比例的ABBA和BABA是因为存在从H3到H1或H2的假定基因流。 注意Denisovans。 因为它们就像尼安德特人,所以与D的偏差较高,尽管幅度不大。 有趣的是,在比较Denisovans,Melanesian和非洲人时,会出现最大的Z分数。 最后,美拉尼西亚人和欧亚人在H0位置与Denisovans配对时,也会导致偏离3。

快速补充说明古代人口结构。 二烯 他认为欧亚大陆人和大洋洲人之间不一定存在尼安德特人混合气。 据我所知,他认为非洲内部存在着人口结构,这一结构在非非洲人口中得到了保留。 与其说是最近才见过的地理上分离的宗族之间的外来混杂,不如说是在这里争论的是,非洲更为紧密的人口之间存在着长期的障碍。 尽管他们不能完全没有根据地拒绝它,但作者并没有发现它是同等的。 下面是它们的两个模型的图形表示:

那么,这会把我们留在哪里呢? 昨天,当我说一些大事要下降的时候 埃德·布雷顿 对古人类学家倾向于过多地夸大故事感到沮丧。 现实是一切都不会改变。 这 霍比特人是, 达尔文尼乌斯 惨败,以及关于 艾达,可以使任何适合人类进化的疲劳。 但是这里有所不同。 您无需为此全力以赴。 在某个时候,您将能够进入UCSC基因组浏览器 在你自己周围戳。 或者,您可以使用 SNP和插入缺失.

如果您是原始自然史的书呆子,那么这是一个活着的好时机。 您永远都不知道早上醒来会给您带来什么惊喜。 您永远不会知道您将如何重新布置您的世界观念。 在文章的较早部分,我提到一位讲师曾问过一个班级,我是一名学生,如果他们认为存在原住民的勃起功能,是否应该允许科学家讨论这些特征。 您可能不会感到惊讶,我说过这样的事情如果看起来是真的不应该超出限制。 显然,科学具有政治意义。 说它没有价值是理想主义的,并且在哲学上是一致的,但它也是幼稚的。 相反,我们需要思考 努力思考我们的价值观如何与我们周围的世界联系起来。 或者至少我们中的一些人需要认真考虑这种事情。

我们不应该认为我们所有人都有完全相同的道德直觉。 但是,从某种程度上说,我认为我们有些担心过度了。 我认识一个人,坦率地承认自己是“白手起家”的极简主义者,因为他们不知道如果许多特征具有某种遗传成分,他们将如何入睡或生活。 同样,我遇到了许多保守的基督徒和穆斯林,他们承认,如果他们不相信上帝,他们将会强奸,谋杀和偷窃。 换句话说,如果上帝不存在,他们将成为精神病患者,因为“为什么不存在”。 这太可笑了。 上帝不存在,而且他们不是精神病患者。 他们可能会认为自己没有对妹妹进行鸡奸,因为上帝从安高(On High)宣告该行为是被禁止的,但我认为从表面上看这是很荒谬的(在边际上,对上帝的信仰可能会产生某种影响顺便说一句,但这显然不是我要讲的内容)。 一切皆有可能,但一切都不尽如人意。 至于人与人之间,群体与群体之间存在很大差异的可能性,如果您承认这一天,那么您当然会举起手来 健康? 如果是这样,的确,人类在道德观念上存在巨大差异,因为我无法理解这种行为。

因此,巴布亚人,以及可能的原住民,大概是非新非洲人的〜7.5%。 那有关系吗他们今天流血吗?昨天没有流血吗? 在深层实质问题上,这一刻与以前没有什么不同。 让我引用约翰·霍克斯:

我们人类的共同血统可以追溯到早更新世和中期更新世。 由于这个共同的祖先,(现在有多个)尼安德特人基因组和杰尼索娃基因组与一些人而不是其他人共享基因。

此外,一些有生命的人携带更多来自尼安德特人的基因,因为他们有相当一部分尼安德特人的血统。 这使得谈论“尼安德特人和现代人类的祖先”变得毫无意义。 尼安德特人是现代人类的祖先。

Denisova也是如此。 谈论尼安德特人,杰尼索娃和现代人类之间的三分分裂是毫无意义的。 我们可以谈论一个人口模型,其中有一个进化枝将祖先的尼安德特人-德尼索娃人口与当代非洲人分开。

当我与人们谈论这些问题时,我不得不一次又一次地提醒自己,“现代人类祖先”并不是一个排斥这些更新世民族的群体。

一旦我们进入了引用人口模型的模式,重要的是要认识到这些模型的局限性。 例如,我们目前不能排除这些更新世种群之间的多种基因流。 我们可以理解基因流水平的一些限制-这些种群结构高度,不是更新世的panmixia。 但是,谈论隔离而不承认我们测试这些总体模型的能力为时过早。

术语上的困难告诉我们一些非常重要的事情。 人类起源科学的大规模重组正在我们身上。 我们习惯使用的术语将变得过时。 一些晦涩难懂的术语将变得非常重要。

我们所知道的善良与真实仍然是善良与真实。 这是一个小小的灵魂,对于术语问题如此感动,我们应该谨慎地允许这种情况发生在我们自己身上。 我现在认为罗马人和穆斯林都讨厌国王的想法。 罗马人推翻了君主专制,建立了共和国,并以专制取代了专制,这几乎就是君主制。 穆斯林有哈里发,是上帝的副vice,苏丹和酋长国是哈里发的副。 尽管将荣耀归给了他们的上帝,穆斯林的专制却是人间的事。 一人一人的统治是实质问题,而不是风格问题。 人的尊严不应视祖先的细节而定。 这不是很明显吗? 我认为这就是20世纪在某种程度上的意义。

回到科学。 我从一个漫长的历史速写开始,用我自己的个人视角观察,因为概率总是通过一杯有先验的先验来过滤的。 我对侵略性和混合性的想法并不感到震惊,因为 格雷格·科克伦(Greg Cochran), 亨利·哈彭丁约翰·霍克斯 已经使我不得不考虑这种现象的合理性。 此外,我一直对保护遗传学以及建模感兴趣 文化进化。 在这些领域中,这种侧向流动并不是未知的。 去年春天,当我与奥伦·哈曼(Oren Harman)首次讨论尼安德特人掺混料的结果时,他提醒我应该谨慎对待此类事情。 许多引人入胜的科学故事通常不会成功。 然而,在充分尊重奥伦的情况下,在这种情况下,我们确实需要观察到,确实有一群真正的学者涌入这些数据。 此外,这是旧的东西,而不是新的东西。

这些结果将不会仅是狭och的相关性而仍然是孤立的发现。 我相信这两篇论文可能会将平衡正统观念向一个新的方向转移。 旧模型和遗传研究将以新的视角出现。 未考虑到的异常将再次出现。 在 纽约时报 斯坦福大学遗传学家Carlos Bustamante 似乎表明 卡尔·齐默(Carl Zimmer)表示狩猎正在进行。 也许人类基因组比我们想象的要复杂得多?

最后,一个人想知道这是怎么错过的。 7.5%并非微不足道。 然而,一代人的mtDNA和NRY研究似乎没有做到这一点。 我认为这种古老的混合物没有出现在结构中,因为它是欧亚大陆人和大洋洲人遗传背景的稳定组成部分。 它使我们想起了解释的局限性。 我们知道我们所知道的取决于我们已经知道的。 由于我们了解更多,现在可能会生成一组不同的推断。 虽然谦虚。 还没有时间来强化新的正统。

个人说明: 圣诞节快乐! 显然现在是我休息的时候了。 致以最良好的祝愿,让我们在2011年提供更多信息和更多数据。 希望我们不必等待太久 奥齐的基因组.

引文: Reich,David,Green,Richard E.,Kircher,Martin,Krause,Johannes,Patterson,Nick,Durand,Eric Y.,Viola,Bence,Briggs,Adrian W.,Stenzel,Udo,Johnson,Philip LF,Maricic,Tomislav ,好,Jeffrey M.,马克斯·博内特,托马斯,阿尔坎,坎,傅,乔梅,马利克,斯瓦潘,李,亨,迈耶,马提亚斯,艾希勒,埃文·E,斯通金,马克,理查兹,迈克尔,塔拉莫,萨赫拉,Shunkov,Michael V.,Derevianko,Anatoli P.,Hublin,Jean-Jacques,Kelso,Janet,Slatkin,Montgomery和Paabo,Svante(2010)。 西伯利亚自然界Denisova洞穴中一个古人类素的族群的遗传史: 10.1038 / nature09710

 
拉齐布汗
关于拉齐卜·汗

“我拥有生物学和生物化学学位,对遗传学,历史和哲学充满热情,虾是我最喜欢的食物。如果您想了解更多信息,请访问http://www.razib.com上的链接”