最近,我有一个朋友给我发送了有关人类遗传数据集的电子邮件。 有些像 人口仅限研究人员使用。 但是,有很多数据可供公众使用。 扎克·阿杰马尔(Zack Ajmal) 已发布于 其中大部分 在某一点。 随时在评论中发布指向其他人的链接。
最近,我有一个朋友给我发送了有关人类遗传数据集的电子邮件。 有些像 人口仅限研究人员使用。 但是,有很多数据可供公众使用。 扎克·阿杰马尔(Zack Ajmal) 已发布于 其中大部分 在某一点。 随时在评论中发布指向其他人的链接。
几个月前,我购买了一台不错的台式机,只是为了处理 ADMIXTURE 和其他软件包来分析基因组数据。 最近我设置了一个约 100 GB 的 Dropbox 帐户,并开始将我所有的输出文件从 ADMIXTURE、PLINK 等以及各种脚本(Perl、shell、R 等)“推送”到公众中文件夹(更准确地说,一个脚本正在运行 ADMIXTURE 并将文件移动到适当的 Dropbox 文件夹中,因为我键入此内容,并且 Dropbox 与在线文件夹同步)。 我这样做有两个原因。
首先,我想让数据生成管道对我来说更容易。 我现在没有运行 ADMIXTURE,然后用 R 费力地处理文件以生成绘图,而是创建了一个系统,其中一些自动脚本开始运行 ADMIXTURE,然后另一个脚本为 破坏,然后运行 distruct,然后修剪图像输出并将它们转换为 PNG。 这应该让我能够重新启动我的副业,即使我正忙于我生活中的“主要事件”。
其次, 我开始觉得“基因组博客革命”的承诺正在逐渐消失. 诚然,您只能使用相同的数据集做很多事情,因此我将尝试将大型谱系文件放在我的 Dropbox 帐户中。 但似乎人们需要更多的推动力。 为此,我希望使流程更加“交钥匙”的脚本分发能够激励人们前进。
附录: 我知道第一段的某些内容对某些读者来说是胡言乱语。 但我希望你会欣赏 结果 那些胡言乱语!
您是否与他人共享您的信息? 您的个人遗传信息如何影响您的生活方式以及您做出健康和医疗决定的方式? 遗传信息可以创造新的社区和联系吗?
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生物医学伦理中心的社交网络和个人基因组学研究邀请 18 至 75 岁的参与者在焦点小组环境中与我们一起度过大约 2 小时。 参与者必须从 23andMe, Inc. 购买直接面向消费者的个人遗传信息,与他人分享他们的信息,并愿意讨论他们的观点和经验。 焦点小组成员将收到一张价值 50 美元的礼品卡以供他们参与,并且可以根据需要免费提供托儿服务。 如需更多信息或注册,请通过电子邮件联系项目经理 Simone Vernez [电子邮件保护] 或致电(650)723-9364。有关研究本身的更多信息,包括特定的研究目的和资金,请访问 http://bioethics.stanford.edu/research/SocialNetworkingandPersonalGenomics.html. 有关参与者权利的一般信息,请联系1-866-680-2906。
另外,我没有就此决定咨询我的父母或兄弟姐妹。 我认为它们有下行风险的可能性很小。 远低于他们在车祸中丧生的机会。 我的基因组,我的权利。 当然,我不是一个纯粹的自我主义者霍华德·罗阿克(Howard Roark)。 我问了一个感兴趣的人,他可能会和我一起遭受未来的下行风险,如果我的判断是没有根据的话,他们不会担心我是否这样做。 老实说,我是一个头脑头脑的人,一个思考的人,不是行动,但是这种举动确实使我感到好像我正在影响这个世界上的一点点变化。
Facebook上的一个朋友问我是否不担心自己 加塔卡德 将来。 一点都不。 我的SNP中没有可操作的部分,一旦科学研究赶上了基因型数据 我怀疑我们的完整基因组将成为该机构已经常规访问的记录的一部分。 秘密测序和分析其他人的遗传信息的技术将在那里并且将被使用。 眼下的问题不是 if,但 ,尤其是。 我认为,在不久的将来,我们需要面对彻底透明的可能性。 说到: 你怎么知道 is 我的基因型? 相信我,这是! 🙂