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刚刚发布的有关Y染色体谱系的开放获取论文/预印本, 基于重测序的校准人Y染色体系统发育。 由于它是开放式访问,因此您可以阅读整个内容(很短)。 让我从讨论中引述:

尽管如此,R1b(可能还有I1)在欧洲的迅速扩张与非洲E1b1a不太像星形的扩张形成了鲜明对比,这与过去5,000年来非洲的农业,铁艺和班图语的传播有关(Berniell-Lee等(2009年)。 R1b和E1b1a样本均来自本地捐助者(分别来自欧洲和非洲)和混合的美国捐助者,因此抽样策略并未为这一差异提供明显的解释。 相反,不同的系统发育结构具有更大的单个E1a1a分支分辨率,可能反映了从更大更多样化的种群开始的扩张,因此保留了更多的祖先多样性。

R1b是最常见的单倍群 在西欧。 这个群体将其成长放在4-13,000年前。 这对他们意味着新石器时代的扩张。 我对这个数字有一定的信心,因为即使在今天的西欧大部分地区,这种谱系的存在比例约为1%左右,但远古的DNA提取在距今5到10,0000万50年前的欧洲还没有发现太多R1b。 与E1bXNUMXa拓扑结构形成的对比也很明显,因为我们有一些半历史证据证明了班图族的范围扩展,并且有大量常染色体遗传数据表明了人口统计学的替换。 在南部非洲和东部非洲许多地方发现的适合班图人的合理替代品仍然以布什曼和-格米人的形式存在。 在欧洲可能并非如此。 较“星状”的系统发育表明该男性谱系呈爆炸性增长(这与 成吉思汗单倍型).

关于R1b的来源仍然存在合理的争论。 在冰河时代结束之前,它在西欧的出现频率是否很高? 还是与中东农民一起到达的? 还是印欧人? 我认为我们可以更有信心地说,无论其起源如何, 向农业的过渡并不是从西方欧亚大陆现有人口中平等地取样的,但是却导致了赢家通吃的动力,因为特定的人口数量小的初始优势迅速扩大,然后又增加了它们的优势(例如,更多的人意味着在战争中取得更大的成功,以及更多的领土扩张,从而导致了更多的土地用于人口统计扩展)。 由于人类行为生态学的某些合理原因,似乎这种“赢家通吃”的趋势将最明显地体现在Y染色体谱系中。

通常说起我们的“旧石器时代的思想”,以及我们作为一个物种的大多数存在都是在冰河时代的狩猎者和采集者这一事实。 但重要的是要记住,向全新世的过渡导致人类的物种学,甚至可能是我们表型变异的范围发生了根本性的重新排序。

H T 二烯

 
• 类别: 科学 •标签: 基因, R1b, R1b1b2 

悉尼歌剧院侧视图有时在应用领域中,艺术许可受到特定创作渠道功能的必要性的限制。 至少在创新技术生产出更轻,更坚固的材料之前,就想到了架构 释放 紧身衣的形式(这是否是积极的发展,取决于品味)。 但是,当调色板受限制时,您只能做很多事情。 这可能是错误,也可能是功能。 科学不是艺术,但从本质上讲,它是关于宇宙的故事。 故事可以在 or 数学,无论如何,归根结底,这是人类尝试以自然的方式绘制自然并使其微妙的图案为我们所理解。 人类在我们追求中的一些偏见是透明的。 为什么要有人类学? 专门研究人类及其最接近的生物亲属的一门完整学科。 我们不要用客观而无趣的眼光来仔细研究这些模式。 我们受到预设,方法的约束以及摆在我们面前的结果的影响。 在第二次世界大战后的分子革命之前的几十年中,理论进化生物学的出现可能部分地是由于以下事实的事实:只有如此之多的结果可以从经典的进化遗传技术中挤出,而后者依赖于追踪由于育种群体中的大量效应突变,因此只有有限的表型。 随着分子进化的兴起,您看到了理论框架的结晶,例如 中立理论,以说明 崭新成果的爆发.

研究博客网站 在2000年左右,历史人口遗传学发生了类似的情况。 从母亲传给女儿的mtDNA谱系分析已经成熟,并且Y染色体分型技术开始流行,因此两性之间可能出现对称性。 ”线粒体前夕”现在与“Y染色体亚当。” 尽管mtDNA和Y谱系只是祖先的两个直接谱系,但由于它们的大部分序列之间都没有重组,因此很容易在序列分析的背景下进行分析 合并理论。 相反,基因组常染色体区域的谱系被 重组,从而以各种方式混合并匹配变体,使重建过去的历史变得更加困难。 因此,我们有了从mtDNA和Y染色体中提取遗传变异的技术,并且我们知道如何对它们的进化进行建模。 两者共同产生了一个遗传时间机器。

spencer_wells_00a结果是利用单亲标记物使纸张膨胀。 您可以通过以下方式在某种程度上看到时间顺序: 斯坦福大学人类人口遗传学实验室 在线存储库。 另一个副产品是出现了公共知识分子,他们满足了将调查结果解释并传达给非专业听众的需求。 四本书是该时代的象征,布莱恩·赛克斯(Bryan Sykes)的作品 平安夜的七个女儿:揭示我们遗传祖先的科学,斯潘塞·威尔斯(Spencer Wells) 《人类之旅:遗传漫游》,斯蒂芬·奥本海默(Stephen Oppenheimer) 真正的平安夜:走出非洲的现代人之旅和史蒂文·奥尔森(Steven Olson)的 绘制人类历史:基因,种族和我们共同的起源。 作为职业新闻记者,奥尔森的待遇是奇怪的,与个人解释一样多的报告文学。 相反,Sykes,Wells和Oppenheimer从自己的角度出发进行学术研究。 奥本海默(Oppenheimer)和威尔斯(Wells)也将他们的书与 电视 纪录片。 威尔斯(Wells)继续受到公众的关注,他已经成为一种新型的知识型企业家, 地理计划。 然后,单亲标记的年龄催生了职业和真实性。 例如,mtDNA和Y染色体的变异模式导致了一个共识,即约75%的现代欧洲人的祖先来自 旧石器时代的狩猎者-采集者。 新石器时代农民贡献的血统比例从东南到西北递减,在不列颠群岛和诺登的遥远地区趋于零。

R1b图这种推论很大程度上是基于当代遗传变异模式,是通过将现代的单倍群分配给假定的古代种群来进行的。 左边是频率的图 单倍体R1b,这是西欧最常见的Y染色体谱系。 在被认为是旧石器时代欧洲遗传底质最原始的巴斯克人中,这一频率最高。 这里的想法是,巴斯克人显然是伊比利亚的土著,他们早在凯尔特人,腓尼基人,最后是罗马人等外来者到来之前就已经存在(这在某种程度上影响了现代巴斯克人的民族主义)。 他们的非印欧语系被认为是许多方言的遗迹,这些方言在印欧语席卷其间之前就已经存在。 历史遗传学家在欧洲“土著人民”中频繁使用R1b和其他单倍群,使用这些假定的本土基因作为现代参考,将假设的史前群体的祖先数量固定下来。 但是推论基于假设,这些假设无法直接进行检验。 直到那之前,又发生了另一种方法论革命:提取古代DNA! 这些新的结果浪潮在2000年代后期逐渐浮出水面, 尚未解决 我们的成见。 现在看来,过去的情况可能比我们想象的要复杂,随着时间的流逝,人类遗传变异的最淡淡的模糊可能使我们对过去的图景的理解蒙上了一层阴影。

最近,一些研究回头研究了R1b单倍群内的变异,特别是在西欧,R1b1b2和 总结 实际上,它在地中海东部地区最为多样化。 由此得出的最合理的推论是,R1b1b2起源于东部,并扩散到西部,由于种群经历瓶颈后因遗传漂移而频率上升,然后规模迅速扩大。 另外,这些血统的最后一个共同祖先大约在10,000年前。 这自然颠覆了遗传学家在2000年代初充满信心地推动的模型,从而关闭了有关现​​代欧洲人出身及其与冰河时代的狩猎采集者的关系的辩论的大门。 一种 跟进文件 驳斥了有关R1b1b2起源和扩展的新主张。 过去一直是历史悠久的稳定而传统的人口遗传领域,如今已陷入混乱之中,研究人员正在更加仔细地研究曾经在阳光下度过的单亲世系。 大概是这样。

因此,在这种背景下, 欧洲人类遗传学杂志 步入“ R1b争议”,偏向那些在新石器时代的农民中争辩其起源的人。 中欧和西欧的主要Y染色体单倍群R1b全新世时代的创始者效应:

核心Y染色体单倍群R-M207内许多分支的系统发育关系支持单倍群R1b的西亚起源,在那里最初分化,随后其携带M269突变的亚群之一迅速传播到欧洲。 在这里,我们提供了通过质谱分析从2043个西亚和欧洲人群中筛选的M269 S118 Y染色体的412个M1来源的Y染色体,对M412 SNP进行了评估,这些数据将中欧和西欧R116b谱系的大部分与东欧,环乌拉尔文所观察到的相分离地区,近东,高加索和巴基斯坦。 在MXNUMX二分法内,主要的SXNUMX子包层在多瑙河盆地上部和巴黎地区显示出一个频率峰值,而向意大利,伊比利亚,法国南部和不列颠群岛的频率下降。 尽管此频率模式非常接近线性石斑鱼(LBK)(新石器时代文化)的传播,这是过去一万年来导致许多史前文化发展的出现,但L10(xM23)仍然可能存在更复杂的新石器时代场景)组件在东南欧和其他地方。

这里没有令人难以置信的新颖分析技术。 相反,围绕R1b1b2的困惑促使研究人员扩大了人群的覆盖范围,并对单倍群周围的标记进行了重新排序。 这些系统发育树由家谱构成,这些家谱由突变步骤分开,子代突变步骤沿着特定分支向下,并区分各种衍生进化枝。 该术语可能会引起混淆,但在本研究中,R1b1b2等效于M269分支。 他们所做的是分析R1b1b2分支及其姊妹进化枝的系统发育关系,并绘制其频率随地理分布的变化。 以下是一组数字,显示了欧洲各个分支的发生频率。 最后一个图有几个面板,因为它们都是子面板,并且对全局没有太大兴趣。 第一个图具有多个分支,因此您可以在浏览地图之前查看它们之间的关系。

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M269确实是重点关注的对象。 它及其子分支是旧石器时代与新石器时代之争的核心。 比较第一个图像中的系统发育树,以及后续图像中的等位基因频率分布。 西欧变种似乎是在安纳托利亚或其附近地区发现的祖先变种的子枝。 作者还确认了可以追溯到大约10,000年前的最后一个共同祖先的合并,尽管这些方法偏向于夸大价值,所以这是一个上限。 他们还使用PCA分析来显示单倍群变异如何表现出簇模式。 第一个面板具有单倍群,其中PC 1将祖先的R1b变体与子代分离,第二个PC则将每个子分支分离。 第二个面板输入人口中R1b单倍群的各个部分。 在单倍群的分布中,地理地图有明显的概括。

r1b最终

这个故事的寓意是什么? 我不打算探讨它们在各种考古学团体和遗传谱系之间引起的相关性。 正如我暗示的那样,这使我们陷入了麻烦。 我认为细粒度的结果不够可靠,以至于我们不应该太认真地对待这种解释。 相反,它告诉我们我们不知道的内容,以及我们不应该弄清楚的内容。 我倾向于R1b1b2是新石器时代农民带来的主张,该论文反驳说发现撒丁岛的样本有很强的依附性,我怀疑撒丁岛的样本并非非典型且不具有代表性(撒丁岛在遗传图谱上往往是一个离群值因为它的岛屿隔离)。 但是我的信心在这一点上甚至还不算谦虚。 有很多我们不知道的地方。

巨石阵_back_wideSumeria的历史始于大约5,000年前的文字。 但是随着历史的到来,农业对于Norden以及波罗的海和不列颠群岛的边缘地区来说仍然是新事物。 到古罗马人所说的图勒(Thule)成为人们关注的焦点时,在罗马帝国陷落之后,已经超出了我们的视线范围。 最初的遗传学家和考古学家试图合成自己的学科,并为欧洲人和欧洲人的语言,遗传和文化变异建立了合理的模型,他们遵循了简约性原则。 Cavalli-Sofrza,Ammerman和Renfrew 向我们展示了一个模型,在这个模型中,狩猎和聚集并讲非印欧语言的旧石器时代的欧洲人在文化,语言和部分基因上逐渐被从中东带来农业的印欧人所取代。 这就是“人口扩散”的假设。 我认为目前至少在解释力的完全简单性方面,没有人会接受这种可能性。 我们需要重新考虑巴斯克人是否可以再作为旧石器时代的欧洲人的榜样! 巴斯克人本身可能具有文化和基因上的侵扰性,将其语言和民俗带入地中海沿岸的农业地区,最终边缘化了除“文明”范围之外的少数狩猎采集者。 此外,我们必须记住,历史早于历史,我们所说的史前史是丰富的,许多发展只是模糊地保存在口头传统的迷雾中(尽管传统很快就保真地衰落了)。 最近的扩展 班图南岛 语言无法从丰富的记录中受益,因为它们在有识字的社会中传播。 突厥语和印度-伊朗方言的扩展只能在大纲中看出,因为这些民族处于社会的边缘,而书写是其文化的一部分。 欧洲向农业的转移发生了数千年,而这数千年都是有识之士。 巨石阵和巨石是由社会建造的,我们只能通过它们最坚固的纪念碑来理解。 石头说明了遗传学无法解决的复杂性。 有时,承认自己不知道本身就是一个答案。

引文: 迈尔斯(Myres),罗西(Rootsi S),林(AA),贾维尔(M. J,维伦斯R,基维西尔德T和Underhill PA(2010)。 在中欧和西欧,主要的Y染色体单倍群R1b全新世时代的创始者效应。 欧洲人类遗传学杂志:EJHG PMID: 20736979

图片来源:弗雷德里克·文森特(FrédéricVincent),马修·菲尔德(Matthew Field),国家地理杂志,维基媒体

 
拉齐布汗
关于拉齐卜·汗

“我拥有生物学和生物化学学位,对遗传学,历史和哲学充满热情,虾是我最喜欢的食物。如果您想了解更多信息,请访问http://www.razib.com上的链接”