由于我一直在运行此数据集，并进行了一些修改，现在我可以挑选出一些趋势，这些趋势在K = 8时我感觉很稳健。例如，您在整个东非看到的类似于欧亚混合物的混合物以南部为特色，以阿拉伯（可能也门）为中心。 这在总体上具有地理意义。 埃塞俄比亚人和索马里人（我有一些索马里人的样品，我与埃塞俄比亚人一起扔了，因为库什克人埃塞俄比亚人似乎比索马里人更像犹太人埃塞俄比亚人）缺乏班图斯的遗传影响。 相反，他们与尼罗撒哈拉人民有亲和力。 最后，桑达威人倾向于仅在较高的K时作为单独的种群“爆发”，通常尽可能长地与Nilo-Saharan元素聚类。

让我们在前两个主要组成部分上查看以上人群的PCA：

PCA看起来与您惯常看到的有所不同，因为样本中仅包含西欧亚和非洲群体。 因此，第二个因素不是欧亚大陆熟悉的东西轴线，而是姆布蒂人与其他非洲人之间的隔离。 在该图的最右边，有Orcadians，然后是Druze，Saudis和Yemenis。 然后，您在垂直轴上有非洲之角人口，埃塞俄比亚人和索马里人。 然后是Masai和Sandawe，以及肯尼亚班图人乐队Luhya。 马赛人是一个令人困惑的团体。 即使在删除有问题的个人之后，马赛人的成绩也往往会显得很不稳定。 另一方面，Sandawe总体上更一致。

推断祖先群体的遗传距离并不令人惊讶。 这是MDS可视化文件：

您看到的一贯趋势是，马赛人比桑达维人更接近欧亚人， 但是，“马赛人”模态祖先成分与“桑达维”祖先成分距离欧亚人不远，甚至更远。。 在较高的K处，一旦“ Sandawe”元素被划分出来，它将在Sandawe中极为占优势，在其他东非群体中则以较低的比例出现， 特别 非班图，例如马赛人。 在上面的埃塞俄比亚人中，我不会过多地分配股票，因为结果相当分散在K族和人口组合中。 马赛人的人口似乎总是像欧亚人那样的“阿拉伯人”比例较低，这就是像上面的PCA一样将人口拖向欧亚人的原因。 桑达威队似乎缺乏这种混合。 相反，他们与欧亚人的亲和力更深，可能根本不是由于混和（ADMIXTURE本身并不完美，并且可能将混和的群体转变为“纯”成分，正如我们有时在富拉尼人或南亚人中所看到的那样）。 ，而且我怀疑莫扎比人）。

回到桑达威及其在东非历史上的地位。 与P格米人和科伊桑人不同，他们是 不能 从这里我可以看到，相对于其他人类血统而言，这是基础。 也就是说，它们不会在人类系统树中从分支的主要簇中“分离”出来。 实际上，与the格米人和科伊桑人不同，他们像马赛人一样， 接近 比西非或班图人更多的是欧亚人。 换句话说，他们是 减 基础。 实际上，从图片中删除最近与欧亚混血的混血儿时，桑达威可能比大多数Nilotic群体更接近欧亚混血。

我不知道桑达威人是否是坦桑尼亚地区的土著。 如果我必须赌钱，我不会说，根据与马赛人，甚至埃塞俄比亚和索马里的库奇人和犹太人的亲缘关系，一些关于北方血统的学术假设可能是合理的。 桑达威人与班图人邻居的区别似乎很明显，并且与南部非洲的科伊森人之间没有特别的亲密关系。 许多人类学家和历史学家指出，有些群体可以“恢复”狩猎和采集的功能。 但是，在东非大部分地区的班图人统治下，桑达维人并非如此。 我认为，一个合理的模型是，桑达威人是东非狩猎采集者的底物的一部分，而东非狩猎采集者大多已被班图人消灭和吸收。 在北部，相关的民族为新兴的尼罗撒哈拉，埃塞俄比亚和库什克人社会做出了贡献，这些社会由于生态和自身的农业传统而能够避免被班图人淹没。 在这个模型中，桑达威人对科伊桑人群体的亲和力更多的是横向文化的借用和归结的影响，而不是紧密的遗传关系。

好的，现在让我们修剪一些“纯”和无关的人群。 此外，我将删除一些K。 因此，将使用新的基数重新计算比例。 因此，请记住，南非Bantus显示出西非地区较高，部分原因是Khoisan比例被删除，从而夸大了其他所有元素的百分比。

现在，让我们看一下推断总体之间的成对Fst值。 记住这一点 测量可归因于遗传变异的比例 之间 人口差异。 值越大，遗传距离越大。 我会给推断的人口标签，但不要太在意。

这是 非非洲群体与非洲群体之间的遗传距离 在条形图上 .

一些一致的趋势：

– Mbuti和Khoisan与非非洲人的距离最大。

–下一个是比亚卡（Biaka）。 同样，这可能是由于Biaka与邻近群体之间的混合，或者是Biaka y格米人与非Khoisan / Mbuti非洲群体之间的紧密联系（参考了最后的共同祖先）。

–班图斯人与西非人的距离大致相等。

–尼罗河星团和非非洲人之间的距离略小。

– 最后，一个 非非洲人与Sandawe群体之间的差异始终较小。

一如既往，我们需要记住，这些人可能不是真正的真正祖先群体。 我毫不犹豫地假设，随着时间的推移，在莫扎比人所属于的西地中海群体与中北部非洲的一些尼罗河种群之间会有一些低水平一致的基因流动。 基因频率的这种平衡自然会降低Fst值。 第二， 相对的 最初，当我查看非洲数据时，Sandawe群集的紧密程度突然跳到我的头上。 奇怪的是，它给我留下了深刻的印象。

这是维基百科的 桑达威:

桑达威（Sandawe）是位于坦桑尼亚中部多多玛（Dodoma）地区科多（Kondoa）区的一个农业族裔。 在2000年，桑达威人口估计为40,000。

桑达威（Sandawe）语言是一种带有喀哒声的音调语言，显然与南部非洲的K族语言有关。 最近的研究表明，hoe族的祖先是牧民，并从东北（也许从现代桑达维地区）迁移到南部非洲。

但是，桑达维（Sandawe）似乎离南非丛林人样本还不算近。 以下是选定的推断祖先非洲群体的Fst关系的多维标度（对x轴的权重更高）：

PCA图的一个方面是 时刻 跳出来的是非洲群体和非非洲群体之间的鸿沟，这些鸿沟经常被最近可能混和在一起的人群所覆盖。 一种解释这一现象的假说是，自“非洲以外”事件以来，非洲与世界其他地区之间几乎没有基因交流。 可能是由于生态（撒哈拉沙漠）。 但这是另一个解释： 班图人的扩张消除了中部和东部非洲的大部分遗传变异，这种变异可能部分跨越了非洲与非非洲之间的鸿沟。 考古学和人类学表明，目前在东非大部分地区和南部直至南部的班图族和尼罗河族这两个族群都在过去3,000年的规模上具有侵略性。 因此，像哈德扎（Hadza）和桑达维（Sandawe）这样的团体被认为是较古老的文化和遗传变异的遗物。 这就是为什么一旦您控制了明确的可能掺混物（例如富拉尼）后，桑达威就比其他非洲群体更接近欧亚人的原因。 或者，可能是由于来自欧亚大陆的反向迁移，桑达威本身也经历了更长时间的混合事件。

最后，让我留下一堆MDS图，这些图可视化Fst差异。