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听着,证明!


在下面的评论中,安东尼奥向我指出了这份工作文件, DNA祖先测试对美国人的身份有何启示? 审查关于种族和基因组学的舆论。 我可能有点呆板,但是我无法确定在哪里可以找到最新版本(我在一个作者的网站上偶然发现了另一个工作文件版本)。 这是摘要:

基因组学研究不久将对我们生活的许多方面产生深远影响,但其政治影响和关联仍未得到开发。 我们在此研究项目中的广泛目标是分析美国人正在学习的基因组科学知识,以及他们如何应对这一新的挑战。 可能 皱巴巴的 技术。

我们在这里通过关注基因组学革命的一个领域来实现这一目标,即基因组学与种族和民族认同的关系。 基因组祖先测试可以通过显示种族边界模糊或混合来模糊种族边界,或者通过揭示祖先的同质性或指向特定地理区域或群体作为可能的先祖来修正种族边界。 某些测试或某些情况可能允许两种结果。 以并行方式,关于种族的基因组信息可以强调其可延展性和社会建构性或可能的生物学基础。 我们认为,个人选择获取哪些信息,以及他们如何对有关种族血统的基因信息做出反应将部分取决于他们自己的种族或种族身份。

我们以三种方式评估这些假设。 首先是一项民意调查,其中包括关于接受对比DNA测试结果的假设个人的短片。 其次是对大约5,500种报纸文章的自动内容分析,这些文章专注于种族相关的基因组学研究。 最后,我们对大约700篇文章进行了细粒度,手工编码的内容分析,这些文章描述了进行DNA血统测试的人员。

三个主要发现与三个实证分析平行。 首先,大多数受访者认为DNA血统测试的结果具有说服力,但是黑人和白人对他们的种族认同有不同的情感反应和影响。 亚洲人和西班牙裔介于这两个极端之间,而多种族则表现出截然不同的反应模式。 其次,报纸上的文章更多地教育了美国阅读公众,即种族具有遗传成分,而不是种族是纯粹的社会建构。 第三,非裔美国人对表示种族分类模糊的测试不满意地做出了反应。 本文以讨论,下一步步骤概述以及有关基因组学对政治科学和政治意义的观察作为结尾。


作为与 我昨天指向的论文 这有点过时了。 自2010年中期以来,我们已经走了很远! 这篇文章的顶部是我昨天在大约2个小时内生成的一些ADMIXTURE图。 您的K = 10,带有〜250,000个标记。 左侧是针对各种人群的结果,右侧是针对我为自己的利益而奔跑的个人的结果。 识别号很小,但是您可以将其中一些识别出来。 前两个分别是ID001和ID002,分别是我的父亲和母亲。 我将打破隐私的标签,并告诉您常规读者Paul Conroy的ID010。 他看起来像是……爱尔兰人。 在该条形图中,还有许多其他常规读者和朋友,家人以及拉丁美洲的许多常规读者。 如果要在此线程上,可以“退出”自己。 我将告诉您ID042是匿名的泰米尔·婆罗门(Tamil Brahmin),而ID043是来自伊朗的亚述人Paul G.。 ID034是匿名的Ashkenazi犹太人,我之前曾发布过该基因型。

调查结果很好, 但是现在正在重新建立对基因组学的公众接受和解释。 我花了一些时间在最好的方法上,以从ADMIXTURE和PCA中获得一些见解,因为我不想让人们感到困惑。 大多数反应是平庸的。 事实证明,以拉丁美洲人为“纯西班牙人”为前提的拉丁美洲人并不总是“纯西班牙人”。 向往美国原住民血统的白人美国人的希望常常破灭了。 白人美国人由于对周围原住民血液的浪漫主义而拒绝了部分美国原住民的祖父母的家庭历史,结果证明他们是部分美国原住民的美国人。

人们确实有一些需要解决的困惑,但这并不像学者们会给他们这么多的见识。 我知道上面是一篇工作论文,但下面的句子中出现了一段简短的句子:“……从定义上讲,西班牙裔或多或少都是混血儿……”。 不,西班牙裔美国人在美国是专门针对种族中立的术语而构建的。 显然,来自加勒比海地区的许多西班牙裔人也不会自认是混血儿。 老实说,作者知道任何西班牙裔吗?

那么,您在科学家谱学方面有什么经验? 我已经谈论过自己的个人旅程 最后。 我认为种族作为一个概念确实具有生物学效用,但我向前迈进的最大问号是口述历史如何与我们的基因组所告诉我们的迅速分离。 特别是 享有特权的祖先。 从各个方面来看,我已经令我满意的是,母亲的口述历史和文字记录告诉我们,母亲的祖母确实有少量但可检测的中东血统。 但是,这与她和我父亲共享的一部分相形见which,这使他们与东亚有联系。 但是没有人知道任何这样的联系。 这些都是被遗忘的祖先,这让我反思了模因的记忆并不一定是对基因的记忆。 这可能不像通过个人基因组学来种族化那样有趣,但是在一定程度上 问题是20世纪。 数十万人正步入未来,无论模棱两可的算法所产生的结果看起来多么“令人担忧”。

 

撒哈拉沙漠以南的非洲和美洲印第安人混合气在旧有的美国人中的踪影:

有些人喜欢高估旧有股票中美国人的欧洲以外的掺混物,而另一些人则认为这种情况从未发生过。 它确实发生了,我可以证明这一点,但是肯定不会在很大程度上,否则我不会弯腰去寻找它。

基本上,经过一些初步的实验, 我可以报告说,大约有2兆碱基或更多的撒哈拉以南非洲地区经常出现在我的南欧,美国和英国的旧存货样本中。 它们在其他欧洲血统的人中很少见。

为什么?

我相信,撒哈拉以南非洲的大部分特定人群在中世纪早期就到达了南欧,穆斯林从北非入侵。 另一方面,在英国,它们可能是罗马帝国(见此处)和奴隶贸易的遗留物,其中,英国显然起了主要作用。 我想我不必解释白人美国人如何进行非洲细分市场……。

我不喜欢罗马帝国的角色。 相反,我认为关键是要专注于 海洋 英国拥有的财产的性质,以及18世纪历史上证明的来自非洲和亚洲的众多水手在港口城市中的存在。 荷兰将是一个很好的考验,就像英国一样,荷兰在海上殖民地的影响也很大(葡萄牙语 在非洲祖先的贡献很小,但是情况有些不同,因为葡萄牙在现代早期在大都市中有非洲奴隶。

土著美国人呢? 出于明显原因而更加困难:

我还在一些样本中发现了美洲印第安人和北欧亚地区。 使用罕见的HET / HOM方法很难发现这些,仅是因为欧洲人是欧亚人,并且比起撒哈拉以南非洲人,更类似于亚洲人(因此也属于美洲印第安人)。 但是,通过在SPSmart上的认真工作(即艰苦的工作),可以分离出此类序列并进行成功的MDS分析,如下图所示(由于使用的SNP数量较少,因此看起来确实比上一个更加模糊) )。

似乎很难对以下各项做出确定的评估 个人,但是,我们可以确信,“老美国人”中有非洲人和美国原住民血统的痕迹,但并非无关紧要的元素。 就是说,那些祖先在革命战争之前到达美国的人,因此也起源于这个大陆,当时美洲原住民(以及非洲人)在人口中所占的比例要高得多。

所有这些都是由自称是业余爱好者的人完成的,这真是太棒了。 随着的出现 基因组解压缩, 多德卡德BGA 我们正处于一个新时代(感谢所有贡献软件的研究人员,例如 混合物 到公共工具库)。

感谢背后的校长的辛勤工作和方法的透明性 BGA 我给他放了小费 PayPal帐户。 我知道这种分析需要花费大量时间,但是我怀疑这些早期项目会产生积极的溢出效果,向聪明和好奇的公众展示可以通过很少的毅力和努力来完成。

 
• 类别: 科学 •标签: 基因, 基因组学, 个人基因组学, 科学家谱 
拉齐布汗
关于拉齐卜·汗

“我拥有生物学和生物化学学位,对遗传学,历史和哲学充满热情,虾是我最喜欢的食物。如果您想了解更多信息,请访问http://www.razib.com上的链接”