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更新: 首先,初次访问此博客的人应该知道我对评论进行了审核。 因此,如果您留下令人讨厌的邮件,那基本上就像是一封给我的电子邮件(没有人会看到)。 第二, 身高与智力之间的相关性不是很高。 这种关联可能不会对任何人都直观可见,而只会显示在大数据集中。 因此,请停止提供自己作为趋势的反例(而且,关键是要看家庭,因为当您比较不同人群时,这里的信号将被其他因素淹没)。 第三,一个朋友给我发送了另一篇论文,该论文的确确证了即使在同胞队列中,身高和智商之间似乎也存在相关性。问题在于它很小,因此您需要具有强大功能的大型数据集看见了。

结束更新

一个适度有趣的社会科学发现是身高和测得的智力之间存在正相关(例如,在智商测试中)。 抛开智商测试设计在文化上偏​​向于矮个子的可能性的可能性,人们想知道为什么会这样。 身高是 高度遗传的 种群内大多数变异是由于众多基因变异而引起的性状。 换句话说,没有“矮个”或“矮个”的基因,而是成千上万个变异体,它们构成了整个种群的性状变异。 当我说这是高度可遗传的时,我的意思是暗示 发达社会中大多数身高的变化是由于基因 (80-90%)。 巧合的是,智能在遗传结构上有些相似, 由于许多基因的微小影响而可遗传。 通常,对智力遗传力的估计往往要低一些,大约为50%,而不是80-90%。

由于具有高度多基因的特性,这两个特征都被假定为性选择的“好基因”模型的候选者。 在所有情况相同的情况下,具有较高突变负荷的个体可能具有较低的智力和较短的智力,因为这些性状具有广泛的全基因组覆盖范围,并且是大目标。 杰弗里·米勒(Geoffrey Miller) 交配的心:性选择如何塑造人性的进化,基于此逻辑。 如果突变负荷论点成立,那么矮个子个体的智商降低可能仅仅是由于相同的原因: “坏基因。”


另一种情况是,高个子和聪明的人之间的分类交配已经在等位基因之间产生了相关性,这些相关性趋向于性状分布的这一末端。 这种现象很容易描述。 身高和智力都具有吸引力,即使不是由于相同的基因位点,身材高大和聪明的配对也会导致性状之间的相关性。 我自己的假设是,像这样的事情,可能会在分布的底部产生突变效应(由于有害的等位基因影响人们的身高和智力而产生的巨大效应)会产生大部分相关性。 部分原因是由于我阅读了g因子:

现在已经很好地确定了身高和体重都与智商相关。 如果控制了年龄,则不同研究中的相关系数大多在0.10至0.30之间,平均值约为0.20。 基于兄弟姐妹的研究发现家庭内部没有显着相关性,且天才的孩子(比一般人口中的同龄人高)不比其非赠予的兄弟姐妹高。

每当人们在特质之间建立多效关系时,我总是对特质可能与兄弟姐妹相关(或不相关)的可能性感到好奇。 某种人口结构可以产生相关性,但是模式 在家庭中 通常可以为这些关联的真正遗传基础提供更多信息。

A 新文 in PLOS遗传学 用更多的方法解决这个问题 先进的技术。 他们得出结论:

对异性具有吸引力的性状在按比例缩放时通常呈正相关,以使分数随吸引力的增加而增加,并且这种相关性通常具有遗传成分。 由于影响两个性状的基因(“多向性”)和/或由于杂种交配导致这些性状的选定等位基因之间发展出统计相关性(“配子期不平衡”),因此可以使这些性状在遗传上相关。 在这项研究中,我们对单卵双胎和双卵双胞胎,其兄弟姐妹及其父母(共N = 7,905)之间的协变量建模,以阐明人类中两个潜在的性选择特征之间的相关性:身高和智商。 与以前用于研究高度-IQ相关性的设计不同,本设计考虑了交配的影响,并提供了对加性遗传,非加性遗传和共享环境影响的偏少估计。 尽管有更多证据表明雄性具有非加性遗传效应,但这两种性状都具有很高的遗传力。 在考虑了交配后,发现身高和智商之间的相关性几乎完全是遗传性的。 模型拟合表明,多效性和分类交配都对这种遗传相关性做出了显着且大致相同的贡献。

多效性在这里意味着相同的基因正在影响不同的性状(身高和智商)。 男性和女性的身高和智商之间的加性遗传相关性分别为0.08和0.17。 这些显然是很小的相关性,但这正是我们所期望的。

在使用双胞胎设计进行统计建模之后,有很多关于性选择和进化遗传学的长弧讨论(例如,选择累加了累加的遗传变异)。 这是您在讨论中要做的, 但我不确定它真的会带来任何价值。 对智力和身高的性选择有多强? 数据显示,较高的男人有更多的性伴侣,但是这里的问题是较高的男人有较高的女儿,而这些女儿不一定具有生殖健康的能力。 每当您谈论性别选择时,您都需要考虑由于性别特征的不同价值而可能引起的对抗(例如,男性男子可能有男性女儿)。 至于智商,我不确定该特征是否适合长期使用。 我怀疑交配的“最佳地点”比平均水平要聪明一点,但又不那么聪明以至于令人讨厌。

最后,我真的很想看到大量的兄弟姐妹进行比较。 我认为使用此数据集是可行的,但我在论文中没有看到它(如果我错过了什么,请告诉我)。 在某个时候,我们将获得许多对的准确的高覆盖全基因组,并且当涉及到这种相关性时,我们可以更直接地确定它是否是突变负荷和多效性。 由于恋童癖往往是 更短不太聪明 我愿意接受许多特质之间的深厚生物学联系。 但是我觉得整个区域现在有点混乱。 谈论太多关于性选择的事情时,我挥舞着太多的手,这让我印象深刻。

引文: Keller MC,Garver-Apgar CE,Wright MJ,Martin NG,Corley RP等。 (2013)身高与智商之间的遗传相关:共享基因还是选择性交配? PLoS Genet 9(4):e1003451。 doi:10.1371 / journal.pgen.1003451

 
• 类别: 科学 •标签: 人类学, 基因, 基因组学, 高度, 房源搜索, 选择 

100,000个SNP上的TreeMix,迁移参数= 5

当我读 黎凡特的全基因组多样性揭示了文化的最新结构 in PLoS遗传学 上周,我的想法之一是“树在哪里”? 幸运的是所有数据都是 在线,所以我简单地跑了 混合树 就可以了。 经过多次运行,我知道也许不知道为什么没有人强调一棵树。 尽管可以概括出本文的基本推论,但我所能说的并没有提供太多有用的信息。 您可以从我的TreeMix运行之一在上图中看到结果。 总体而言,本文强调的是 现代中东地区跨种族宗教界限的鲜明遗传差异,混淆了使用地理来预测变异的尝试。

Umayyad哈里发

有两种尺度可以将动力学归类,这可能是造成这种情况的原因。 首先,中东地区长期以来一直是现在,以近亲结婚为特征,这可能会在较短的空间尺度上增加遗传距离。 这可能是具有历史地位的。 回想一下,《希伯来圣经》中有许多表亲婚姻的例子,其中最重要的是雅各布*与他的表亲拉结和利亚的婚姻(雅各布是以色列部落的祖先)。 然而,当代中东社会的一个主要特征是 表亲结婚,兄弟后代的婚姻。 这种文化模式尤其与伊斯兰教有关,它使阿拉伯半岛的闪族人中存在的许多习俗得以编纂和扩展。

其次,存在伊斯兰教兴起的问题,以及表现出内婚制的广泛悔社区的结晶。 我的意思是,伊斯兰化进程伴随着一定程度的婚姻隔离,人们对其隔离的重要性进行了适度的辩论。 主要的分歧是关于阿拉伯半岛的新移民与当地人口之间通婚的程度的争论,而不是当地精英的conversion依和种族身份的转变。 伊斯兰教的崛起不仅带来了一系列新颖的内婚制社区,而且在阿拉伯世界之外的非穆斯林人口与早期穆斯林帝国的庞大规模所带来的人口流动隔离开来。 回想一下,八月初的Umayyads霸权从大西洋延伸到了中亚!

人类的主要后果 伊斯兰教徒 涌入了各种奴隶的核心穆斯林土地。 这沉淀了 扎尼叛乱。 但是那场灾难性事件并没有阻止伊斯兰世界的人类贸易,这种贸易一直持续到20世纪。 重要的是,一定不要忘记,穆斯林世界中的奴隶是多种族的群体(尽管出于各种原因,黑人非洲人及其后裔特别被污蔑为奴隶,并且仍然如此),东方的土耳其人和印第安人,北方的高加索人和来自西方的欧洲人,以及来自南方的非洲人。 所有这些背后的关键因素是,奴隶来自非穆斯林国家,最初不是穆斯林。 并且,出于社会和经济考虑 希姆米斯,无论是各种派别的基督徒,犹太人,萨比亚人,琐罗亚斯德教徒,以及其他各种晦涩的民族宗教少数群体(例如, 曼达恩斯雅兹迪)被排除在这个国际贸易和移民世界的主流之外。

以上论文的作者证实的是 黎巴嫩基督徒,穆斯林和德鲁兹人在基因上非常不同。 地理区域无法预测其聚类。 几乎可以肯定,其中大部分是直接的混合物。 TreeMix图显示了非洲血统在穆斯林中东群体中的影响。 使用 其他数据 我已经提出,沃土新月的许多非穆斯林人口反映了阿拉伯人征服之时的现存变化。 这些人口不仅不受制于胜利的阿拉伯人,而且不受移民或被带到穆斯林世界中心的不同人口的基因流的影响。

一方面 PLoS遗传学 本文是他们使用ADMIXTURE来探索两个祖先集群之间的关系,这些祖先集群被称为“黎凡特”和“中东”,其北部和南部地理区域集中在近东。 这些是那些谁熟悉的 阅读基因组博客. 黎凡特成分可能是普遍存在的“西亚”元素(暗示其与欧洲祖先群的紧密联系),而中东通常被标记为“南阿拉伯”。 在ADMIXTURE中,中东/南阿拉伯元素通常是埃塞俄比亚人中存在的欧亚成分。 要考虑的一个主要问题是中东/南阿拉伯人本身是否是复合物,因为已经发现是“印度/南亚”人。 这可以解释其与其他西欧亚元素的遗传距离。 可能这只是土著人口与北方新来农民之间的综合。 然后,这个混血人口在历史的某个时候经历了自己的人口膨胀,甚至随着伊斯兰教的兴起而与北部的“父母”混为一谈。

这里需要的是更多的数据,而不是更优雅,更强大的方法。 中东的具有种族宗教信仰的少数民族是令人着迷的文化多样性和遗传多样性的宝库。 尤其值得探讨的是,伊朗的琐罗亚斯德教徒与其他波斯人之间以及科普特人与穆斯林埃及人之间的差异。 由于遗传上的亲密关系,要评估阿拉伯人对中东人口的贡献并不总是那么容易,但是在某些时候我们会有更好的认识,我的预测是,在伊朗,阿拉伯人的贡献很小,但在埃及却微不足道。为何后者进行了语言转换而前者没有进行语言转换。

引文: Haber M,Gauguier D,Youhanna S,Patterson N,Moorjani P等。 (2013年)黎凡特的基因组范围内的多样性揭示了文化的最新结构。 PLoS Genet 9(2):e1003316。 doi:10.1371 / journal.pgen.1003316

*雅各的父母也有亲戚关系,以撒的妻子是堂兄的女儿。

 
• 类别: 创办缘起, 科学 •标签: 人类学, 基因组学, 选择 

有一篇很棒的论文 手机 马上, 通过选择的EDAR变体的表达对小鼠最近的人类进化进行建模。 它综合了基因组学,计算模型以及鼠标模型的有效执行,以探索人类的非病理性表型变异。 可能是由于本文的最后一个因素推动了人类进化基因组学的发展,找到了解决这一问题的方法。 手机 (当然还有“影响因素”)。

这里的重点是 雷达,您可能以前听说过的轨迹。 通过摆弄EDAR轨迹,研究人员有了 较早创建 “亚洲老鼠。” 更具体地,表现出一组表型的小鼠被称为能够将东亚人与其他人群区分开,特别是在头发形态和皮肤腺体发育方面。 更普遍地,EDAR牵涉到 外胚层组织的发育。 这是一个非常广泛的领域,因此修饰此基因座会导致许多表型变化也就不足为奇了。 上图说明了在HGDP人口中在东亚人中发现的突变的现代分布。

需要注意的一件事是,派生于东亚形式的EDAR出现在美洲印第安人人群中,这些人与东亚人在距今10,000年前(距今15至20,000年)之间的确存在分歧。 在西欧亚大陆中,您可以找到派生的东亚EDAR变体的两个种群是Hazaras和维吾尔族,这两种种群可能都是最近在东西欧亚种群之间混和的产物。 在美拉尼西亚,EDAR频率与南极混合气体相关。 在地图上没有,但也没有人知道,南亚的蒙达(奥亚)部落的人口也很低, 但不平凡,东亚EDAR的频率。 在这种情况下,它们在没有最近东亚混和物的南亚族群中是例外的。 这使人们相信蒙达族是从东南亚入侵的一部分南亚奥秘人民的后裔,那里存在着大多数南亚奥林匹亚语。

但是让我惊讶的一件事是,欧洲人口中甚至在俄罗斯人中都没有东亚EDAR。 我对这个结果感到有些困惑,因为在过去的10,000年中,西伯利亚人与欧洲人的混合生活成为了可能, 正如一些研究人员所引述的 (这不是一个晦涩的结果,它会反复出现在TreeMix中)。 第二个图显示了在过去30,000年中东亚EDAR单倍型从中推断出的区域。 作者利用数百万个带有大量参数的正向模拟对EDAR的扩展进行建模,以使其适合所实现的分布模式(有关参数,请参见此处的补充资料)。 长话短说,他们推断在目前之前约有30,000年存在一个突变,并且在选择系数的驱动下它以大约0.10的数量激增了频率(相对适应度提高10%,非常强大!)。 这是选择性扫描的最末端,可能与表征其特征的单倍型相同 SLC24A5LCT (该块较短,但由于时间深度较深而有意义)。 再次,我感到困惑的是,为什么在美洲印第安人或蒙达族中发现的这种古老等位基因在具有推定的东亚欧亚混合体的欧洲人中却不存在。 整体不适合我。 我的一个或多个假设有一个弱点。

然后是关于鼠标模型的部分。 对我来说,这方面很巧妙,尽管我不能特别评估它的技术性。 小鼠模型较早用于测试突变对EDAR的影响的条件是拷贝数发生粗略变化,从而导致蛋白质的剂量发生大量变化。 在那种情况下,表型结果是相当极端的。 在这里,他们使用“敲门”模型,在其中重新创建了特定的EDAR点突变。 他们没有发现极端的表型,而是发现老鼠的性状范围更加正常,尽管它们的头发形态变化与人类发生的变化非常吻合。 此外,外分泌腺的数量也有所变化,衍生的东亚EDAR携带者的内分泌腺数量更多(具有累加效应)。 最后,他们注意到乳腺垫面积和分支有差异。 这些都不是令人惊讶的,EDAR是一个重要的调节基因,可以塑造生物体的外围和外部。

为了仔细检查人类在小鼠模型中的相关性,他们在一大批汉族人群中进行了全基因组关联。 特定性状的相关性在他们期望的方向上。 那些具有东亚EDAR变体的人的头发更浓密,铲形门齿,外分泌腺密度更高。 可能需要注意的是,汉族人群中衍生变异的频率很高,以至于他们没有足够的纯合祖先基因型来进行统计,因此他们的比较涉及杂合子与衍生突变体以及祖先状态的副本。 。 就像欧洲人中的SLC24A5一样,在这里很难找到具有非欧洲模式变体的双重副本的具有欧洲传统的个人。

让我们回顾一下他们在这项研究中所做的所有令人敬畏的事情。 他们深入研究了EDAR周围地区的进化基因组学,认为该单倍型是在大约30,000年前的祖先变体中经过硬选择扫描而频率升高的。 并且在选择系数方面具有明显优势。 这可能是过去50,000年非非洲人基因组中自然选择的最大影响指标之一。 其次,他们使用人性化的小鼠模型来探索与东亚人这种突变变化相关的表型范围。 因此,您在一个基因座上具有很强的选择系数,并且具有与该基因座的变化相关的一系列性状。 第三,尽管该领域已有研究(即复制),但他们确认了人类特征与突变之间的相关性。 这都是一门伟大的科学,它显示了小组之间协作的力量。

本文的许多优雅之处和影响力也适用于讨论部分, 但坦率地说,这是我开始崩溃的地方。 您可以在其中了解到 纽约时报 片, 与35,000年历史的突变有关的东亚体质特征。 这里的标题指出了从这一研究领域中得出的合理重要的推论, 人类的许多显着身体特征似乎是由于在几个基因座上发生了强烈的选择事件。 除了EDAR,我还在考虑色素沉着基因座,例如SLC24A5。 如果上山褶皱有类似的东西,我也不会感到惊讶。 如果它是可见的,并且定义了种群之间的差异,那么它通常在基因组上并不琐碎。 在这种差异下通常会有一个故事。

在人类自然历史的广阔范围内,对我而言出现的问题是 我们有特质,我们有选择的基因,但是我们有很弱的故事来解释自然选择的机制和背景。 在这里,与乳糖酶持久性和疟疾抵抗力有关的基因座形成了鲜明的对比。 在这些情况下,选择的因果机制似乎相对清楚。 批评进化论的心理学家不会指责“只是这样”的讲故事领域,但是在进化基因组学的知识上更加隔离的领域也出现了同样的问题(部分原因是该领域非常新,并且在数学和计算上也很抽象)。 为了说明我在说什么,我将引用以上论文的讨论内容:

高密度的外分泌腺是关键的人类激素适应性,能够在剧烈的活动(例如长距离行走和奔跑)中进行有效的蒸发蒸腾(Carrier等,1984; Bramble和Lieberman,2004)。 370A携带者的内分泌腺密度的增加可能在温暖和潮湿的季节有利于东亚的狩猎采集者,这会阻碍蒸发蒸腾。

地质记录表明,中国在40,000至32,000年前是相对温暖和潮湿的,但在32,000至15,000年前,气候变得凉爽干燥,然后在全新世爆发之前又变暖了(Wang等,2001; Yuan等)。等(2004)。 然而,在整个这段时间里,由于夏季和冬季季风的贡献不同,中国可能仍处于相对潮湿的状态。

高湿度,特别是在夏天,可能为个体提供了季节选择性的优势,使其能够更好地激活更多的内分泌腺,从而更有效地出汗(Kuno,1956年)。 为了探索这一假设,需要更精确地选择何时何地等位基因(也许使用古老的DNA来源)以及更详细的考古和气候数据。

适应气候总是一个不错的选择。 这个假设的问题是 该等位基因分布的现代梯度与人们对热和湿度的适应性恰好相反。 另外,这种适应方式没有成本吗? 在最初的向上扫描之后,高频率发现了衍生的EDAR突变体的种群经历了令人难以置信的最后一次冰川最大值的寒冷,而像雅库特这样的群体如今已经适应了寒冷。 不仅如此,从北极到热带地区的美洲印第安人都展现出一种适应寒冷的身体形态,这是贝伦吉亚长期逗留的历史后果。

当然,作者并没有这么简单,而且有些脱节的讨论暗示了这样一个事实,即EDAR具有许多表型效应,并且可能受到多种积极的选择压力。 从表面上看,这似乎是合理的,但这种机制的复杂性似乎不适合于该基因座周围的选择信号如此干净,清晰的事实。 似乎这不是一个容易解开的故事,并且在本文中有很多关于这一事实的隐式承认。 但是在正文末尾添加了以下内容:

值得注意的是,由370A等位基因引起的大部分不可见的结构变化可能会赋予功能优势,例如外分泌腺数目增加,直接与视觉上明显的特征相关,例如 头发的表型和乳房的大小。 这创造了这样的条件,在这种条件下,伴侣的偏爱可能会迅速演变并加强更直接的竞争优势。 因此,随着时间的推移,由单一多效性突变引起的多种性状上累积的选择性作用力可能会推动370A的上升和扩散。

一个简单的结论是,最初的气候适应可能已经让位于文化/性选择适应,而西方前东亚经典(黑色和有光泽的)以及偏爱小乳房。 这个方面在 纽约时报 当然。 我会再次引用:

但是西雅图华盛顿大学的遗传学家约书亚·阿基(Joshua Akey)说,他认为该基因在东亚人群中传播的更可能原因是性选择。 粗大的头发和小的乳房是可见的性信号,如果携带者生下更多的孩子,如果男性愿意的话,这种信号很快就会变得越来越普遍。 阿基博士说,具有明显特征的基因,例如欧洲人的蓝眼睛和金发,具有很强的选择信号,而且与汗腺相比,EDAR的可见性效应更可能是自然选择的驱动力。

此处的段落含糊不清,因为该文章的作者Nick Wade不使用引号,而且我不知道什么是Akey,以及Wade对Akey的理解是什么。 例如,出于生殖偏斜的理论原因(几个男人可以生很多孩子),一般来说,性别选择通常是由女性偏爱男性表型驱动的。 我认为Akey知道这一点,所以我怀疑那部分是Wade的光泽(尽管考虑到偏爱较小的乳房的提议,这是一个合理的水平)。 我想到的主要问题是,著名的人口遗传学家,例如约书亚·阿基(Joshua Akey),实际上如何认真地选择性别作为推动人口变异和选择的力量。 似乎很多时候,性选择被呈现为 前机械世界 这种现象可以挽救我们对特定特质起源的困惑。 但是,我们对性选择可能性的评估大概必须以先前的期望为前提,而这种期望是由人们可以从文献中得出的各种力量之间的平衡得出的,在这里,我对当前性选择文献的了解还很薄弱。 也许我的怀疑是建立在我的无知之上,而提出这一解释的种群遗传学家对文献的状况更加了解。

所有这些使我回到了嘲讽的标题。 上周,当这篇论文首次成为新闻时,我正在与一位日本血统的朋友共进晚餐(他在日本上过小学)。 我问他空白,“你喜欢小乳房吗?” 他最初的回答是“ WTF!?!” 拉齐卜,”但作为老鼠遗传学家,在向他概述了上述结果后,他理解了我的问题的主旨。 从与许多东亚裔美国男性的私人交流中,我不相信在这部分人口中,绝大多数人都偏爱小乳房。 但是这里的关键是 美国人。 这些是沉浸在美国文化中的人。 毫无疑问,东亚的规范有所不同。 我们在美国媒体中看到的名人东亚女性的典型视觉表现形式是,与西方女性名人(例如巩俐,韩国流行歌手的新作)相比,她们的继发性特征更苗条,更轻描淡写。 ,甚至考虑到后者的整形手术)。 毫无疑问,部分原因是整个人群的正常变化范围有所不同,部分原因可能是审美偏好的本质。

但是,根深蒂固的心理原因驱使性选择的可能性(据我所知,华南和西伯利亚没有一种文化)使我们回到有关更新世思想的旧观念。 并且,这使我们回到了进化心理学领域,这个领域既是对进化科学在理解人性方面的效用的怀疑论者的怀疑者,也是对进化生物学的严格实践者的鞭策者。 然而,这里并不是进化心理学家,而是我经常在媒体上援引性别选择的,经常被肋骨缠住的统计遗传学家。。 但是我们是否知道这是性选择,还是我们最好的猜测? 因为最好的猜测常常是错误的(尽管最好的猜测比最坏的猜测更可能是正确的!)。

在过去的十年中,进化基因组学已经走了很长一段路。 例如,我们知道遗传结构以及许多性状的自然历史某些方面。 但是,仍然存在缺点。 乳糖酶的持久性是规则的例外。 就象为什么人类色素沉着这样简单的表型,在过去的10年中为什么它一直是欧亚大陆的重复选择目标也无可争议的答案。 通常,正确的答案就是我们只是不知道。

引文: http://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2013.01.016

 


我的女儿有四个祖父母。 从基因上讲,她是其祖父和祖母的25%以上,而其外公祖父和祖母的25%以下。*为什么? 因为她的血统与母亲以及父亲也具有50%的遗传同一性。 这一切都非常简单。 但是文化上呢?

通过生物遗传,我们可以说基因是发生遗传的基础。 与文化 模因 与正式的逻辑和分析系统的基础相反,它的成果远不止是例示而已。 然而,我们可以相对清晰地将文化的许多方面描述为特征或表型。 这很重要。 回想一下,尽管缺少 令人满意的继承理论.


调查人类表型变异的一个更为迷人的方面之一是,可以考虑遗传控制的那些与至少完全具有“拟因”特征的那些相反的不同动力学。 例如,肤色的变化主要是遗传控制的。 换句话说,在遗传意义上,肤色是可遗传的特征。 相反,人们说的语言是环境的一种功能。 在必要和确定的意义上,一个人的头发形状,血型和鼻子形状是视其亲生父母而定的问题。 语言,宗教和烹饪偏爱是偶然事件,取决于父母的偏爱。

但这还不止于此。 在有性生物中,遗传遗传是对称的(常染色体上父母双方的贡献相同),并且是完全垂直的(后代的父母)。 相反,文化继承可以是不对称的(即,一个人基本上继承了一位父母的文化)和水平的(一个人可以继承同辈的文化)。 在 养育假设 朱迪思·里奇·哈里斯(Judith Rich Harris)讲述了英国精英寄宿学校中文化连续性的故事。 几代人的规范和风俗习惯都是由年龄较大的学生传给年龄较小的学生,没有父母的参与。 这种有规律和系统的准世代间水平传播说明了文化传播的灵活性,这在生物学遗传学上几乎没有相似之处。 生物遗传学逻辑之所以强大的原因之一是该系统被自身的约束所包围,从而减少了推理空间并缩小了推断范围。 通常,复杂性会滋生难处理的问题(请参阅:经济学)。 这就是为什么对类似于生物学的文化进化过程进行正式和系统的研究是一个古怪的追求(由著名人物,如EO Wilson和LL Cavalli-Sforza定期提出,并由Peter Richerson和Robert Boyd及其研究人员推动学生数十年)。

然而,所有这些都是论文的更广范围 英国皇家学会学报B程序。 到目前为止,它尚未在线,所以我将指向您的报告 自然, 基因比故事更快地混合。 这是最上面的结果:

如果民间故事只是像纸上的墨迹一样通过扩散传播,人们会期望看到这些变化中的平滑梯度是距离的函数。 相反,研究人员发现,文化之间的语言差异为这种传播造成了重大障碍。

这些壁垒比基因交换的壁垒更强- 一条消息可能粗略地表达为:“我会和你一起睡,但是我更喜欢我的故事而不是你的故事。”

具有讽刺意味的是,尽管文化传播具有强大的灵活性, 通常,文化差异表现出明显的群体间差异。 常识和群体遗传理论都支持这一发现。 在没有进一步询问此事的情况下,我会断言,并愿意下 100 美元的赌注, 佛兰芒人和瓦隆人之间的遗传距离小于瓦隆人和加泰罗尼亚人之间的遗传距离。 瓦隆人的语言显然比其他佛兰德语邻居与其他浪漫方言有着更紧密的联系(转到 谷歌翻译 并用相同的短语听各种日耳曼语和罗曼语的语言,这很明显)。 但是并不能因此认为这种文化相似性必然导致遗传相似性。

就人口遗传学而言, 基因流是平衡等位基因频率的强大力量。 两个人口之间的每一代只需要一个移民,以防止他们形成分歧。 即使是两个种群之间的1%混合,也将迅速平衡等位基因频率差异,特别是考虑到在大多数基因座上,这些差异并不是不相交的(频率1对0)。 通过距离隔离定义的连续基因流是跨邻近种群的恒定均质力。

但是通过迁移介导的全基因组种群间规模的基因同质化 确实适合文化。 It 五月 在某些情况下,但总体而言并非如此。 用语言最容易说明这一点,这就是为什么我专注于该示例。 的情况 “萨宾妇女的强奸” 早期罗马人的传说是对文化和遗传遗传之间区别的传奇说明。 罗马人在他们的历史早期就吸收了许多团体。 实际上,精英贵族 一族 克劳迪娅 甚至有父辈的Sabine血统。 但是,无论他们家谱的生物学性质如何,拉丁罗马文化矩阵都将持续存在并得以传播。 萨宾妇女的子女在文化上是罗马人,而不是萨宾人和罗马人的混合体。

可以用其他文化特征来说明这一现实。 现代墨西哥人是欧洲人和美洲印第安人之间的遗传混杂人群。 但是他们的宗教是欧洲教派(即使他们的罗马天主教具有本土风味,也没有人将其与阿兹台克人或玛雅人的宗教相混淆)。 他们的语言也是欧洲语言(即使有土生土长的外来词,当地的墨西哥西班牙语也能理解卡斯蒂利亚语)。 但是,他们的 美食 尽管受到伊比利亚影响,但可以说主要是在美洲人的基础上。

这里对区域,种族和国家结构的关注并非偶然。 如上所述的文化变异表现出高水平的群体间变异。 当比较约鲁巴和托斯卡纳的基因时,大多数变异都在每个组内。 但是,当比较约鲁巴语和托斯卡纳语的语言时,大部分变化是在两组之间。 对群体或个人群体的有机类比比对生物遗传抽象更适用于文化实体(例如, 基督的身体)。 术语的由来 Shibboleth 这说明了群体间变异这一现实的功能相关性:即使文化在几代人和整个人口中都是高度可塑的,但在个人生活中并不总是那么容易。 您的讲话方式标志着您的出身和班级。 它限制了您的规范,并限制了与您标识的对象的形状。

然后,回到我的女儿。 她会说英语,并且不会宗教信仰。 她的规范和观点对于普通美国人而言并非非典型。 她会吃培根(好吧,她 具有),并在成年时喝啤酒。 从文化上讲,从各个方面看,她都像她的外祖父母,而不是她的外祖父母。 从来没有一个伟大的问题。 在选择将自己的孩子带到美国环境中时,我的父母冒着将我们从其所嵌入的文化中分离出来的风险。 事实如此,而且永远都会如此。 几代人的梦想可能会死去,但他们的基因会继续存在。

*她最近的整个血统书已进行了基因分型,因此可以精确地知道这些比例。

 

南亚的大多数人讲两种语言中的一种,即印度-雅利安语和德拉威语。 这两者并不是特别密切相关。 Indo-Aryan 是一种印欧语言,这在大量明显的语言中是显而易见的 同源 与其他印欧方言。 我的英语流利程度最低,仅是印欧语系中最东端的,而英语流利度则是英语中最西端的一种。 伤口, 男子马努沙, 鼻子NAK)。 与我相反,德拉维语是独特的,因为口音和节奏显然是南亚语言,但它们完全不可穿透(尽管从德拉维语到印度-雅利安语有很多借词)。


但是在这篇文章中,我将探讨那些讲印度本土的亚奥古语族(即蒙达族)的人们的遗传关系。 一直以来,传统的问题一直是奥亚语言是否来自印度,还是来自东南亚。 更准确地说,蒙达文化是传入印度还是蒙达文化是印度东部原始的亚洲-亚洲领土的遗迹?

作为背景,我认为让读者了解越南和 Munda 之间的领土很可能在大约 2,000 年前由南亚方言主导,这一点很重要。 缅甸人和泰国人都是从中国南方进入历史时期,推翻了盛行于东南亚低地的孟族或高棉文化。 在缅甸人和泰国人的情况下,新来者将他们的语言强加于土著人口,但大体上从土著人那里吸收了大部分高雅文化元素(例如上座部佛教)。 泰国和缅甸的君主制直接借鉴了高棉和孟的受印度影响的政体。

东南亚地区最近流行的南亚语种广泛分布和种类繁多,表明它们有可能从该地区衍生而来,但这并不是该模式偏爱的确定点。 但是现在还有其他的遗传研究途径。 几年前 纸出来了 据报道,将他们与东南亚联系起来的蒙达人的Y染色体谱系在东南亚更为多样化。 这很重要,因为人口的扩张和迁移往往会通过更大的遗传漂移来使血统趋于同质,而“源”人口更有可能维持多样性。 此外,也有证据表明 雷达 它具有最近在整个东亚出现频率增加的特点。 这似乎使蒙达到达全新世,而不是更新世。 最后,有些男性血统与东南亚有一定的一致性,但是女性血统完全是土著。 这是对移民模型的经典期望,在移民模型中,由于这些群体缺乏妇女和儿童的流动性,他们对男性有强烈的偏见。

我决定使用 爱沙尼亚生物中心数据集,以及HGDP和HapMap。 对于那些对技术细节感到好奇的人,我将爱沙尼亚生物中心标记物套装从约600,000万减少到了130,000万。 我还通过Plink在–geno 0.01和–mind 0.80上放置了样本,以获取高质量的个体和良好的标记覆盖率。 为了明确起见,我重命名并合并了原始数据集中的一些总体(例如Chamars = UP_Dalits)。 我运行了初步的MDS,以确保数据不奇怪,然后将其检出。

所以做我跑的分析 混合树。 我以华裔美国人作为外来人口,并希望进行5次迁移,并且还试图通过查看1,000个SNP的窗口来校正剩余的LD。 您可以在下面查看我的第一幅情节。

我要重点关注的是从柬埔寨人流向蒙达的基因流。 如果Munda入侵南亚,这正是人们所期望的。 更有趣的是,观察到没有基因流 来自南亚群体的缅甸人,尽管他们离南亚更近了! 那时,这可能是在深挖历史的东西。 蒙达族与其他南亚族群较早分离的事实也与“混合”或“结构”柱状图的结果保持一致:蒙达族的南亚血统相对来说是没有融合的。

接下来,我想更多地关注东部人口流动。 因此,我删除了很多使我的基因流动边缘不堪重负的西方群体。

在这种情况下,再次存在来自柬埔寨结的粗糙区域的基因流参数。 也许更奇怪的是,从同一地点进入缅甸人的基因流参数非常强大。 基因 藏缅语和孟语(奥亚语)之间的混合人口。

我当然不准备断言“案件已结案”。 但是似乎我们需要再次将概率转移到侵入性假设上。

图片来源: 维基百科上的数据

 

“科学美国人” 克里斯蒂·威尔科克斯(Christie Wilcox)的帖子标题带有挑衅性, 棕色眼睛的人似乎更值得信赖,但这还不是全部,其中报告了一个新的 PLoS ONE的 纸, 值得一看的面孔遇见棕色眼睛。 像克里斯蒂一样,我会喜欢用我自己值得信赖的年轻的棕色眼睛的脸来说明这篇文章,但我担心我的处境有点狡猾! 无论如何,要写些什么? Wilcox审查了结果的要点。 简而言之, 这里的问题是棕眼睛 男子 似乎比蓝眼睛的男人更有“可信赖的面孔”。 事实证明,当眼睛经过数字操作后,颜色不会影响感知。 相反,正是眼睛颜色和面部比例之间的相关性驱动了最初的联想。 科视Christie完成:

考虑到信任对人际交往的重要性,从友谊到业务合作关系甚至浪漫史, 这些发现提出了一些有趣的进化问题。 为什么某些人脸形状看起来更危险? 为什么即使不被认为是值得信赖的蓝眼睛脸型也能持续存在呢? 我们的行为是否以我们尚未了解的方式与我们的身体联系在一起? 没有简单的答案。 面部形状和其他形态特征部分地基于遗传学,也部分地基于环境因素,例如发育过程中子宫中的激素水平。 在寻求了解我们如何看待信任的过程中,我们可以更多地了解生理与行为之间的相互作用以及我们自己的进化史。

这些发现确实提出了进化问题,我对行为与眼睛颜色的相关性感兴趣,而我过去也是如此。 但是,现在我对这本文献的可靠性有很多疑虑。 最初阅读这篇文章时,我的眼睛立即搜寻出您在上方看到的情节。 观察间隔。 在更简单的设计中或在假设已得到事先支持的模型中,这样的间隔不会引起我的注意,但这是一个特殊的且可能有悖常理的结果。 此外,如果您仔细阅读本文的“方法”部分,请注意尝试控制线性回归模型中的人口统计混杂因素。 这没有什么错,并且由于样本量的性质(<100),他们没有机会获得理想的研究人群。 但是,这类统计技术恰恰是强大的工具的味道,这些工具在自觉和不自觉地被心理学和生物医学科学所滥用。 您可以从岩石中挤出相关性。

这是一个 吉姆·曼兹(Jim Manzi) 会说我们面临着“高因果密度”。 那里 is 有文献表明,蓝眼睛的孩子和棕眼睛的孩子在行为上存在差异。 不幸的是,当 杰森·马洛伊(Jason Malloy) 看看是否有巨大的差异 非同步 数据集,他找不到它。 这并不意味着在这种表型上有所不同的个体之间就没有区别,但是这种区别可能是微妙的,需要弄清各种混淆。 这使我想起了关于性吸引和MHC的混乱文献。 那里可能有些东西,但是论文常常会提出矛盾的结果,或者增加一个复杂的层次(例如,您被那些气味与异性父母不同但又不太不同的人所吸引)。

为了顺应这份具体论文和结果,我敢打赌这会成功吗? 否。我认为结果可能并不可靠。 我是否认为蓝眼睛的人与棕色眼睛的人在生物行为上会有差异? 在这里,要更加谨慎,因为我的信心很低,我认为实际上会发现存在一些兴趣和差异现象。 在这种情况下,我认为需要做的就是看同级对。 因为由于欧洲人眼色遗传的遗传结构的发生,您有一个巨大的潜在样本空间,他们拥有不同眼色的兄弟姐妹,这些人在遗传上有很多共同之处,并且拥有共同的家庭环境。

这带给我遗传学和进化。 尽管我可能会喜欢克里斯蒂在上文中回顾过的论文的方法和结果,但就目前看来,我认为它们是可以辩护的。 但是有些讨论确实让我挠头:

因此,我们初步建议,将性别联系和性别选择结合起来,是最有可能解释棕色眼睛与可信任面孔之间协方差的原因。 而且,蓝眼睛的表型是 现在在北欧丰富,因此 应该 具有某种适应性优势,最有可能是受到性选择的青睐……可以弥补人们对可信任度的损失。 在偏爱彩色和可见物理特征与可信赖外观的优势之间进行权衡,可能会导致欧洲眼睛和头发颜色的高度可变。

考虑一下这句话: 干耳垢 表型在东亚现在很丰富,因此它应该具有某种适应性优势。 仅仅是一个特征丰富并不意味着它具有选择性的优势。 相当, 多效性 意味着无优势的性状可能会传播,就像在选择性扫描中搭便车会导致等位基因的传播一样,这些不是选择的直接目标。 尽管作者提到了遗传文献(并被引用),但他们并没有对其进行详尽的探讨。 真可惜,因为过去5年中已经很好地探索了蓝眼睛的遗传学。 我敢断言我们现在已经了解它了。

杂合子(我的女儿)

蓝眼睛和棕色眼睛的遗传模式是孟德尔遗传学中隐性表型表达的经典例证之一。 换句话说,两个蓝眼睛的父母只能引起蓝眼睛的孩子,而棕色眼睛的父母则可能引起两种眼睛的颜色,因为棕色眼睛的表型包括纯合子和杂合子(棕色占蓝色的显性)。 这是有用的,但是对于继承在现实世界中的工作方式的描述太简单了。 欧洲人中约有75%的蓝眼睛和非蓝眼睛颜色变化似乎是由于跨越基因的基因座造成的 OCA2 HERC2。 有各种各样的修饰基因,但是从一个大致的角度来说,孟德尔经典模型根据种群内的隔离来检测的正是这个基因座。 但是〜75%并非100%,并且眼睛的颜色比蓝色和棕色更多。 换句话说,眼睛的颜色继承很复杂,但是没有 也有 复杂。

也许更重要的一点是 OCA2-HERC2 该区域在效果上不限于虹膜色素沉着。 这最初是白化病突变所在的区域。 有证据表明它会影响皮肤的颜色 欧洲人亚洲人。 并且,该区域中的这些变体似乎确实是自然选择的目标。 对于欧洲变体,让您大吃一惊的是,它们的特点是共同继承的长基因组块,这是最近自然选择的标志。 其次,必须注意,由于其他原因,该块很长。 这就是为什么我对此区域最初选择蓝眼睛颜色的原因表示怀疑的原因。 尽管最初的隐性表达单基因模型太简单了,但大多数蓝眼睛的人倾向于是纯合子是正确的。 这意味着在等位基因频率轨迹增加的初始阶段,它的比例将非常缓慢地增加,因为大多数变体将位于杂合子中,因此自然选择将不受欢迎。 您期望的不是一个很长的均匀块,而是一个狭窄的区域,因为重组会在早期混合并匹配该区域。 这听起来可能很深刻,但是当进化论的假设基于可靠的遗传基础时,它们的说服力最强。 我们对眼色的遗传学有很好的了解,并且对它的进化史了解得不多。 我们应该利用这一点。

在这篇文章的过程中,我的意图是回到“因果密度”较低的领域。 眼睛颜色的遗传学并不是很简单,但是在直观上很容易处理。 相比之下, PLoS ONE的 让我感到有问题的原因是,尽管在某些特定条件下结果在统计上很显着,但总体而言情况很复杂,需要进行一些分解。 在为表型的起源构建合理的进化故事的问题中,一个更普遍的问题是表型。 在大多数情况下,您都不会发现任何一对表型之间的相关性(至少在统计意义上如此)。 但是该过程最终将产生相关性。 有些会给您很多洞察力,但有些会是虚假的。

那么,对该主题进行探索的未来途径是什么? 我对遗传学感兴趣,所以你知道我要去哪里。 查看兄弟姐妹对,看看与脸型和眼睛颜色的相关性是否成立。 但更重要的是 面部形态 终于开始被阐明了。 事实证明,该性状是高度多基因的,每个基因座仅预测一小部分性状变异。 对我而言,这在试图与眼睛的颜色建立遗传相关性方面构成了直接的问题,因为该性状具有遗传结构,其中大部分变异都位于基因组的一个区域附近。 但是这里的面部形状差异可能更加微妙,因此在最近出现的GWAS分析中没有发现。

我希望将来能对非常大的数据集进行简单的解释。 在这里,对于不太大的数据集,我们有一个较为复杂的解释。

 

 

一周前,基思·克洛尔(Keith Kloor)发表了一篇文章, 科学,环保主义和共和党有什么共同点,他为此在这些类别中缺乏非白人代表而感到遗憾。 事实上,我认为基思在科学方面是错误的。 甚至将数据集限制给美国公民和永久居民 亚洲血统在许多科学领域都有很好的代表。 但是,并非所有科学都是平等的。 2011年,共有158个博士学位被授予美国公民或永久居民的“进化生物学”类别。 在这135名非西班牙裔白人中,有5名是亚洲裔。 在“神经科学”中,分别为742、535和96。在“动物学”中分别为55、49和0。在“生物信息学”中,分别为80、51和17。最后,在“生态学”中,分解为330, 300和11。 如果您参与了学术生物学,那么我很确定这些数字不会让您感到惊讶,即使您从未考虑过。 您甚至可以通过浏览以下网址的海报来推断这些 2012年ASHG,并了解人群的变化情况。

我们可以用另一种方式看待这个问题。 在2010年《美国新闻与世界报道》中, 前10名 生态与进化研究生课程。 输入大学和“生态学”,然后输入“神经科学”后,我访问了学院的网站。 通过查看姓名,有时甚至是头像,我将每个人分为“亚洲人”(由美国人口普查定义)和“非亚洲人”。 你可以找到 数据在这里。 请注意,左列是生态系,右列是神经科学。

原始结果是:

大学与系 亚洲 不是亚洲人 %亚洲人
伯克利–生态学 0 46 0.0%
伯克利–神经科学 4 40 10.0%
哈佛–生态学 3 48 6.3%
哈佛–神经科学 21 127 16.5%
戴维斯–生态 8 117 6.8%
戴维斯–神经科学 12 73 16.4%
芝加哥–生态 3 22 13.6%
芝加哥–神经科学 11 65 16.9%
斯坦福大学-生态学 2 17 11.8%
斯坦福大学-神经科学 19 74 25.7%
康奈尔–生态 1 31 3.2%
康奈尔–神经科学 3 39 7.7%
UTexas –生态 3 43 7.0%
UTexas –神经科学 7 63 11.1%
耶鲁大学-生态学 0 23 0.0%
耶鲁大学-神经科学 13 83 15.7%
普林斯顿–生态 0 15 0.0%
普林斯顿大学–神经科学 2 17 11.8%
亚利桑那州–生态 0 54 0.0%
亚利桑那州–神经科学 0 20 0.0%

 

以下是%和计数的图表:

这有关系吗? 在美国社会中,尤其是从社会文化范畴的中部到左侧,多样性至关重要。 通常,这意味着特别是种族和性别多样性的案例(同样, 我一直在争辩 在向阶级多样性致敬之前,几乎总是敷衍了事,对意识形态多样性的关注也很少。 通常,在这些参数中,关于多样性的问题通常是“为什么不这样做”,因为与人口不同步的比例会立即引起人们对这可能是为什么的质疑。 我个人的立场与此不符。 相反,我的态度更是“那又怎样?” 我通常个人并不关心这些事情。 与大多数人不同,我的默认假设不是所有群体都有相同的才能和偏好,因此很难评估理想的人口组合的范围和性质。 歧视。 在科学中,对我来说重要的不是“谁”,而是“什么”? 也就是说,正在发现什么。

关于亚裔美国人与美国生物科学的问题对我来说是个人利益。 我自己的热情非常依赖于进化生物学。 关于基因组学和生物信息学的任何好奇心都是由种群和进化遗传学问题引起的。 坦白地说,这意味着我在白人周围度过了很多时间,因为无论出于何种原因,进化生物学比生命科学的许多其他领域都更加白人化。 相反,如果我偶然进入分子生物学或神经科学研讨会,那么听众的天性自然要多样化得多,其多样性归因于亚洲祖先背景的庞大人群。

我不知道这是否有任何深远的意义。 我怀疑如果亚裔美国人在人类进化基因组学中的代表性和在癌症研究中的代表性一样,由于早期的以欧洲为中心的数据集,可能会更早或更集中地关注确定性偏倚的问题。 但这仅是利润的转变。 似乎进化生物学家根本不了解这个问题。 更重要的是,我想强调跨领域的这种差异,因为我认为它体现了偏好和期望的近距离威力,而不是歧视或缺乏外展能力。 举一个我的意思的例子,我的父亲拥有物理化学博士学位,曾经打趣我说:“如果你学习神经科学,那会很好,然后我可以告诉人们你研究大脑。” 尽管对他来说很方便,因为我主要关注的领域是遗传学,这是他可以告诉他的朋友的一些可理解的知识,尽管有关“基因工程”和“基因疗法”的问题总是回到我身边,这表明人们认为我的主题是正确的 必须 是生物医学的。 无论出于何种原因,大多数进入大学学习某种生物学的年轻亚裔美国人都不会倾向于被生态或进化等领域所吸引。 一位亚裔美国人是生态学家,甚至对我开玩笑说,有时他的朋友称他为“双胞胎由于他的学科重点。 我不认为亚裔美国人在生态学或进化论中缺乏代表性与歧视无关,我也不认为生物医学科学对亚裔传统人士的内在偏见也较少。 简而言之,许多在理科研究生院就读的亚裔青年可能已经引起了人们的注意,因为他们没有就读医学院。 坦率地研究海星的系统发育,或诸如此类的事情,将坦率地导致更加困惑和失望。

在这种情况下,似乎问题显然不是歧视或偏见(尽管存在,但我认为跨领域的变化不大),而是关于科学应具备的专业才能的文化先入之见。 进化生物学家可以进入韩裔美国教会为自己学科的价值辩护,但是即使假设听众不相信创世论的个人(很多人也会这样做),也很难说服他们抽象和理论上的进化问题更多比具有更实际的生物医学重点的项目值得关注。 这并不能说服那些以零假设开始的人,即歧视性气氛的变化解释了种族和种族在田野中的代表性变化,但是,我希望它能使人们重新考虑不同的假设。

附录: 此外,哀叹科学中缺乏“少数群体”的情况似乎经常是“亚洲人如何成为白人' 现象。

 
• 类别: 科学 •标签: 选择 

上图和左图是我父亲的截图 23andMe 轮廓。 有趣的是,他的mtDNA单倍群在孟加拉族中并不普遍,后者在M的一个分支上占80%以上。在上面的地图中清楚地表明了我父亲的mtDNA谱系在中亚的分布。 相反,他的整个基因组主要是南亚型,如23andMe通过他们提供的估计所证明的那样。 谱系组成 利用更广泛的基因组。 这里的主要结论是mtDNA可以提供信息,但不应被认为具有代表性,或者不应该被视为具有现代意义上的祖先字眼。


出于历史记录,出于可理解的原因,mtDNA在人类遗传学和系统地理学领域迫在眉睫。 线粒体产生的遗传物质比细胞核中发现的遗传物质多,因此前线中垂悬率最低的果实也是如此。PCR 时代。 此外,由于mtDNA谱系不会重组,因此非常适合于 合并的 一个理想的倒置树状系统发育汇聚在一个共同祖先上的框架。 最后,假定mtDNA是中性的,因此反映了人口统计事件不受适应性干扰,并且具有较高的突变率,从而产生了大量变异,可用来区分人类家谱的分支。

这些假设中有许多现在是 有争议的。 但这不是本文的重点。 在密集的1万标记SNP芯片时代,为什么我们仍将重点放在一个特定遗传区域的历史上? 一句话:神话。 夏娃,原始的女人。 甚至成为客串的“我们所有人的母亲” 在科幻大结局中!

在1987中 发表的论文发现,非洲人在人类人群中所携带的mtDNA变异比例最大。 此外,这些血统在150,000万年前就汇聚成一个共同的祖先。 由于mtDNA存在于人类中,因此有一个150,000万年前的人类就携带着这个祖先的世系,所有现代世系都起源于此。 线粒体DNA是从母亲传给其后代的,所以这个人一定是女人。 由于明显的原因,她在媒体上被贴上了夏娃的名字。 科学的宣传引起了相当奇怪的大众反应,最终导致了 “新闻周刊” 盖亚当和夏娃被描绘成赤裸的地方 提取 来自埃迪·墨菲(Eddie Murphy)的 来到美国 薄膜。

问题是人们通常认为mtDNA前夕是 仅由 从她所居住的时代开始,是所有现代人类的祖先。 为什么他们认为这是常识,并且不需要多加考虑。 现实情况是,科学所讲的故事就是 mtDNA,推断出作为mtDNA宿主的人群是偶然的。 这些推论需要谨慎谨慎地做出。 系统发育将在某个时候聚回到共同祖先的基本逻辑。 随着时间的流逝,遗传谱系已经灭绝,因此从夏娃时代起,大多数mtDNA谱系都灭绝了。 在夏娃的同时,还有许多活着的女人,他们对当今现代人类的遗传特征至少起了同样的作用,甚至可能起了更大的作用。 我们只能说的绝对是他们的mtDNA世系不再存在。 随着mtDNA由母亲传给女儿(男性显然拥有mtDNA,但我们已经死胡同,不传给任何人),一个女人的mtDNA世系灭绝的所有需要​​是她只有一个儿子。 尽管她在mtDNA系统发育上没有留下任何印记,但显然她的儿子可能为后代贡献了基因。

在古老的DNA和密集的SNP数据集泛滥之前,学者们对于他们认为可以从mtDNA和Y谱系中推断出的信息抱有太大的野心(例如, 真正的平安夜:走出非洲的现代人之旅)。 我们现在处于另一个时代,对过去的推论不仅仅停留在一条腿上。 但是,mtDNA夏娃的传奇之所以持续存在,并不是因为它具有令人信服的科学性质,而是因为在这种情况下,科学背负了先前的概念性家具。 这产生了讲故事的能力,但是基于事实的一个薄薄的故事就变成了另一个高个子的故事。

所有这些都在我的脑海中,因为其中一位参与其中的科学家 英国的脱氧核糖核酸, 吉姆·威尔逊,已写了一个 响应 致Vincent Plagnol的 促进遗传谱系检测的夸大与错误 (见 点击此处 有关此争议的更多信息)。 总的来说,我认为威尔逊的反驳没有说服力。 它写得很好,但具有诡辩的风度和法律上的准确性。 我很感激 威尔逊的科学 以前,所以我不会因为他的专业能力而感到失望。 相反,一些对公司坚定不移的发言人使他处于一种微妙而无法防御的境地,而他正在博弈地试图挽救一只坏手。 重要的是,他丝毫没有向我保证,他的公司没有将英国的残酷诽谤法作为威胁,以基于科学为依据的无声批评他们的商业模式。 一个更普遍的问题是,威尔逊处于这样一种情况下,即在保持他作为科学家的正直的同时,他绝不能损害公司的前景。 从我所看到的情况来看,一旦科学成为一项业务,无论客观的光环多么有利可图,都必须放弃成为科学家的幌子。 营销的性质使得科学必不可少的必要谨慎和资格成为沟通过程中的主要责任。 是关于 销售,不 使人信服.

回到夏娃,威尔逊编组了一个非常奇怪的论点:

正如您所暗示的,亚当和夏娃确实存在的说法是指mtDNA和Y染色体非重组部分的最新共同祖先。 我不同意这些人没有什么特别之处: 80年代后期,线粒体夏娃登上《时代》杂志的封面肯定是有原因的!....

轻微的qui测,但我怀疑他的意思是 “新闻周刊” 覆盖。 更严重的是,从科学的角度来看,这种论点是怪异的。 相反,当针对可能购买可能认为可以告诉他们与“夏娃”的关系的套件的普通观众时,这是一个比较合理的方法。

在讨论之后 基因组解压缩 我参加了进一步的交流 格雷厄姆·库普(Graham Coop)艾尔文·斯卡利(Aylwyn Scally) 在Twitter上,并决定今天下午花20分钟询问人们对线粒体夏娃的看法。 我所说的“人”是指在遗传学和法医学等领域从事研究生教育的个人。 我粗略的“实地研究”使我感到非常震惊。 当然,这些人并没有在概念上犯一些基本的错误,但存在很大的困惑。 我只想知道公众的想法是什么。

当类比,典故和等价物利用我们扎根的类别和概念并将它们转换为外国认知环境时,它们将非常有用。 通过指出结构和关系的相似性,人们可以更全面地理解人们正在探索的新颖基础。 说印度总统类似于英国皇后是一个信息丰富的比喻。 在这两个职位上,个人都是主要的礼仪国家元首。 相比之下,美国总统和英国皇后的数字则大不相同,因为美国行政长官根本没有仪式。 这不是一个有用的类比,即使从表面上看也没有词汇上的变化。

夏娃是谁? 一个简单的阅读是,她是全人类的祖先,更重要的是,她是回到时代初的全人类的唯一祖先。 这是公众直观理解的概念。 谁是 线粒体DNA 前夕? 一个150,000万年前繁荣昌盛的女人,恰巧携带着mtDNA世系,该世系将漂移到固定在现代人类祖先中。 我认为这确实是非常不同的事情。 为了诗歌和行销的目的,使用夏娃这个名字是合理的。 但是从科学的角度来看,它所做的只是混淆,混淆和误导。

文森特·普拉尼奥(Vincent Plagnol)偶然遇到的惨败只是更广泛问题的征兆。 科学家需要进行大规模的概念清理,因为诸如“线粒体夏娃”和“ Y亚当”这样的引人入胜的词句渗透了上一代人的文化,并误导了许多真诚和敬业的真理追求者。 这是至关重要的,因为个人基因组学和对族谱的科学理解现已脱离了业余爱好者,爱好者和研究人员的贫民窟。 尽管我怀疑这个行业将是巨大的,但它会无处不在,并且是我们信息产品中无缝的一部分。 如果人们的脑海中仍然存在诸如线粒体夏娃之类的想法,那么可能会使他们对手头工具的用途及其更广泛的意义的认识蒙上阴影。

 

罗曼史历史分布如果您居住在美国,关于欧洲与种族宗教少数群体的关系,您会听到很多关于欧洲的事情,这就是穆斯林的问题。 这可能是9/11塑造的以美国为中心的视角,当时许多劫机者原来都在德国呆过。 此外,伦敦和马德里的恐怖行动突出表明了这些年来这些问题的持续存在。 这些令人震惊的事件使人们更加关注地缘政治的十字准线,欧洲正处于大规模移民的第二个时代。 尽管这次是目的地,而不是来源。

但是最近去过欧洲,值得注意的是,在一些地区,种族方面的日常紧张局势通常集中在吉普赛人身上(我用的是较旧的术语,因为在美国在政治上已经正确的人称“罗姆人”(Roma)包括即使是欧洲的吉普赛人中也只有一部分(即使人数更多)。 现在,欧洲许多地区都有两个截然不同的吉普赛人(一个长期居住的本地群体)以及来自欧盟东部国家的罗姆人。 尽管这些传统的游牧民族与土著居民之间的关系从来没有没有过紧张关系,但很显然,有些东西接近 莫迪斯维旺迪 已经实现 在大多数欧洲国家中,大多数是吉普赛人,而少数是本地吉普赛人。 巴尔干罗姆人的涌入增加了一个新变量。

研究博客网站 但是, 政治大惊小怪 对我来说只是重新点燃了好奇心 关于吉卜赛人的遗传起源。 从文化上讲,他们的南亚血统再清楚不过了。 他们说印度-雅利安语。 在欧洲许多地方,他们对自己的称呼来自印度-雅利安语中的“黑色”一词,因为它们比他们定居的土地的本地人要暗,而且实际上在外观上常常看起来很南亚。 巴尔干罗姆人尤其如此。 另一方面 羽衣甘蓝 芬兰的人看起来是黑发欧洲人。


欧洲吉普赛人的遗传学问题在于,直到最近,他们才专注于单亲世系。 尽管这已经证实了他们的南亚血统,但仅考虑母体或父系直接后裔在评估血统方面仍有待改进,而且这两个标记(mtDNA和Y)由于它们是单倍体(一半为许多副本)。 但是有一篇新论文 美国身体人类学杂志 使用有一些结果 16个常染色体STR (一组高度变异的标记)。 欧洲吉普赛人的遗传历史速写:常染色体标记物的角度。:

在这项研究中,对123个不相关的葡萄牙吉普赛人进行了15个高度多态性常染色体短串联重复序列(STR)的分析。 15个标记的平均基因多样性为76.7%,低于在非吉普赛葡萄牙人群体中观察到的基因多样性。 STRs的子集用于与其他吉普赛人和相应的宿主人群进行比较。 有趣的是,吉普赛族与非吉普赛族周围的人群相比,多样性的减少显然是根据东西方梯度而变化的,这与他们在欧洲的分散情况以及内部结构复杂性的降低相类似。 遗传距离分析表明,吉普赛族之间的平均遗传分化水平比相应的非吉普赛族之间的平均分化水平大得多。 吉卜赛人之间的异质率很高,可以用强遗传漂移和有限的群体间基因流动来解释。 但是,当通过主成分分析解决遗传关系时,所有吉普赛族群体聚集在一起,并且与其他族群明显区分开来,这表明了它们的共同起源。 关于推定的祖先遗传成分,与欧洲人或西亚人的高掺混物估计相比,掺混物分析没有显示出当前吉普赛基因库中的印度血统。

这不是500,000 SNP芯片分析,因此一切都需要一粒盐。 但是,在评估欧洲吉普赛人的遗传基因时,有16个标记远远超出了通常需要处理的两个标记,因此在进行推断时肯定是一种改进。 本文真的值得一看。
吉普赛人1

石膏2

第一张图显示了作为13个STR的函数而分为两个维度的方差。 该表显示了自举混合物的估算值和标准偏差。 他们在西亚人中使用了3人口模型,但是在我看来,他们并没有因此而获得明智的结果,因此我删除了这一部分(只有600像素的表格很难理解那些荒谬的表估算)。 我认为最后一种将西亚人与欧洲人融合在一起的模式最有意义。 我认为这里的主要问题是,对于这些人群中的16个STR,不一定要根据祖先的信息性进行过滤,您将在边缘获得奇怪的结果。

这些结果证实了先前的Y和mtDNA结果发现,欧洲的吉普赛人群体在基因上是片段化的,并且似乎已经经历了瓶颈。 在本文中,他们似乎还发现了吉普赛族群体从东到西的遗传方差减少的模式,这是有道理的,因为他们经历了欧洲的一系列瓶颈的历史模型。 世界上吉普赛人的遗传遗产的任何合理模型都假定,它们是沿南亚和西欧之间的连续体分布的不同程度人口的复合体,但在这里您会看到一个二维图,看起来不像南亚人和欧洲人的线性组合。 为什么? 由于它们独特的遗传史,导致它们“随机游走”到不同于祖先群体的等位基因变异模式中。

但是,这些种群的第二个遗传动力学似乎是混杂的。 拥有16个STR,并且根据所调查的人群而具有明显的敏感性,因此应谨慎对待将本文的研究结果加重。 然而,似乎可以理解的是,离巴尔干半岛越远,南亚混合气体的数量就越少。 这不仅是合理的 先验,但根据经验,人们普遍认为,欧洲北部和西部的吉普赛族在外表上看起来比巴尔干地区的南亚人少。

这里最后要考虑的是,他们用作南亚人参考的印度人口并不代表吉普赛人起源的祖先印度群体。 吉普赛人的印度-雅利安语似乎与印度西北部的语言具有最多的特色, 旁遮普语和印地语。 但是具有适当STR进行比较的样本是中印度和南印度。 总的来说,我认为这不是一个要考虑的问题,但要记住一些事情。

更大的收获是分离 在文化和生物学模式之间的继承与坚持。 吉普赛人的语言在其宽泛的轮廓中保留了印度-雅利安语的特征。 这就是为什么吉卜赛人的南亚起源能够由英国的印度水手确定的,他们听到并大致上理解了吉卜赛人所说的话。 罗曼尼彭超越宗教和国籍差异的吉普赛文化精神,显然可以追溯到南亚的一些前辈(例如,强调避免外来者污染食物)。

尽管具有独特的文化背景,但各种吉普赛人在遗传上已不及南亚人。 这是有道理的,他们似乎很可能在大约1000年前或40代后离开了印度。 他们已经在巴尔干半岛居住了600多年,也就是24代。 让我们不切实际地假设罗姆人到达拜占庭地区时是100%的南亚人(中东有相关群体,因此似乎可以肯定他们沿途拾起了中东血统,但没关系)。 每代人有99%的内婚,意味着他们今天将是79%的南亚人。 95%的内婚制将导致他们成为29%的南亚人。 90%的内婚制意味着他们将是8%的南亚人。 现实更加复杂。 在社会规范没有得到加强和罗姆人较少的早期,内婚率很可能要低得多,尤其是当吉普赛乐队与巴尔干其他贫困群体混合在一起时。 大量结构的证据 横过 吉普赛族指出,同族婚姻的发展比民族组织要低得多,这与更广泛的南亚文化内的趋势是一致的。

更一般地说,似乎罗姆人及其亲属不能仅仅被理解为是欧洲人,中东人和南亚人在基因或文化上的简单线性组合。 他们的独特历史改变了他们的生活,面对排斥和迫害,他们的坚持不懈和人口膨胀是他们社会文化传统在功能上取得成功的明显证据。

引文: GusmãoA,Valente C,Gomes V,Alves C,Amorim A,Prata MJ和GusmãoL(2010)。 欧洲吉普赛人的遗传历史速写:常染色体标记物的观点。 美国身体人类学杂志,141(4),507-14 PMID: 19918999

 

Uni_Freiburg _-_ Philosophen_格雷琴·雷诺兹(Gretchen Reynolds)的有趣帖子 审查有关运动和智力的证据。 标题为“ Phys Ed:运动可以使孩子们变得更聪明吗?”,因此从公共政策的角度来看,这绝对被视为“可行的”,尤其是考虑到年轻人肥胖的增加。 凭直觉,我认为在美国,大多数人都同意这一点。 实际上,当您患上流感或其他疾病时,通常会降低生产力(过去三年来我看过的大多数电影都是病了,因为我无法专注于困难的材料),因此在认知功能增强与健康状况之间可能会自然地联系在一起。

首先,雷诺(Reynolds)指出 根据一项研究, 这表明:

1)最适合的孩子比心理测验得出的最不适合孩子更聪明

2)最适合的孩子“基底神经节明显增大,这是大脑的关键部分,有助于保持注意力和“执行控制”,或清晰协调动作和思想的能力。“ 研究人员控制了社会经济状况和体重指数,

第二个 根据一项研究, 表明健康的儿童具有更好的工作记忆和更大的海马体积。 最后, 早期的一项研究 使用瑞典应征者的数据显示,即使在同卵双胞胎中,钳工的双胞胎也更聪明。 请注意,主要作者在前两项研究中是相同的。 在进一步评论之前,如何看一下论文中的某些表格和/或数字?


第一张图像有第一张纸上的两个表,第二张图像有第二张纸上的表,最后一张是最后一张纸上的表。

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你们大多数人都知道,仅仅因为论文是通过同行评审取得的,并不意味着它们将经受住时间的考验。 多年来,我对神经影像学的结果也越来越怀疑,主要是因为现在有心理学证据表明,大脑的图像以非常不理性的方式增加了研究的可信度。 要真正理解前两项研究,您可能必须是一位认知神经科学家,尤其是其中一位具有心理计量学背景的人。 当您比较同卵双胞胎和单卵双胞胎时,并且将性状之间的相关性视为遗传相关性的函数时,上一个研究更为直接。 从理论上讲,后者在基因上是相同的 如果不是完全在实践中,因此有人认为差异可能与环境有关。

也许吧,但这取决于您标记的“环境”。 我们可能会看到由胎儿环境或发育早期的随机事件引起的差异。 适应性方面通常是相关的。 如果运动和智力方面的能力都嵌入了许多遗传和生理途径中,这似乎是不可能的。 y,则由于发展的随机方面而引起的变异可能以相同的方式影响两个性状集群.

换句话说,我想充分说明运动和有氧健康作为高智商的驱动力的有效性,我们应该等待更多的研究。 另一方面,有很多关于有氧健康价值的数据,以及肥胖症的不利方面,因此还有其他可以继续发展的理由。 我怀疑这些研究是否进入了 时代精神 您很快就会出版一些很笨的书,标题为“每天1小时的运动如何为您带来10个智商点! (如研究所示!)”。

请注意: 快速搜索产生 像这样的论文,因此虽然在某些情况下似乎有一定的锻炼效果,但我尚不清楚运动有长期的认知益处。

图片来源:Michael Schmalenstroer

 
• 类别: 科学 •标签: 健康管理, 选择, 社会科学 

800px-Pfau_imponierend性选择 因为缺乏更好的用词,所以它是一个性感的概念。 查尔斯·达尔文(Charles Darwin)阐述了 人的后裔,与性有关的选择。在 第三只黑猩猩 贾里德·戴蒙德(Jared Diamond)赞同达尔文的论点,即性选择可以解释人类的起源,因为每个孤立的人群都有自己独特的审美偏好。 最近,进化心理学家杰弗里·米勒(Geoffrey Miller)提出了一种有趣的,甚至是投机性的论点。 交配的心:性选择如何塑造人性的进化。 显然,这是可以出售的科学知识。

性选择本身 有多种口味。 乍一看,最有悖常理的一个想法是这样的想法,即鹿角等许多特征的成本都很高,并且仅存在于发出健壮的信号的状态,这会导致成本降低而又不致残废。 这个想法是由阿莫兹·扎哈维(Amotz Zahavi)在 障碍原则 在1970年代。 最初由理查德·道金斯(Richard Dawkins)在原始版本的 自私的基因,扎哈维(Zahavi)的思想已被适度的主流接受,而道金斯(Dawkins)开创性著作的第二版反映了经过修订的评估。 这实际上是性选择的“良好基因”模型的子集,雌性是从一系列表现出变异负荷差异的雄性中选择的。 一种更加反复无常的性选择形式是“逃跑”,就像遗传漂变一样,不需要任何韵律或理由。 相反,任意初始偏好可以与正反馈回路中的遗传偏好结合在一起,从而使人口的平均表型值偏离先前的中位数,直到一旦性状开始变得过度适应不良,自然选择就会施加抵消压力(例如,想象选择)越来越长的尾羽,直到鸟类的飞行能力受到抑制)。

研究博客网站保罗_贾马蒂_2008但是,尽管该理论得到了必然的报道,并且在几本通俗科学著作中占据了中心地位,但性选择领域的主要作用还是在学术文献中(与此形成鲜明对比的是, 水生猿假说)。 正如经济学家可能会说的那样,许多关于性选择的言辞轮廓都高度程式化。 我们看到的是雄鹿的图像,雄鹿对着大鹿角,海豹着它们的东西,美丽的羽状鸟聚集起来, 。 紧接其后的是一组数学模型,这些模型颜色短,希腊符号长。 但是这些形式化模型是有价值的。 显然,就性别选择的表现而言,物种之间存在广泛的差异(如果在给定物种中,性选择或无性选择完全如此)。 象海豹的性二态性并不是判断所有物种的标准。 为了探究产生这种差异模式的变量,必须以代数方式对其进行分析,在其中可以对每个变量进行单独操作以正确表征其影响。 因此,从 美国博物学家 旨在表明如何 选型交配 可能会出现在性选择框架中 做爱不是战争:什么时候竞争能力较弱的男性应该选择劣质但可以抗辩的女性?:

男性对伴侣的选择是一种尚未充分选择的性选择机制。 一些理论研究表明,雄性可能会(但仅在极少数情况下)表现出相反的雄性配偶选择(RMMC;即,竞争激烈的雄性专注于繁殖力最强的雌性,而劣质雄性则只与繁殖力较弱的雌性配对以避免被更强大的竞争对手击败)。 在这里,我们提出了一个新模型,通过放宽先前模型的一些限制性假设并考虑广泛的已知因素来改变性选择的能力(男性对生殖的投资,女性之间的质量差异,经营状况)来探索RMMC。性别比例)。 出乎意料的是,我们发现雄性在广泛的情况下表现出相反的配偶选择。 RMMC主要发生在雌性遭遇率高而雄性将大部分时间用于繁殖的时候。 即使在男,男比赛中没有受伤的风险,或者当女性之间的质量差异很小时,也会采用这种取决于条件的策略。 因此,RMMC应该是性选择中广泛但被低估的组成部分,并应在很大程度上有助于许多类群中观察到的配对配对模式。

标题易读且引人入胜,但论文内容涉及数学公式和计算特质。 它尖叫着“相信我,我的参数!” 但是现实是一件复杂而繁杂的事情,可能要对它进行建模必须超越优雅的简单性。 如上所述,抽象的性选择模型通常是多余的。 那就是模型的美,您将所有精力从现实的重建中移除,直到您开始失去试图理解和预测的现实方面。 我对性选择文献并不完全熟悉,因此第一张表对我们了解先前模型的范围有所帮助,因为本文是本文的扩展,并在一定程度上与之相关。

性别比1

在这项研究中要重点关注的主要参数是雄性和雌性的质量,雄性之间的竞争以及交配的成本。 当前研究中检查的所有参数都与这些广泛的类别有关。 例如,密度会增加竞争,而性别比例也会改变。 这是“交配游戏”的模型,而不是某个物种的个体生活史中可能发生的所有现象,因此它受到某种特殊方式的约束。 男性有特定的有限寿命,可以建立一系列的关系。 这些关系自然是有限长度的,并且是给定男性寿命的特定比例,尽管该比例在模型中可能有所不同。 此外,雄性在获得生殖报酬之前必须进行“交配前保护”。 基本上,雄性与雌性配对后一段时间不能交配。 在此保护期内,雄性可能不得不抵挡求婚者,因此存在投资全部枯竭的风险。 这是男性和女性的素质都发挥作用的维度。 例如,低质量的雄性不是好的防守者,而高质量的雌性将引起很多关注。 还有一些因素,例如寻找伴侣时的掠夺风险,如果一个人失去了当前的伴侣而失去了上等男性,则必须这样做,或者,一个人最初没有配对,并正在决定是否拒绝接受与女性配对的提议。

坦白说,本文概述的模型是复杂的,它可能说了一些东西,他们必须将很多细节嵌套到补编中。 表2列出了所有感兴趣的参数。

性别比3

如您所见,某些参数具有一些离散值。 其中一些显然是现实中的连续变量,但出于建模目的,您必须简化操作,尤其是在要进行大量计算的情况下。 他们在参数的几种不同变化上进行了互动的“游戏”,并指出了男性的变化方式。 进化稳定策略。 下面的三幅图说明了高品质和低品质的男性对高品质和低品质的女性的响应地形,其中在y轴上交互的次数(从您的角度看,该轴突出“远离”)和“排斥指数”在Z轴上(垂直)。 高品质的雄性在顶部面板中,低品质的雄性在底部面板中,高品质的雌性在左侧面板中,最后,低品质的雌性在右侧面板中。 每个图形都有一个根据标签在x轴上变化的不同参数。

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拒绝指数是指低于0表示接受而高于拒绝。 在第一个数字中,变量是每个生殖事件花费的时间,范围是男性一生的1%至50%。 在这种情况下,高品质的男性总是接受高品质的女性,而拒绝低品质的女性。 但是随着投入时间的增加,低质量的雄性会更接受低质量的雌性,并倾向于拒绝高质量的雌性。 为什么? 高素质的女性很可能会吸引高素质的男性的注意力,低质量的男性无法与之抗衡。 在交配游戏中,与高质量雌性配对将是一种低回报的行动,因为保留这种雌性并繁殖的可能性很低。 对于低质量的雌性,其逻辑是相反的,这些雌性将吸引其他雄性的注意。 当然,这些雌性的繁殖力较弱,但从劣质雄性的角度来看,低繁殖力比无繁殖力要好。

第二个数字表示高品质和低品质雌性之间的受精率,从5%到100%。 在第二种情况下,两个班级之间的生育力没有差异,这解释了图B,当X轴接近100%时,高品质的雄性急剧下降到低品质的雌性的接受区域。 对于低质量的男性,情况就不同了,因为一旦比率差异开始收敛,他们就会更快地拒绝。 但是,请注意y轴的作用,即假设一个女性不保护伴侣时,女性互动的次数。 随着这些相互作用次数的增加,拒绝阈值会随着低质量雄性的越来越少而不断下降,以保护高质量雄性。 这必须是因为自由职业男性的互动次数越多,推测竞争性互动的次数也就越多,这些男性可以借此从一个守卫的男性“窃取”女性。

最后,最后一组数字集中在“工作性别比”(OSR)上。 OSR的范围是从女性偏爱的0.2到男性偏爱的2.4。 当女性数量不足时,高品质的男性将开始接受与低品质的女性的配对,如第三幅图的B部分所示。 在“稀缺”的环境中,这是有道理的。 低质量男性的行为更奇特。 在极端女性富余的情况下,他们的行为会收敛于高质量男性的行为:他们拒绝劣质女性,而接受高质量女性。 当性别比接近1时,低质量的男性开始排斥高质量的女性,而接受低质量的女性。 似乎在男性对雌性竞争的背景下,至少在遗传质量方面,平衡的配种比例会导致最佳的性状匹配(即,低质量的雄性可能更喜欢高质量的雌性,但这不是最佳的决定,因为这种可能性的回报很低)。 但是,随着性别比例趋向于男性过剩,低质量的男性没有好的选择。 高素质的女性会拒绝她们,因为有很多高质量的男性可供她们选择,而低质量的女性现在可以被高素质的男性接受,高品质的男性将在低质量的男性竞争中赢得她们。

这大部分是常识。 形式量化模型与语言描述之间的映射相当好。 我们直觉地知道,在男性过剩的情况下,将是低质量的男性被竖起腰,而低质量的女性将变得有价值。 您可以提供来自工科大学或军队的轶事,也可以引用历史示例,例如性别偏见的边疆社会。 在现代旁遮普人 进口妻子 来自南亚东部较贫穷地区的人,因为他们的性别比不平衡。 但是,这里是数字的关键所在,因为定量模型向您展示了变量的移动如何改变响应。 有人担心 “光秃秃的树枝”,无法在亚洲结婚的男性及其对社会稳定的可能影响。 但是,在预测由于女性的狂躁竞争而导致的不稳定时,必须牢记社会中裸露的树枝的确切比例。 形式化模型可以为我们提供有关应该关注的阈值的更好指南。

最终,像这样的论文需要通过实验和观察来验证。 但是它们是有用的工具包,是思想和概念化的磨练者。 如果您不提出问题并以清晰独特的方式做出预测,则很难进行测试,验证和反驳。

引文: Venner S,Bernstein C,Dray S和Bel-Venner MC(2010)。 做爱而不是战争:竞争能力较弱的男性何时应选择劣质但可抗辩的女性? 美国博物学家,175(6),650-61 PMID: 20415532

图片来源:BS Thurner Hof,Kristin Dos Santos

 

在人类基因组中大约3亿个碱基对中,存在相当多的变异。 可以将这种变化划分为不同的类别,某种程度上是人为分类系统的人为构造,但是仍然映射到特别重要的真实人口统计或生活史事件。 有些变异是特定于人群的,而有些变异是特定于一组人群的,并且还有一些变异,我们只在家庭中发现。 大概当全基因组测序和分析成为常态时,这种区别仍然有用,但是我们应该能够深入到我们希望的任何分析水平。 但是直到那一天到来之前,我们将不得不依靠人口序列,这些人口序列具有深层次的序列,可以合理地代表人类变异的一个子集。

研究博客网站 我经常在此博客中提及其中一些人群, 人均国内生产总值, 堆图人口 是三个范围广泛的杰出数据集。 这些群体仅覆盖一小部分人口,而在这些人口中仅覆盖了个人基因组的一小部分(尽管在人口中可能有所不同的组成部分)。 一种 新文 in 自然 仔细研究了HapMap扩展到一组新的种群。 由于它不在HapMap联盟的范围内,因此作者列表本身为我们提供了许多可能具有群体遗传兴趣的个人! (尽管不是一组具有代表性的人口差异; Broad研究所的Papuan员工在哪里?)已经在几篇论文中找到了HapMap下一阶段的一些数据(通常在补编中),但是这看起来像是对即将发生的事情的概述和品味(该论文于去年秋天提交)。 整合不同人群中常见和罕见的遗传变异:

尽管在鉴定影响人类疾病的遗传变异方面取得了很大进展,但大多数遗传风险仍然存在。 要获得更全面的了解,就需要对全基因组范围广泛的人群中不常见的等位基因进行全面检查的全基因组研究。 为了指导此类研究的设计和解释,我们在来自1.6个全球人群的1,184个参考个体中对11万个常见单核苷酸多态性(SNP)进行了基因分型,并对其中100个中的692个3碱基碱基区域进行了测序。 这种常见和稀有等位基因的集成数据集称为“ HapMap 5”,既包含SNP,也包含拷贝数多态性(CNP)。 我们表征了低频变异体之间的特定人群差异,测量了较大参考面板所提供的估算准确性的提高,尤其是在等位基因频率≤XNUMX%的SNP估算中,并证明了估算新发现的CNP和SNP的可行性 。 全球人群中扩大的基因组变异公共资源支持对基因组变异及其在人类疾病中的作用的更深层次的审视,并且是迈向高分辨率人类遗传变异图谱的一步。

由于 补品对所有人免费 如果您没有学术访问权限,我建议您下载它们。 主要区别在于它们在补品中不那么精巧,并且图形质量较低。 人口(原始的HapMap人口以粗体显示):

休曼德爱丽德多态中心(Centre d'Etude du Polymorphisme Humain)在美国犹他州收集,祖先来自北欧和西欧
中国北京的汉族(CHB)
日本东京(JPT)中的日语
尼日利亚伊巴丹(YRI)的约鲁巴(Yoruba)

美国西南部(ASW)的非洲血统
美国科罗拉多州丹佛市的华人(CHD)
美国德克萨斯州休斯顿的古吉拉特邦印第安人(GIH)
肯尼亚Webuye的Luhya(LWK)
肯尼亚Kinyawa的马赛(MKK)
美国加利福尼亚州洛杉矶的墨西哥血统(MXL)
意大利的托斯卡纳(意大利托斯卡纳,TSI)

因此,请记住其中一些缩写! 这些人群之间的一个特殊区别是 有些是亲子三重奏,有些则不是。 因此,CEU示例是三重奏,而TSI不是。 这显然很重要,因为您将在CEU样本中拥有一系列的关联性,而在TSI中则不会。 具有三重奏或不具有三重奏具有分析性的利弊,但是,出于涵盖全球人类变异的这类数据集的主要目的,您可能希望拥有无亲属关系的个体。 这些是具有三重奏的样本:CEU,ASW,MXL,MKK和YRI。

为了获得SNP和CNP,他们将Affymetrix和Illumina芯片的结果进行了合并,并在约1.5个个体中产生了约1,000万个变体。 就大范围探讨大图问题而言,这是相当不错的,尽管我不确定 比人口众多的HGDP好得多(尽管 大约一半 SNP)。 而是,本文关注的主要问题之一是找到足够的稀有变体,这些变体可能由于其覆盖范围狭窄而未出现在初始面板中,以便进行 归责 为了进行统计分析 全球风电系统。 因此,例如,他们将归因于英国研究小组的CEU与CEU + TSI进行了比较。 这是他们发现的结果(MAF =主要等位基因频率):

对于常见的SNP(MAF≥5%),较大的HapMap 3参考面板与已经非常出色的性能只有很小的差异(平均值2 从0.946升至0.961)。 但是,正如预期的那样,稀有(MAF <0.5%)和低频SNP(MAF = 0.5-5%)有了更大的改善。 他们的综合均值2 由大量的稀有SNP(0.60%)和低频SNP(0.76%)驱动,从41增加到25,其中r2 增加至少0.1,得出平均值r2 这些分别为0.62和0.49的子集的改进...

因此,较旧的HapMap数据集可以使用更常见的变体,但是较大的样本集确实会提供一些不那么常见的变体。 这很直观。 对我来说有趣的是,犹他州白人的CEU样本在基因上可能接近于1958年出生的一群英国白人,但是添加托斯卡纳样本仍然有用。 为了了解这种估算的能力如何在种群之间下降,随着遗传距离越远,共享的稀有变体越少,它们以成对方式估算,或者将种群与推定的混合物进行比较。 因此,只要将CEU + YRI与适当的权重结合起来,就可以很好地模拟那些在欧洲与西非主要血统混合的比例很高的非裔美国人。 对于稀有等位基因,尤其如此2 非裔美国人和约鲁巴人,非裔美国人以及约鲁巴和犹他州白人的普通SNP分别为83%和86.5%。 对于稀有SNP,它是45.5%的71.7%! 添加其他HapMap 3总体的模型实际上在插补方面效果较差。 东方欧亚人有不同的遗传变异,这简直使人困惑。

从直觉上很明显,为什么当您增加样本量时会出现稀有等位基因。 但是,为什么稀有等位基因在人群中更具特色? 如果它们是常见的等位基因,它们可能已经存在了很长时间,祖先的变异也可能存在,或者有时间通过​​基因流传播。 相反,稀有等位基因可能是新的,因此在人群中更具特色。 同样,肯定存在通过家庭传承的等位基因。

图3显示了样本量对发现的SNP的影响:

hapmap3fig3

注意两组曲线:非洲与非非洲。 本文证实了以下发现:非洲人比其他人口具有更多的遗传多样性,而东亚人则更少(大概如果美洲印第安人在样本中,他们将四舍五入)。 从文字:

根据此衡量标准,对于不同的人口对,其信息性差异很大。 与非非洲多样性在很大程度上是非洲多样性的子集的观察结果相一致……与相反的情况相比,非洲样品为非非洲样品中的变异位点提供了更完整的发现资源……仅关注30 A原始样本中的低频变异(一两个副本,对应等位基因频率为3.3%或更低),即使非洲样本对于非洲以外的多样性也高度不完整,信息比率降至40 – 60%的LWK和YRI…一般来说,对于低频变异,只有密切相关的人群才能充分捕捉变异,……可能反映了低频变异的最新起源。 LWK和GIH这两个种群被我们的任何其他种群捕获得很差,这是与祖先种群混合的结果,与我们的区域测序数据中的任何种群都不密切相关……。

hapmap3fig2a同样,非洲的遗传多样性可以为其他人群提供信息,但是由于低频等位基因变异,即使非洲人也不足以说明非非洲群体。 从历史上讲,其中很大一部分可能是由于非非洲变种自非洲以外事件以来才出现。 图2a显示了通过低频SNP测量的种群之间以及种群内部的成对关系。 更准确地说,他们从一个种群中选取了30个随机个体,并将它们与同一种群(无重叠)中的30个随机个体以及其他种群中的30个随机个体进行了比较。 黑色条形是相同的人口比较,而彩色条形代表整个人口比较。 条形越高,样品间的一致性越好; 一个样本集中的SNP映射到另一样本集中的SNP。 首先,观察CEU与TSI之间的最小差异。 欧洲人在遗传上是相对同质的,甚至可以追溯到 人类基因的历史和地理 显然,大陆内部差异相对较小。 与CEU参考相关的下一个是古吉拉特人GIH。 从我们所知道的所有其他研究中,这是有道理的。 南亚人比其他任何一个人口都更接近西欧亚大陆。 同样,YRI与来自肯尼亚的班图族样本LWK最接近。 但是,尽管人口相关性的排名顺序与您在Fst中发现的大致相似,但作者注意到,成对比较不是对称的。 GIH可提供71%的TSI低频SNP信息,但TSI仅可提供55%的GIH信息。 为什么? GIH更加多样化,但古吉拉特人也可能是 类欧洲人和非欧洲人,因此您看到的是欧洲分数之间的重叠。 由于托斯卡纳人缺乏非欧洲人的血统,古吉拉特人将拥有其中未找到的等位基因。

说到古吉拉特人,我想强调的补品中有一些有趣的结果。 它们再次说明了语境的重要性。 PCA图表。 它们是现实的表示,但仅具有您解释它们的能力以及您提供给他们的输入的能力。 以下是来自补充内容的一组图像,您可以快速浏览它们。 我已经根据人口和背景对其进行了标记。 注意总体如何根据插入分析的总体集合移动位置。 这些都是方差的两个最大组成部分。

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请注意,古吉拉特人和墨西哥裔美国人如何在全球PCA地块上重叠。 为什么? 因为它们的基因频率是东西欧亚遗传变异的线性组合,所以近似为一。 我之前已经指出 当您查看变化的其他组成部分时,重叠部分就会消失。 但是,如第二幅图所示,您不必这样做。 仅使用墨西哥裔美国人,欧洲裔和古吉拉特人,您会发现墨西哥裔美国人的方差成分不同于其他两个。 这是因为古吉拉特人的非欧洲血统与墨西哥裔美国人的血统迥然不同,尽管当他们排在欧洲人,东亚人和非洲人旁边时,他们聚在一起。 请记住,在全球范围内,PC 1是非洲对非非洲,因此删除非洲人会立即释放出该图的空间。 最后一个数字显示了墨西哥人与中国人和欧洲人的关系,再一次,您看到了变化,这不仅仅是中国人和欧洲人的线性组合,美洲印第安人也没有发现自己的独特之处。 相比之下, 非裔美国人 是西非人和欧洲人的直接结合。 值得庆幸的是,由于非裔美国人的遗传学,他们的父母群体位于原始的HapMap中。 对于古吉拉特人和墨西哥裔美国人,您在原始HapMap中仅拥有一半的图片,并且您必须使用不完善的东亚替代品(对于古吉拉特人而言,这是非常不完善的,对于墨西哥裔美国人来说则是不完美的)。

关于系统发育关系的最后一个问题: 我在其他南亚人中也看到过古吉拉特人中的一种奇怪模式 仍然很明显。 在与墨西哥裔美国人+欧洲人+古吉拉特人的情节中,古吉拉特人似乎是欧洲人+其他事物的线性组合。 什么赖希等。 会被称为“北印度祖先” +“南印度祖先”。 但是古吉拉特语+欧洲图显示,在变化的第二部分中,古吉拉特语的两个群集之间存在差异。 古吉拉特语小组正在发生某些事情,它在方差的最大组成部分上与欧洲人有些距离,因为在第二维度上,他们偏离了其他古吉拉特语群体和欧洲人。 这在质量上与南亚数据集的模式相似,而南亚数据集的变化与欧洲-南印度坐标轴正交。 在欧洲人和南印度人之间的那些中,正交分量是惊人的。 CEU + GHI + CHB的图也没有向我们表明它是东亚的。

hapmap3select无花果当然,本文不仅涉及验证扩展医学遗传学数据集和阐明系统发育关系的能力。 有几个小节,但我想我会跳到最后,它们暗示检测自然选择。 至少这似乎是初步的。 在最初的HapMap中,它们并没有真正适合人群,但为新组找到了一些有趣的东西。 左侧是补充文件中的表格(我对其进行了一些编辑),该表格显示了从 CMS 测试托斯卡纳,马赛和卢希亚(第二个是来自肯尼亚的Nilotic和Bantu)的自然选择。 我将结果提供给对特定位点感兴趣的读者,这些位点在列表中似乎对他们有意义或不有意义。 看来,本文的这一部分主要是为了表明新的种群在充实进化现象方面具有一定的作用,由于人口覆盖受限,HapMap的原始分析中可能缺少这些现象。 将托斯卡纳与CEU进行比较,将马赛与Luhya进行比较,应该可以告诉我们有关乳糖酶持久性演变的信息。 这些对的种群在祖先方面(尤其是欧洲群体)彼此非常接近,但是毫无疑问,当地的生态和文化条件施加了不同的选择压力(大多数托斯卡纳人似乎缺乏常见的乳糖酶持久性等位基因)。北欧我上次检查过)。

最后,从结论:

随着测序技术的改进,低频变化变得越来越容易获得。 更高的分辨率无疑将扩大我们识别与疾病和其他人类特征有关的基因和变异体的能力。 这项研究将CNP和低频SNP与常见SNP整合到比以前更多样化的人群中。 结果强调需要表征每个群体以及等位基因频率的每个阶层中的群体遗传参数,因为不可能从以往的经验中推断出常见的等位基因。 不出所料,低频变异在人群之间甚至是紧密相关的人群之间的共享较少,突出了广泛采样以全面了解人类变异的重要性。

勇敢的读者可以在以下位置随意浏览数据 HapMap网站.

引文: 国际HapMap 3联盟(2010)。 整合不同人群中常见和罕见的遗传变异性质: 10.1038 / nature09298

 
拉齐布汗
关于拉齐卜·汗

“我拥有生物学和生物化学学位,对遗传学,历史和哲学充满热情,虾是我最喜欢的食物。如果您想了解更多信息,请访问http://www.razib.com上的链接”