人口重新排序显示欧洲父系的近期大规模扩张:

来自大约一万年前的新石器时代农民（KYA）或旧石器时代的狩猎者-采集者的欧洲人的比例已引起了广泛的争论。 Y染色体（MSY）的男性特定区域已广泛应用于此问题，但缺乏对多样性和时间深度的公正估计。 在这里，我们显示出欧洲的父系家族最近经历了整个非洲大陆的扩张。 在10名男性（包括3.7个欧洲和中东人口）中，对334 Mb的MSY DNA进行重测序，确定了系统进化，其中包含17个单核苷酸多态性。 约会表明，三个主要谱系（I5,996，R1a和R1b）占我们样本的1％，最近的合并时间在64和3.5 KYA之间。 连续不断的7.3/13人口有着相似的历史，其人口膨胀率从〜17-2.1 KYA开始。 我们的结果与古代MSY DNA数据兼容，并与线粒体DNA数据形成对比，表明广泛的男性特有现象引起人们对欧洲青铜时代社会结构的关注。

纵观本文，它基本上证实了我们从古代DNA和其他大规模测序项目中了解的知识。 直到最近，许多Y染色体系统发育分析还是利用高度可变的区域（微卫星）完成的。 这具有很大的优势，因为差异很大。 但是，它不像基因组中更慢的突变区域那样精确。 但是，由于没有SNP变异体，Y染色体很难进行下一代测序。 这就是为什么我们在这里看到一些收获的原因。

特别是在北欧，相对同质性归因于经历了“星状”扩展的少数世系。 这与大草原人口的到来在人口统计学上是地震这一想法非常吻合。

今天，成为家长制的一部分很重要。 问问任何人是科恩，或自称赛义德，还是孔夫子的后代。 守旧派文化人类学家会认为这些父系是“虚构的”，它们的存在是为了将不同的精英宗族捆绑在一起，成为一种社会力量。 在某种程度上，这可能是正确的。 但并非完全如此。 遗传的复杂故事 科恩斯 强调亲属关系可能并不总是虚构的。 对于赛义德人，我认为其中很多 is 虚构的。 说到南亚人汗（Khan）姓氏，甚至没有人假装我们从耿吉赛德（Genghiside）血统中走下来。 相反，可汗已经从姓氏变成了荣誉称号。

在我的帖子中 父权制与该隐和亚伯一同出现 我将一种社会现象与全新世中期Y染色体有效种群的急剧崩溃联系起来， 基因组研究, Y染色体多样性的最新瓶颈与文化的全球变化相吻合。 不幸的是，一些与纸张有关的媒体似乎颇具误导性。 例如， “ 8,000年以前，每17个女人中只有一个男人生过孩子” （这是 另一种）。 除了有效人口崩溃的事实 仅适用于部分血统， 喜欢 格雷格·科克伦（Greg Cochran） 我对赢家通吃的生殖交配市场的形象表示怀疑。 具体来说，我认为在特定年龄段中，只有〜5％的男性有后代，而其他人则没有。 相反，我认为累积的生殖偏斜可能会影响男性从特定父系制中获得社会特权，因此Y染色体单倍型在整个世代中“席卷”了整个人口。

我的基本想法与格雷格·克拉克（Greg Clark） 儿子也兴起。 克拉克（Clark）的经济历史数据集表明，长期来看 精英世系出人意料地与地位下降保持了隔离。 尽管世代之间流失很多，但从长远来看，有一个很强的趋势线，即精英阶层仍然是精英，非精英阶层仍然是非精英。 这可能是由于文化或遗传因素造成的； 克拉克最终对此表示怀疑。 但是，这表明社会地位是高度可遗传的。 总是这样吗？ 我怀疑，随着复杂社会的兴起，这种类型的动力学只能追溯到全新世，而社会地位则与可以由父子传递给他的物质和权力的积累联系在一起。 此外，在复杂的社会中，出现了群体级的竞争性游戏，即赢家通吃，因为父权制相互对抗，最终结果是最终的胜利或失败。

最终，这与我们对一个真正的“后宫社会”的印象完全不同，后者可能在具有这种生殖偏见的小规模社会中出现。 相反，它是一种更加微妙和渐进的，富人越来越富裕的动态，从遗传的意义上讲，地位和特权在各代人之间更加复杂。

附录： 格雷格·科克伦（Greg Cochran）和 基因组研究 论文指出，有效种群似乎并没有像您期望的那样伴随着常染色体的崩溃。 我要补充的一点是 混合物 由于会提高多样性，因此会夸大人口规模推断。 大部分全新世种群似乎已经混合，因此常染色体有效种群可能被人为夸大了。

我想建议，遗传和考古记录支持 柯南野蛮人 就我们的男性祖先的看法而言，是“生活得很好”。 基本上，是征服敌人并抓住他们的女人，这是对敌人的一种升华。 来自成吉思汗的有争议的报价。 科南也许是虚构的，但成吉思汗不是。 发生这种情况时，有大量的间接证据表明， 成吉思汗是巨大的。 汗不仅生了许多儿子，而且他们的儿子也等等。 全世界有成千上万的男人 成吉思汗及其家人的直接父亲后代。

这是众所周知的。 但是现在有了更多新的知识，这要归功于 基因组研究, Y染色体多样性的最新瓶颈与文化的全球变化相吻合。 本文的优势在于，它利用Y染色体的全基因组序列来产生系统发育推断。 这很重要，因为相对于其余大部分基因组，Y染色体的遗传变异很小。 不利的一面是，由于利用了技术对Y进行全基因组测序，因此299的样本大小不如我们用来分析单亲谱系的大小那么大。 将来，这种情况将会改变，因为世界各地的数据库中有成千上万个Y的全基因组序列，尽管资助机构分配的计算能力可能不足以按照论文中显示的方式来处理它们（不会将整个序列用于很多分析，而是约35,000个SNP）。

那么，论文的主要发现是什么？ 用一个 贝叶斯天际线图 （BSP）很明显 四千至八千年前， 男 世界许多人口的有效人口规模。 同样清楚的是，女性有效人口并没有经历同样的剧烈收缩。 补编有个人数字，许多历史和考古事件可以轻松地映射到这些人口规模的变化上。 例如，非洲人口规模后来的减少可能是由于该大陆后来采用了农业，并与班图人的扩张同步。 在新世界中，数据似乎显示有效人口规模的持续减少和持续减少。 这 哥伦比亚交易所 并且此后可能导致人口大量收缩。 有趣的是，在欧洲数据中检测到两个事件，其中样本量相对较大。 第一次重大下降似乎与“第一批农民”（例如LBK文化）抵达北欧相吻合。 在中东（橙色），您会看到崩塌，然后在很早的时候迅速上升。 这与这里的农业早期历史相吻合。 但是在欧洲的样本中，上升迅速，然后在大约3,000年前稳定下来。 这可能是 印欧 到欧洲的文化。 如果其他地区的样本量与北欧一样大且具有代表性，那么使用BSP方法可能也出现了如此细微的细节（要明确的是，我怀疑欧洲有效样本量的下降是由于I类单倍体，而延误了扩展是由于R1a和R1b在几千年后才到来）。

同样令人感兴趣的是不同进化枝的深层结构。 那些进入Y染色体单倍群的人可以从该图的左上角提取更多内容，但它显示了主要基团的关系及其最近的扩展。 Q和R进化枝对我的亲和力表明，那些认为这些与“北欧亚先祖”有某种联系的人是正确的。 同样，I和J在同一进化枝中的位置也表明了它们来自古代西欧亚更新世群的共同血统。 I谱系最专门与欧洲的狩猎采集者相关，而J谱系传统上与从各个方向扩展到中东的农民群体相关（请注意，J的一个分支位于中东，中亚，南亚和欧洲）。 我同意 二烯 与横跨撒哈拉以南非洲和西欧亚大陆的血统相对应的E分支表明可能是更新世向非洲的反向迁移。 我也想知道他们是否与神秘的“基础欧亚人”有某种联系。

他们强调的论文的重要部分是，在距今约50,000年之前，存在着大量单倍群，这些单倍群与当今在欧亚大陆普遍存在的单倍群有关，Y染色体Ne大约为100。 尽管作者指出，他们没有足够的能力拒绝单独的“南方之路”移民模式，但这似乎与非非洲人在“非洲以外”事件后迅速扩张的观点是一致的。被常染色体数据检测到。 对于Y和mtDNA数据的局限性，这是一个很好的警告； 这两个基因座拒绝了古老的混合物，因为非非洲人源素谱系已经灭绝（mtDNA和Y的周转率高于重组的常染色体区域）。 此外，抽样中还存在一些主要缺陷。 例如，在非洲人口中，似乎没有一些狩猎采集者群体，即科伊桑人或东部my格米人被包含在数据集中。 该地图还显示，未对东北亚（中国，日本和韩国）和大洋洲进行广泛采样。 但是，从他们确实拥有的人口覆盖面的更广泛视角来看，这些只是次要问题。

这些结果的最重要的含义与现代人类生存过程中人类社会组织和行为的变化本质有关。。 上面的论文的作者似乎理解了这一点，因为对该论文中的主题有广泛的关注：

雄性迁移率的增加可能会降低雄性Ne，但如我们的经验数据所观察到的那样，不太可能导致Ne的短暂急剧降低。 各界之间的竞争，在后代之间预期的后代数量方差的增加会大大降低N e（Whitlock and Barton 1997）。 例如，如果竞争是通过男性驱动的征服进行的，则影响可能是男性特定的。 一个历史的例子可能是蒙古扩张（Zerjal等，2003）。 运输技术的创新（例如，发明了轮子，马和骆驼的驯养以及开阔水域的航行）可能促成了这一模式。 可能吧 我们观察到的影响是由于文化驱动的后代内男性后代数量上的男性方差增加以及迪姆之间的男性特异性方差增加，这可能是由于性别偏见的迁移方式增加（Destro-Bisol等人2004； Skoglund等人2014）和男性特定的健身文化遗传所增强。

要重申这里所说的话：

1）在全新世期间，我们看到了强大的父系力量的兴起，它们参与了群体间竞争的赢家通吃。

2）在“获胜”父系中，可能存在获胜者通吃的动力，或者至少是高生殖变异

当涉及到农民和游牧民族之间的对抗时，我确实认为跨种族竞争的模型是很现实的。 但是，当涉及到农民和游牧民族反对狩猎采集者时，我认为没有人能称其为竞争。 在大多数情况下，后者将很快被农民和游牧民族淹没； 消除，排除或至少被同化（在猎人-采集者密度高且久坐的地区有例外）。 至于农民和游牧民族的复杂社会，即使在他们内部，不平等和分层的上升也意味着从属或次要的男性及其血统被边缘化，留下的后代很少。

男人在 平均大15％至20％ 比女人。 男人也是 强 比女人。 但是，大猩猩之间的性二态性远远不足。 这表明男性之间的性竞争已经减弱，或者至少不在物理领域。 尽管我不是那个阵营的成员，但他相信我们所理解的战争必定是全新世农业社会的特征，但似乎人口密集的高压锅导致群体间暴行的规模急剧增加。 对这种变化做出反应的一种方法是在身体上变得更大，但是在生物进化如何重塑人类体形方面存在局限性。 不仅如此，而且更大的人类可能需要更多的营养投入，而马尔萨斯条件下的农业革命并没有大规模地实现这一目标。 因此，人类做了他们最擅长的事情： 文化创新.

文化创新是一揽子交易。 父系宗族的中心作用往往是施加力量以维持社会秩序，并在群体间竞争中扮演矛尖的角色，最终导致这些群体几乎完全拥有权力。 父系制的重要性自然导致确定亲子关系的重要性增加，因此，社会风俗强调了女性的贞操。 这些强大的血统基于大猩猩很久以前就得出的解决方案：将雌性当成动产，并捍卫她们的财产。

“群体中的人”是由农业社会的特定社会文化条件引起的，而他们本身并不一定以任何方式触发。 但是，一旦您对小组中的男人种姓的出现有一点好处，那么发展这种种姓的小组就会受益。 在这些群体中，种姓最终接管了群体的身份，并使自己的利益与群体的利益相适应。 雅典人 城邦 是民主的，但仅适用于出生于雅典的自由男性。 换句话说，古代世界对激进民主的最激进的实验还是相对排斥和具有政治权力和代表权的性质所界定的（同样，请记住，雅典经济地位较低的自由出生男性的权力与它们在海军中作为划桨手的重要性）。

过去几个世纪以来，经济和社会力量以广泛的同情心发言，导致了过去一万年文化创新的缓和，这些文化创新对人类的自由力量产生了直接的影响。 这种巨大的放松在某种程度上可以理解为古老的父权制垄断的瓦解，体现在遍布世界的大家庭和宗族上，首先是所有男人和女人的民主代表制。 在西方，从10,000年到1800年，非熟练工人的收入大幅度增加，扭转了新石器时代出现的“赢家通吃”的趋势。

话虽这么说，后工业和后唯物主义世界在北欧这样的地方盛放，却不完全是旧石器时代。 后新石器时代的一些创新，例如有组织的宗教，可能会留在这个充满社会复杂性和密度的世界中。 精英男性世系对权力的极大下放是一个特定方面，我认为现代更类似于旧石器时代。 更为自由的性伦理也是另一个方面，现代世界更像是狩猎者和采集者。 但是自主的人，一个孤岛，是一个虚构的。 狩猎采集者过去和现在都是社交动物。 毫无疑问，就像现代的狩猎采集者一样，它们也受到禁忌和规则的束缚。 现代西方许多人提倡的平等主义愿景是对后新石器时代世界的社会控制的一种反应，但这些社会控制本身植根于人类的认知冲动。 谷物世界中的竞争尚未完全形成，并且 在大镰刀重新用于血腥目的之前，人类就存在着对暴力和统治的冲动.

引文： Y染色体后裔集群和男性差异生殖成功：年轻的血统扩张在亚洲牧民游牧人口中占主导地位

当涉及人类进化遗传学时，我有两个广泛的兴趣领域。 一方面存在功能生物学和种群遗传学的经典问题。 性状的变化以及如何随时间和空间选择变化。 然后是人口统计学，系统地理学和系统发育学的问题。 这是“历史人口遗传学”趋于下降的领域。 在1995年至2005年之间，有一个重要时期，重点是重建从单亲母系（mtDNA）和父系（Y染色体）谱系推断出的系统树。 通过使用合并框架，这些非重组区域生成了直观吸引人且在计算上易于处理的树，这些树说明了历史之间的关系。 这些通常叠加在地理地图上以重建过去的格局。 自2005年以来，密集的SNP芯片出现，人们可以在成千上万的标记上打字，从而迎来了一个新时代，单亲研究也逐渐淡出了人们的背景（今天，我们正在进行全基因组分析）。 但是有时单亲研究仍然有用，特别是因为已经有一个庞大的样本和研究数据库可供人们使用。 中的新论文 欧洲人类遗传学杂志 就是这样 Y染色体后裔集群和男性差异生殖成功：年轻的血统扩张在亚洲牧民游牧人口中占主导地位这篇文章顶部的图是主要结果的总结，它显示了如何将其数据集中极其常见的Y染色体单倍群与特定历史事件相关联。 作者使用了一系列欧亚人口中超过5,000名男性的数据集。 调查遗传变异很明显，单倍群计数显示出指数分布。 仅在少数个体中发现了许多基因型， 但在许多人中发现了一些.

作者将单倍群称为“下降群”（DC），而不是单倍群。 您可以在顶部的表格中看到DC。 DC2是熟悉的单元组R1a1a，我是它的成员。 DC1是 “成吉思汗” 单倍群。 因为他们使用的是快速变异的微卫星，所以合并估计的间隔很宽。 但， 我几乎100％确信R1a1a会融合到比10,000年前更近的时期。 原因是我看到一些张贴者使用了ASHG Y染色体上的全基因组序列。 由于突变较慢的SNP的巨大标记集，因此这些估计值应更精确，而且对于这些常见男性谱系的最后一个共同祖先，它们也出现在相对较近的时期。 实际上，如果我正确地记得，在这些研究中，R1b和R1a之间的差异可以追溯到大约10,000年，因此R1a必须具有更近的合并。 用于R1a1a扩展的TMRCA令人怀疑地接近于最近一篇关于南亚人崛起的论文，该论文来自于一个土著群体与西欧亚人之间的混合物，来自帝国实验室， 印度最近人口混合的遗传证据。 但是，即使在本文中，也有证据表明从西部到南亚的Y染色体有明显的输入，因此我怀疑它也支持西欧亚人与土著群体之间的混合发生在不同的西欧人之间，而不仅仅是一组（即，印度－雅利安人可能是最后的西欧亚人，他们在公元前3000年到1000年之间快速连续到达）。 这些结果似乎也支持了“亚洲亚洲人”的祖先分布广泛的推测。

R1a1a辉煌

在最终评估中，我对 具体的故事要比一般的故事多。 这种“超级男性”血统模式是新的吗？ 很明显，“阿尔泰式”区议会与土耳其人和蒙古人有关联，并且是根据历史而出现的。 R1a1a及其表亲年龄较大，居住在历史悬崖上的考古学阴暗地带。 但是这种模式对我们的血统而言是原始的吗？ 我自己的推测是，总的来说，这种模式是在远古时代每当创始人事件发生时就预示的。 例如，扩展到大洋洲和新世界。 但是世界有什么不同 after 新石器时代的历史是，定期对父系的树进行“修剪”，因为一个分支会暂时统治它们。 将会消除许多古老的血统，因为一颗新的闪亮之星将主导穹苍。 但是那一刻的回声回荡了几千年，正如人们在单倍群中所看到的那样，这种单倍群遍布欧亚大陆的广阔地带，而且频率与规范不成比例。 人口爆炸像雷电一样，爆炸到人类文化景观中，并定期重塑未来的宗族拓扑。

引文： Y染色体树突然成叶：13,000个涵盖大多数已知进化枝的高信度SNP

有一篇关于人类Y染色体系统发育的新的开放获取论文， Y染色体树突然成叶：13,000个涵盖大多数已知进化枝的高信度SNP，这也很有趣，因为它比本文本身具有参考意义。 引用的论文是“ Batini，C，P Hallast，D Zadik等”。 已提交。 人口重新排序显示了欧洲父系的近期大规模扩张。 自然通讯。” 正如我之前提到的，从ASHG的几位海报中可以明显看出，更大样本量的全基因组测序正在使人们更加清楚地了解欧亚大陆几种常见谱系的发展是最近和迅速的。 特别是我正在考虑R1a和R1b。 我们已经从较早的工作中知道了这一点，但是这些最新结果只是证实了这一点。 从视觉上看，事实是显而易见的。 请注意，在上图中，R1b是如何从单个节点立即散开的。 这反映了最近人口的迅速增长。

但当 人间之旅 和 平安夜的七个女儿 在2000年代初期撰写的文章中，我们假设Y和mtDNA的系统发育可以全面地告诉我们人类史前史。 事后看来，这可能要求太多。 但是，由于这两个血统是特定于性别的，因此这两个血统可以为我们提供有关社会结构的大量信息。 特别是，近来Y染色体谱系的快速扩张可能表明 父权制，因为有势力的男性由于垄断整个社会的资源而开始将一夫多妻制视为一种可行的策略。

如果我必须预测的话，我相信女性血统倾向于以距离动态隔离为特征。 相比之下，男性血统会由于群体的迅速扩张和融合而被定期修剪，这些群体能够在广阔的领土上边缘化或消灭竞争对手。 这 成吉思汗效应 只是这种现象中最突出的。 可以肯定的是，在史前时代也发生了这种情况，例如农业等新技术引发了社会革命，人类之间专业化和分层的兴起。

在格雷格·科克伦（Greg Cochran）的博客中，他一直在 发布 on 印欧。 在很长一段时间里，他就有很多这样的想法，但在我向他讲述了一些有关ASHG 2014的更多信息之后，它在具体细节方面变得非常明确。 例如， 巴基斯坦卡拉什（Kalash） 很多 与“北欧亚先祖”（ANE）的漂移。 “很多”是指与北高加索地区和东欧地区的范围相同。 来自巴基斯坦的其他HGDP样本的信号略低，但仍然值得注意。*在Iosif Lazaridis在2014年ASHG上的演讲中，他概述了欧洲ANE祖先的广泛分布可能与欧洲人的迁徙有关 亚姆纳文化，从中得出 战斧文化。 您今天在东欧和中欧看到的遗传变异是Yamna人的代表。 他们之所以知道是因为他们有这些地区的古代样本。 Yamna本身是类似亚美尼亚人的中东人口和“ Eastern Hunter-Gatherers”（EHG）的混合体，“ Eastern Hunter-Gatherers”（EHG）类似于西部的人，但拥有更高的ANE（因此WHG + ANE，而亚美尼亚人-相似的人口与“欧洲第一农民”（EFF）类似但不完全相同。

但这不是本文的重点。 有两个有趣的Y染色体张贴者。 一个显示 贝叶斯天际线图 这说明，您认识和喜爱的许多Y染色体谱系经历了大约5至10万年前的快速人口膨胀。 第二个发帖人具有从高覆盖全基因组测序获得的Y染色体系统发育。 他们有四个来自R1血统的人，其中两个来自R1a1a。 一个人是印度人，另一个人是俄罗斯人。 合并是在大约5,000年前。 进行此分析的个人并不了解贝叶斯天际线情节海报，因此当我告诉她时，她立即跑过去看了看。 R1a个人与R1b的合并大约在10,000年前。

我知道，关于Y染色体，关于时钟和校准的争论很多。 但是考古学，古老的DNA，常染色体研究和单亲世系都伴随着一幅连贯的图画。 Y染色体数据强烈表明我们在谈论 “星系史” 在最近的人类历史中。

*卡拉什（Kalash）值得 是不 来自亚历山大大帝的士兵。 而是，它们似乎是导致现代南亚人的混合物的早期例子。 他们与其他人口流离失所是由于他们被孤立和配偶。

由于各种原因， 线粒体前夕 Y染色体亚当抓住了公众的想象空间。 这让很多人感到沮丧， 如： me。 我已经进入这个主题的疲劳阶段，但是对恶性模因必须采取某种反击措施。 即使是通常不与种群打交道的遗传学家，也会因mtDNA和Y染色体系统发育的含义而感到困惑。 梅利莎·威尔逊·塞勒斯（Melissa Wilson Sayres），谁在工作 ÿ染色体，网址为： 熊猫的拇指, Y和mtDNA并非亚当和夏娃：第1部分。 如果您有对此问题感到困惑的朋友/熟人，这可能是一个不错的起点。

里面有两篇论文 科学 出现在Y染色体上 Y染色体测序解决了男性与女性共同祖先在时间上的差异 和 1200撒丁岛的低通DNA测序重建了欧洲Y染色体系统发育。 我可以推荐什么 二烯 不得不说，在我看到这部令人震惊的作品之前，我不会发表评论 新科学家: 阿拉伯飞行：150年来早期人类发散。 由于标题的原因，我最初并不认为这与Y染色体有任何关系，但事实证明，该文章利用了以下发现：三个主要的非非洲单倍群体彼此迅速连续地分开，以此作为标题的钩子。 实际上，Y不仅不提供人类历史的确切记载，甚至甚至不一定告诉我们有关人类历史的信息。 这是一个标记，而不是时间机器。 重复： 特定遗传基因座的历史 不是人口的历史. 必须说。

信用： 丹·里夫斯

Y染色体很奇怪。 基因欠佳，而且有很多重复。 这是mtDNA系统发育和系统地理分析比Y染色体早10到15年的原因之一（另一个主要原因是PCR年龄 （mtDNA非常丰富）。 尽管mtDNA的高变区由于其高突变率而成为极好的分子钟（尽管在足够深的时间深度，由于碱基开始转换，这会引起问题），但在下一代测序时代中，Y染色体围绕着Y染色体寻找 单核苷酸多态性 太乏味了（斯宾塞·威尔斯（Spencer Wells） 人间之旅 专注于提取和制备的精髓。

尽管在过去十年中与Y染色体有关的所有怪异故事之一，是牛津遗传学家布莱恩·赛克斯（Bryan Sykes）提出的独特理论，并在他的书中概述 亚当的诅咒：没有人的未来。 正如我在Y染色体上方观察到的那样，Y染色体倾向于充满基因垃圾（因为它不会重组，有害突变往往会累积）。 有一些重要的功能区域（例如， SRY），但也有发生与性有关的疾病的原因：在大多数情况下，男性必须依靠X染色体来吸收Y的余量。推断这种遗传衰变的赛克斯认为，人类雄性将在约一千万年内消失由于这个过程的必然逻辑。 不用说，大多数科学家对此表示怀疑。 外推而没有看到投影是否通过了嗅探测试，这是一个傻瓜的差事。 在任何情况下，都没有自然法则可以决定性别 具有 通过Y染色体。 鸟类和爬行动物有雄性，尽管 有点不同 性别确定系统。

与其通过对Y的判断，不如说是更适当的调查范围。 由于其具有重复序列的丰富性（难以测序）和有趣的基因的稀缺性（因此为什么要打扰），在某种程度上它已经通过微卫星在分子标记之外发挥了短暂的作用（对于那些对特定基因感兴趣的人除外，例如 SRY 和 采风））。 中的新论文 基因组研究 试图对一些哺乳动物类群中Y染色体的进化史进行分类和调查。 哺乳动物Y染色体的比较分析阐明了祖先的结构和谱系特定的进化:

尽管已对三十多个哺乳动物基因组进行了测序以提高质量， 其中很少有Y染色体。 这限制了我们对基因持久性和丧失的进化动力学的了解，限制了我们识别保守调控元件的能力，以及我们对于不同类型的选择在这种独特的基因组环境中维持基因的作用程度的了解。 在这里，我们介绍了来自两个食肉动物（家养的狗和猫）的第一个MSY（Y染色体的男性特定区域）序列。 通过将这些数据与其他可用的MSY数据结合起来，我们的多方向比较可以使选择水平的首次考虑成为问题，而这些选择水平会限制Eutherian Y染色体的进化。 尽管整个系统发育过程中都有基因的得失，但我们显示，以太子祖先保留了15个MSY基因的核心集，其中大多数受到负选择的约束，持续了近100亿年（My）。 X简并和两性基因类别在大多数哺乳动物中被划分为不同的染色体结构域，但在人类谱系中进行了根本性的重组。 我们确定了多个保守的非编码元件，它们可能调节欧舒尔MSY基因。 新的两性基因家族的获得伴随着积极选择的特征，并已不同地影响了不同物种中MSY基因组成的退化和扩展。

毫不奇怪，与这些睾丸功能有关的基因似乎在这些生物体中受到约束或处于选择之下。 在某些方面，Y染色体的存在原因是睾丸。 并不是那么令人惊讶，但引人注目的是这些哺乳动物谱系中Y染色体的基因组结构发生了根本性的分歧。 图很好地说明了这一点：

点击放大

纵观这些结果，这些结果实际上是粗糙的（我想知道，与其他生物相比，人类Y染色体第一次脸红时更大的结构复杂性是否与分配给其测序的更大资源有关）。赛克斯错了的原因是 Y染色体上的进化过程不是线性进行的。 这些血统的轨迹大相径庭。 其中一些可能是由于沿袭特定的选择压力（例如，r与K选定的物种及其与精子竞争的关系）。 其他人可能只是随机的。 与较宽的基因组相比，Y染色体的漂移更大（有效种群较小）。 无论细节如何，都有一个更广泛的故事要讲。

大约在10年前，人们可能会谈论 mtDNA前夕 和 Y染色体亚当。 然后，“人类故事”可能会从大约100,000年前蓬勃发展的一小批东非核心人口迅速发展为典型，并越狱横扫非洲，整个世界岛屿，甚至越过大洋洲和新世界。 在此过程中，所有其他人类世系都被灭绝，边缘化和消灭，他们的文化和基因被遗忘了。 不再， 我们物种的起源 在非洲境内外，可能有几次与“其他”血统的混合事件。 想象一下带有网状图的图形，而不是分叉的树。 系统发育树，具有轻巧但引人注目的晶格支架，将不同的分支绑在一起。