去年冬天有著名的报道说,布什人之间的遗传差异似乎比欧洲人和亚洲人更大。 后两个组在以下方面是分开的 至少40,000年。
至少? 拉齐卜,您距离欧洲人和东亚人的离婚时间还很遥远。 我认为这已经接近30,000年了 最多。 越来越多的证据表明,直到22,500年前,祖先的欧洲人和祖先的东亚人是同一个人。
如今的欧洲人和东亚人主要来自一小群游牧民族,这些游牧民族曾经漫游过欧亚大陆的北部地区—草原苔原带,在上个冰河时期从法国西南部延伸至白令西亚。 然后,该种群在冰川最大时分裂为两部分(Rogers,1986; Crawford等,1997)。 按时间顺序,这种东西向基因流动的障碍与Laval等人的年代相吻合。 (2010 )的祖先欧洲人和祖先东亚人之间的分歧。
评论者强调,斜体字是我的话。 粗体也是注释者的(我必须在该注释中修复一些HTML,但我认为我已根据注释者的意图进行了更正)。 我读了(并写了博客) 论文 引用,所以我很清楚低值的隐含意味着这里存在着东,西欧亚大陆的更近的共同血统。 我有些怀疑。 问题的部分原因是这类计算模型非常棘手,而我们大多数人并不精通构建模型的各个活动部分。 请从引用的论文中考虑以下内容:
我们测试了不同的进化模型……这些模型允许对人类原始人类进行不同程度的渗入。 我们假设早期的原始人传播(直立人)在约1.25年前和〜2.25万年前离开非洲…各种祖先迁徙强度(m 0,祖传移民率是指大约40,000至100,000年以前非洲以外的现代人类外迁之前的移民所占的比例……通过调整替代率 δ,然后我们模拟了一些场景,这些场景考虑了现代人类对古人类的不同替换水平(即古物质向现代基因库中的渗入程度不同),包括最极端的情况(δ = 1)且无替代项(δ = 0)以及几种具有不同中间替换级别的方案…汇总统计数据是通过合并所有人口样本(全球样本除外)来计算的 FST),以最大程度地减少与大陆人口有关的近期人口统计事件的影响。 因此,我们在所有模型中都考虑了三个现代人口的大小不变。 具有剩余祖先迁移率的模型(m 0〜10 - 10) 以及 完全替换 (δ = 1)显然比其他模型更适合我们的数据…最高ψ1the1 与其他ψ相比,经过多次测试校正后,该模型的明显更高。1 值,P <0.01)。 但是,我们无法辨别完整的(δ = 1)和 几乎完全(δ≥0.99) 原始人类的替换(ψ之间的差异1 对这种成对比较而言并不重要),这表明不能完全排除古人类对我们当今基因组的微小贡献……。
本文的这一部分产生了可能的预测 假。 从他们的模型得出的最高概率方案是“完全替代”,接近 在论文发表后不到一个月的时间里证伪了 (尽管直到有更多数据输入之前,我们仍然应该在表明尼安德特人掺和物的结果中保留一定的误差空间)。 但是,即使是第二高概率模型,即0-1%的过时掺合料, 也可能是错误的。 尼安德特人混合气估计在1-4%之间,很可能自然会在区间内,而不是在边缘(我要了解,未来的研究将澄清分数,并且几乎是中点,而不是沿着边缘)的分布)。 显然,这并不一定能证明欧洲人和东亚人的祖先约有20,000年BP的说法是错误的,但是,这应该使我们谨慎对待在假定的人口模型上可能对一系列输入很敏感的模型过多的权重。 。 我认为一个非常相似的模型,其一些参数经过微调,可以与最近的发现相吻合,这些发现证实了通过古代DNA的掺和作用。 但是,这种模型在事后的用途是什么?
提出相对较近的欧亚共同血统时,一个更大的问题与以下事实有关:在许多分析中(尽管不是全部),很明显东亚人比欧洲人更接近大洋洲。 当涉及大洋洲人,巴布亚人,美拉尼西亚人和澳大利亚原住民时,考古学非常清楚和独特。 看来Sahul在大约50,000年前就已定居。 目前的假设是,巴布亚高地和澳大利亚原住民的现代人口是这些人口的后代。 这意味着大洋人已经与其他非非洲人隔离了大约50,000年,其中不包括最近的掺混物(例如,南极洲的影响,欧洲原住民之间的掺混物)。 凭直觉,东亚人和西亚人应该与大洋洲组成一个阵营,但这并不是我们经常看到的(尽管有时我们确实看到了)。 上面是最近关于Fst的论文的Fst距离的可视化 澳大利亚原住民。 您可能看到的不仅仅是各个组之间最后一个共同祖先的时间。 这些人口中有一些是孤立的,很可能经历了人口瓶颈(美洲印第安人和大洋洲人)。
右边是同一篇论文的PCA。 这是您看到的HGDP的标准人群,此外还有原住民,这些人显然与欧洲人混为一谈。 而是专注于巴布亚人。 请记住,您只捕获了HGDP集合中变化的两个最大部分。 但是PCA 3和PCA 4显示,欧亚人和非洲人聚集在一起,而大洋洲人和美洲印第安人则彼此正交。 我个人不会比东亚人更了解欧洲人对巴布亚人的看法,尽管在这种情况下,我认为这与欧洲人并不一致。 让我们以另一种方式来看待这个问题。
以下是同一篇论文的标准STRUCTURE条形图,K = 2到K =8。最右边的人口是大洋洲,土著,美拉尼西亚和巴布亚人。 在最左边的非洲人,然后是东亚人,然后是欧洲人(我删除了南亚和中亚人):
同样,您必须仔细解释这些结果。 东亚人,美洲印第安人和大洋洲人倾向于首先与欧洲非洲人分开。 稍后,您会看到原住民之间明显的欧洲混合,以及美拉尼西亚人之间的南洋混合。 但是,仍然要注意,随着K值的升高,大洋洲和欧亚人之间的遗传变异往往会首先与欧洲人分开。
现在让我们看另一篇论文, 非洲人和非裔美国人的遗传结构和历史。 两个数字。
正如他们所说,越来越好奇。 第二个数字可能实际上与大洋洲人早于欧洲人+东亚人的分支一致。 但是,再看看美洲印第安人分支。 目前所有的研究都表明它们来自西伯利亚群体。 它们的遗传距离可能是种群瓶颈和/或缺乏与种群间遗传交换的函数。 世界岛。 一个问题是,第二篇论文将广泛的非洲人口作为输入。 这是本文的STRUCTURE结果的一部分:
最后,一棵树从 从全基因组变异模式推断出的全球人类关系:
我有点用图表来充实这篇文章,但是原因是,每当我试图评估历史或考古假说时,这些图表总是贯穿我的脑海。 显然,这并不能阻止 棒棒糖。 我如此内部化了非非洲人是非洲人的一个分支的模型,因此我忽略了考虑非非洲人与非洲人的遗传距离差异,甚至不包括那些最近来自撒哈拉以南非洲的明显混血的人,例如莫扎比人。 此外,由于以下原因,您始终必须考虑当地的遗传特性 隔离 由于沿袭的某些分支上的进化参数不同,这可能会欺骗群体之间最后一个共同祖先的时间。 显然,尼安德特人掺和物的故事与 古代DNA的其他令人困惑的结果 应该使我们对先验的稳固性非常谨慎,因为先验可用于构造任何给定断言的概率计算。
回到欧亚大陆和大洋洲。 对我来说,关键是我确实相信考古学家将萨胡尔,新几内亚和澳大利亚的人口固定在50,000年之前是正确的。英国石油公司也对新几内亚高地的人口和非欧亚组成部分抱有一定的信心。原住民血统可以追溯到最初的定居时期。 看着上面的树木,我根本不相信东亚人和欧洲人距大洋洲人的间隔时间只有一半。 解决方案的一部分可能是 混合物。 我谦虚地接受这样的主张,即南亚人是混合人口,而且他们的立场是 之间 西欧亚大陆和东亚欧亚大陆,但更接近前欧亚大陆,与古代基底和西欧亚大陆人口之间的混杂关系有关,后者在过去一万年间侵入了该次大陆。 类似的模型可能适用于东亚欧亚大陆,那里的这些人口是与萨胡尔(Sahul)远缘的远古群体的混合物,是西伯利亚边缘的入侵群体。 然后,可以通过旧石器时代的这种共同的古老血统来解释东亚人与大洋洲人的相对亲密关系(特别是巴布亚人,他们似乎没有南洋人的混合物)。 目前阿穆尔河以南的东亚地区变化格局,可能主要是由于中国北方某地农业创新所在地的农民人口膨胀所致。
当然,有很多模型可以通过口头构建,并找到 一些 对文学的支持。 我个人的偏爱,尽管只是微弱,但还是将西欧亚人与所有其他非非洲人分开,距今大约40,000年前。 然后将大洋洲人与所有其他非西欧亚非人人分开。 然后将美洲印第安人与东亚欧亚人分开。 最后,在全新世时期,西欧亚大陆和东亚欧亚大陆的一部分被扩张,并逐渐取代了整个东南欧亚人口,这些人口横跨印度到萨胡尔边缘。 这并没有消除围绕欧亚大陆北部边缘的基因流动的可能性(实际上是可能性)。
但归根结底,这是谦虚和谨慎的日子。 当然,在写作过程中,我有时会忘记这一点,但是回应并不是去反驳和大胆地宣称自己的立场。