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菲律宾内格里托。 信用: 肯·伊里奥(Ken Ilio)

在下面发布 我提到过,马来西亚人和菲律宾人Negritos似乎是两个非常不同的人口。 我想对此进行更详细的探讨,因此我自然决定在 泛亚SNP 数据集。 由于数据集中只有约56,000个标记(相对于HGDP中的约600,000和HapMap中的1万以上),使目标变得更加困难。 此外,与其他数据集的交集很小。 例如,只有约20,000个SNP具有HGDP。 考虑到所有这些,我警告说总有没有总比没有好。 从数据集中删除了亲戚和HapMap人口(感谢 扎克)。 另外,我用HapMap中的古吉拉特人加强了南亚人口,该古人中有约32,000个SNP。 经过几次测试后,我决定删除 马尔布里。 他们总是很早就与附近的许多其他人分开而摆脱种族,而且他们的遗传距离非常高。 这个部落只有数百个编号,如果他们受到很多人口瓶颈的困扰,导致等位基因频率非常独特,我也不会感到惊讶。

但是在得出结果之前,让我们先备份一下。 谁是 “内格里托斯”? 如术语“ Negrito”所暗示的,是指以小尺寸和非洲特征(非常黑的皮肤和卷曲的头发)为特征的一系列人口。 通常,它们的分布范围仅限于东南亚(有建议称,Negrito种群可能只是在最近才在澳大利亚的雨林中灭绝,但这是推测性的。在更古老的规模上,有一些记录可能被解释为暗示了Negritos的存在。台湾最早是1900年,而过去1,000年来在中国南部)。 因此,您可以将它们从安达曼群岛到菲律宾的分布与马来半岛中孤立的群体放在一起。 推测Negritos是来自北方的稻农到来之前的东南亚原始居民。 像非洲P格米人一样,大多数内格里托人都说野兔在其他人群中广为人知。 菲律宾的那些人讲南斯拉夫的方言。 有趣的是,马来西亚的人说的是南亚语,因此在语言上与北方的许多族群有亲缘关系,被南斯拉夫语系人包围。 只有安达曼岛民有一种独特的语言,这使他们与亚洲大陆的影响力相对孤立,这才是有意义的。

我从K = 4到K = 12运行ADMIXTURE。K= 8对我来说最有用(在K值较高时,主要动力是菲律宾Negritos开始分裂成许多不同的簇)。 我做了一些外观上的更改。 有了这个东亚和东南亚繁重的数据集,所有各个印度团体之间几乎没有区别,所以我将它们合并在一起。 我对地理上相邻但没有遗传差异的相关人群也进行了相同的操作(例如,中爪哇省和东爪哇省)。

这两个Negrito团体的区别非常明显。 但是,更明显的是两个推断聚类之间的Fst值。

NE亚洲 内格里托 苗族 美拉尼西亚 亚洲人 内格里托 南亚 南岛
NE亚洲 0 0.101 0.046 0.099 0.095 0.098 0.07 0.045
菲律宾Negrito 0.101 0 0.11 0.105 0.113 0.124 0.108 0.096
苗族 0.046 0.11 0 0.108 0.107 0.099 0.072 0.058
美拉尼西亚 0.099 0.105 0.108 0 0.099 0.113 0.104 0.1
亚洲人 0.095 0.113 0.107 0.099 0 0.104 0.103 0.108
马来西亚Negrito 0.098 0.124 0.099 0.113 0.104 0 0.086 0.098
南亚 0.07 0.108 0.072 0.104 0.103 0.086 0 0.062
南岛 0.045 0.096 0.058 0.1 0.108 0.098 0.062 0

这里明显的是 两个推断种群之间最大的遗传距离是在马来西亚和菲律宾内格里托群之间! 让我们对关系进行一些可视化:

观察到菲律宾的Negrito集群倾向于与南斯拉夫的人有亲戚关系,而马来西亚的Negrito集群则对南亚人有一个亲和力。 您可以从不同的部落中得知,在前一种情况下,与南洋人混合在一起,但马来西亚的Negritos呢? (谁是济海人, 宪水 这是单个条形图:

在这个人口中有大量的亚洲-亚洲混合气。 之前我们已经看到ADMIXTURE的推断人群群只是一个 粗暴 过去存在的实际人口的指南。 现实情况是,人类的历史一直以人口的反复裂变和融合为特征,因此所有ADMIXTURE群集都将根据您使用的时间顺序组合在一起。 马来西亚和菲律宾Negrito集群与地理上接近的集群之间的亲和力向我表明,他们在告诉我们有关古老混合事件的信息,这些事件已重新组合成一个新的复合种群自然不属于该算法的地步。 可能是在台湾之后,菲律宾是原始南朝鲜人的第一个主要登陆地,因此它们可能在很早的时候就对Negritos产生了重大影响。 即使使用ADMIXTURE,大多数Negrito部落也已经清楚了这一点。 对于马来西亚的Negritos来说,混合不是那么极端,但是他们说一种南亚语的事实表明了杂交。

我还进行了一些主要成分分析。 基本上每个维度代表遗传数据集中的独立变化轴。 变化的第一个组成部分显然是东亚的ins欧亚大陆。 请注意,它是第二维的5倍。 我强调了两个Negrito人口。 观察到它们通常没有表现出特别的亲密关系:

那么这个故事的寓意是什么? 不要凭封面判断一本书! 直到最后一个冰河时代结束〜12,000年前,水域上升为止,欧亚大陆的东南部地区,再到大洋洲,都没有那么零散。 从地理上看,您拥有今天的马来西亚和印度尼西亚西部的圣达兰州。 东部有萨胡尔(Sahul),它将澳大利亚和新几内亚合并在一起。 20世纪,身体人类学家向印度扩展,向东南扩展至澳大利亚。 异种种族。 使用ADMIXTURE和PCA 能够 看到冰河时期东南欧种族从印度延伸到澳大利亚的阴影。 因为在澳大利亚和美拉尼西亚以外的地区,阴影很深,或者是很薄的淹没层,或者是残留的部落,例如菲律宾的阿提(Ati)或马来西亚的西曼格(Semang)。


马来西亚Negritos〜1900

但是这些人口有其自己的人口结构和区别。 我敢打赌,马来西亚的Negritos距离Andaman Islanders的Onge更近,而这两个群体是从 西 桑达兰德斯的分支。 菲律宾Negritos来自 分支,以及他们与美拉尼西亚人的亲密关系 五月 这是由于两个族群之间存在着长期的基因流动(另一种选择是,两个族群中很老的南洋杉混种都将其非南洋杉混种的等位基因频率移到了更近的位置)。 总的来说,我怀疑过去的大约10,000年与过去有根本的不同,因为农业人口统计学的影响,人口的替代和扩张以前所未有的规模发生。 就遗传多样性而言,其余的Negritos可能只是冰山一角,随着猎人让渡给农民,它们消失了。

图片来源: 马克西米利安·道尔贝克(MaximilianDörrbecker)

 
拉齐布汗
关于拉齐卜·汗

“我拥有生物学和生物化学学位,对遗传学,历史和哲学充满热情,虾是我最喜欢的食物。如果您想了解更多信息,请访问http://www.razib.com上的链接”