想象一个半黑半白的人。 有些特定的等位基因对黑人或白人祖先具有高度诊断性（例如， SLC24A5 或达菲（Duffy）。 在混合个体中，这些等位基因将与来自一位亲本的同一染色体片段相关。 他们将有线性的血统。 通俗地说，一对染色体来自一个种群，另一对来自另一种群。 现在，假设您有一群白人和黑人血统混杂的个体，他们在世代之间相互配对。 祖先的分数将保持大致相同 （假设有大量有效种群），但是特定种群的祖先的基因组片段将被分解 重组。 初始混合事件产生的代数越多，祖先段的块就越会被加扰。 LD是可以测量此数据的统计数据，因为我们正在谈论整个基因座上相关等位基因的模式。 给定足够长的时间，LD将收敛于您在随机交配种群中的期望值。 但是，如果混合事件发生的时间足够近，则LD将在一定间隔内升高，这可以使您对过去发生混合事件的时间有所了解。 Ashkenazi犹太人的LD形态是经过欧洲人和中东人混合而来的，而不仅仅是等位基因频率介于这两类人之间的人口。

关于方式，近交如何？ 我会就近亲繁殖的意思发表后续文章，但这是一篇论文，可以使人们更好地了解阿什肯纳齐犹太人的生活， 基因组时代的亚伯拉罕的孩子–主要的犹太散居人口组成了具有共同中东祖先的独特遗传集群:

犹太人之间的IBD表现出较高的共享段频率...一个社区中的中位数对人群共有50 cM IBD（四分位数：23.0 cM和92.6 cM），预计该水平将由一个表亲中的第4或第5个表亲共享。完全纯种的种群。 但是，这些社区中的典型共享群体比第5个堂兄弟之间的共享群体要短（8.33 cM长）， 表明大多数成对的犹太人之间有更远距离的亲戚关系s...。

在不同的犹太社区中，观察到三种不同的模式……希腊和土耳其犹太人的IBD水平相对适中，与法国HGDP样本中观察到的相似。 意大利，叙利亚，伊朗和伊拉克犹太人表现出很高的IBD水平，这是极度近交人群所期望的。 与其他人群不同 阿什肯纳兹犹太人展出 在范围较短的一端增加了细分受众群的份额 （即5 cM长度），但在较长的一端（即10 cM）减少了共享…。

另一张纸， 精细的种群结构和下一代测序时代:

可以容易地量化基因组共享的数量，并且可以估计种群中随机的一对个体之间的关系程度。 例如，在阿什肯纳兹犹太人口中，随机的一对个体在基因上平均与第四堂兄弟相似，这表明最近的族谱可能很重要。 近交对稀有疾病发生率的影响已在历史上的内配气种群中得到证实，例如阿什肯纳兹姆，哈特人和一些岛屿群……但是，如果世界上许多地理区域的结构都按逐代相同的精细结构（ IBD）分析，那么这些地区的人群中稀有等位基因的发病率也可能升高，而相应的独特稀有疾病的发病率也相应上升。 实际上，就基因组片段的平均IBD量而言，Ashkenazim在上述全球样本中并不是异常值.

正如该文件所指出的 拉尔夫（Ralph）等。 等 许多欧洲人口共享IBD片段，表明在〜2,000年的时间范围内存在相当多的相关性。 许多短道的阿什肯纳兹（Ashkenazi）犹太模式是为什么服务喜欢 23andMe 对那个背景的个体产生了如此多的“相对”匹配。 这些人有很多相同的祖先，但是这些人通常回溯到很久以前。 因此，当考虑“近亲”为近亲表亲婚姻的产物时，阿什肯纳兹犹太人不是以这种方式近交的。 它们不会表现出异常长的IBD区域，这就是您在两个父母之间有很多非常共同的祖先的情况下在人群中流动的东西。 父母与子女之间的关系系数为50％。 表亲之间（在近亲交往中）为12.5％。 在四个表亲之间是0.2％。

仅仅因为阿什肯纳兹犹太人没有通过这种措施自交，并不意味着他们在基因上不是相对同质的人，并且表现出很大的独特性。 他们是这样。 但是正如我前面所说，这种独特性很可能是由于古老的世界主义混合，然后由于他们在伊斯兰和基督教文明中处于边缘化少数群体的地位而导致向相对严格的内婚制转变。

但是自然会变得比这更复杂。 在伊斯兰教和基督教崛起为嵌入犹太人的主要宗教文明之后，启蒙犹太教犹太教建立了一个 莫迪斯维旺迪。 犹太人是一个法人实体，是少数人从属于多数人的企业，其与多数人的关系是通过在社区中有发言权和权力的知名人士进行调解。 尽管犹太人经常对死刑执行感到困惑，但犹太人在前现代政治部门中的地位并没有争议。 犹太人是有义务的对象，通常对有能力的人有用。 他们不是有权利和责任的公民。 在过去的几个世纪中，这种情况已经明显改变。 法国大革命和民族国家观念的出现，在这个民族国家中，所有公民在法律面前享有同等的权利和责任，加上科学的种族观念，使犹太人与他们所居住的社会（特别是在欧洲）的关系变得复杂（尽管泛土耳其人和泛阿拉伯民族主义是相似的，并导致相似的身份问题）。 尽管有西班牙这样的现象， “血液清洁”以及犹太人的自我观念 以色列到了19世纪，犹太人提出了具有非常特殊和确定的生物学品质且可遗传的种族观念。 纳粹的彻底灭绝计划与先前对犹太人社区的袭击形成鲜明对比，在犹太人社区，conversion依基督教和更广泛的同化是合理的目标。 纳粹分子不仅要消除犹太人的文化，而且要消除他们的生物学上的存在。 具有讽刺意味的是，欧洲犹太人自己将这种种族/民族特色的感觉内化了，即使在根本没有宗教信仰犹太身份的人（例如西格蒙德·弗洛伊德）中也很明显。 这解释了最初的犹太复国主义计划的世俗性质，该计划的目的是为犹太人创建一个民族的民族家园，从而使他们在国家之间而不是在国家之间成为一个国家（这是一个宗教和同化犹太人最初反对）。

随着大屠杀和第二次世界大战后种族民族主义的拒绝，根据头骨度量标准以及更合理的血统来对人进行测量和分类的通常是伪科学的实践，因此声名狼藉。 一些学者开始重新配置犹太人，而不是将其配置为生物后裔，而是将其配置为宗教意识形态或自白，最终成为种族身份。 这种文化模式的最极端支持者认为，犹太人群体是通过文化传播和宗教信仰化而出现的。 波兰的犹太人是采用犹太教犹太教的波兰人。 摩洛哥的犹太人是采用犹太教犹太教的阿拉伯人或柏柏尔人。 依此类推。 换句话说，这所学校将犹太人转变为德国改革运动的尝试，使犹太人成为另一种没有种族内涵的宗教坦白（因此需要对选择的某些方面进行重新解释） 员工兜帽）。

但是，由于基因科学的兴起，以及在犹太世界更广泛的潮流中，这种钟摆已经转回去了。 关于第二个问题，我将指出，美国改革运动已从其更为激进的调解中撤回了对外邦人的敏感性。 与手头主题特别相关的是，改革犹太教扭转了其对犹太民族思想的拒绝。 我怀疑这在很大程度上是因为美国犹太人和西方国家的犹太人在反犹太主义下降时，不需要通过自觉地将自己与主流的宗教身份观念结合来证明他们属于自己的身份。

现在我们来谈谈遗传学。 这 犹太人的遗传学涉及大量相关领域。 它的很大一部分是出于医学上的考虑，特别是“犹太疾病”，例如泰-萨克斯（Tay-Sachs）。 尽管大量研究的最终目的是澄清关联研究中的人口分层，但是在过去的几年中，人们对犹太人彼此之间以及与其他人群的可能起源和关系有了很多了解。 最初的重点是单亲谱系，雄性和雌性标记分别通过Y染色体和mtDNA。 这些的总体结果是 完全替代和纯粹文化传播的极端情况都是错误的。 一方面，世界各地的犹太人普遍拥有意料之外的遗传亲和力，这不是从地理上就能预测的，而只能从他们作为犹太人的共同宗教-种族身份来预测。 但是犹太人在地理上的聚集方式让人想起了他们所定居的外邦人口，这表明他们可能是在最初分离后独立发展和/或与当地人口混合在一起的。

其中最流行的 此博客上的帖子 着重讨论了阿什肯纳齐犹太人和外邦人之间的差异，尤其是欧洲血统的人们。 左图说明，年纪轻轻或犹太人的白人美国人在基因上很容易区分开。 考虑到医学遗传学家早就知道这种疾病具有生物学根源，并且在这些人群中严重偏重，因此犹太人表现出特别独特的遗传特征可能并不令人惊讶。 独特的性状暗示着独特的基因。 而且从文学记录中证明的犹太人的人口历史可以很容易地在遗传学研究得出的许多结果的框架内进行拟合。

但是，我上面提到的关于流离失所的犹太人社区之间的分歧的问题又如何呢？ 中的新论文 美国人类遗传学杂志 竭尽全力试图在不同的犹太人社区以及他们可能与之交往的其他人群之间建立一套关系。 基因组时代的亚伯拉罕的孩子：主要的犹太散居人口包括具有共同中东祖先的独特遗传集群:

一个多世纪以来，犹太人和非犹太人都试图定义当代犹太人的亲缘关系。 先前对血型和血清标志物的遗传研究表明，犹太人群体起源于中东，成对的犹太人之间的遗传相似性更高。 然而，这些和后续研究的单等位基因Y染色体和线粒体遗传标记并不能解决组内和组间犹太遗传同一性的问题。 在这里，对七个犹太人群体（伊朗，伊拉克，叙利亚，意大利，土耳其，希腊和阿什肯纳兹）进行全基因组分析，并与非犹太人群体进行比较，结果显示出独特的犹太人群体，每个群体都有中东血统，与当代中东人十分接近。东部人口，以及不同程度的欧洲和北非混合物。 根据主要成分，系统发育和通过血统（IBD）分析确定了两个主要类别：中东犹太人和欧洲/叙利亚犹太人。 IBD区段的共享以及欧洲犹太人彼此之间以及与南欧人口的接近表明欧洲犹太人的起源相似，并且驳斥了中东欧和斯拉夫人口对阿什肯纳齐犹太人形成的大规模遗传贡献。 艾克肯纳兹犹太人基因组中IBD的快速衰退与严重的瓶颈紧随其后的是大规模扩张相一致，例如所谓的人口膨胀奇迹，即从50,000世纪初的15人增长到5,000,000世纪初的19人。 XNUMX世纪。 因此，这项研究表明，欧洲/叙利亚和中东犹太人代表了由共享的IBD遗传线编织在一起的一系列地理隔离物或集群。

我能看到的这项研究的主要局限性是，没有包括非阿什肯纳兹犹太人的两个非常众多且有趣的群体，即摩洛哥人和也门人。 也门尤其令人感兴趣，因为在历史上对坚持犹太宗教的也门国王有一些提及，因此暗中可能把相当数量的南部阿拉伯人带入了该宗教。 我所看到的有关也门犹太人遗传学的研究在关于他们是否与其他犹太人或与非犹太人也门人表现出更多亲和力方面混杂在一起。 但是紧挨着结果宝库的那是一个小小的抱怨。 快速回顾研究中的组：

阿什肯纳兹（Ashkenazi）–轻松，中欧犹太人

伊拉克犹太人–米兹拉希（Mizrahi），大概是从巴比伦社区后裔的犹太人，其历史可以追溯到 第一次流放

伊朗犹太人– Mizrahi，应来自巴比伦犹太社区。 在波斯美索不达米亚征服巴比伦后的大部分历史中，美索不达米亚和伊朗的心脏地带被合并为一个政治部门。 在奥斯曼帝国设法抵制波斯之后，美索不达米亚和伊朗之间的分歧得以固定，波斯的萨法维德王朝在16世纪试图收回伊拉克之后，美索不达米亚和伊拉克之间的分歧得以保持。

叙利亚犹太人– Sephardic，但古代黎凡特犹太人的住所，其历史可以追溯到古罗马时期和1492年后的Sephardim。 叙利亚的原始礼拜传统显然延续到近代灭绝之前的现代时期

土耳其犹太人– Sephardic，但安纳托利亚犹太人的住所可以追溯到上古罗马时期和1492年后的Sephardim

希腊犹太人–主要是塞帕尔迪克人，是希腊犹太人的住所，其历史可以追溯到上古罗马时期和1492年塞帕尔丁之后（请注意，直到19世纪，希腊还是奥斯曼帝国的一部分）

意大利犹太人–我相信这项研究将他们归类为Sephardic，但该群体的起源和性质尚不明确。 意大利的犹太人社区可以追溯到上古罗马，因此不在Ashkenazi-Sephardic二分法之列，但在操作上它受到Sephardic Diaspora泛地中海游移的影响

实际上，最后一点是不同的犹太社区相互影响和相互影响，这是一个普遍的事实。 在极端的情况下，在中世纪时期对犹太人的迫害远至德国和西班牙，导致新移民涌入印度南部喀拉拉邦的犹太社区。 就像有一个从大西洋延伸到中国边界的伊斯兰世界，以及一个横跨西班牙和俄罗斯的基督教世界一样，犹太人的世界也从其心脏延伸到了中欧和中东，一直到遥远的地方前哨基地，如华北的开封和南印度的喀拉拉邦。 但是，强大的文化相互联系流并不一定需要大量的基因流。

让我们看一下图中所示的结果。 首先是一张表格，显示以上列举的犹太人口与HGDP数据库中选定群体之间的成对遗传距离。 对角线上方的数字表示Fst，换句话说，遗传变异在总种群中的比例，由种群之间的行-列对定义。 数字越大，两个种群之间的遗传距离越大。

由于我不得不缩略一些数字，因此以下是描述这些结果要点的文本：

这些发现表明，最遥远和最有区别的犹太人口是伊朗犹太人，其次是伊拉克犹太人（分别为所有其他犹太人口的平均FST 0.016和0.011）。 最接近的遗传距离是希腊人和土耳其人Sephardic犹太人（FST = 0.001）之间的距离，后者又接近意大利人，叙利亚人和Ashkenazi犹太人。 因此，可以识别出两个主要群体，可以归为中东犹太人和欧洲/叙利亚犹太人，这一观察结果得到成对FST和系统树分析的支持……。

在150年前希腊独立之前，土耳其和希腊社区在运作上几乎是统一的，因此，小距离是有道理的。 值得注意的是，在遗传距离上的区别映射到了罗马帝国和波斯帝国之间的区别，在罗马帝国和波斯帝国中，两个犹太人社区分别以不同的位点出现，分别是美索不达米亚和巴勒斯坦-亚历山大轴。 在罗马帝国境内的叙利亚犹太人比欧洲犹太人更像欧洲的犹太人，而不是东方的伊拉克犹太人。 尽管这可能部分是由于过去几百年来西班牙Sephardim的涌入。

但是Fst的数字可能很难用数字解释 完形 时尚。 因此，让我们看一下PCA图。 他们过滤了SNP，以获取最原始的信息。 也就是说，在人口差异之间表现出很多差异。 他们使用这些SNP提取了变异的最大独立成分。 请注意，PC 2和PC 3之间的差异很小，因此都引起了人们的兴趣。 首先，以下是与其他HGDP人口相关的犹太人群体：

没有惊喜。 犹太人跨越欧洲人和中东人。 但是，让我们深入研究。 他们还使用了PopRes数据集，据我回忆，该数据集比HGDP更具国际性。 我添加了一些澄清标签。

在我们如何理解犹太人，特别是阿什肯纳兹犹太人与欧洲人的关系方面，以上内容并没有真正改变。 粗略地说，犹太人与欧洲群体的遗传关系追踪了一个地区受到罗马影响的程度。 犹太人最接近意大利人，最不接近芬兰人和俄罗斯人。 另外，请记住要谨慎对待PCA图； 据我所知，这些维度不属于旨在最大程度地提高犹太群体之间人口差异的SNP集合，从而提高了区分犹太群体的能力。

回到HGDP样本，您会看到类似的模式。

伊朗犹太人和伊拉克犹太人，未曾受塞巴第散居犹太人或罗马帝国感动的犹太人与西方的犹太人群体截然不同。 实际上，有趣的是观察到，至少在总基因组含量上，各个黎凡特阿拉伯阿拉伯群体与伊拉克犹太人和伊朗犹太人相邻时，它们与叙利亚犹太人非常接近。

观察变异的另一种方法是通过结构，那里有K个祖先基团，单个基因组被认为是K个基团的合成。

结构图证实，阿什肯纳兹犹太人比其他犹太人更欧洲化，伊朗犹太人欧洲化程度最低。 地理学的这种影响，或者说是距离的隔离，在其他研究中也得到了证实。 但是，在完全不考虑距离的完美国际化的犹太人散居人口中，它应该更弱或不存在。 该模型似乎是错误的。 对于这种模式，最合理的解释是由单亲血统支持的， 是当地的犹太人口与周围的人口混杂在一起。 当然，可能是Ashkenazi犹太人经历了人口瓶颈，成为一个高度内婚的近交社区，因此遗传漂移导致了它们的独特性。 但是在那种情况下，他们应该表现出与巴基斯坦卡拉什（Kalash）一样独特的特征，可以认为他们是通过基因隔离形成了自己的“微种族”的。

回到大体上的遗传关系摘要，这里是用上面的Fst数生成的系统发育树。 我认为应谨慎对待这些树木，因为此类树木本质上是尖锐的且不连续。 甚至作者都观察到，这些犹太人群体以及整个人类群体的特征是随着时间的流逝而产生的基因流动和混合，因此，其中某些代表下的假设是理想化的。 树木总是被认为是健壮的，但是不知何故，我在不同的研究中已经看到非常广泛的树木，这常常取决于标记集或同一组人口的技术。

最后，作者检查了犹太群体基因组中的后裔认同度（IBD）。 IBDjust指基因组的一个区域与另一个相同的事实，因为它们是同一原始副本的后代。 例如，兄弟姐妹的后代具有巨大的基因组区域，因为每个亲代贡献了后代基因组的一半。 几代人通过重组打破了一条物理链上遗传变异的相关性。 如果两个不相关的个​​体的基因组长区域在血统上相同，则表明他们共享一个最近的共同祖先，而他们的基因组贡献并没有被太多的时间和重组所稀释。

本文的图3总结了主要的IBD结果。 在面板A中，红色条形是犹太-犹太比较，黄色是非犹太-犹太人，蓝色是非犹太-非犹太人。 小图C在二维平面上绘制了从IBD结果得出的遗传关系。

犹太人在血统上共享许多相同的基因组。 另外，关于哪些组彼此接近，其他结果也达成了普遍共识。 他们在文本中指出，犹太人之间血统相同的部分很小，这意味着重组已经打破了大块。 因此，这意味着高比例的犹太人-犹太人IDB是更多过去的许多共同祖先而不是最近的一些共同祖先的功能。 尤其是阿什肯纳兹犹太人，与较长的街区相比，跨短街区的基因组共享增加，这表明人口稀少。 基因位点在IDB基因座周围也被适度富集，这可能表明了犹太人群在功能上的共性。 如果您对犹太人倾向于共享IDB的基因感兴趣，请在此处列出：

毕竟我们在哪里？ 我认为讨论的这一部分解决了广泛的调查结果：

中东人口是由巴比伦和波斯帝国中的犹太人组成的，据认为这些地区在地理上一直保持连续。 相比之下，其他犹太人口则是由近来移徙是犹太人普遍习俗的希腊移民形成的，后者是从巴勒斯坦移居或驱逐出巴勒斯坦的犹太人和converted依犹太教的个人组成的。 在古罗马时期，大规模的宗教信仰转换导致罗马时代有6万人从事犹太教活动，占罗马帝国人口的10％。 因此，包括阿什肯纳兹犹太人在内的这些欧洲/叙利亚犹太人彼此之间以及与法国，意大利北部和撒丁岛人之间的亲缘关系，在建立欧洲/叙利亚犹太人群体和这与阿什肯纳兹犹太人在很大程度上是are依的卡扎尔人或斯拉夫人的直接直系后裔的理论不符。 在最近的其他几项研究中，还观察到了Ashkenazi犹太人与南欧人口的遗传接近性。

早期历史很重要，这些发现所指出的是，即使在2,000年之后，今天仍然存在西方和东方犹太人之间的鸿沟，这种鸿沟属于罗马波斯政治鸿沟。 就文化和遗传学而言，都有“先行者”的优势。 即使美国只有一小部分人是英语血统，但绝大多数美国人会说英语，并坚持 英国起源的文化传统。 同样，在群体历史的早期，混合事件可能会产生较大的影响，这要取决于后来人口规模的变化。

作者将重点放在特定的文化和历史参数上，指出奥古斯都时代的犹太人与查理曼大时代的犹太人非常不同。 到查理曼大帝时代，法利赛人的犹太教已将其他群体（在某种程度上除外卡拉派）边缘化。 在奥古斯都时代，犹太人被划分为不同的派别和说服力，并且充满多样性。 此外，在罗马宗教市场上，犹太人是一个中等企业家群体。 希律王朝本人是convert依的。 犹太人的宗教活动和信仰范围广泛，从埃森纳人近乎修道院的隔离，到订婚但分离主义的法利赛人，最后到在“希腊化犹太教”专栏下的更多融合主义习俗。 许多学者断言基督教是犹太教派最终起源于最后一个部门，基督教最终吸收了所有其他形式的希腊化犹太教。 法利赛人的犹太教，后来成为犹太教犹太教，最近又发展为犹太教 这里 犹太教的形成在很大程度上是由于必须适应和安抚主要的基督教和伊斯兰宗教文化，并在中世纪早期融入其中。 从基督教或伊斯兰教转变为犹太教通常是死罪（尽管在穆斯林土地上不禁止从基督教向犹太教的转变，尽管在穆斯林土地上居住的穆斯林很少，但在基督教土地上从伊斯兰教转变为犹太教是不被禁止的）。 因此，在公元500年以后，似乎发生了这样的情况：尽管有一些原始的黎凡特起源，但具有地理上确定的遗传多样性特征的犹太人散居者从周围人群中遗传分离出来。 这解释了为什么尽管斯拉夫基因在波兰-立陶宛以及后来的俄罗斯帝国中长期逗留，但它们相对较少地流入阿什肯纳兹。 相比之下，凯撒大帝时期的罗马犹太人社区已经很庞大了，大概与各种起源的城市无产阶级通婚了。讽刺的是，这些数据表明现代犹太人，尤其是阿什肯纳齐姆（Ashkenazim），但在较小程度上由于异教徒的希腊罗马世界的不受约束的特征，犹太人在很大程度上受到了尖锐的批评，而塞普哈季姆也与欧洲的异族有着共同的血统。 雅典（Contra Tertullian）雅典与耶路撒冷有很大关系。

图片来源：维基百科

引文： Atzmon，G.，Hao，L.，Pe'er，I.，Velez，C.，Pearlman，A.，Palamara，P.，Morrow，B.，Friedman，E.，Oddoux，C.，＆Burns， E.（2010）。 基因组时代的亚伯拉罕的孩子：主要的犹太散居人口组成了具有共同中东祖先的独特遗传集群《美国人类遗传学杂志》： 10.1016 / j.ajhg.2010.04.015