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古遗传学

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洞穴绘画和史蒂夫工作在我 加载后 我只研究了论文中的一些结果 欧洲冰河世纪的遗传史 (无毛)。 我没有真正探索过许多结果,尤其是发现随着时间的推移,欧洲人口中尼安德特人的血统似乎逐渐减少。 这是一个后续行动。

无论如何,这是一个有趣的时刻,可以让您活着并对这些主题感兴趣。

51OftfuYlSL._SX316_BO1,204,203,200_ 我们所处的时代是在一个无知的时代,而在那个时代,我们将被基于大量数据的解释所淹没。 尼安德特人的整个基因组于2010年发布。今天,我们有更多的完整基因组,可能正在出售的质量各异的1,000个古代基因组(例如,其中一些尚未出版)。 从遗传数据重建人类历史已经从从系统发育树的提示推断到检查节点深处的点转变了。

这让我想起了一个在 猴子的旅程 有系统学背景的古生物学家和古生物学家之间的关系。 古生物学家理解进化关系的方式是检查化石记录,并以推测的祖先形式及其后代重建树木。 编队声称,这种方法依赖于不完整和不可靠的化石记录,因此,其功能不如简单地以更严格的方式查看现存的变化那么强大。 正如我所暗示的那样,尽管cladists的严格程度改变了系统进化学的领域,但在我们认为cladists的极端主义消除知识的全部领域和替代方法之前,并没有席卷该领域。

我个人认为这是一件好事。 但是,在考虑古遗传学的新结果时,可能需要考虑群策群力的一些警告。 现实情况是,在许多方面,基于化石的古生物学和古生物学提供的原始数据几乎没有差异。 由于各种技术原因,从DNA序列的整个基因组进行系统发育推断可能比分析例如古人类蛋白的牙齿要强大得多。 这些牙齿会给您系统发育和功能方面的信息。 但是,当您有成千上万(或什至数百万)种变异时,重组将更加强大,而这正是DNA所能提供的。 其次,这些标记可以为您提供更多有关各种功能的信息,而不仅仅是简单的牙齿(我在这里不是在贬低牙齿,因为它们非常有用!)。

2016年05月07日12:50:12的屏幕截图

扩展数据表5

随着越来越多的数据进入其中,越来越明显的一件事是 现代欧洲人色素沉着的遗传结构是全新世的产物,甚至可能是近4,000年来的产物。 一种更令人激动的说法是,建造吉萨金字塔时,北欧人口的表型在任何人群中都可能没有出现! 当然,这里有一个主要警告,因为我们知道浅色皮肤的出现具有不同的遗传结构,因此古老的更新世欧洲人可能只是具有不同的功能性SNP排列。 关于此警告的主要警告是,色素沉着是一种在整个哺乳动物中都有很好特征的特征,因此预测要比其他特征少得多。 如果我们最终从Gravettian时期的欧洲人那里获得了足够的高质量基因组,并且它们缺乏十个主要色素沉着基因的衍生SNP,那么我们可以肯定地说它们处于祖先状态。

然后,研究人员从字面上将肉放在古老的骨头上。 但是我们仍然看到我们看到的。 古遗传学与古生物学一样面临着同样的问题:偏斜采样。 尤其是当某些时期和区域的样本量较小时,我们的照明无法让我们感觉到我们所不知道的东西。 欧洲冰河世纪的遗传史 给了我们一张关于遗传更新的图片,但是其中的Goyet样本代表了早期 奥里尼亚人 原来是人口的祖先,然后又回到了史前时期( 玛格达琳人)长达10,000年 Gravettian 插曲。 除非它们穿过虫洞,否则显然这是空白和有偏差采样的结果。 随着DNA样本数量的增加,我们将更好地了解方法的斑驳和偏见,但我们永远不会完全消除这个问题。 我认为,同样的事实也解释了为什么许多报纸都看到新石器时代农民重新兴起了中石器时代的猎人-采集祖先。 前者一直都在那儿,但是由于空间的不连续性,它们在大部分时态样线中都没有被采样。

当我们穿越无知和知识潜能之间的这段时期时,我们可以开始对未来的形态作出猜想。 在下面的评论中 安德鲁·奥·威尔克(Andrew Oh-Wilke) 这表明远古时代的人们比我们想象的要远得多。 我认为这是对的。 在 猴子的旅程 作者建议,在生物地理学中,有一个远离 戒备 用某种随机的长距离弥散模型来解释变化。 变异性模型强调了由于地质过程而出现的地理障碍,以及由于基因流量减少而导致了两个种群之间随后的分歧。 随机长距离散布背后的想法基本上是,许多模式是由于随机的怪胎事件造成的,例如一小群旧世界的猴子以某种方式使其从非洲横渡大西洋,并成为整个新家族的祖先。世界猴子。

F5.中 变异性模型与人类史前关系不大,因为在大多数情况下,我们并不是在谈论地质时标。 追赶时尚也有例外。 Berengia和Sahul都有人口,海平面上升之后,在水屏障的相对位置隔离了上升的群体。 但是即使在此之后,总会有一些接触,因为人类可以穿越水屏障。 历史人口遗传学中的变异模型有一个类似物,即人类遗传变异和多样性的按距离隔离模型。 主要的例子是在2005年的论文中 人口遗传与地理距离之间的关系为起源于非洲的一系列创始人效应提供了支持。 这个模特的 逻辑 是声音。 有人认为,人类从空间的某个点开始,并随着人口的前进波而向外扩展,因为各群散布到古人类居住或根本没有人类居住的领土(例如美洲和大洋洲)。 由于这会导致一系列创始者效应,因此您会看到一种模式,即远离非洲的人群遗传多样性较少。 另外,可以认为人类的遗传结构受地理距离支配并表现出渐进的变异。

51t9ODAPTaL._SX366_BO1,204,203,200_ 什么纸 借助古代DNA开创人类基因的新历史和新地理 确实表明 用于支持遗传多样性衰减的按距离隔离模型的遗传数据没有能力真正表明这是正确的模型。 什么 大卫赖希埃斯克·威勒斯列夫(Eske Willerslev) (以及其他)用古代DNA(以及在Reich的情况下的新颖方法)表明的是:1)人口更替相对普遍2)大多数(全部?)现代人口最好被认为是古代血统之间的混合物,在许多情况下病例脉冲混合迅速发生。 像vicariance模型一样,按距离隔离模型也很无聊且笼统。 它很容易建模,并且没有针对历史偶然性提出特殊诉求。 换句话说, 这是用作零假设的理想模型。 但这并不意味着它是正确的,或更准确地说,它可以捕获大多数动态。

一个例子就足够了。 就史前史而言,欧洲是世界上最清楚的主要地区。 利用简单和通用的人口遗传人口统计过程的“标准模型”产生了一个很好且简单的模型来拟合数据。 大约50,000年前,人类离开非洲,他们定居中东/中亚。 大约40,000年前,他们到达了欧洲。 大约一万年前,农民从中东到达,并从东南扩展到欧洲,其遗传信号随时间向西北方向稀释。

粗略地讲,这是古代DNA所提供的模型。 大约50,000年前,人类离开了非洲,与许多尼安德特人混在一起。 大约40,000年前,他们到达了欧洲。 大约35-40,000年前,第一批现代欧洲人被另一人口取代。 第二人口在文化上与第一人口相似,并且为现代欧洲人贡献了一些祖先(尽管比例很小)。 它被另一个人口代替,尽管与之相关的人口确实对现代欧洲人(Gravettians)的贡献不大。 它被与第一个有后裔的欧洲人有关的人口所取代(玛格达利安人,部分是奥里尼亚克人的后裔,与格拉维蒂安人的流失并不多)。 然后,马格达莱尼亚人被维拉布鲁纳(Villabruna)种群所取代,这是冰河时代末期的旧石器时代末期。 比利亚布鲁纳(Villabruna)来自近东和较小范围的东亚。 或者,维拉布鲁纳(Villabruna)的人口入侵了近东,甚至可能入侵了东亚,或者之间有中间人口。 一切都还不清楚。 然后,成为中石器时代的猎人-采集者的维拉布鲁纳人口被近东群体淹没,近东群体的异国血统与其他所有非非洲人(基础欧亚人)无关。 最后,新石器时代的人群被草原上的人口淹没,他们本身就是非常不同的元素的复合体。

这是一个困难的,历史上偶然的故事。 它不是整洁,整洁的,而且是模范的狗。 概括起来并不容易。 但是,它可能是一个比早期模型捕获更多显着动态的模型。

展望未来,我们可以从中得到什么概括? 出于历史偶然性和生物地理原因,已经很好地阐明了欧洲。 但是在接下来的十年中,世界其他地区将以类似的方式进入理解的视野。 我将做出的一个预测是 群体间的障碍在人类过去的今天比今天更早,至少就它们在遗传学上的相关性而言更为强大。 在过去的4,000年中,超族裔宗教和虚拟亲属关系的出现可能为大规模的基因流动铺平了道路。 此外,人类的人口密度使得栖息地的景观不那么斑驳,而相邻种群之间常规的连续基因流动才更可行。 在史前史上,稀疏的人类团体可能已经主动组织起来交换伴侣,也许是在注重文化的聚会中。 这可能意味着交换伴侣与其说是亲近关系,不如说是一种文化亲和力。

我们在更新世的欧洲人中看到的一种转变模式与这样的观点一致,即社会文化边界是主要的缺陷线,不利于基因流动。 当一个群体在文化上崩溃时,就像在新世界中发生的那样,在最近的两个群体之间可能会发生混合。 但是,这也自然而然地通过邻近地区发生,就像中国的回族一样。 猎人与采集者世界中的力量平衡可能已经朝着前者迈进了。 修补采样意味着我们不知道在马格达林时代之前和奥里尼亚史时代之后的人民在哪里持续存在。 10,000 年 Gravettian统治时期,但他们在那里,争取时间。 对10,000年的任何现代理解都将期望我们导致大量的混合和基因流动,但这似乎并没有发生(有些确实发生了,但是看一下混合图,马格达利尼亚人的奥里尼亚克人> 50%,而格拉维蒂人的人是〜0 %)。

其次,营业额可能部分归因于生态力量。 在历史的现阶段,人类是动物,其生存受到自然变迁的强烈影响。 由于机会减少,少数人可能很容易灭绝,并流到了可持续的水平以下。 尤其是如果它们不属于更广泛的冗余支持网络的一部分,那么情况似乎不太可能。 即使发生饥荒,农业人口仍在数量上保留着一个水库。 狩猎采集者可能没有。

最后,欧洲可能是一个特殊情况,因为在冰川期,它处于居住的前沿,但不可能完全 自成一格. 人类系统树的树枝被修剪得相当规则。 世界其他地区的遗传历史可能表现出相同的周转模式,并且是人口统计学上占主导地位的群体的较近根源。

 
• 类别: 科学 •标签: 古遗传学, 科学 
拉齐布汗
关于拉齐卜·汗

“我拥有生物学和生物化学学位,对遗传学,历史和哲学充满热情,虾是我最喜欢的食物。如果您想了解更多信息,请访问http://www.razib.com上的链接”