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南亚

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东南亚

重建东南亚岛屿地区的南极洲人口历史,马克·利普森,卢宝如,尼克·帕特森,普里亚·摩尔雅妮,高应钦,马克·斯通金克,邦妮·伯杰,戴维·赖希·多伊: 10.1101/005603

人类历史上最奇怪的方面之一是,边际上的定期团体似乎崭露头角,并进入了迅速扩张到处女地的阶段。 我所说的“处女”并不一定是无人居住的,而是相对于定义扩张集团的生产方式而言是处女。 一个经典的例子是 盎格鲁撒克逊人流散者的崛起 在1600年至1900年之间,因为它定居了其他人口居住的领土,人口密度低得多。 这 班图扩展 是另一个例子。 在这两种情况下,您看到的都是人口的迁移,该人口已经找到了每单位土地产生更多卡路里的方法,数字的权重导致土著人口在不同程度上被边缘化和/或吸收。 在盎格鲁北美和大洋洲,土著血统的混合相对较低,至少在欧洲人口中如此。 在东部和南部非洲,非班图族的混合人口肯定更高。

南极扩张

南极扩张

这种动力源于我们的血统。 它回去了 至少 到50到100万年前的非洲边缘地区现代人类的兴起,以及随后在世界范围内的扩张(与旧的人类素系相融合)。 最近的一个案例是南极洲向台湾的扩张,其中包括从东非一直到南美的纵向梯度,以及从夏威夷到新西兰的纬度梯度。 甚至在今天,我怀疑人们会对这一点印象深刻,但是当您观察到现代人类似乎已经稳定了他们的射程时,那就更加令人惊讶了。 大洋洲附近 持续约30,000年。 与中东的“第一批农民”不同,南极洲人的扩张与生产方式无关,而在于开创航海技能以及在大范围水域进行冒险活动时缺乏理智和理性。

的问题 为什么 台湾一小群东南亚人开始以可能引发世界范围内的文化和人口革命的方式来迁徙,这仍然是一场公开的革命。 但是可以探讨的第二个问题是这些海员与谁接触的性质。 当然,大多数讨论都围绕在大洋洲附近吸收美拉尼西亚掺合料。 对我来说,第二个问题一直是南洋人在海上东南亚的统治地位。 基本上是印度尼西亚和马来西亚。 在过去的几千年中,东南亚大陆一直是奥亚人主导的地区,直到大,苗,西藏-缅甸人团体到达。 奥亚大陆会不会一度在海洋东南亚人口中占一席之地? 关于bioRxiv的预印本旨在探讨这个问题, 重建东南亚岛屿地区的南岛人口历史:

从复活节岛到马达加斯加,南极洲的语言遍布全球一半。 语言学和考古学的证据表明,始于四千到五千年前的“南澳大利亚人的扩张”可能根源于台湾,但当今讲南斯拉夫人的人口的祖传仍然是有争议的。 在这里,我们主要关注东南亚岛屿,我们使用追踪祖先基因流的新方法分析了4个种群的全基因组数据。 我们显示,所有抽样的南岛人族群都具有与原住民台湾人比与任何现今大陆人口更紧密相关的血统。 令人惊讶的是,西岛的东南亚人口也从嵌套在现代澳大利亚语言的当今人口变化中的来源继承了祖先,而这些人口在历史上几乎是大陆独有的。 因此,要么东南亚岛上曾经有大量的南亚人,要么是讲南洋语的人迁移到大陆并穿过大陆,然后在大陆混合,然后再继续到印尼西部。

在讨论中,作者明确指出, 南洋和东南亚的混合发生在海洋东南亚定居之前。 尽管他们的标记集不能推断混合事件的发生时间,但东南亚西部混合的相对均匀性和考古证据似乎指向这样一种观点,即说亚洲裔的人并没有推动过马来西亚半岛(那里有说亚洲语的人)在内格里托人的内部)。 对我来说,这总是让我感到奇怪,因为显然爪哇岛已经适合广泛的水稻种植,而今天的印度尼西亚与整个东南亚大陆一样人口众多。 但似乎人口在水上的扩散可能是高度偶然的,并非不可避免。 例如,野蛮人入侵意大利大陆的活动经常在将大陆与西西里岛分隔开的海峡处停止,而Vandal对航海的采用一直有些神秘。 尽管整个直布罗陀都有基因流动,但似乎确实存在水屏障导致了主要的遗传不连续性。 然而,在几万年前的史前时期,澳大利亚人和美拉尼西亚人的祖先从Sun他兰(Sundaland)到萨胡尔(Sahul)。

 
• 类别: 科学 •标签: 南亚, 南方人, 东南亚 

南亚的大多数人讲两种语言中的一种,即印度-雅利安语和德拉威语。 这两者并不是特别密切相关。 Indo-Aryan 是一种印欧语言,这在大量明显的语言中是显而易见的 同源 与其他印欧方言。 我的英语流利程度最低,仅是印欧语系中最东端的,而英语流利度则是英语中最西端的一种。 伤口, 男子马努沙, 鼻子NAK)。 与我相反,德拉维语是独特的,因为口音和节奏显然是南亚语言,但它们完全不可穿透(尽管从德拉维语到印度-雅利安语有很多借词)。


但是在这篇文章中,我将探讨那些讲印度本土的亚奥古语族(即蒙达族)的人们的遗传关系。 一直以来,传统的问题一直是奥亚语言是否来自印度,还是来自东南亚。 更准确地说,蒙达文化是传入印度还是蒙达文化是印度东部原始的亚洲-亚洲领土的遗迹?

作为背景,我认为让读者了解越南和 Munda 之间的领土很可能在大约 2,000 年前由南亚方言主导,这一点很重要。 缅甸人和泰国人都是从中国南方进入历史时期,推翻了盛行于东南亚低地的孟族或高棉文化。 在缅甸人和泰国人的情况下,新来者将他们的语言强加于土著人口,但大体上从土著人那里吸收了大部分高雅文化元素(例如上座部佛教)。 泰国和缅甸的君主制直接借鉴了高棉和孟的受印度影响的政体。

东南亚地区最近流行的南亚语种广泛分布和种类繁多,表明它们有可能从该地区衍生而来,但这并不是该模式偏爱的确定点。 但是现在还有其他的遗传研究途径。 几年前 纸出来了 据报道,将他们与东南亚联系起来的蒙达人的Y染色体谱系在东南亚更为多样化。 这很重要,因为人口的扩张和迁移往往会通过更大的遗传漂移来使血统趋于同质,而“源”人口更有可能维持多样性。 此外,也有证据表明 雷达 它具有最近在整个东亚出现频率增加的特点。 这似乎使蒙达到达全新世,而不是更新世。 最后,有些男性血统与东南亚有一定的一致性,但是女性血统完全是土著。 这是对移民模型的经典期望,在移民模型中,由于这些群体缺乏妇女和儿童的流动性,他们对男性有强烈的偏见。

我决定使用 爱沙尼亚生物中心数据集,以及HGDP和HapMap。 对于那些对技术细节感到好奇的人,我将爱沙尼亚生物中心标记物套装从约600,000万减少到了130,000万。 我还通过Plink在–geno 0.01和–mind 0.80上放置了样本,以获取高质量的个体和良好的标记覆盖率。 为了明确起见,我重命名并合并了原始数据集中的一些总体(例如Chamars = UP_Dalits)。 我运行了初步的MDS,以确保数据不奇怪,然后将其检出。

所以做我跑的分析 混合树。 我以华裔美国人作为外来人口,并希望进行5次迁移,并且还试图通过查看1,000个SNP的窗口来校正剩余的LD。 您可以在下面查看我的第一幅情节。

我要重点关注的是从柬埔寨人流向蒙达的基因流。 如果Munda入侵南亚,这正是人们所期望的。 更有趣的是,观察到没有基因流 来自南亚群体的缅甸人,尽管他们离南亚更近了! 那时,这可能是在深挖历史的东西。 蒙达族与其他南亚族群较早分离的事实也与“混合”或“结构”柱状图的结果保持一致:蒙达族的南亚血统相对来说是没有融合的。

接下来,我想更多地关注东部人口流动。 因此,我删除了很多使我的基因流动边缘不堪重负的西方群体。

在这种情况下,再次存在来自柬埔寨结的粗糙区域的基因流参数。 也许更奇怪的是,从同一地点进入缅甸人的基因流参数非常强大。 基因 藏缅语和孟语(奥亚语)之间的混合人口。

我当然不准备断言“案件已结案”。 但是似乎我们需要再次将概率转移到侵入性假设上。

图片来源: 维基百科上的数据

 

如果您还没有阅读我的帖子 “走向亚洲的对立面”,如果您不熟悉东南亚大陆的历史,史前历史和人种志,那么这可能是个不错的时机。 在这篇文章中 我将关注东南亚大陆,以及它在遗传上与印度和中国之间的隐含关系,以及我们可以对人口统计学和历史做出哪些推断。 尽管我将在初步结果中涉及马来半岛,但我已从数据集中删除了印度尼西亚和菲律宾的样本。 这意味着在这篇文章中,我将不谈南洋人的传播。

我向您提出两个试探性问题:

–公元1000年之前东南亚大陆印度文化的传播与印度基因之间的关系是什么?

–公元1000年后东南亚大陆地区的泰族文化传播与泰族基因有什么关系?

上面的两张地图显示了东南亚大陆上的奥亚语和泰语的分布。 请注意,当您将两者合并在一起时,它们会覆盖东南亚大陆东部2/3的大部分地区。 进入中国的北部地区的奥亚洲语的支离破碎的性质,立即向我们暗示,过去该地区很可能会有一个连续的奥亚语言区域。 从the族的历史和神话中 我们知道这群人是在公元1000年左右从中国南部边缘迁徙而来的 当我们注意到中国南方仍然有泰族人时,这是显而易见的,并且从历史上可以证明,泰族人在当今泰国的扩张在一定程度上得到了证明。 在1000年至1500年之间,该民族进行了大规模的民族重组 湄南河流域。 这是人口替代,文化吸收或两者兼而有之吗?

第二,印第安人对东南亚大陆的影响是什么? 确定印度影响力的最简单方法之一是脚本。 缅甸文,泰文和柬埔寨文都源自 Grantha,是一种古老的泰米尔文字(东南亚岛屿的非伊斯兰文字,例如爪哇语和巴厘岛语,也源于南印度的前身)。 印度的宗教影响力也比北方更大,以南方的形式表现出来。 谢维特 印度教和斯里兰卡的上座部佛教。


我查看了三个数据集。 我将他们中的大多数从K = 2分配到K =12。这意味着我将所有个体都放入一个公共池中,并告诉ADMIXTURE程序来估算他们在K人口总数中的比例。 通过这种方式,我们可以大致了解人群之间的关系。 请记住,这些不一定是真实的总体,并且投入池中的变异的性质会极大地影响推断成分的性质。 我没有报告从数据集中提取的清晰,独特和客观的实体。 我们正在寻找取决于输入和参数的模式的人类可理解的解释。 他们在告诉我们一些真实的东西,但这不像测量落球的加速度。 就像描述球相对于一组不同参考对象的位置一样。 有一个具有特定位置的真实球,但是描述会根据您使用的引用而有所不同(例如,在对象A的左侧和对象B的下方,在对象C的右侧以及对象D的上方等)。

这是集合:

1)一个“大”集,其中包括大陆的泛亚人口,HapMap中的美国白人以及一些马来半岛群体。

2)一个“媒介”集,修剪了大多数北亚群体,马来西亚群体和美国白人。 因此主要是东南亚大陆,中国南部和印度。

3)一个“小”集合,该集合除去了许多东南亚人口,但保留了印度人口。 我故意让印度人重载这个场景,以研究在一些东南亚国家中印度人掺混的可能性。

一些注意事项。 泛亚数据集约有56,000个标记。 这是可以忍受的,但不是最佳的。 对于欧洲对印度对东亚对内格里托而言,这绝对足够了。 但对于区域内变化而言,最优值也不少。 因此,将其与一粒盐一起食用。 但是,由于我正在研究印度与东亚地区,因此我对与该数据集相关的发现颇有信心。 其次,白人美国人与泛亚人群的交汇点约为30,000个标记。 对于柬埔寨人来说,只有约22,000。 大约有100位美国白人,但只有11位柬埔寨人。 因此,请谨慎对待柬埔寨的结果。 最后, 请记住,祖先的成分是抽象的,可能暗示稳定和长时间混合的杂种种群是它们自己的独特成分,以及高度近交的分离株。

我将在下面显示三种分析和可视化。

1)ADMIXTURE条形图,显示特定祖先元素的组或个人的祖先比例。

2)跨祖先元素的Fst估计。 这是遗传距离的粗略总结。 我有时还会向您显示二维可视化,但是请记住,这会删除一些关系信息。 表格更准确,但可视化效果更易于阅读。

3)最后,我使用EIGENSOFT运行一些PCA。 这就是说,我采用了数据池,并允许程序提取出变化的独立维度。 我运行它,以便将其拉出前6个尺寸。 东西方始终是最大的倍数。 请记住,图未按比例绘制。

我还应该说,我所展示的K是在报告的种群中自交亚组开始分裂成自己的组成部分之前(在印度人中尤其如此)。

从头开始 我在泛亚数据集中注意到,某些团体,尤其是蒙斯和马来人,似乎显示出印度人的掺入。 我的问题是:这是真正的印度混合物,还是最近的欧洲混合物? 这就是为什么我拥有白人美国人的大型数据集的原因。 结果如下:

因此,孟和马利与西方欧亚元素的混合物似乎不太可能来自欧洲人。 相反,这与印第安人是一致的。 实际上,我非常有信心,它也不是西亚人,马来人也有可能,因为在这个规模上,这一部分往往与欧洲人保持一致。 最后,我要告诉你,孟和马来人的混合物是 相对 甚至。 换句话说,该群体的估计并不会因为一两个高度混杂的印第安人而发生变化,这对于我们来说是一个很好的判断 最近 通婚。 不是闻所未闻的。 马哈蒂尔·穆罕默德(Mahathir Mohamad) 祖父是喀拉拉邦穆斯林。

现在让我们看一下PCA。 我将关注维度1、2和3。请记住,这是遗传变异等级排序的三个最大维度。 在这些图中,一维是迄今为止最大的维数,至少是五分之一。 这是西方对东方的欧亚维度。

我已经强调了重要的部分。 两个笔记。 首先,我认为您确实看到了有关孟&马来人转向印度人而不是欧洲人的建议。 这与ADMIXTURE结果完全吻合。 其次,请注意,“印度新加坡人”的人口是异类的。 它主要是泰米尔人,但样本中显然还有其他印第安人,还有一些具有马来人或中国血统的人。

此外, 请注意,在ADMIXTURE结果中,泰族和壮族之间的相似性较高。 是中国的第二大族裔,据说是泰族移民到东南亚大陆的原始人口。 在我继续之前,您应该对一些较晦涩的群体的位置和民族语言的亲近感有所了解:

地理位置 团队 语言组
泰国北部 南亚
泰国北部 拉瓦 南亚
泰国北部 周一 南亚
泰国北部 帕隆 南亚
泰国北部 计画 南亚
中国南部 Wa 南亚
泰国北部 姚明 苗族(Mien)
华南和泰国北部 苗族 苗族
中国南部
泰国北部 卡伦 藏缅人
中国南部 吉国 藏缅人

这里未列出的一个方面是其中一些人口是否归类为“山地部落”。 孟族和赫丁族都是南亚大陆的,但前者在某种程度上类似于东南亚大陆上的希腊人,而后者则是一个部落隔离区,在泰国北部的山丘中得以保留。 希腊人,我的意思是星期一被缅甸的Bamar和泰国的Tai所同化或统治,但在这两种情况下,孟族都被赋予了东南亚印度文化的精髓。 从缅甸南部的伊洛瓦底江下游到泰国的湄南河下游盆地,孟星期一曾一度上升。今天的终点是曼谷。 相比之下,像赫丁(H'tin)和拉瓦(Lawa)这样的团体可能相对不受印度的影响。 苗族是东南亚的相对较新来的人,例如,这解释了他们作为泛灵论者的地位。 最后,您有类似Wa的小组,从技术上讲,它们甚至都不是东南亚的,但 ,那恭喜你, 南亚。 他们应该给我们一种不带印度烙印的南亚文化氛围。

让我们继续第二步,中等数据集。 我要删除白人美国人,马来西亚人和北亚群体。 现在,我包括柬埔寨人。

同样,星期一有印度成分。 柬埔寨人也是如此。 请记住,虽然其他所有人都有56,000个SNP,但柬埔寨人只有22,000个SNP,因此我们需要小心。 尽管您看到HGDP中的这一元素也运行良好。 也就是说,是印度的附属机构。 它在柬埔寨人中分布相对均匀,因此您不能将它归结为几个混血儿。 同样,您会看到壮族和泰族之间的相似之处。 主要区别在于,泰族似乎与各种东南亚群体混在一起。 这是意料之中的。 然而,令我惊讶的是,从这些结果来看,泰族人的扩张似乎在人口上占主导地位,而不仅仅是语言上占主导地位。 即使是曼谷的样本,这一点也很明显。 稍后对此进行更多讨论。

以下是推断的祖先群体之间的遗传距离。 标签给出了模态填充,然后给出了语言族:

吉诺·布尔曼 赫廷_奥地利 南亚人 帕隆_奥斯特罗 苗族
吉诺·布尔曼 0 0.073 0.057 0.115 0.092 0.085
赫廷_奥地利 0.073 0 0.03 0.088 0.065 0.06
0.057 0.03 0 0.09 0.064 0.047
南亚人 0.115 0.088 0.09 0 0.117 0.117
帕隆_奥斯特罗 0.092 0.065 0.064 0.117 0 0.09
苗族 0.085 0.06 0.047 0.117 0.09 0

以下是一些可视化效果:

这是PCA:

在此图中,您会看到星期一和柬埔寨人再次向印第安人转移。 另外,请注意壮族和泰族大部分重叠得相当好。 y轴由南亚的山地部落,然后是藏缅部落组成,还有一个间隙,直到您击中Tai集群为止,该集群最终与Hmong合并。 就瑶族在the族和苗族之间而言,这里有合理的语言家庭亲和力。

最后,我们转到以印度为中心的运行。 我现在已经删除了很多东南亚团体。 一些山地部落显然是相对孤立的,因此在PCA上抛出自己的集群或分歧很容易。 这是遗传差异的作用,如果您与基因流相对隔离,则会形成遗传差异。 因为我删除了这么多人口,所以我只剩下三个K,然后才能使Qasi-Family聚类显示为K。 另外,我将向您展示柬埔寨人和孟人的个别柱状图,以说明印度成分不仅是孤立的外加剂实例:

在这种情况下,Fst很简单:

南亚 南亚
南亚 0 0.028 0.084
0.028 0 0.085
南亚 0.084 0.085 0

是PCA 在这个过程中很有趣。 第一个不太特殊:

好吧,首先,由于这是印度的重点设置,因此您会看到,它超出了标准的东西方尺寸。 您有几个较低阶的维度将印第安人分开! 我以前曾假设,始终在HGDP中始终出现在柬埔寨人中的印度部分是具有深厚远古血统的“祖先南印第安人”的功能。 赖希等。 这个古老的人口可能与东南亚的许多族群有亲缘关系,因此柬埔寨人的残余集群可能已经是该族群深层冰河时期的一部分。 这些结果使我相信,这并不是那么简单的解释。 在此样本中,具有最高ASI的人群是部落人口Bhils。 在其中一个图中,您可以看到Bhils构成了分布的一端,而Gujarat Vaishyas则构成了分布的另一端。 显然,这是祖先北印度-祖先南印度的氏族。 星期一和柬埔寨人与市中心的偏离不大,向我暗示他们不太偏向ASI! 此外,分布的“中心”偏重于种姓南印第安人。 那么这是一个不错的解决方案,因为它与历史早期时期南印度特定影响东南亚的历史证据完全吻合。

这不是灌篮。 自混合以来需要时间的估计。 它应将ANI-ASI混合事件的日期定为最新日期,并且应与维吾尔族人处于同一范围内。 不幸的是,只有56,000个SNP,我不确定这个估计是否可行,但我会仔细研究。 此外,在东南亚,还需要对Y和mtDNA谱系进行更深入的调查。 他们可能表现出性别偏见的迁移。 我确实在寻找西欧亚大陆特有的SLC24A5变种,在南印度,这种变种不低于〜50%,但这不在泛亚SNP数据集中。 它在HGDP中,而11个柬埔寨人中没有一个。 这将倾向于ASI假设,但可以看到,西欧亚变体可能只有大约50%,而柬埔寨人不到南亚的10%,因此不会出现在22个基因中是完全不可信的副本(使用现实的假设,我发现N = 50的柬埔寨人不会找到SLC24A5的西欧亚副本)的概率约为11%)。

在这篇博文中,我没有为太庄关系投入太多的空间,因为在情节中很明显。 泰族显然已经转向了亚洲国家组织,但远没有我预期的那样。 实际上,从字面上理解ADMIXTURE组件,您可能会推断,在星期一和高棉语中掺入的泰语掺混物比其他方法要多! 当您认为泰国的人口几乎是柬埔寨的五倍时,这可能并不完全令人难以置信。 但是我读过的标准模型表明,泰族战士乐队征服了Mon-Khmer indigenes,并吸收了他们的许多高级文化。 就人口统计而言,这些结果很难与之相提并论。

我对发生的事情有一个可能的解释。 在过去的约1,000年之前,泰国大部分地区的人口可能并不太多,低地农业是由精英领导的。 大族可能带来了卓越的农业技术,因此进入了人口迅速向低地边界扩张的阶段,在孟买和高棉统治时期,低地边界是没有平行的。 换句话说,泰族的乐队很小,最初的数量是孟族和高棉族。 但是,通过有利的资源方向和将新的耕地优先分配给族裔群体,小的quickly族人口可能很快就会占领了先前的居民。 这是模型中概述的 伊斯兰教的兴起与孟加拉国的边界。 在其中,作者基本上认为,孟加拉东部人口稀少,直到大规模的穆斯林精英推动了开放农业疆界的项目。 被征召的农民要么是穆斯林,要么是改信伊斯兰教,因为与仍然是印度教徒的西孟加拉邦相比,农民的经济状况较为动荡,文化景观相对不稳定且动荡不安。 在这种模式下,孟加拉东部的伊斯兰化与当地部落的改建没有多大关系,而与孟加拉人的农业殖民地的人口快速增长有关,这是由农业项目,伊斯兰化的殖民地或从少数穆斯林那里获得的殖民地推动的。莫卧儿(Mughal)精英在西部地区进行农民耕作,目的是建立印度教上等种姓被边缘化的地区。 同样,泰族在东南亚的扩张可能已成为事实上的“空”态。 在孟和高棉的高级文化被吸收的时期,泰语在数量上可能是较小的元素。 当前比率是后来的社会和人口统计过程的函数。

 

髓: 胃中细菌之间的遗传关系可以告诉我们很多不同人群之间的关系。 另外,细菌的不同菌株的分布可能对公共卫生产生重大影响。

上图是昨天在《公共科学图书馆•世界》(PLoS ONE)上在线发布的一篇论文: 的进化史 幽门螺旋杆菌 序列反映了过去人类在东南亚的迁徙。 这篇论文引起我的注意有几个原因。 首先,我展示了 对近代东南亚的历史和史前历史有些好奇。 阐明该地区的历史动态可能涉及人类进化和文化进程的更普遍的问题。 第二, 幽门螺旋杆菌 是一种引人入胜的生物,它与特定人群的联系非常紧密,可以揭示不同群体过去的互动。 简而言之,就像人类 幽门螺旋杆菌 展现出地区特色和当地历史。 但除此之外 幽门螺旋杆菌 引入新人群后,自然选择也会受到影响,因此可以作为文化交流的窗口,否则可能会留下少量的人口统计足迹。 换句话说, 幽门螺旋杆菌 人口的增长可以与佛教的传播相提并论。 这种宗教与一些南亚和中亚血统的佛教徒一起传入中国和日本,但总的来说,它的传播是模因而不是佛教徒人口的自然增长。

首先,让我们看一下摘要:

东南亚的人口历史是由众多的迁徙和人口膨胀所塑造的。 基于考古学,语言学或人类遗传数据的重建通常受到经典人类遗传标记(例如线粒体DNA的高变区)中信息性多态性数量有限的阻碍。 在这里,我们分析了人类胃细菌的管家基因序列 幽门螺旋杆菌 来自东南亚各国,我们提供的证据表明 幽门螺旋杆菌 伴随着至少三个古代人类迁入该地区: i)从印度的迁移,将hpEurope细菌引入泰国,柬埔寨和马来西亚; ii)携带hspEAsia细菌的南亚语系祖先迁移到越南和柬埔寨。 iii)泰国人的祖先从中国南方迁移到泰国, 幽门螺旋杆菌 hpAsia2的人口。 而且, 幽门螺旋杆菌 序列反映了iv)在过去200年中,中国人向泰国和马来西亚迁移,传播了hspEasia菌株; v)在过去200年中,印度人向马来西亚迁移,同时传播了hpAsia2和hpEurope细菌。 细菌种群的分布似乎强烈影响胃癌的发病率,因为以hspEAsia为主的国家分离出的胃癌发病率很高,而在hpAsia2或hpEurope菌株比例较高的国家发病率很低。 将来,hpEurope菌株在亚洲人群中的寄主范围扩大,再加上人类的运动,可能会对亚洲的胃癌发病率产生重大影响。

幽门螺旋杆菌 尽管有一些水平的基因流动,但可以将其分为地理范围有限的非常独特的谱系。 一个进化论似乎通常局限于欧亚大陆的西部,另一个进化论区域仅限于欧亚大陆的东部,并且还有一些非洲特定的血统。 但是在这些特定的分支中,人们可以细化到更细的颗粒。 例如,在较广泛的西欧亚菌株家族中有印度血统。 随着时间的推移,突变会导致局部种群中独特变异的形成,因此,对谱系之间的突变步骤进行简单评估,就可以推断出一个共同祖先的后裔。

让我们暂时了解一些没有微生物益处的历史。 在某种程度上,东南亚可以被视为东南亚的一部分 “大印度,” 或多或少。 在泰国和柬埔寨这两个国家是最明显的,这两个国家是产生安哥尔(Angor Wat)的高棉文明的文化继承者。 这两个现代社会在宗教和艺术上的敏感性通过先驱政体而深受南亚规范的印记。 这些社会的上座部佛教仍然与南亚(特别是斯里兰卡)有着至关重要的联系,并且比起日本的禅宗(源自中国的禅宗),在敏感性上更明显地是印度人。 在越南,尚有一小批占婆帝国残余的马来人塞伊维特印度教徒。

由于现代与现代之间伊斯兰的介入,海上东南亚的亲和力有点阴云密布。 达摩 过去的。 只有巴厘岛人仍然是印度尼西亚早期受到印度影响的政治的重要继承者, 室利佛逝马贾帕希特。 尽管存在这种观念上的现实,但印度的影响力仍然可见,即使是在印尼穆斯林中,尤其是在东爪哇省,那里的罗摩衍那阴影皮影戏仍然很受欢迎。 像Angor Wat一样 婆罗浮屠 Java的使用证明了印度具有里程碑意义的过去。 但是,就算是南亚穆斯林也可能是东印度洋贸易网络中至关重要的参与者,该网络在第二个千年中逐渐伊斯兰化,但即使是现代海洋东南亚所宣扬的伊斯兰风味也可能与印度有某种联系。

然后,我们面临的问题是: 如果印度人过去在东南亚的影响如此强大,那么印度人的基因在哪里? 作者指出,线粒体DNA分析(母系)在本地人群中没有明显的频率显示南亚特定谱系。 对mtDNA的固定对我来说似乎很奇怪,原因有两个。 首先,使用泛亚SNP数据集,存在一些常染色体数据。 第二, 有充分的理由假设印度移民将是男性。 这个时期的神话和粗略的历史参考似乎并未设想大规模的民间移民,印度男人在那里带走了妇女和儿童并重建了家园。 相反,通常这些人被描绘成宗教专家或天才的军事领袖。 作者指出,有证据表明大约2,000年前泰国有印度工匠。 这似乎是合理的,在大约4,000年前就有关于苏美利亚(Sumeria)印度商人的小镇的记载! 但同样,没有理由这些工匠一定要带他们的妻子。 相反,如果他们是为了自己的技能而购买的,那么它们可能仅仅是人类财产,这是两个独裁者之间资本主义交易的对象。

文化转移的性质以及这种转移的较高保真度, 在我看来,有些印度人确实移民了东南亚。 但是它们很少,其遗传影响极小。 相反,我们看到的是,模因的功能与基因有很大的不同。 印度模因迅速吞噬了文化制高点,并从爪哇到泰国北部成为规范(越南北部是该规则的例外,因为它受到中国的影响)。

幽门螺旋杆菌 尽管具有更具体的生物学特性,但它们与模因具有许多相同的倾向。 作为细菌,它可以在种群中迅速传播,并使自身与原始宿主的内源性自然增长脱钩。 这种传播可以通过自然选择来驱动,这意味着它不能很好地体现其寄主的血统。 但是,即使是自然选择,也无法消除人们对不同群体之间的原始联系所做的推论。

在本文中,作者从证据的本质中提出了证据。 幽门螺旋杆菌 在东南亚,古董时代过去印度人和东南亚人之间有明显的身体接触。 更确切地说,下图显示了西欧亚大陆关系的本质 幽门螺旋杆菌 印度和东南亚的血统,以欧洲和其他西欧亚大陆的样本为对照。

您在这里看到的是 印度 幽门螺旋杆菌 尽管与欧洲血统相同,但它还是东南亚分支机构的基础。 这告诉您,此处考虑的印度血统和东南亚血统之间存在亲和力,但是由于一段时间的分离,这种亲和力会降低。 这很重要,因为东南亚的某些地区(例如马来西亚)在过去的几个世纪中到印度的人口众多。 东南亚有一个独特的血统这一事实表明,这两个族裔之间存在很长的隔离期,而且不能归因于西欧亚印第安人的频率 幽门螺旋杆菌 只是为了最近的联系。 至少在东南亚大部分地区。 事实证明,在菲律宾,西欧亚大陆 幽门螺旋杆菌 与西班牙人口聚居。 这必须是数百年殖民主义的产物。

还有令人着迷的历史和地理常识:

分布的研究 幽门螺旋杆菌 毒力因子 钙A 在越南人中,有84%的菌株带有cag-right主题的II型……这是东亚菌株(hpEastAsia)的特征,范围从南越的胡志明市的76%到北越的河内的93% 。 但是,在欧洲(hpEurope)菌株中,I型cag右基序的频率存在显着差异。 北越南不存在I型主题,但在湄公河三角洲附近胡志明市的样本中有8/49(16%)个被发现。 有趣的是,在越南人吞并17th 一个世纪以来,这座城市曾是高棉重要的海港,被称为“捕食者Nokor”……因此,hpEurope病毒株在湄公河三角洲的越南人中似乎也很常见,因此 起源于中国西南部藏区和云南地区,与越南与老挝和柬埔寨接壤的安纳米特山脉似乎为遏制印度在湄公河流域的影响形成了有效的自然屏障,解释了hpEurope菌株在越南其他地方的患病率较低。

我们今天所了解的越南民族国家的地理轮廓是一个相对较新的现象。 越南人民 ,是一个古老的民族。 但是在过去大约2,000年的大部分时间里,我们所知的越南被划分为北部的Kinh,中部和南部的高棉人和后来的南洋人。 与东南亚其他民族不同,Kinh视其北方为中国的文化典范。 而印度在东南亚的影响力( 乔拉冒险)是通过“软实力”实施的,中国人定期对越南进行直接统治,否则将其归为朝贡国。

这里不需要任何地理确定性。 文化或军事力量的投射与距离成比例地下降。 对于文化而言,投射并非呈线性下降,而是经常表现出急剧的断裂。 越南人击败击败占巴并开始吞噬高棉王国东部后方后,便没有将安南米特山脉向南移动。 相反,他们转移了人口和人口的文化身份,从而转移了文明界限。 随着Kinh的传播和高棉的撤退,分隔印度语和Sinic的界线向南移动。 这并没有完全消除印度的影响。 印度占婆族仍留在越南,而湄公河三角洲的特雷瓦达佛教则有一定的购买量,与中国派生的大乘佛教占统治地位的其他国家不同。 印度就是这样 幽门螺旋杆菌 越南南部地区也仍然有残留物,这证明了贸易和文化网络在过去的某个时候将其绑定到大印度。

接下来让我们看一下东亚地区的分布 幽门螺旋杆菌:

这个数字很难看懂,但它的简短之处在于:有美洲印第安人,台湾大洋洲人,中国人和东南亚人血统。 更具体地说,作者试图推断出一个特定的东南亚特定血统的起源,该血统在中国南部表现出一些重叠。 这是因为他们认为它可以追溯到东南亚国家联盟(也许是东南亚最早的农业学家)的迁徙。 这 幽门螺旋杆菌 有问题的菌株跨越中国南部到马来西亚。 该地理区域涵盖了现在由泰语或马来语居住的地区,但似乎整个地区在某一点上都被南亚文化交流组织所控制。 关键在于看印度东北部的蒙达是否也携带同样的东西 幽门螺旋杆菌 拉紧。 实际上,该菌株的系统进化树分析 幽门螺旋杆菌 在南亚人或他们的后代中发现的昆虫也许能够使他们了解他们是否是印度外来的(“较早的”血统应该是基础的)。

到目前为止,我一直专注于系统发育问题。 人类和细菌种群之间是如何相互联系的。 但是,在工作中存在功能性和适应性影响以及动态变化。 在适应方面,似乎有些应变 幽门螺旋杆菌 在某些环境中比其他人更适合。 在殖民统治时期的几个世纪里,西班牙人在菲律宾的身影很少。 西班牙人与当地人之间存在很大的居住隔离,而中国人通常比西班牙人高两个数量级。 但是你有一种情况 幽门螺旋杆菌 西班牙血统似乎占主导地位。 为什么? 作者报告说,有大量证据表明,欧洲人 幽门螺旋杆菌 毒株是通才,胜过专业的东亚和美洲印第安人血统。 我认为不能忽视这样的事实,即“欧洲”毒株是从欧洲到印度的一大片西方欧亚大陆特有的。 由于它们的人口众多,这些血统可能比其他人口具有更多的多样性,因此可以适应各种条件。

功能性和公共卫生问题是东亚 幽门螺旋杆菌 可能是导致该地区胃癌发病率高得多的原因。 你可能知道 幽门螺旋杆菌溃疡,因此它对该地区的影响不足为奇。 在阅读本文之前,我听说东亚胃癌的发病率是由于使用调味品引起的。 这表明了许多医学科学的困难,这些医学依赖于因果关系的相关性和粗略的猜测。

显然,我对依赖人类的病原体分布等标记能告诉我们历史感兴趣。 但是从长远来看,这些病原体,疾病风险和其他表型特征之间的复杂相互作用是真正的作用所在。

引文: Breurec S,Guillard B,下摆S,Brisse S,Dieye FB等。 (2011)。 幽门螺杆菌序列的进化史反映了东南亚人类过去的迁徙PLoS之一: 10.1371 / journal.pone.0022058

图片来源: 马克·亚历山大

 
• 类别: 科学 •标签: 人类学, 南亚, 基因, 药物, 东南亚 

标记显示按以下方式抽样的人口 HUGO泛亚SNP联盟


髓: 东南亚由一系列不同的民族定居。 可以通过检查遗传变异的模式来部分分辨定居的模式。 在南岛人到来之前,整个东南亚地区的南亚人似乎都占主导地位。

大约一年半以前,我查看了 in 科学 它首先通过了 HUGO泛亚SNP联盟 数据集,汇集了广泛的亚洲人口。 您可以在上面的地图上看到这些位置(哎呀,标签太小,无法读取代码)。 与该数据集相关的重要问题是 它在东南亚地区的覆盖面很广,在 人均国内生产总值。 不幸的是,只有约50,000个标记,在我看来,这对于真正细粒度的区域内分析而言并不是最佳选择。 但是总比没有好,并且绝对足够进行更粗略的规模分析。

自从我第一次审阅本文以来,有些事情已经发生了变化。 首先,我取下了 泛亚SNP数据集。 我很快就会自己玩。 二,看完后 奇怪的平行,音量 12,我对东南亚历史了解得更多。 最后, 近大洋洲之间古老混合的可能性 使曾经是该地区的遗传 桑达兰(Sandaland)和萨胡尔(Sahul) 特别感兴趣。


在介绍遗传学之前,让我们回顾一下东南亚的民族志,因为这可能使我们梳理一些结果的含义。 东南亚最大的民族语言群体是 南方人。 与南岛人有关的一个有趣的观点是 他们不仅限于东南亚。 如您所见,南美洲人的范围从南美海岸(复活节岛)到非洲东南部(马达加斯加)。 虽然有 关于这个的辩论 在我看来,南岛移民目前最有可能的出发点是台湾。 尽管今天台湾主要是汉族,但这是相对较新的移民的产物。 土著居民显然是南澳大利亚人。

虽然东南亚为重点,但第二语言族是泛亚语系。 这个民族语言群体的内部结构很多,因为那里有一个众所周知的连贯的高棉族,其中包括缅甸和泰国的一些少数民族以及柬埔寨人。 另外,您在东部有越南人,在印度东北有一些部落。 关于这些印第安部落,Munda,是否是最初的印第安人,将由Dravidian和Indo-Aryan的演说家后来取代,还是侵入该次大陆,一直存在着争论。 我相信 最新的遗传数据 指出从东方入侵南亚。 在历史时期之前,东南亚大陆上的南亚大陆可能不太分散。 缅甸和泰国的两个主要民族都是入侵性和吸收性高棉人,历史上证明了后者的势头。

最后是缅甸和泰国(以及老挝)的民族语言群。 前国家由 巴马尔是大约1,500年前起源于华南地区的汉藏人口。 在缅甸,星期一的生活依然存在,而具有泰国血统的Shan族在整个国家的东北边缘占据着统治地位。 在泰国和老挝,Mon-Khmer的边界被边缘化为孤立的残余群体。 但是值得注意的是,在这两个政体中,高棉人都为征服种族的文明取向定下了基调。 泰国被遗弃的中国人影响了大乘佛教,而印度人则影响了被征服民众的小乘佛教。 尽管泰国人和柬埔寨高棉人之间存在观念上的种族鸿沟,但由于柬埔寨社会的共同根基,其广泛的文化相似性 高棉帝国 清楚了。

有了民族志背景,让我们看一下我们从本文中获得的两个主要数据。 第一个图显示了族群语言数据库中以颜色编码的人口关系数据库的系统树。 在那棵树旁边,有一个K = 14的结构图,这意味着14个祖先种群。 他们已经对条形成分进行了上色,以与民族语言类别相匹配(例如,红色= Austro-Asiatic,Austro-Asiatic情态成分)。 第二个图显示了两个PCA面板。 在数据集中,PC 1是遗传变异的最大组成部分,PC 2是第二大组成部分。 我为巴布亚族人添加了标签。

回到上面的时间顺序,我们知道泰国人排在最后。 在那之前,中藏人来了。 我想知道的问题是南亚人与南亚人之间的关系。 有趣的是,不仅在东南亚的岛屿地区,而且在许多华南地区的人群中,南澳大利亚人的比例都很高。 相比之下,在泰国的孟高棉山部落中,它们大概是泰国移民之前存在的群体的代表,而该部落却不存在。 对我来说,值得注意的是,南亚人不仅表现出与泰国和中藏关系有关的分裂,而且在某种程度上表现出与南朝鲜人有关的分裂! 马来西亚中部的原住民似乎讲一种亚洲-亚洲语言。 最终,在人口稠密的爪哇岛,东南亚岛屿南部边缘的南亚大陆部分频率升高。

由于东南亚大陆的文字记录更厚,我们知道,奥亚人团体早于泰国人和中藏人。 我相信,东南亚地区的奥古斯语元素也早于南洋语。 就是说,我相信,在菲律宾和台湾之间的南极洲人到达之前,存在着南亚大陆基底。 马来西亚内陆的Negritos具有遗传和生理上的独特性,他们会讲奥亚语。 这不足为奇,似乎狩猎者-采集者团体经常转而使用常驻农业人员的语言。 由于他们的孤立,其中一些团体坚持讲马来西亚“第一批农民”的语言,即使这些先驱者被新移民吸收。

PCA清楚地表明,在这些东南亚人群中,南澳大利亚人在遗传上是种类最多的。 为什么? 我相信这是因为他们是迟到者,他们与居住在目标地区的任何人按顺序混合在一起。 在东南亚岛屿的东部,混合物是美拉尼西亚人。 STRUCTURE图和PCA都显示出这种双向混合的证据。 结构简单明了,但请注意,第一个面板中,而在第二个面板中,南极洲人相对于外群的线性分布。

为什么爪哇岛的南亚大陆地区比北部地区高? 由于爪哇岛的肥沃性,它今天是印度尼西亚人口最稠密的地区。 我假设,更有效的农业形式可以促进南澳大利亚人的传播,这种农业可以从边缘土地上挤出更多的生产力。 相对于爪哇,马来半岛,婆罗洲和苏门答腊在农业上处于边缘地位。 在爪哇,南亚大陆的密度最高,而在北部地区则很薄。 南极洲人似乎有可能在岛上和海上边缘地区进行了一系列“跨越式”的跳跃,而这并非由亚洲亚洲人所耕种。 一些印度尼西亚人团体,例如住在苏门答腊岛西海岸同名岛屿上的明塔怀(Mentawai),与台湾人聚在一起,好像他们在整体上移植了自己的社会。

在谈到东南亚的遗传学和史前史时需要提到的一件事是“ Negritos”。 如他们的名字所示,他们是一个具有非洲特色的小人物。 从上面的图表可以清楚地看出,这些人在基因上与非洲人的关系并不特别密切。 菲律宾的内格里托人似乎与美拉尼西亚人有某种关系。 有趣的是,他们说的是南澳大利亚语。 再次追随边缘化的土著人似乎吸收其邻居的语言的趋势。 马来西亚的Negritos有所不同, 但请注意,其中一个人口表现出南亚文化,但是 不能 南极洲,外加剂。 这与我的假设相吻合,即在他们自己被南洋人所吸收之前,南亚人是最早将这些部落边缘化的人。

一个对人种学方面的东南亚了解程度超过我的人,也许可以用更大的能力来解读上述结果。 但是在这一点上,我认为我们已经有了这样的年表:

1)首先,您在东南亚拥有广泛的美拉尼西亚人相似的狩猎和采集人群。

2)然后,亚洲亚裔人口从中国南部的边缘向南移动。 有些人向西推到印度,而另一些人向南跳到适合爪哇等农业地区。

3)然后,南极洲的居民沿着水路向南掠去,并把东南亚的南亚大陆人边缘化,尽管不是在大陆上。

4)巴马尔(Bamar)来自中国南方,距今已有1,000多年的历史,它使缅甸的南亚奥秘边缘化。

5)泰国人不到1,000年前从中国南部到达,占领了东南亚大陆的中部地区,并向缅甸西部入侵。

我可能会猜测,马达加斯加的马达加斯加人是南澳大利亚人,他们的祖先几乎没有南亚的元素。 我相信是这样,因为它们是跨越式发展的一部分,社会通过适当的点对点将水移植到各个社会中(马达加斯加人的语言似乎是婆罗洲南部方言的一个分支!)。

到目前为止,我一直在谈论北向南运动。 然而,论文观察到遗传多样性出现了南北梯度变化,这暗示着作者从南向北迁移 (北部的东亚群体是南部的子集)。 但是,过去可能比我们认为的要复杂。 现代人类完全有可能通过一条南方路线到达东北亚,在冰河时期向南退缩,并向北扩展,有些群体又将其推回南方。 实际上,看看美拉尼西亚人与东亚欧亚大陆之间的距离有多远,我认为最合理的模式是东南亚没有相对较新的扩张。 相反,大多数东亚欧亚人的祖先在中国的避难所中幸存下来,而一系列以农业为动力的扩张则在最近重新塑造了东南亚。 这些种群或多或少地与土著基质混合在一起。 这将导致遗传多样性的吸收。 最后,汉族从黄河流域的大规模扩张可能在过去约3,000年间导致了中国许多宗族的灭绝。

引文: 。,Abdulla,M.,Ahmed,I.,Assawamakin,A.,Bhak,J.,Brahmachari,S.,Calacal,G.,Chaurasia,A.,Chen,C.,Chen,J.,Chen,Y 。,Chu,J.,Cutiongco-de la Paz,E.,De Ungria,M.,Delfin,F.,Edo,J.,Fuchareon,S.,Ghang,H.,Gojobori,T.,Han,J. 。,Ho,S.,Hoh,B.,Huang,W.,Inoko,H.,Jha,P.,Jinam,T.,Jin,L.,Jung,J.,Kangwanpong,D.,Kampuansai,J 。,Kennedy,G.,Khurana,P.,Kim,H.,Kim,K.,Kim,S.,Kim,W.,Kimm,K.,Kimura,R.,Koike,T.,Kulawonganunchai,S 。,Kumar,V.,Lai,P.,Lee,J.,Lee,S.,Liu E.,Majumder,P.,Mandapati,K.,Marzuki,S.,Mitchell,W.,Mukerji,M 。,Naritomi,K.,Ngamphiw,C.,Niikawa,N.,Nishida,N.,Oh,B.,Oh,S.,Ohashi,J.,Oka,A.,Ong,R.,Padilla,C 。,Palittapongarnpim,P.,Perdigon,H.,Phipps,M.,Png,E.,Sakaki,Y.,Salvador,J.,Sandraling,Y.,Scaria,V.,Seielstad,M.,Sidek,M 。,Sinha,A.,Srikummool,M.,Sudoyo,H.,Sugano,S.,Suryadi,H.,Suzuki,Y.,Tabbada,K.,Tan,A.,Tokunaga,K.,Tongsima,S 。,Villamor,L.,Wang,E.,Wang,Y 。,Wang,H.,Wu,J.,Xiao,H.,Xu,S.,Yang,J.,Shugart,Y.,Yoo,H.,Yuan,W.,Zhao,G.,&Zilfalil, B.(2009年)。 《亚洲科学中的人类遗传多样性图谱》,326(5959),1541-1545 10.1126 / science.1177074

 

我目前正在阅读Victor Lieberman的权威 奇怪的平行卷:第2卷。 所以我对来自 BMC遗传学, 孟高棉语族群的遗传结构及其对泰国北部邻近泰族的亲和力,由指向 二烯 今天。 以下是结果和结论:

在种群中观察到很大的遗传变异(mtDNA和Y染色体分别约为80%和90%)。 孟高棉语族群之间的遗传差异比泰语族群高得多,尤其是在父系遗传标记上。 这两个主要的语言群体在遗传上是截然不同的,但仅占总遗传变异的一小部分(1%至2%)。 群体之间的遗传距离与他们的语言差异相关,而地理距离不能解释遗传差异模式。

...

在泰国北部,讲高棉语的人群彼此之间以及与Tai族相比,都表现出遗传差异。 两种语言群体之间不同的漂移效应和婚后居住模式解释了它们内部以及之间的遗传变异模式中很小但很重要的一部分。

在很多情况下,需要综合学者向我指出我之前意识到的事实星座的整体结构。 利伯曼的作品也是如此。 我知道,泰国人民的爆发是在过去的1,000年中发生的,在此之前,该半岛在西方的藏缅语人口和东方的奥亚语之间进行划分(后者在高棉语和英语之间进行划分)越南文)。 此外,据推测,藏缅语言本身在西部地区取代了亚洲亚洲国家(现代缅甸在孟邦的持续存在证明了这一点)。 记录中的内容 音量1 of 奇怪的平行 虽然那是 参与和同化泰国入侵的三个地理区域不同。 在中心,泰国人成功地统治了先前的团体并将他们的身份强加于该地区。 人们常断言,现代柬埔寨作为一个独立国家的存在是法国人从暹罗帝国的扩张野心给予它的保护的作用。 但是在东方,越南人几乎没有受到泰国人流浪的影响。 与中国一样,越南的泰国人被边缘化为“山区部落”。 最终,在西部,在成为缅甸的地区,泰国人没有占领文化制高点。 但是他们也没有像东方那样被绝对边缘化。 相反,the族成为缅甸景观的一部分,并融入了上座部佛教文化,但也是次要的 民族报 到缅甸多数人(以及Karens,Mons等)。

这与遗传学有什么关系? 可能什么都没有,什么都没有,而且所有答案都在两者之间。

东南亚大陆中部的民族语言认同发生了巨大变化,东部地区缺乏民族认同,西方国家处于等位地位,这应该很好地检验这种民族语言认同传播的性质的命题。 它是纯粹的构造,人口统计的替换,还是这两个参数的某种定量组合? 不幸的是 BMC遗传学 本文仅关注Y染色体和mtDNA,即父系和母系。 这些标记物很有用,但我宁愿看一下基因组的总含量。 尽管在泰国北部的一小部分地区,民族的覆盖面令人印象深刻。 空心圆圈代表孟高棉民族,黑暗的泰国民族。 孟-高棉语是假定的土著人,而泰国语是侵入性的。 至少在过去的1,000年中。

下面,我重新编辑了Y和mtDNA多维比例尺图。 Y在左侧,而mtDNA在右侧。 聚类模式显示了跨谱系的关系。 同样,空心标记代表星期一的高棉语群体​​,封闭符号代表泰国语。

由于本文是开放获取的,因此我邀请您阅读他们的解释。 我要说的是,泰国男性血统的聚类非常有趣,并且可以通过一组相关男性入侵该地区并从土著中吸取妻子的模型来很好地解释。。 相比之下,Mon-Khmer Y染色体谱系散布的更多,这可能是由于它们与历史上更远的共同祖先合并在一起的事实。 泰国人口入侵东南亚的人口特征可能是男性军乐队的迁徙。 在这些军人设法推翻先前命令的地区,例如东南亚中部地区,他们可能垄断了妇女的进入渠道,并进入了人口膨胀时期。

幸运的是,我们确实有一些厚标记常染色体数据。 在左侧,我已经编辑了 数字 由HUGO泛亚数据生成。 条形图在K = 14处。我切除了许多无关的种群。 条形图中的颜色对应于与更广泛的语言家族的关联。 所以红色似乎是南亚大陆的,而蓝色是泰国的。 从图中可以看出,华裔泰国人缺少红色的“高棉”成分。 有趣的是,东南亚高地的苗族人在文化上与低地的上座部佛教佛教文化相比处于边缘地位,它显示出与泰国和奥亚大陆群体截然不同的证据。 他们缺乏与岛屿东南亚人,马来人和台湾原住民的亲和力,这些人似乎在更广泛的南方华人中很普遍。 泰国的卡伦(Karen)可能是我们对缅甸的藏缅人最好的代理人,他们是南亚人之后的人,也早于泰国人。 根据这些数据,看起来克伦族人很难与南亚人区分开来,尽管与泰国人截然不同。

泛亚数据集还有很多不足之处。 东西方的覆盖面不多。 我怀疑东南亚会变得有些复杂,而从泰国的语言和基因之间的相关性推断得出的结论只能使我们走到现在为止。 但这是一个开始。 在 奇怪的平行 作者认为,东南亚大陆可以向我们介绍欧亚大陆的一般历史过程。 我希望并怀疑,它可以告诉我们关于其他地区随着时间的推移语言和基因之间相互作用的更一般的信息。

 

蒙达2

过去的十年显然在人类基因组学领域非常活跃,但是在世界范围内的南亚遗传关系领域,它见证了名副其实的革命和反革命。 最终轮廓仍有待确定。 在1990年代中期,传统观点认为,南亚人是西欧人的更广泛群体的一个分支,尽管与核心的中东,北非,欧洲和高加索进化枝距离较远。 较早的自然人类学文献会断言,南亚人主要是高加索人,但 桔梗 元素以不同的比例混合在一起,作为地理和种姓的函数。 更具体地说,我认为准确的是,可以沿 AR拉赫曼纳瓦兹·谢里夫。 区域和种姓主义只是相互关联。 Subrahmanyan Chandrasekhar 是泰米尔·婆罗门(Tamil Brahmin),但在美国经历了反黑人种族主义。 鉴于他的观点,我认为这是合理的 外貌.

研究博客网站 这种粗略而现成的主流理解,得到以下方面的支持: 经典遗传标记,在21世纪初被推翻了。 一条思路 有人认为,南亚人与西方欧亚人群相比更具​​特色。 这项工作的代表是一份类似 最早的定居者的遗传遗产在印度部落和种姓群体中都存在。 这些研究人员倾向于从女性血统mtDNA开始,然后以Y血统(父系血统)作为补充。 单独的证据线,通常取自 Y染色体结果, 表明印度人民与欧亚中部人民之间有着深厚的联系,尤其是通过 R1a 单倍群。 此外,令人惊讶的是,第一组结果的一个方面是 南亚人更接近 东方,而不是西方,欧亚人。 但是到了最后,单亲研究得到了SNP芯片产生的一系列结果的补充, 研究了成千上万的遗传变异。 这些研究似乎支持了南亚人比东亚人更接近西欧亚人的观点。 最后 去年 一篇论文提出了一个假设,即几乎所有南亚人口实际上都是两个群体之间的古老稳定杂交体,一个类似欧洲的人口“古老的北印第安人”(ANI),另一个不再以混合形式出现的群体“古代南印度人(ASI),其中安达曼岛民是远亲。 尽管总体上对ANI略有偏见, ASI的分数 随着一个人往东南走,又沿着种姓阶梯上升。 换句话说,实际上可以将独特的“南亚”祖先群体视为这两个要素的组合。 天然底物在类似欧洲的遗传背景下的混合物。

奇怪的是,这听起来像一个古老的想法,认为是具有高加索混合体的高加索人群。 我们 现在知道 印度部落人民与整个南亚和东南亚土著群体以及澳大利亚和美拉尼西亚之间的联系充其量是微不足道的。 因此,“ Australoid”一词并不是真正意义上的内容,甚至可能引起误解。 就历史语言学而言,我认为我们没有通过诉诸“雅利安人入侵”来解决问题。 在南印度部落群体中甚至从德拉维种姓群体中分离出来的ANI比例很高,这说明这种混合事件非常古老,并且可能是在雅利安人到达印度次大陆之前发生的。

但是在这个游戏中有两个以上的演员。 在 重建印度人口史 作者承认他们的模型是程式化的,现实更加复杂。 此外,他们在数据中认为来自印度东北部的某些部落群体具有超出双向混合事件范围的元素。 他们从更广泛的分析中删除了这组数据,因为这似乎是这些人群的一个受限现象。 中的新论文 分子生物学与进化 将第三个元素重新注入图片。 印度大洋洲讲者的人口遗传结构:景观障碍和性别特定的混合物的作用。:

目前定居在南亚和东南亚的大洋洲地区发言人的地理起源和传播时间仍存在争议。 已经提出了两个相互对立的假说,均假设语言散布是一个象形的组成部分。 这些假设中的第一个将东南亚地区的大洋洲语发源地,随后在新石器时代散布到南亚,而第二个假说则提倡新石器时代以前的起源和南亚这种语言家族的散布。 为了测试这两种替代模型,本研究结合了单亲遗传标记与来自核基因组的610,000个常见SNP位点的分析。 印度AA发言人的Y染色体单倍体O2a频率很高; 我们的结果表明,该单倍群在东南亚具有更高的多样性和合并时间(17-28 KYA),有力地支持了两个假设中的第一个。 不过,主要成分和“结构体对常染色体位点的“类似”分析还表明,印度AA族裔的人口史更为复杂,其特征在于两个祖先成分-o N代表Y染色体和EDAR结果的模式,另一个代表mtDNA多样性和基因组结构。 我们建议今天在印度的机管局发言人来自东南亚的传播,然后与当地印度人口进行广泛的性别特定混合。

这里需要一些背景。 众所周知,南亚在语言上是多样的,但是这种多样性可以归纳为几个大家族。 首先,印欧语系以印支雅利安语和伊朗方言(如果包括英语,则为日耳曼语)代表。 第二, 德拉威 从巴基斯坦的Brahui到孟加拉的Malto,该次大陆遍布各种语言。 但是,它们确实是南亚南部地区的主要语言。 话虽这么说,从历史上看,他们的分布很可能延伸到了北部,巴基斯坦西部的Brahui是那个时期的遗物,而印度中部的部落支离破碎。 也有证据可以追溯到马哈拉施特拉邦讲德拉维教语的历史时期。 纯粹从语言学的角度来看,似乎很明显,许多印度-雅利雅语言是在德拉维语的语言基础内演变而来的。.

接下来,在遥远的北方,有藏族血统和亲和力的语言。 这些是其起源和关系的解释。 但是在印度次大陆的东北三分之一,有两组 南亚 语言。 前缀“ Austro”表示20世纪初期历史语言学与自然人类学之间的共生关系(最著名的例子是从南亚和伊朗语境中将社会语言术语Aryan移植到种族化的北欧术语中)。 这篇文章顶部的地图显示了亚洲-亚洲语言的分布及其细分。 该团体显然有东西方的一翼,但是大多数学者认为,这是缅甸人和泰国人民从中华帝国南部边缘并进入东南亚大陆的历史性喷发的产物。

800px-Ramakrishna_Mission_Cherrapunjee_106在印度,奥亚语言分为两大类:蒙达语和卡西语。 卡西族居住在分隔孟加拉和阿萨姆邦的地块上。 他们的文化和社会与印度的规范有所不同(他们是母系,泛灵论者或基督教徒)。 在语言和外表上,与东方人的亲密关系显而易见。 卡西族和加罗族等其他族群是从东方和北方来的相对较新的民族和种族,从西藏和缅甸向印度过渡。 从左图中的Khasi孩子的脸部可以明显看出这一点。 这些人口一旦离开其原籍地,便在不同程度上同化了印度语域。 这 特里普利 例如,人们保留着藏缅语,但是Vaishnav印度教的信徒(我自己的家人曾经是 麦尼克王朝)。 该 阿洪 阿萨姆邦的人被印度-雅利安人的底物完全吸收了。 像保加利亚的布尔加斯人一样,他们唯一的影响力是在民族名字中做出的贡献。 对我自己的遗传以及23andMe东部其他南亚裔的遗传进行的快速调查,清楚地表明了被同化的藏缅语的影响。 一个孟加拉穆斯林个体显然带有一个东亚Y染色体单倍群。

蒙达案则有所不同。 在有关南亚的较古老的历史文献中,有人认为Munda可能是印度最早的居民。 早于德拉维人。 一些南亚血统的读者还指出,在早期的印度-雅利安语中,蒙达语比德拉维语有更多的证据。 但是,蒙达语的东部联系似乎很清楚,尽管其解释远不及远东北部的卡西族或藏缅人民。 如果蒙达语是土著人民,那么理所当然的理由是,高棉语源于南亚。 另一方面,东南亚国家绝大多数的语言都存在于东南亚,而蒙达人本身被认为是东方稻米文化的传承者。

这就是遗传学发挥作用的地方。 已经有其他研究者对Munda的基因产生东方影响的证据,因此本文要做的是详细研究该问题,而不是将其视为影响整个范围的次要影响而将其丢弃。 我已经重新格式化了图3,以显示各组之间的相互关系。 左侧是PCA。 大部分方差是东西方的〜6%,而有些是南北方的〜1%。 右边是从ADMIXTURE生成的条形图。 我已经删除了许多人口。 专注于来自印度的南亚文化团体。

蒙达1

在PCA中,您会看到ANI-ASI混合物的SE-NW轴,这是南亚内部遗传变异的主要方面。 在数字上沿该轴的德拉威人和印度-雅利安人群体是南亚的绝大多数。 但是,蒙达人和其他南亚国家组织并不微不足道。 那里 是有力的建议 东部的印支-雅利安族,奥里亚,孟加拉和阿萨姆语在某种程度上受到奥亚文化元素的影响。 PCA清楚地表明,卡西族与东亚人口之间的联系更加紧密。 但是,南印度样本沿Y轴比Munda沿Y轴更远的事实表明,在Munda种群中存在混合。 查看清楚的条形图。 南印度血统的主要深绿色特征在蒙达族中也很普遍,在伊朗人,卡西族人和东南亚人中发现的数量很少,但蒙达人显然具有东部成分,而南印度人则没有。 这可能是干扰它们在PCA上的元素。

但这只是告诉我们总基因组含量之间的关系。 它不一定告诉我们外加剂事件的历史顺序或迁移方向。 实际上,印度人在东南亚的血统证据可能暗示着从南亚向东南亚迁移(有很多文化证据表明有传播的迹象,尽管人们认为人口运动是边际的)。 他们在论文中指出,一种可能使我们的理解模糊不清的现象是,许多基因流是通过距离隔离(IBD)发生的。 村到村的动态。 与此相反,您在民间徘徊,导致“跨越式”发展。 这 哈扎拉和维吾尔族 都是跨越式的情况,因为IBD无法轻易解释它们的基因组成。 因此,在这里,蒙达人与东南亚人之间的联系,以及东南亚人与南亚人之间更广泛的关系,可能是IBD,或者可能反映了深厚的古老共同血统。 也许ASI小组跨越了从阿拉伯海到南中国海的整个区域,后来才被ANI和东亚人口所覆盖。

为了探究这些问题,作者深入研究了更细粒度的内容,研究了单亲谱系以及一个基因,在该基因上最近的选择似乎对东亚人产生了区别于其他群体的影响, 雷达。 尽管单亲谱系在祖先方面仅提供部分信息,但由于其单倍体遗传模式,它们非常适合约会。 终点分支之间的关系可以为我们提供历史信息。

下图显示了Munda携带的特定Y染色体单倍群的关系和分布,而其他南亚人则倾向于不将它们连接到东部:

蒙达3

单倍群是O2a(M95)。 Y染色体数据的结果尚不清楚,尽管它们似乎确实拒绝了东南亚O2a谱系源自印度谱系的模型。 但是,似乎您没有一个创始人血统从东南亚进入南亚的情况,在印度人中发现了太多不同的O2a分支。 此外,在东南亚,聚结时间(回到上一个共同祖先)更深,但在南亚,蒙达之中仍然很深。 由此看来,南亚方言的起源可以被拒绝,但南亚方言出现的细节目前尚不清楚。 据我所知,作者们本身并不一定认为他们在这一领域的结果是可靠的(即使对模型假设的微不足道的改变也不敏感)。

然而,有趣的一点是,女性血统mtDNA与其他南亚人似乎根本没有多大差异。 我发现有趣的是,这与我们沿主要NW-SE变化轴看到的相同模式。 看来mtDNA谱系团结了南亚人,而Y谱系将它们分开(按种姓和地区划分)。 普遍性有许多例外,但它指出了一种特殊的性别介导的混合过程 西北和东北。 迁徙中的人们重塑了南亚的遗传和文化,但mtDNA谱系仍然指向一个古老的欧亚群体,其东方比西方远,但亲和力强。 mtDNA可能是ASI的最纯净的蒸馏。

最后,他们着眼于 雷达 在南亚人群中。 雷达 在某种程度上可以诊断东亚血统; 似乎在东亚人中相对较近出现了一种变种,可以产生浓密的直发。 这是HGDP浏览器的结果:

埃达尔1

埃达尔2G等位基因表现出共性,因此GA表型在AA和GG之间具有中等的毛发厚度。 基于单倍型结构的自然选择测试表明,衍生的G等位基因是最近的。 右图显示了按族群划分的G变体的出现频率。 气泡大小与频率成正比,而颜色表示语言组。 同样,Khasi和Tibeto-Burman组与您期望的一样,它们展示出派生变体的频率相对较高。 哈扎拉(Hazara)是一个仅在最近1,000年内通过混合活动才出现的团体。 塔鲁人似乎起源于尼泊尔的过渡地区, 尼泊尔人口 即使他们自己在语言和文化上都不是藏族,也与藏族群体有着显着的融合。 有趣的结果是蒙达。 德拉威人团体缺乏派生者 雷达 变体,就像印欧语系的团体一样,没有合理的东亚混合物来源。 但是在Munda中发现派生的变种的比例约为5%。 这远远低于东北部藏缅人的60%或卡西族的40%,但这确实很重要。 这个结果使作者可以拒绝IBD的亚洲-亚洲人群体联系模式,因为Munda拥有其周围其他南亚人群体所不具备的变体。 在这样的删除之下,以语言联系为基础的基因流动似乎是难以置信的,因此,最简约的解释是,蒙达语言是从东南亚飞跃而来的,它是从东南亚到达印度的。

但是,为什么派生变量的频率较低? 显然Munda已与本地底物混合,因此稀释将是一种解释。 另一个可能是,当蒙达(Munda)离开东亚时,发生频率较低。 此外,无论选择力如何推动频率上升,在南亚可能已经减弱,并且可能是针对衍生派生出的选择! 不管事实的真相,派生的存在 雷达 蒙达(Munda)的变种就像是找到欧洲 LCT 东亚人群之间的变异:远距离基因流动和种群移动的明确证据。

那么,这将我们引向何方? 首先,让我观察到,本文的一些作者都是同一名作者,他们基于mtDNA变异主张在2000年代初期为南亚人的主要原住民血统。 在本文中,他们似乎是反对蒙达人的土著血统,或者至少反驳了蒙达人是 ur-印第安人出类拔萃。 我没有详细介绍合并时间,因为它们相当混乱,但是 雷达 在为蒙达市寻找相对较新的外来起源时,这可能是一个“转折点”。 遗传变异中强烈的性别不对称现象也暗示了这一点,我们有大量证据表明,在行动中的男性发生了遗传跨越现象。 印度东北部的卡西人和其他藏缅人之间似乎也存在这种不对称性(本文图2)。

传统上,关于南亚的历史,文化和遗传学的争论一直沿雅利安-德拉维迪主义的轴心争论。 我对重新介绍该方面不感兴趣,但是这些数据将我们引向了另一个现实: 在印度的东北边界,还有另一个组成部分。 作为孟加拉民族,我一直对此有所了解。 我的一些亲戚和家人相像 加洛斯 比其他南亚人在阿萨姆人和尼泊尔人的脸上,这一成分更加明显,他们的语言是印度-雅利安人,宗教是印度教,但是其外观表现出更加多样化的背景。 从某种程度上说,这些地区的南亚人都知道他们的特殊性,即使很少被提及。 我读到,在20世纪初期日本战胜俄国之后,孟加拉知识分子公开表示了他们对亚洲血统的自豪。 随着21世纪中国的崛起,我怀疑更多来自尼泊尔,孟加拉和阿萨姆邦的南亚人会重新发现他们的背景,将他们与东方联系起来,而不是与西方联系起来。 遗传学只是在告诉我们我们已经知道的东西。

引文: Gyaneshwer Chaubey,Maet Metspalu,Ying Choi,ReedikMägi,Irene Gallego Romero,Pedro Soares,Mannis van Oven,Doron M.Behar,Siiri Rootsi,Georgi Hudjashov,Chandana Basu Mallick,Monika Karmin,Mari Nelis,JüriParik,Alla Goverdhana Reddy ,Ene Metspalu,George van Driem,Yali Xue,Chris Tyler-Smith,Kumarasamy Thangaraj,Lalji Singh,Maido Remm,Martin B.Richards,Marta Mirazon Lahr,Manfred Kayser,Richard Villems和Toomas Kivisild(2010)。 印度大洋洲讲者的人口遗传结构:景观障碍和性别特定混合物的作用分子生物学进化论: 10.1093 / molbev / msq288

链接确认: 迪内克斯·庞蒂科斯(Dienekes Pontikos).

附录: 这更多是投机性评论,因此我将其贴在主要文章的正文上。 这是我目前关于南亚人如何发展的非常初步的模型。 在10,000年前的最后一个冰河时代之后的某个时候,ANI到达了,并与ASI杂交,后者是较古老的原始非洲之浪向南亚传播的后代。 此后,但在Aryans之前,Munda从东北到达,并被推入ANI-ASI团体居住的土地。 4,000至3,000年前,印度裔雅利安人到来,并将自己强加给ANI-ASI杂种人口,然后被生物学吸收,并将其语言传授给印度多数人。 我不知道Dravidian的来源,但也许是ANI的语言(它存在于整个印度北部次大陆的碎片中,这暗示着人们的想法,并且可能与古代Elamite(青铜时代的语言)有联系伊朗西南)。 最终,被氰化的ANI-ASI在印度东北部边缘化了Munda,并将其驱赶到高地。 最终,藏缅人到达了历史时期。

图片来源:Wikimedia Commons

 
拉齐布汗
关于拉齐卜·汗

“我拥有生物学和生物化学学位,对遗传学,历史和哲学充满热情,虾是我最喜欢的食物。如果您想了解更多信息,请访问http://www.razib.com上的链接”