外加剂和渗入剂之间有区别吗? 我认为有。 或一直假设有。 但是最近我想知道一个区别是否被广泛接受,人们做出什么样的区别。 也就是说,在某些情况下,很显然,混合和渗入可以互换使用,意思是同一件事。 我已经在科学论文中看到了这一点,并且经常只是做一个心理替代。 但是在其他情况下,我想知道人们使用的术语是否与我使用的含义不同。 后者可能更令人担忧。
左图是由生成的 混合物,该软件采用人口遗传学假设(模型)和数据,并向您显示数据最适合特定模型。 在这种情况下,条形图会向您显示给定个体的混合,前提是将它们放置为 K 祖先的人口。 这些个体按人口进行聚类,因此您会看到整个人口范围的资料。 模型的详细信息,以及模型是否准确地捕获了现实(即是否实际存在 K 过去的任何时间都没有人口?),对于这个职位而言,重要的是,事实并非如此 混合物 正在反映 在两个或多个种群之间的全基因组范围内混合。 输入数据由分布在整个基因组中的数十万个单核苷酸多态性表示。 感兴趣的问题是,即使在两个在系统发育上不同的假设组之间,也可以将种群表示为脉冲混合。
相反,基因渗入集中在遗传变异的问题上,这些遗传变异正在使一个人群与另一个人群相互渗透,并在目标人群中变得普遍。 在植物遗传学中产生基因渗入的经典方法是对具有亲本特征的亲本种群进行混合谱系的广泛回交。 如果一个人继续在后代中选择一个特定的性状,那么一个人的性状和等位基因可能会渗入一个子代中,该子代和一个等位基因在全基因组范围内几乎与一个亲本相同,但是在一个感兴趣的基因上与另一个相同。 。 这样做的实际原因是显而易见的。 想象一下,您有多种适应寒冷的大米,它们容易受到某种真菌感染的影响。 然后,您有了对真菌感染有抵抗力的热饭。 您想要的只是抗真菌感染性,保持所有其他特征,使适应冷饭的稻米最适合其气候。 因此,您将两者交叉,并继续在选择抗性表型时针对冷适应水稻杂交后代。 最终,您将获得想要渗入的等位基因,同时保持所需的遗传背景。 相反,如果仅允许在两个谱系之间进行混合,则可能会出现介于整个表型之间的种群,这使它们在任何气候条件下都不理想。
可以从人类基因组学中找到一个例子 Denisovan-like DNA渗入引起的藏族海拔适应。 在这里发生的是,藏族人中一个非常常见的变体暗示了高度耐受性和适应性,在系统发育上似乎比其他人群更接近于丹尼索万人猿。 尽管事实上藏族人几乎不存在Denisovan血统(最新研究表明,东亚和东南亚的掺混物数量在0.1%到0.5%左右,但在某些东南亚和南亚人群中掺和率最高)。
右侧的网络图说明了此问题。 在全基因组混合图上,藏族看起来像任何东亚人口。 他们似乎是东方汉族农民和长期居住在这些高海拔地区的土著群体的混合体。 但是在周围的地区 EPAS1 它们的遗传变异不适合现代人类,但距人类约500,000年前的Denisovan人发素产生了我们本系的90%至99%。
所以发生了什么事? 我们知道,过去差异很大的人类血统之间的杂交水平较低。 由于遗传上的不相容性,实际上似乎有些选择是针对我们自己基因组中的古老谱系的独特等位基因。 也就是说,尼安德特人血统在基因组水平上的百分比可能低于您对100,000年前的所有血统进行族谱分析所获得的百分比,因为在人类占主导地位的遗传背景中已经有针对尼安德特人变种的选择。 但不在 所有情况。 在少数情况下,尼安德特人(Nianderthal)和德尼索瓦(Denisovan)的变体并非不那么合适,也不是中立的,而是受到了青睐!
因此,可以想象这样一个场景:在最初的世代中,大量人口与少量尼安德特人人口之间的混合导致后代混合的程度约为5%。 由于针对尼安德特人等位基因的选择,这一代人的基因组血统趋于约2.5%。 但, 在一个基因座子集上,尼安德特人等位基因的频率会增加,在某些情况下会渗入高水平。 这可能是由于随机性造成的。 在具有数十亿个碱基对和数千万个核苷酸多态性的基因组中,一些等位基因将随机漂移至更高的频率。 但是,在尼安德特人的高频等位基因集中,您可能会发现由于适应性渗入而变得常见的变体。 请参阅以下文章 联合会, 尼安德特人和Denisovan样单元型的渗入有助于人类通行费样受体的适应性变异。。 免疫学变异总是一个很好的候选者,因为这些基因座的遗传多样性受到高度青睐,而且长期居住的人口通常具有局部适应性。
因为我的研究重点通常是微观进化过程,所以这是种群遗传学家所感兴趣的事情,所以我实际上并没有在谈论物种层面的动态(尽管人参可以说是截然不同的物种)。 关于混合和渗入的大部分工作是由专注于种间差异的生物学家完成的,但我相信总体框架仍然有效(事实上,混合和渗入的问题以及在不同血统之间更为清晰和明显)。 在植物中,特别是杂交和渗入在野生和家系中很常见。
我不打算将这篇文章作为权威。 当我阅读有关“祖先渗入”的文章时,很明显,今天人们正在融合和渗透这些定义。 实际上,我在中检查了渗入和混合的定义。 人口遗传学原理 和 进化遗传学的要素。 没有任何东西,因为关于这个问题的辩论在这些领域不是很活跃。 在这一点上,我真的很好奇其他生物学家的想法。 我仍然认为区别很重要,更重要的是很有用。 如果没有,我想听听意见。 如果有人有不同的定义,我想听听大家的意见。