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进化基因组学

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1970 年代初期,著名的进化遗传学家理查德·C·莱文廷 (Richard C. Lewontin) 写道,群体遗传学“就像一台复杂而精致的机器,旨在处理一种没有人成功开采过的原材料。” Lewontin 的意思是,在 1930 年代,当 RA Fisher、Sewall Wright 和 JBS Haldane 建立... 了解更多
生命之树的不同谱系何时、如何以及为何发生分歧,长期以来一直是进化科学的当务之急。 现在必须补充一点,似乎这个故事的很大一部分也与长期分开的树枝的纠缠有关。 古生物学研究了... 了解更多
我们越是用强大的基因组技术深入挖掘表面,我们就越会看到我们认为对自然历史有清晰了解的自然历史变得更加混乱。 一旦清除了混乱,我们将获得精确复杂性的礼物,但现在在许多领域... 了解更多
在整个生命之树上进行的进化过程受到不同动态的影响,这些动态可以塑造和影响个人、种群和整个生态系统的结构和特征。 例如,想象一下夏威夷群岛特有生物的系统发育和种群遗传特征。 因为夏威夷群岛是... 了解更多
存在进化的事实。 然后,关于它如何进行的争论由来已久。 前者是一个已解决的问题,只剩下很少的智力。 后者是进化遗传学和进化生物学的重点。 辩论是一个古老的辩论,可以追溯到第19届... 了解更多
在生物物理尺度上理解遗传学的基本方面之一是表征跨越碱基对的原始序列信息(例如 AGCGGTCGCAAG....)与交织在一起以创建基因组的各种大分子之间鸿沟的过程集收集组织,并启用生理过程,从而导致... 了解更多
马是一种美丽的动物。* 这不是一件小事,但另外一个事实是,它在历史上具有重大意义。 显然,马作为战争工具的兴起在我们的脑海中是卓越的,但在更平淡的层面上,役马通过其影响彻底改变了许多社会...... 了解更多
大多数读者都知道我参加了 ASHG 2012。我将把这篇文章分成两半。 第一,会议概况。 其次,特定海报等。 概括: - Life Technologies/Ion Torrent 显然聘请 d-bag 兄弟代表他们出席会议。 海报上的人很好,但是操作 Ion Torrent Bus 的人…… 了解更多
核心:自然选择的遗传成分有不同的风味。 其中一些成分比其他成分更难以捉摸。 这使得“阅读标签”成为一项重要的活动。 正如您可能知道的,当您查看给定生物体基因组的变异模式时,您可以从自然界做出各种推断...... 了解更多
一位朋友向我指出了这篇文章在《自然》中的热烈评论部分,重建隐藏种族的基因组。 问题是大自然最初声明波多黎各的土著泰诺人已经灭绝。 这导致了大量愤怒的评论,其中一名研究人员卡洛斯·布斯塔曼特 (Carlos Bustamante) 感到…… 了解更多
核心:人类 X 染色体受到来自自然选择的更多压力,导致遗传多样性减少。 但是,人类种群中 X 染色体多样性的差异似乎更多地是种群历史的函数,而不是这些种群之间自然选择能力的差异。 在过去的几年里... 了解更多
图片来源 The Pith:在这篇文章中,我回顾了一篇涵盖人类分娩进化维度的论文。 具体来说,我们物种特有的特征和倾向,可能支持这些特征和倾向的基因,以及它们如何与更广泛的公共卫生考虑相关。 人类婴儿是特别的。 不像……的后代 了解更多
图片来源:Karl Magnacca The Pith:在这篇文章中,我回顾了果蝇果蝇基因组中自然选择模式的一些发现。 我将它们与人类基因组学中非常相似的发现联系起来,尽管方向相反。 不同形式的自然选择及其对基因组结构的影响也受到关注...... 了解更多
上面的图表让你觉得奇怪吗? 它显示的是,随着有害突变率的增加,种群的平均适应度下降(有害突变多于有利突变)……但在某些时候,种群的适应度会反弹,尽管(或者可能是因为) ?) 有害的突变! 这个会... 了解更多
数字 1 比 -1 受到更多的关注,杂合性的概念比纯合性受到更多关注。具体来说,后两者之间的区别相当简单。在二倍体生物中,基因是重复的。如果等位基因相同,则它们是纯合的。如果它们不同,那么它们就是杂合子。性染色体... 了解更多
自然选择发生了。 它由查尔斯·达尔文 (Charles Darwin) 详细假设,并已在实验室中通过观察以及通过现代基因组学方法的推断得到证实。 但科学不仅仅是粗笔。 我们需要深入到更细粒度的级别,以精确和详细地了解动态,... 了解更多
由于对“遗传性缺失”的所有合理担忧,人类基因组学的时代并没有完全破产。 正如我之前在 2005 年的优秀著作《突变体》中所观察到的那样,进化遗传学家 Armand M. Leroi 断言我们确实对人类色素沉着的正常变异没有很好的理解。 当时我觉得... 了解更多
在过去的十年里,进化遗传学家迈克林奇一直在阐明一个基因组复杂性模型,该模型依赖于随机因素作为基因组大小增加的主要动力。 这一论点在 2003 年的一篇论文中得到了阐述,并在他的《基因组架构的起源》一书中得到了进一步阐述。 有几个活动部件... 了解更多
进化论的伟大之处之一是它是对现实和动力学的特定具体方面的形式上的抽象。 它使我们可以从对自然状态的不完整的先验知识中榨取推理汁。 换句话说,您可以进行预测和建模,而不必观察所有的最后... 了解更多
拉齐布汗
关于拉齐卜·汗

“我拥有生物学和生物化学学位,对遗传学,历史和哲学充满热情,虾是我最喜欢的食物。如果您想了解更多信息,请访问http://www.razib.com上的链接”