上方的条形图显示了卡拉什人(Kalash)黄色的人群,在一群欧亚人口中非常有特色。 该图来自 罗森伯格实验室论文。 这个结果没有任何异常,您可以通过使用各种杂色标记集来轻松生成此图。 卡拉什(Kalash)与众不同。 但是重要的是要保持区别 透视。 他们不是遗物,是远古时代的遗迹,没有时间和记忆。 相反,它们恰好是一个高度分散的西北南亚群体。 它们的差异是由于少量内生配种的孤立繁殖种群所致。
这意味着卡拉什有一个 低长期有效种群,受到等位基因频谱漂移的影响更大。 小型人群的等位基因频率波动会一代一代地波动,往往会失去很多遗传多样性,还会修复许多等位基因。 其结果之一是遗传近交和较高的隐性疾病负担。 这些具有大量漂移的种群在去除有害等位基因方面的选择效率较低,如果隐性表达变异体是固定的,那就是这样。
但是人口大量漂移的另一个主要后果是,每个人出于所有实际目的都是准相关的,当您尝试某种聚类时,它们自然会作为一个非常自然的分组而消失。 他们是低挂的水果。 当您在PCA上绘制种群时,通常会删除紧密相关的个体,因为它们自然会形成紧密的簇,并压倒了您要寻找的种群之间的变异,从而占用了所有最大的维度,从而使它们与非亲戚区分开来。 卡拉什(Kalash)等近交群体也这样做,即使不那么大胆。 如果您可以牢记这一点,则可以对人口的自然历史做出适当的推断。 如果不能,那么您会感到困惑。
这是一篇不错的论文的序言 PLOS遗传学, 过去4500年以来埃塞俄比亚阿里铁匠和耕种者共同起源的证据:基于聚类的推理经验教训,报告较早的出版物, 埃塞俄比亚的遗传多样性揭示了语言分层和对埃塞俄比亚基因库的复杂影响, 不能控制由于内婚而引起的漂移的影响,因此得出了错误的结论。*我不会重复使用它们的方法,因为本文是开放获取的。 但是,它们对漂移的解释要好得多,并且表明,可能是遗传上不同的种姓的差异与内婚配偶导致的漂移增加的影响更多,而不是过去一段时间内两个谱系的分离所造成的。 请记住,在任何两个分开的谱系上都会积累漂移。 但是,如果其中一个子系的种群数量非常小,那么漂移会将其移离祖谱的速度更快,从而产生人为的“长分支”。
卡拉什(Kalash)和阿里(Ari)是极端的例子。 但是它们说明了一个总的原则,即当我们不控制人口历史的变迁时,我们在做出推断时应谨慎行事,这可能会扭曲我们以公平,平衡的方式进行观察的方法的力量。
*这两个出版物的作者有重叠之处,这表明如果新的数据或分析能够说服科学家,科学家们的所作所为也可以推翻他们自己的结论。
知道为什么铁匠在埃塞俄比亚的社区中会像纸上所说的那样被边缘化吗(我没有理由怀疑)而没有解释?
我会天真地猜测他们会受到重视和尊重,而不是被边缘化,但显然所有熟练的工匠都受到这种待遇,铁匠受到的待遇最为严厉。
不,不知道。 假设:如果你能在精英之间买卖熟练的工匠,他们就会更有用。 将他们变成经济生产的工具,就像奴隶一样,比可以发起竞购战的自由代理人更好。 我们知道,例如,蒙古人饶恕了熟练的工匠,但他们并没有以人道对待他们。
我会天真地猜测他们会受到重视和尊重,而不是被边缘化,但显然所有熟练的工匠都受到这种待遇,铁匠受到的待遇最为严厉。
回复:@Razib Khan
不,不知道。 假设:如果你能在精英之间买卖熟练的工匠,他们就会更有用。 将他们变成经济生产的工具,就像奴隶一样,比可以发起竞购战的自由代理人更好。 我们知道,例如,蒙古人饶恕了熟练的工匠,但他们并没有以人道对待他们。
我希望这篇论文是群体遗传学的一个转折点。
这在一些较低的 K 运行中已经相当明显。 Ari 铁匠和修炼者在低 K 时非常相似,直到铁匠由于他们的孤立而占据了自己的部分。
与 Kalash 的情况非常相似,K 值较低时与邻近的南亚人相似,而 K 值较高。