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对两个古巴人的深入分析
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大约一个星期前 我发了个帖子 分析一个 其中报告了由 50 名古巴人(以及其他各种西班牙裔/拉丁裔群体)组成的祖先。 这篇论文的一个值得注意的方面是,每 1 个古巴人中就有 3 个是 90% 或更多的欧洲人血统。 值得注意的是,六分之五的古巴裔美国人认定为白人。 也就是说,欧洲血统。 这里的主要警告是,这些古巴人是从纽约市采样的,在较小程度上来自中西部。 来自拉丁美洲的推定的欧洲白人个体中的非欧洲混合物这一事实并不奇怪。 我们之前的期望应该是混合物是非平凡的,但不是占优势的。 例如,大多数白人人口 阿根廷有美洲印第安人血统 (或者,更准确地说,阿根廷人总血统的约 15% 是美洲印第安人)。 至少在概念上,古巴的种族混合文化比阿根廷多得多,因此即使是白人古巴人中的非白人混合也不足为奇。

根据上述论文(以及您可以在其他拉丁美洲白人身上找到的数据),以及两个古巴裔美国人熟人的基因分型,我断言,大约 10% 的古巴白人血统是将成为非洲人。 这自然引起了一些反对意见。 有些人不太礼貌。 我认为我必须诚实的主要问题是: 我真的不太在意这个话题. 现在,我对它很感兴趣。 具体案例说明了一个更大的整体,它评论了各种人口统计和人口遗传动态。 但我并没有对古巴人或任何其他群体的特定祖先量子的具体实例进行大量投资。

其次,有人反对对科学方法论的细致关注,例如代表性和样本量。 这在抽象上是一个严重的反对意见,但现实是一代基因组学已经进行了与“犹他州白人”一样没有代表性的血统。 坦率地说,科学和知识寻求在操作上是一个临时和草率的过程,没有对适当的科学方法论书给予足够的关注。 当我们没有太多信息时,任何额外的信息通常都是有用的,只要我们记住这会引入流程中的错误。

话虽如此,一位评论者引起了我的注意 有趣的论文. 它报告说,在庞大的哈瓦那古巴白人人口中,有 6% 的非洲血统。 主要的缺点是他们只使用了 60 个 SNP,而不是上述研究中的 60,000 个 SNP。 当然,这 60 个 SNP 将“提供祖先信息”,但在 6% 与 10%(我之前的估计)的情况下,我不确定我是否应该完全相信精度并更新我的值。 但我认为,尽管如此,这项研究还是得出了相同的定性结果: 古巴白人,就像拉丁美洲的白人一样,似乎通常表现出相当多的非欧洲血统。

但为了推进讨论,让我注意到上述论文的评论者提供了古巴裔美国人的两种 23andMe 基因型:她自己和她的丈夫。 我现在将她称为“古巴 1”,将她的丈夫称为“古巴 2”。 我创建了以下人群的汇总数据集:


犹他州白人队 HapMap
曼登卡 HGDP
约鲁巴 HapMap 和 HGDP
日本和中国的HGDP
玛雅人HGDP
苏瑞HGDP
古吉拉特语 HapMap
法国巴斯克语
西班牙人口?

合并后标记集减少到 200,000。 这对于洲际差异来说有点矫枉过正,但没关系。 我将 ADMIXTURE 运行到 K = 7,并对 10 个维度进行了 PCA。 所有最终结果都可以查到 此处.

在 K = 6 后,ADMIXTURE 不再提供信息(约鲁巴亚结构在 K = 7 时开始摇晃)。 以下是完整结果:

在样本中,Cuba 2 拥有最多的非洲血统。 此外,请注意他高贵的美洲印第安人血统。 这更值得注意,因为它不存在于西班牙样本中。 PCA 中的模式同样清晰(两个古巴人被圈出)。

我只标记了第二个情节的西班牙个体,这是一个放大图。古巴 2 的非洲和美洲印第安人血统在 PCA 和 ADMIXTURE 中很清楚。 Cuba 1 似乎确实有一些非洲血统……但她也可以成为摩尔人时期拥有非洲血统的西班牙人。 我确实相信摩尔人确实将非洲血统引入了西班牙。 为什么? 以下是巴斯克与非巴斯克西班牙人(古巴 1 和古巴 2)的个别图:

总的来说,看起来古巴 2 是 5-10% 的非白人。 古巴 1 肯定比典型的美国白人拥有更多的非白人血统,但可以说只是在西班牙的一个分布范围内。 在染色体水平上对混合物模式的进一步分析将回答这个问题(后哥伦布时代的混合物不会在欧洲遗传背景下重新组合)。 古巴 1 或古巴 2 似乎都没有中国血统。 相反,他们在 23andMe 中的“亚洲人”几乎可以肯定是美洲印第安人。 对于 Cuba 2 来说绝对是这种情况。 Cuba 1 看起来是该组件的“噪音”水平(这增加了我对非洲混合物古老和摩尔时代的可能性的估计,因为后哥伦布混合物可能表现为三- 种族)。

如果您是拉丁美洲白人,我邀请您通过 contactgnxp -at- gmail -dot- com 将您的基因型发送给我。 特别是如果有人告诉你你是“纯西班牙人”。

(从重新发布 探索/ GNXP 经作者或代表的许可)
 
• 类别: 科学 •标签: 人类学, 种族 
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  1. 我们对西班牙现存人口与拉丁美洲白人祖先的良好匹配有多大信心? 据我所知,殖民地已经被不成比例的伊比利亚conversos和moriscos(被迫皈依基督教但仍然从“天主教君主制的神圣土壤”中清除的Sephardic犹太人和穆斯林摩尔人)定居。 新莱昂/新墨西哥州的 Crypto-Sephardic 居民在基因水平上有特别详细的记录。 美国第一座犹太教堂位于罗德岛,由南美塞法迪姆建造。 公关圣胡安的防御工事是由摩尔人设计和建造的。

    这些人可能拥有更多的北非遗产,无论如何都被驱逐出祖先的土地。 许多人当然去了马格里布,但许多人选择了美洲。

  2. 您应该包括摩洛哥或其他北非本土样本。 如果没有北非样本,西非人将充当一些确实存在于伊比利亚的北非血统的代表,特别是西部三分之一(葡萄牙、加利西亚、埃斯特雷马杜拉、莱昂等)这样做您的分析将变得更加精确,您可以做出更明智的声明。

    我正在阅读所有条目,但没有提到除巴斯克人之外的伊比利亚人中相当令人惊讶的西非部分。 对于我训练有素的眼睛来说,很明显这是北非血统的代表,而不是直接的西非血统。 加那利群岛的情况证明也是如此,至少在很大程度上是这样,而且在古巴(这几乎与您的普通加那利群岛几乎相同),至少是 Cuba-1。 Cuba-2 似乎实际上混合了低水平,而且两者似乎都有一些西班牙不存在的美洲印第安人血统。

    FWTWWA 的参考资料或进一步阅读:
    http://forwhattheywereweare.blogspot.com.es/2011/12/north-african-genetics-through-prism-of.html
    http://forwhattheywereweare.blogspot.com.es/2011/04/africanness-of-europeans-and-west.html
    http://forwhattheywereweare.blogspot.com.es/2011/04/canarians-nw-africans-iberians-etc-from.html

  3. #1,我见过这样的东西,拉丁美洲的伊比利亚血统看起来很不典型(除了你提到的特殊例外)。

    #2,除了莫扎比特之外,非洲样本没有与足够多的 SNP 相交以实现良好的 ADMIXTURE。 虽然有足够的 PCA,所以我稍后会检查。

  4. 将不忠诚的民族和宗教团体推到偏远的边疆和殖民地,在那里他们会认同帝国而不是反对他们,这是所有时代的帝国统治者的作案手法。 沙赫阿巴斯和约瑟夫斯大林以非常相似的方式重新安置好战部落,如果相隔 500 年。 英国向其持不同政见者提供了美国殖民地,而俄罗斯帝国则在高加索以南新征服的土地上重新安置了其持不同政见者,如摩洛卡人。

    世界许多角落也发生了对犹太血统的帝国臣民的清洗。 例如,这就是一种常见的乳腺癌易感突变,它可以追溯到巴比伦犹太人的流放时代,它传播到全球,不仅在拉丁美洲,而且在印度和马来西亚成为最常见的风险因素(大概是来自葡萄牙的流放者)。 俄罗斯帝国还禁止犹太人进入其“圣地”,但保持其在西伯利亚和南部的边境开放。

    因此,可以预期任何历史边疆/殖民人口都可能有点异常……

  5. 我认为 Dm 指的是基因 BRCA1。 根据欧洲遗传学杂志(1 年 2010 月 1800 日)上的一篇文章,这种突变大约在 400 年前首次出现在北欧。 它在 500 到 XNUMX 年前进入德系犹太人基因库。

  6. 纽约古巴人可能往往是在迈阿密不受欢迎的人,也许是因为他们的白人往往不如迈阿密古巴权力精英。

    我查看了维基百科的著名古巴裔美国政治家名单,其中大部分是佛罗里达人。 对于大约十几个在维基百科上有照片的人,我注意到只有一个,当我的穆拉托达尔变成 XNUMX 岁时,可能会让我觉得有点像撒哈拉以南非洲人。 其他人看起来都像普通的美国白人。

    相比之下,我查看了像 Minnie Minoso 和 Tony Oliva 这样的古巴棒球运动员后杰基罗宾逊的照片。 他们往往很黑。 最近在美国长大的古巴球员,如何塞·坎塞科 (Jose Canseco) 和拉斐尔·帕尔梅罗 (Rafael Palmeiro),往往都是白人,因为他们来自流亡阶级。

    多米尼加人也有类似的情况。 大多数来自 DR 的多米尼加球员都是黑人,但美国的多米尼加人往往是混合的(美国出生的亚历克斯罗德里格斯比萨米索萨更能代表典型的多米尼加裔美国人的颜色)。

  7. 我很想看到一个关于“意大利”美国人的类似研究(很多,如果不是大多数,实际上是西西里人,就像我的姻亲一样。)也问问“北方联盟”的“意大利人”翁贝托博西,如果他们声称西西里人。 这是一个关于著名的“白人”意大利裔美国人 Louis Prima 的故事,他来自我的家乡新奥尔良,他的父母与我一些姻亲的祖先乘坐同一条船来到这里:

    http://www.hoyhoy.com/artists/prima.htm

    (只是希望能引起轰动!让它们像我们的一些家庭内部聚会一样有趣和喧闹!)

  8. 拉丁美洲本身就是一个世界。 仅巴西就比美国大陆的领土更大,而且巴西的遗传多样性比美国多。 巴西有比整个北美地区(墨西哥、美国和加拿大)更多的“纯”美洲印第安人,因为我们有亚马逊。 萨尔瓦多巴伊亚和里约热内卢等地的黑人和真正的非洲文化比任何北美城市都多。 我们拥有完整的亚洲和日本基因队伍,巴西南部的德国血统巴西人比小瑞士还多,吉赛尔·邦辰(巴西第 6 代)是世界上最成功的顶级模特。 美国人民对巴西和拉丁美洲的无知令人好奇。 你永远不能试图将世界上大部分地区的不同国家作为同一个同质集团进行比较,就像你不能比较孟加拉国、缅甸、尼泊尔、澳大利亚、新加坡一样,因为它们是不同国家的大小、人口和历史. 最后但并非最不重要的是,我想记住第一篇文章中的 Dm,第一个美国犹太教堂是由新教北欧和塞法迪犹太人在他们敢于攻击我们光荣的王国后在巴西输掉一场长期战争后被驱逐出巴西的人建造的,巴西葡萄牙语是我们迷人的美国地区的一种战争语言,我们仍然(自 1500 年以来)由我们中的一个人指挥,一位男子气概的总统代表我们自己类型的“欧洲”巴西权力,被混为一席之地和霸权。

  9. 好挖掘,查尔斯🙂! 其实有 *二* BRCA1 突变常见于犹太“癌症家族”。 您查找的那个(传统上称为 5382insC)确实起源于北欧,而德系犹太人的 STR 单倍型似乎源自波兰单倍型,最有可能是在十七世纪大屠杀时期。 当然 5382insC 没有出现在西班牙裔犹太人和拉丁美洲。

    我想到的 BRCA1 突变更常见,更古老,传统上称为 185delAG。 它(以及潜在的 STR 单倍群)在德系犹太人和塞法迪犹太人中共享,就此而言,在伊拉克犹太人中也是如此……实际上在美洲和南亚也是如此。 单倍型年龄和地理分布非常一致,将突变的出现置于公元前 586 年巴比伦流放之后美索不达米亚

  10. 这可能是一个愚蠢的问题,但是……伊比利亚人的中东(北非和西亚)在哪里? – 或者它在这个级别看起来是普通的欧洲人? 为什么犹他州白人的南亚成分比伊比利亚人的大,如果在西亚更常见?

  11. 伊比利亚人的中东(北非和西亚)在哪里? – 或者它在这个级别看起来是普通的欧洲人? 为什么犹他州白人的南亚成分比伊比利亚人的大,如果在西亚更常见?

    首先,它们不在样本中。 我不是在测试那个问题。 至于“南亚”部分,正在上升的是有一个共同元素,它跨越印欧人口,并在南印度和西欧下降。 这在其他运行中显示为“西亚”。

  12. @Dm
    感谢您让我关注 185delAG!
    5382insC 向德系族群的基因渗入估计发生在 1500 年至 1600 年之间。这是东欧犹太人的和平时期,然后集中在波兰-立陶宛帝国。 该基因可能是通过与诺夫哥罗德犹太化异端相关的转换引入的。 在俄罗斯受到迫害的皈依者在 PL 帝国寻求庇护。

  13. 请参阅我在“算法只是算法”下的评论,这是对该博客条目的更新。

  14. 嗨,对不起,如果这写得不好,英语不是我的第一语言。

    西班牙在殖民时期向美洲派遣最多殖民者的两个地区是埃斯特雷马杜拉和安达卢西亚,尤其是塞维利亚周边地区。 这两个地区在殖民者中的比例非常高。
    埃斯特雷马杜拉在 1492 年的人口为 200 万,在接下来的两个世纪里可能会增加到 XNUMX 万人。 它的人口在十七世纪末减少了一半,没有人知道有多少是因为移民,多少是因为西班牙葡萄牙边境的战争。 皮萨罗来自埃斯特雷马杜拉。

    殖民时代后,十九世纪下半叶和二十世纪初有大量移民到古巴和阿根廷,当时古巴因糖(以及后来的美国旅游业)而非常繁荣,阿根廷因其农产品出口(阿根廷)在 Beefer 船发明后立即变得富有。
    当时,大多数移民来自北方,主要是加利西亚人,还有阿斯图里亚斯人和巴斯克人(巴斯克人在殖民时期也有过多的代表,往往是精英)

    此外,在西班牙殖民帝国的头几年,受迫害的少数民族可能被过度代表为移民,而第一个到达的影响更大,后来的移民与第一批移民的后代一起繁殖。

    阿根廷和美国之间的两大区别是:

    1)1870年之前的阿根廷有一个典型的拉丁美洲人口,白人、混血儿、黑人,在种族上介于智利和巴拉圭之间,也有一些黑人。 它人口稀少,1.800.000 万人,面积只有印度的一半(阿根廷的另一半仍然由美洲印第安人控制,他们已经成为像美国西部当地人一样危险的骑马者。
    因此,从 1880 年到 1940 年来到这里的数百万欧洲移民来到了一个没有像新西兰或澳大利亚这样只有少数“野蛮人”的国家,或者像美国这样的主要由纯欧洲人和他们的奴隶居住的国家,他们来到了一个种族歧视的国家。混杂的拉丁美洲国家,无论人口多么稀少,都不是一个完整的沙漠。

    2)阿根廷接收了不同的移民,主要是意大利人、西班牙人,其次是中欧和东欧的异质群体。

    另一个问题是,在阿根廷,白人是中产阶级,拥有欧洲的生育率,来自没有接受那么多欧洲移民的省份的非白人拥有更多的后代。 在一个拥有 2.5 万人口的国家中,玻利维亚人、巴拉圭人、智利和秘鲁移民的后裔也远远超过 40 万。

  15. 应该指出的是,古巴的大多数西班牙血统来自加那利群岛,这不是真正的西班牙人,因为加那利人有本土的“Guanche”混合物,源自柏柏尔,西班牙人不存在。 事实上,加那利群岛大约有 18% 的土著人。 还应该注意的是,这里的“非洲人”在低 K 值且没有其他非洲样本的情况下,作为北非人工作,而不是真正的撒哈拉以南地区。

  16. 我去过迈阿密,遇到了许多古巴裔美国人,对我来说,他们让我觉得他们是明显的混血儿。 来自 Coral Gables 等城市的一些精英古巴裔美国人看起来像地中海品种的纯欧洲人。 但是我遇到的许多古巴裔美国人明显带有非洲和/或美洲原住民的混合物,尽管他们会强烈否认这一点。 只是我的想法。 尽管如此,古巴裔美国人的平均外表比墨西哥裔美国人、危地马拉人和萨尔瓦多人要“白”得多。

  17. @#16Wal D,你说的不是真的。 我一生中的大部分时间都住在迈阿密,迈阿密的大多数古巴人看起来都是欧洲人。 他们没有否认任何事情,因为迈阿密的大多数古巴人没有任何非洲或美洲原住民的混合物。

  18. 安迪加西亚有典型的迈阿密古巴人的外表。 在迈阿密,古巴人有许多不同的外表。 我们有金发、黑发和红头发的古巴人。 古巴不仅有来自西班牙的移民,许多来自欧洲各地的人移民到古巴,但伊比利亚人占了大多数。 在迈阿密,来自加那利群岛的西班牙人经常被问到他们是否是古巴人。 他们对古巴人感到困惑,因为我们有相同的口音,加那利人看起来像白人古巴人,这并不奇怪,因为大多数白人古巴人的祖先来自西班牙加那利群岛。

    这是迈阿密古巴人的照片。 绝大多数看起来像你会在迈阿密遇到的白人古巴人。 我的照片列表中的古巴人是普通的中产阶级古巴人,而不是精英古巴人。 我们确实在迈阿密有混血古巴人,但他们不是大多数。
    这些照片中的所有古巴人看起来都是欧洲人:

    在这张照片中,左边的第一个人不是古巴人

    您还可以查找其他白人古巴人,例如 Gelet Martinez、Marili Cancio、Carlos Ponce、Raul Esparza、Bronson Arroyo、Jose Diaz Balart、William Levy、Cari Dominguez、Carlos Eire、Daniella Garcia、Dominik Garcia、Tico Torres、Raul de Molina, Eddie Cibrian、Lincoln Diaz Balart、Mario Diaz Balart、Albio Sieres、Robert Menendez、Otto Rich、Elizabeth Rebozo、Ana De Armas、Sisi Fleites、Ileana Ros、Elizabeth Caballero、Ana Quincoces Rodriguez、Raul Malo、Johnny Goudie 和 Lisandra de la克鲁兹。

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