DIY外加剂分析
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迪内克斯·庞蒂科斯(Dienekes Pontikos) 刚刚发布 DIY多德卡,一种DIY外加剂分析程序。 你可以 自己下载文件。 它在 都 Linux和Windows。 由于我已经在Linux中拥有工具,因此我决定尝试Windows版本,它似乎可以正常工作。 它的局限性在于您从Dienekes为您设置的参数开始,但是如果您不想编写自己的脚本和 熟悉 有了所有科学计划,我认为这是一个很好的选择。 此外,它的运行速度似乎相当快,因此您无需花费数天的时间尝试使用不同的参数。
Dienekes已经让我忙了起来,但我将父母的基因型文件通过了系统。 结果如下:
菌群数 | 拉齐卜 | 母亲 | 父亲 |
东欧 | 6.9 | 6.5 | 4.3 |
西欧 | 1.7 | 3.1 | 5.5 |
地中海 | 6.3 | 5.6 | 5.9 |
新非洲 | 0 | 0 | 0 |
西方亚洲人 | 0 | 2 | 3.9 |
南亚 | 65.9 | 59.6 | 60.4 |
东北_亚洲 | 2.9 | 3.8 | 3.6 |
东南亚风味 | 15.8 | 16.6 | 15.5 |
东非 | 0 | 0 | 0.2 |
西南风味 | 0.5 | 2.5 | 0.7 |
西北非洲 | 0 | 0 | 0 |
古非洲 | 0 | 0.3 | 0 |
需要注意的主要事情是,我母亲比父亲拥有更多的东亚血统,并且西南亚人口占百分之几。 在我使用各种参数设置和参考总体混合进行的数十次ADMIXTURE运行中,这些始终是一致的发现,因此DIY Dodecad很好地复制了这些发现。 尽管人口数量对我来说似乎有点欧洲中心,所以我会最推荐那些具有西欧亚血统的人。
(从重新发布 探索/ GNXP 经作者或代表的许可)
关注@razibkhan
你妈妈的西亚是2,你爸爸的西亚是3.9(几乎是4),你却是零?...
它给了我另一个与我从扎克的分析中得到的结果不同的结果。 例如,在 HAP 南亚 + Onge 上为 42%,而 DIYDodecad 只显示我为 28% 南亚。 其他人更相似——HAP 显示我为 13% 西南亚,而 Dodecad 的西亚 (9.77%) + 西南亚 (2.94%) 是 12.71%。
Dodecad 似乎认为我比 HAP 或 23andme 更像东亚人。 23andme 说 4% 是亚洲人。 HAP 说 2% 是东亚人,1% 是西伯利亚人。 另一方面,Dodecad 表示 0.93% 的东北亚和 5.80% 的东南亚。 那是 7%——大约是其他人所说的两倍。
你妈妈的西亚是2,你爸爸的西亚是3.9(几乎是4),你却是零?...
我已经介绍了为什么这可能是一个真实的结果,而不仅仅是广泛的噪音。
http://blogs.discovermagazine.com/gnxp/2011/01/asian-in-all-the-right-places/
但对于 DIY Dodecad 来说,它也可能是噪音。 我认为这应该用作第一遍。
#2,他没有像 zack 这样的南亚偏态参考集。 一些 ASI 正在填充你的东亚人。 我可能是 5-10% 的东亚人,但 dodecad 是 15%。