计算能力的极限-1982年的阴影
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我给女儿买了一本上网本,所以现在我的电脑正在24×7全天候进行Harappa Prohect的工作。
而且,Simranjit足以让我使用服务器。 出于隐私原因,我不会在此处上传任何参与者的数据,但是它比我的计算机快得多,因此对于在参考数据上运行Admixture非常有用(尤其是交叉验证)。
至于退一步,我下载了当前的1000个基因组数据(1,212个样本,2.4万个SNP)。 它是vcf格式。 使用vcftools进行转换 将其转换为ped格式大约需要3周。 是的,你听到的是对的。 顺便说一句,从南亚的角度来看,好东西将在今年晚些时候出现,其中包括100名阿萨姆人AhomF,100名来自加尔各答的Kayadtha,来自海得拉巴的100名Reddys,来自孟买的100名Maratha和100名Lahori Punjabis。
另外,我在周日晚上和晚上的大部分时间都在急诊室,并由于我的努力而被诊断出输尿管结石症。 我只能说的是:Percocet欢呼三声!
首先,祝扎克一切顺利。 第二,他已经结束了 70个人 ,在 哈拉帕祖先项目 数据库(除了公共数据集)。 如果您是南亚人,伊朗人,缅甸人或藏族人,这里是 参加细节.
(从重新发布 探索/ GNXP 经作者或代表的许可)
关注@razibkhan
我很乐意与任何询问以下问题的基因组博主/科学家分享我的 C++ 代码 [电子邮件保护] (我已经把它寄给了扎克)。 想到 vcftools 是如何写得如此缓慢,我不寒而栗。
*苦涩无趣的笑声*
是的,我给我女儿买了一台上网本。
现在她有两台笔记本电脑,一台是苹果电脑,一台是微软兼容的“以防万一”,还有一台 iPad,而我正在使用!@#$%^ 上网本。 通过机场安检时,她感到非常尴尬。
小心聪明的女儿,扎克,她们接管了。 今天6岁,明天泽世界。 好处是他们爱和关心他们愚蠢的老父亲。