请参阅Luke Jostins的帖子,网址为 遗传推论 和 基因组解压缩.
更新: 史蒂夫·许 称重。 他读了补充! 疯狂的道具。
“这表明遗传风险因素相互独立,无论存在哪些其他风险因素,每种变异都会以相同的量增加遗传风险*。 当然,这显然是一个球形奶牛的情况”
如果奶牛进化成球形,这正是你所期望的。 有 我们的 DNA 显然已经模块化(即专门为缺乏多基因性而选择)。 它就像一个局部函数的近似值(例如,钟形曲线),由频率的离散(但无限)总和(某种正弦曲线)组成。 有限的近似最终会重复(周期性多基因性),但是当您尝试将其应用到理论数学之外时,无限的(且不重复)的近似会遇到所有这些愚蠢的“哲学问题”。 值得庆幸的是,热力学解释了这种模糊性,并且,功能模块性存在(除了在少数反对者的眼中)。
显然这不是故事的全部。
发现了一些关于上位性在人群中的进化意义:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19366665 Neher RA, Shraiman BI., Kavli 理论物理研究所,加州大学圣巴巴拉分校 “我们证明,尽管频繁重组,大量多态性相互作用基因座可以表现出合作行为,将等位基因锁定为有利的基因型,从而导致由一组竞争性克隆组成的群体。 …我们的结果表明,许多弱上位相互作用的集体效应会对种群结构产生巨大影响。”
假设模型有效,这似乎建立了上位性的潜在上限:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21697174
“”获得的适应度在 K = 3 到 5 时最大,我们从中推断 中间量的上位性和多效性是最 有利于适应”
使用 NK 模型: “遗传相互作用的 NK 模型 [31-33] 由圆形、二元 在 N 位点编码等位基因的序列,其中每个位点都有贡献 通过与其他 K 个基因座的相互作用来确定单倍型的适应性。”
重复的帖子被我删除了
重组和上位性之间的竞争可导致从等位基因到基因型选择的转变(2009)
“自然种群中存在的常设变异为选择采取行动提供了重要的原材料,特别是在环境或杂交事件发生突然变化之后(20)”
http://www.scribd.com/doc/77821868/
也,
右图: 来自贾斯汀的文章: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21697174
看起来像这样的连续(混合?)近似: http://mathworld.wolfram.com/CavemanGraph.html
鉴于此,这很有趣: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22197359
...
也——也: http://www.scribd.com/doc/74944514/
上位性在大肠杆菌和酿酒酵母中普遍存在。 这是一个实验事实。 在什么理论基础上,人们会认为对于 H.sapiens 来说并非如此?
我的意思是它暂时与人类基因组中的多效性和可加性相关联(确实如此)。 穴居人图是这种平衡行为的离散理想化。 实际的“穴居人”提供异常表型这一事实表明,有时语言有自己的思想(例如“法国人称之为……pied de Néanderthal。“)
小世界:有序与随机之间的网络动态:
“最高度聚类图的一个明显候选者是完整图,其中每个顶点都与其他每个顶点相邻。 然而,这种结构自动违反了稀疏性条件,因为它必然具有 k = n - 1。因此,需要一个全局稀疏但局部密集的图。 也就是说,k << n 和 y ~ 1。
更好的解决方案是所谓的穴居人图,它由许多完全连接的集群(或“洞穴”)组成,其中每个成员彼此相邻(图 4.1)。 每个顶点都有 ky 度,因此每个簇必须由 n_local = k + 1 个顶点组成,并且必须有 n_global = n/(k + 1) 个这样的簇。 另请注意,所有边都是多个三元组的一部分,因此没有边是捷径。 因此穴居人图满足稀疏条件并且仍然有 y = 1,但它不能满足另一个基本条件:它是连通的。 那么,最好的解决方案似乎是对穴居人图的近似近似,它既是周期性的又是连通的。“
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“这表明遗传风险因素相互独立,无论存在哪些其他风险因素,每种变异都会以相同的量增加遗传风险*。 当然,这显然是一个球形奶牛的情况”
如果奶牛进化成球形,这正是你所期望的。 有 我们的 DNA 显然已经模块化(即专门为缺乏多基因性而选择)。 它就像一个局部函数的近似值(例如,钟形曲线),由频率的离散(但无限)总和(某种正弦曲线)组成。 有限的近似最终会重复(周期性多基因性),但是当您尝试将其应用到理论数学之外时,无限的(且不重复)的近似会遇到所有这些愚蠢的“哲学问题”。 值得庆幸的是,热力学解释了这种模糊性,并且,功能模块性存在(除了在少数反对者的眼中)。
显然这不是故事的全部。
发现了一些关于上位性在人群中的进化意义:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19366665
Neher RA, Shraiman BI., Kavli 理论物理研究所,加州大学圣巴巴拉分校
“我们证明,尽管频繁重组,大量多态性相互作用基因座可以表现出合作行为,将等位基因锁定为有利的基因型,从而导致由一组竞争性克隆组成的群体。 …我们的结果表明,许多弱上位相互作用的集体效应会对种群结构产生巨大影响。”
假设模型有效,这似乎建立了上位性的潜在上限:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21697174
“”获得的适应度在 K = 3 到 5 时最大,我们从中推断
中间量的上位性和多效性是最
有利于适应”
使用 NK 模型:
“遗传相互作用的 NK 模型 [31-33] 由圆形、二元
在 N 位点编码等位基因的序列,其中每个位点都有贡献
通过与其他 K 个基因座的相互作用来确定单倍型的适应性。”
重复的帖子被我删除了
重组和上位性之间的竞争可导致从等位基因到基因型选择的转变(2009)
“自然种群中存在的常设变异为选择采取行动提供了重要的原材料,特别是在环境或杂交事件发生突然变化之后(20)”
http://www.scribd.com/doc/77821868/
也,
右图:
来自贾斯汀的文章: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21697174
看起来像这样的连续(混合?)近似: http://mathworld.wolfram.com/CavemanGraph.html
鉴于此,这很有趣: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22197359
...
也——也: http://www.scribd.com/doc/74944514/
上位性在大肠杆菌和酿酒酵母中普遍存在。 这是一个实验事实。 在什么理论基础上,人们会认为对于 H.sapiens 来说并非如此?
我的意思是它暂时与人类基因组中的多效性和可加性相关联(确实如此)。 穴居人图是这种平衡行为的离散理想化。 实际的“穴居人”提供异常表型这一事实表明,有时语言有自己的思想(例如“法国人称之为……pied de Néanderthal。“)
小世界:有序与随机之间的网络动态:
“最高度聚类图的一个明显候选者是完整图,其中每个顶点都与其他每个顶点相邻。 然而,这种结构自动违反了稀疏性条件,因为它必然具有 k = n - 1。因此,需要一个全局稀疏但局部密集的图。 也就是说,k << n 和 y ~ 1。
更好的解决方案是所谓的穴居人图,它由许多完全连接的集群(或“洞穴”)组成,其中每个成员彼此相邻(图 4.1)。 每个顶点都有 ky 度,因此每个簇必须由 n_local = k + 1 个顶点组成,并且必须有 n_global = n/(k + 1) 个这样的簇。 另请注意,所有边都是多个三元组的一部分,因此没有边是捷径。 因此穴居人图满足稀疏条件并且仍然有 y = 1,但它不能满足另一个基本条件:它是连通的。 那么,最好的解决方案似乎是对穴居人图的近似近似,它既是周期性的又是连通的。“