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尼安德特人杂交与霍尔丹法则
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詹姆斯·温特斯先生在 复制错字 为我指出了一个简短的假设文件, 尼安德特人与人类的杂种。 本文认为,尼安德特人的雄性与最近离开非洲的人口中的雌性进行选择性交配,结合 霍尔丹定律,解释了三个事实:

–现代人缺乏尼安德特人Y染色体谱系。

–现代人缺乏尼安德特人的mtDNA谱系。

–尼安德特人常染色体祖先在现代人类中可能存在。

如果您不知道,Haldane的规则基本上表明, 异配性。 在人类中,雌性是同配子,XX,雄性是杂配子,XY。 故障不一定是死亡(或自然流产)。 可能是不育的(例如,导致精子鞭毛功能失调的某种突变或遗传不相容会导致这种情况)。

所以你有一个场景 仅由 尼安德特人的雄性与南方的入侵群体杂交。 这些配对中的杂种将缺乏尼安德特人的mtDNA,因为mtDNA仅从母体传出。 但是雄性后代将具有尼安德特人的Y染色体。 这就是霍尔丹的规则所在: 这些雄性依次繁殖。 因此,只有雌性杂种会遗传它们的基因。 这些雌性显然不通过Y染色体。 并且,他们将传承其非尼安德特人母亲的mtDNA。


显然,这使得 逻辑意义上。 我如何判断呢? 这取决于其他选项以及上述模型的移动部分的概率。 关于霍尔丹规则在尼安德特人与非尼安德特人的配对中有效的想法,我的主要问题是: 这两个血统都没有分开很长时间。 作者为最近的共同祖先付出了约250,000万年的时间。 让我们加倍。 那仍然不是很大的分歧。 几年前,我读了一些关于哺乳动物杂交的文章。 有很多直接的原因与妊娠有关,为什么这是我们的血统而不是鸟类的问题,例如,在您的最后一个共同祖先生活过的物种之间存在可行的杂交实例 数千万 过去的几年。但这并不必然涉及霍尔丹的统治问题。不孕不育问题往往会在数百万年而不是数十万年的时间内出现。

无论如何,替代方案如何? 对mtDNA和Y染色体谱系可能存在某种选择性偏倚。 这可能是直接生物学的。 想象一下,尼安德特人的mtDNA与某些疾病相关,且身体不适。 作者提到了这类问题。 但这可能是社交的。 在整个拉丁美洲,混合种族人群中的美洲印第安人Y染色体谱系已经被批发替代。 实际上,您在欧洲Y染色体谱系+非欧洲mtDNA谱系的许多社会中都有复制,并且常染色体有所不同(例如,在墨西哥,常染色体是平衡的,在阿根廷它主要是欧洲的)。 还有一个问题是,由于与常染色体相比有效种群规模较小,因此mtDNA和Y染色体谱系受到更剧烈的随机动力学影响。 常染色体是父母双方共同贡献的组合,但单亲世系仅从一个传承。 相对于mtDNA谱系的传播,雄性是完全死胡同,因为它们没有传递,而雌性自然没有Y染色体。 尼安德特人的mtDNA和Y谱系可能已经灭绝,如果它们是目前人口中约30,000年的一小部分人(这是“固定”并替换所有其他谱系的概率与它的比例成正比的话)时间频率 t 0)。

但是,对我而言,真正的主要问题确实是尼安德特人与非尼安德特人之间混合不相容的合理性。 在尼安德特人-非尼安德特人掺和物的证据出现之前,这是一个普遍的想法,基于与其他哺乳动物的比较,我开始对此表示怀疑。 但是现在我们有了更详尽的遗传数据。 左边是补充表 西伯利亚Denisova洞穴中一个古人类素族的遗传历史。 它显示了自成对种群之间最后一个共同祖先以来的时间(F =法语,其余各行与各列相同)。 我不会约会 严重地。 我要指出的是,尼安德特人和其他人口之间的最后共同祖先甚至没有比非洲人和非非洲人之间的相乘因子大。 这些特定的估计值在其幅度的细节上可能是错误的,但是我认为在我们同意混合不兼容的可能性之前,我们需要考虑极高的可能性,即尼安德特人几乎没有我们所想像或曾经想像的差不多。

以下视频仅用于娱乐目的:

(从重新发布 探索/ GNXP 经作者或代表的许可)
 
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  1. 基因奥姆! 天哪方言!

    我认为他走在正确轨道上的一件事是尼安德特人看起来像个坏蛋! 😉

  2. 正如我之前在这里的评论中所建议的那样,我怀疑霍尔丹的规则是尼安德特人和非尼安德特人人口之间基因流动模式的合理贡献者。 不过,我不太相信这篇论文试图将 Y 和线粒体数据联系起来——这没有任何意义。 Haldane 的规则不会对线粒体基因流动构成任何障碍。

    尽管 250,000 年确实相对较短,但它与 Mus musculus 亚种(500,000 年)之间的差异相似,并且这些明显显示出杂交效应。 取决于你所观察的人群,两者之间的杂交 家养小家鼠 亚种可以表现出完全的生育能力、雄性不育,甚至是非互惠的雄性不育,这取决于哪个亚种贡献了 X / Y 染色体。 如果您查看之间的混合区域 小家鼠家养 人口,有证据表明性别比例偏斜取决于哪些性染色体存在于哪些遗传背景上,这再次支持了性对抗基因促成物种形成的论点。

    值得指出的是,它不一定是完全的杂交不育:杂交在几代的过程中分解也会对基因流动形成有效的障碍。 这就是你在十字架上看到的 莫洛西努斯 和实验室小鼠(主要是 家养)。 在 F1 代中,雄性和雌性都有生育能力,但是当您回溯到 FXNUMX 代时,雄性的生育能力就会丧失 莫洛西努斯 X 上 家养 背景。 有合理的转录证据表明 X 和 Y 连锁基因之间存在基因组冲突,具有相互作用的常染色体修饰符。

    显然,啮齿动物和人类之间存在差异:首先是世代时间和新陈代谢率。 500,000 年也比尼安德特人/非尼安德特人分裂和随后的基因流动之间的间隔要长得多。 另一方面,我们不知道不同的小鼠种群何时开始表现出杂种分解/不育,我们只知道它花了 超过500,000年。

  3. 我一直觉得尼安德特人的重建通常看起来太像现代欧洲人了。 我们不需要一路追寻狭缝杀手猿(!),但尼安德特人与现代欧洲人之间的遗传距离大于现代欧洲人与非洲人之间的距离这一事实表明,外观上的差异可能是也更大。 我想知道他们真正的样子! (我确实认为他们至少有可能有毛皮!!!)

  4. 你只知道探索频道的一些制作人将与来自北方的 Vicious Ape Rapers 尼安德特人合作。 他们已经用尽了 UFO、Nostradamus、Hogs Gone Wild、Ghosts 和 Big foot。 可怜的胆小的人类,他们所做的只是去寻找新的食物来源,当他们都依偎在夜火周围时会发生什么,猿强奸袭击。

  5. “……但尼安德特人和现代欧洲人之间的遗传距离大于现代欧洲人和非洲人之间的距离这一事实表明,外貌上的差异可能也更大。”

    它没有。 构成完形“外观”的表型非常不稳定。 有人可能会争辩说(我不一定)适应欧洲的生活(显然包括对沐浴的厌恶和对荧光服装的喜爱)导致尼安德特人和欧洲人的面部特征发生了广泛趋同的变化。 由于神经嵴中颅面、内分泌和肠神经系统组织的共同发育起源,对与生理学相关的许多特征的选择可能会继发影响外观。

    这一切都在挥手,但我认为遗传距离不一定能很好地代表我们所经历的面部相同性,特别是在人群之间,而选择性环境可能被低估为系统性变异的来源面部特征。

    也就是说,我真的不认为这些重建看起来很像欧洲人,除了看起来像比尔马赫的那个。

    Danny Vendramini 是我的新 Erich von Daniken。 真是个疯子! 我想知道它是否已经被选中。

  6. 我只有一个疑问:什么是“评论祖先”? 🙂

  7. 确实非常有趣。

    为了支持 Miko 关于遗传相关程度和外貌相似性的观点,Papaun 部落成员与汉族人的关系比西非人更接近,而外貌则表明完全相反。

  8. 我已经敲这个鼓好几个月了。 我很高兴看到其他人也开始接受它。

    此外,还有一种非常简单的方法可以解决为什么现代人类中的所有尼安德特人混合物都来自尼安德特人男性的问题,这是上述分析中缺失的一环。 你所需要的只是一个场景,其中尼安德特人与人类的关系本质上是强奸/投掷/季节性聚会,而不是稳定的长期婚姻,或者(可能不太可信)尼安德特人与人类的关系是母系的(这似乎是在与我们对尼安德特人社会结构的了解很少)。 无论哪种方式,混血儿最终都会成为他们母亲的部落。

    在现代人类母亲(从尼安德特人父亲那里怀孕)的情况下,这些混血孩子加入了现代人类基因库。 对于尼安德特人的母亲(从现代人类父亲那里怀孕),这些杂种最终进入了尼安德特人的基因库。

    问题在于,尼安德特人的基因库是一个池塘,当尼安德特人灭绝时,它就会干涸,因此与尼安德特人母亲的混种孩子连同他们的尼安德特人母亲大家庭一起灭绝,只留下现代人类母亲的混血孩子。基因库。

  9. 乍一看,美洲印第安人的例子似乎值得怀疑,因为这种模式不仅反映了接触,还反映了殖民者和被殖民者之间的权力差异。 但是 OHWilleke 的评论(#11)让我思考——仅仅因为人类最终取代了尼安德特人并不意味着他们在两组之间的相遇中占了上风。

    如果尼安德特人在这些互动中占上风怎么办? 狩猎采集者不能偷窃物质财产,但他们可以偷走女人。 如果您谈论的是长期的朝贡关系,那么也可以想象尼安德特人能够识别(并声称拥有)混血儿子。 (想象尼安德特人的社会重视儿子多于女儿并不是一件容易的事——这与我们在许多现代人类社会中发现的情况非常吻合。)

    我认为加勒比岛人是一个(部分)模型。 男人和女人说不同的语言——据报道,男人说加勒比语,而女人说阿拉瓦坎语(可能反映了长期被俘虏的泰诺妇女)。

    这种模式有一个弱点——如果大多数混血儿子被父亲找回,那么接触就不得不延长。 如果有长时间的接触,那么人类与尼安德特人的基因渗入很可能是 更多 比尼安德特人对人类更明显。 推定的杂交化石的缺乏可能会反对这一点……尽管另一方面,尽管缺乏化石,但我们知道存在杂交种。

  10. FWIW, 约翰霍克斯应该是这方面的专家,一年前说过:

    “我不断地看到人们,他们 应该知道得更好,说新的尼安德特人基因组结果表明基因流一定是尼安德特人与现代人类女性交配,而不是相反。

    你看,他们固执地认为 mtDNA 没有显示出尼安德特人进化枝在当今人口中幸存下来的迹象。 这个结果确实让一些人相信杂交是不可能的。 他们感到困惑的是,基因组的其余部分有明显的混合迹象。 就像他们的世界失去了控制一样。 我没有说出任何名字,但如果你关注过很多关于尼安德特人基因组的新闻,你可能已经看到了这个建议。

    我不知道为什么他们没有想到尼安德特人的 mtDNA 类型可能由于自然选择而丢失。”

    不过,我喜欢一种更平衡的方法,例如在我阅读的帖子中。

    @戴夫张伯伦:

    您不认为电影制片人/作家/导演文德拉米尼没有考虑过这一点吗? 从一开始,也许。

    [哎哟! 他也出现在广告中。]

  11. 当 DNA 测试在另外 5 到 15 年内变得司空见惯时,我设想在现代 Hs 中会发现尼安德特人的 Y 或 MT-DNA 谱系。 随机。

  12. “我不知道为什么他们没有想到尼安德特人的 mtDNA 类型可能由于自然选择而丢失。”

    虽然这是可能的,但似乎没有特别有力的证据表明自然选择在现代人类 mtDNA 变异中发挥了重要作用。 mtDNA 变异看起来更适合选择性中性,它伴随着自然选择的其他遗传和/或文化驱动因素驱动的趋势,这些驱动因素恰好与 mtDNA 变异一致。

    霍克斯最近发现,在东欧亚人中发现的尼安德特人 DNA 与在西欧亚人中发现的尼安德特人 DNA 大不相同,这也证明了我们的大部分尼安德特人 DNA 遗产,虽然从选择性的角度来看并没有起到决定性的反作用,但也没有提供决定性的作用。选择性优势。 只有在西欧和东欧亚尼安德特人的 DNA 遗产中发现的基因数量占总数的比例大于随机机会的预期时,才能证明选择性优势。

    与 mtDNA 相关的选择性因素可能与代谢率有关,因为线粒体与调节代谢密切相关。 这是一个特征,人们期望在较冷的气候中的尼安德特人比现代人更能适应较冷的气候,现代人将是较近的非洲外籍人士,那里的气候较温暖,至少对于那些像许多人一样迁移到较冷地区的现代人来说是这样。尼安德特人与现代人类互动的时代。 因此,现代人类 mtDNA 相对于尼安德特人 DNA 具有选择性优势,这将是相当令人惊讶的。

    我也不认为 Eze @14 是正确的,即随机 DNA 测试很有可能在未来 5-15 年内在现代人类中发现尼安德特人 Y 或 mtDNA 谱系。 所有已经进行过单亲 DNA 单倍群分型的欧亚人的总样本量已经达到数万甚至数十万,其中非典型的孑遗种群大多是过采样的,到目前为止还没有发现一个这样的案例。

    考虑到过去 30,000 年来世界所看到的人口扩张量(大约一万倍)(内纳德特人 DNA 的最年轻起源),很难想象一个拥有一千多代的基因在人口急剧扩张的时期,他们的年龄将留在人口中,但如此罕见,以至于它或它的系统发育后代不会出现在与已经存在的样本一样大的样本中。

  13. 嗯,文德拉米尼知道大猩猩不是双足动物吗? 我不认为 黑猩猩 真的都是双足动物。 他说尼安德特人是灵长类动物,但没有指出他们更具体地是原始人。 有趣的是,当他表面上在户外时,他的声音与在室内时的回声是一样的。

  14. “尼安德特人男性与最近离开非洲的人群中的女性选择性交配”

    不可能。 非洲人一定是侵略者,他们得到了女人。 否则,我们将成为尼安德特人,想知道非洲人发生了什么事。

  15. 这为我已故父亲最喜欢的表达方式之一增添了全新的含义,用来形容顽皮的孩子或其他失控的人“像被强奸的猿一样狂野”。 不过,说真的,我同意视频“仅​​供娱乐”下的建议。 我确实很开心。

  16. 与助产士交谈。 多年来,我一直在网上引用一位看着健壮的尼安德特人骨盆——在分娩过程中不会裂得更宽——说他们无法安全地分娩杂交种,但克罗马农妇女会。

  17. 智人肉体的消耗,尤其是大脑,可能为尼安德特人智人最终灭绝提供了线索。 看看像新几内亚中部高地库鲁这样的朊病毒病,在 1940 年代后期和 1950 年代,几乎消灭了在那里生活了数万年的部落。 我们的祖先并没有将尼安德特人猎杀至灭绝。 我们的脑朊病毒杀死了它们。 有点诗意的正义,那个!

  18. @# 3 贾斯汀·吉安科拉,

    “啧啧方言!” . 你不会说方言吗?

    该视频绝对仅供娱乐。

  19. 请大家统计一下。 mtDNA 线消失了——不是因为自然选择,也不是因为携带这些线的人没有繁殖,而是因为随机统计效应。 一个个人的例子:我的祖母大约有五十个活着的后代,都携带着她的 DNA 的一部分。 然而,她的 mtDNA 线永远消失了。 那是因为她有五个儿子和两个女儿。 那两个女儿没有女儿,只有儿子! 另一方面,我的外祖母只有十个在世的后代。 她有一个女儿,她有一个女儿,她有两个女儿。 她的 mtDNA 线继续存在!

    在一个稳定的种群中,每个繁殖的雌性恰好留下两个繁殖的孩子,90% 的原始 mtDNA 系将在短短 34 代内被破坏。 那还不到1.000年。 因此,如果您从混合种群中的 1.000 名女性尼安德特人开始,那么在 100 年后,只有不到 1.000 条尼安德特人 mtDNA 系将存活。 又过了 1.000 年,不到 10 年。又过了 1.000 年……您可以对尼安德特人的 Y 染色体系进行相同类型的计算。 综上所述:如果尼安德特人是我们共同祖先中的一小部分,那么任何两个尼安德特人基因都极不可能在 30.000 年后存活下来。 (实际上,mtDNA 和 Y 染色体作为一个基因遗传,因为它们是一体遗传的。)结论:我们不必构建复杂的婚姻习俗或生殖模式理论来解释缺乏今天的尼安德特人 mtDNA 或尼安德特人 Y 染色体; 我们只需要做一些合理的数学运算。

    三十年来,占统治地位的正统派——“最近走出非洲”学派——一直严重依赖于我们 25.000 个基因中的一个基因。 实际上,每个基因都有自己的祖先树! 整个画面将非常复杂,我们刚刚开始拼凑几块拼图。 我们所知道的是,普通人携带大约 1.000 个从我们的尼安德特人祖先那里继承的基因。 (我头骨后面的“尼安德特人发髻”证实了我的混血血统!)我们其余的大部分基因很可能都是最近的非洲血统(“最近的”意味着 100.000 万年或更短时间),但我们没有知道这一点。 一旦我们开始看到亚洲直立人的 DNA,我们就会知道更多,而且我相信我们会遇到很多惊喜。 我们认识自己是谁以及我们来自哪里的方式正在发生一场革命。

  20. 娱乐,是的。 科学,没有。

  21. 请大家统计一下。 mtDNA 线消失

    你在和谁说话? 你注意到我在我的帖子中提到了这一点,因为你读过它?

  22. 在 4:13 他拿着头骨,所以它看着天花板,说它有一张突出的脸。 如果你正确地握住它,那么眼睛就不会向前看。

  23. 致 Razib Khan:你说的很对,伙计。 你确实指出来了! 然而,很多人——包括几位著名的古人类学家——三十年来一直忽视这个简单的事实! 随着对更多化石的分析,我们应该期待看到今天丢失的大量 mtDNA 系。 这些线不仅可以在尼安德特人和丹尼索瓦人身上找到,而且在“现代”智人、非洲和其他地方也可以找到。 这绝不是说那些人没有活着的后代!

    几年前,一个澳大利亚团队发表了他们对芒戈湖化石的研究结果——我应该补充一下,这是完美的“现代”标本。 他们发现的 mtDNA 落在了根植于著名的“非洲前夜”的公认树之外,因此,他们的研究在很大程度上被忽视了。 无论他们的结果是否如一些批评者所声称的那样是由污染引起的,这样的结果正是人们所期望的——基于纯粹的统计依据。

  24. 文德拉米尼的许多论点似乎是没有坚实根据的纯粹猜测。 但有一件事让我印象深刻:Vendramini 和 Balseiro 的尼安德特人重建的基于硬组织的部分(例如眼睛的位置和大小)是否具有任何科学有效性? 我问这个是因为,与遗传学不同,我对面部重建一无所知。

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