RSS
髓： 大约 130,000 年前，人类家谱的布须曼人分支出现了分歧。 大约 50,000 年前，非非洲人从非洲人中分离出来。 大约 35,000 年前，欧洲人和东亚人分道扬镳。
古人类学中一个容易混淆的术语是 古老 智人 (AHS)。 这与 解剖学上的现代人类 （AMH）。 一个简单的 走出非洲 “recent-origin-with-replacement”模型允许回避语义上的不精确性，将不同的种群归为一个通用类别，例如 AHS（类似地，术语“动物”而不是“人类”具有一些口语化的效用，但它在科学上并不有用）。 但是 与古代血统混合的可能性 在现代人群中 迫使我们努力解决 AHS 和 AMH 之间的二分法，因为现代人可能是这两个类别的混合物（更不用说 行为上的现代人, 他们是 AMH 的子集)。
我认为充实一个既精确又准确的新范例的细节将是未来几年的一个项目。 但在我们继续前进之前，我们需要更坚定地巩固我们对当代人口系谱关系的理解。 在过去的几年里，这一领域取得了重大进展，证实了现代人类占主导地位的非洲遗产的大致轮廓。 遗传学家已经从经典标记转向 SNP 数据，专注于数十万种遗传变异。 但现在他们正在转向全基因组序列，除了错误之外，它包含了人类遗传变异最低阶方面的全部内容。*今年夏天早些时候，我回顾了一篇论文 自然 这是一个预示， 从单个全基因组序列推论人口历史。 今天 自然 发表了另一个， 从个体基因组序列对古代人类人口统计学的贝叶斯推断.
作者分析了六个人类基因组，一个北欧人、一个尼日利亚约鲁巴人、一个中国汉人、一个科萨部落的南非班图人和一个南比亚布须曼人。 其中一些示例很熟悉。 北欧的是Craig Venter，而南部非洲的样本和论文中的一样 科伊桑基因组学. 黑猩猩是外群。 由于这是一篇计算量大的论文，请注意它对参数有些敏感，例如黑猩猩和人类谱系之间的分歧时间以及 人类突变率 在评估任何给定最终数字的可能性时。
作者建议做的是使用 合并模型. 在所有条件相同的情况下，由于不同的突变和随机遗传漂移的影响，人类种群将开始表现出遗传差异。 对差异或区别的估计可以让人对分离后的时间有一个粗略的了解。 但显然这是一个非常简单的模型，并没有考虑基因流动等可以减少种群间差异的因素。 但是当他们包括一个基因流参数时，他们发现系统发育树和对最后共同祖先的估计相对稳健。 请注意，在上述人群中，大多数成对案例中只有最小的基因流动似乎是合理的（例如，自分离以来北欧人和中国汉人之间没有太多基因流动）。 南非班图人是个例外，因为这个人来自一个已知有科伊桑混血儿的部落。 此外，许多科伊桑人也混有一些班图人（甚至南非的欧洲人）。
以下是他们的顶级结果：
– San – 非 San 差异约 130,000 年 BP
– 欧亚大陆 - 非洲 BP 约 50,000 年的分歧
– 欧洲 – 东亚差异约 35,000 年 BP
首先，作者指出，他们的方法在欧洲人和东亚人之间产生了差异，这在考古学上比仅使用等位基因频率的约 20,000 年差异更合理。 这可能是由于等位基因频率是遗传变异的一个子集，并且由于各种原因它们可能存在偏差（特别是“遗漏”了非欧洲人中常见的许多变异）。 至于第二个，我会让作者说话：
值得注意的是，我们对 ~130 kya 的点估计表明 San 分歧发生的时间是非洲-欧亚分歧的 2.5 倍， 主要人口群体在走出非洲迁移之前至少出现了约 80,000 年的分化，而桑族分化的时间是人类与尼安德特人的分化的三分之一以上…仍然，人类有效种群规模足够大，以至于这些分歧时间相对于谱系在祖先种群中找到共同祖先所需的时间而言很小。 事实上，在将桑人个体与欧亚人个体区分开来的突变中，预计只有约 25% 会在桑人分化后出现。 因此，San 人口的古老差异并没有改变一个基本事实，即人口群体内部发生的人类变异比他们之间发生的要多得多
现在有相当多的数据和结果表明，撒哈拉以南非洲传统上以狩猎采集为生的人口与非洲大陆的农民和农牧民之间存在着深刻的差异。 如果这些结果是正确的（并且它们似乎符合 南非班图人和科伊桑人的早期基因组分析) 然后我们在这里对非常简单的“走出非洲”模型进行了相当直接的反驳，在该模型中，一个东非群体取代了其他所有人。 布须曼人似乎属于另一个血统。 其次，这些结果表明 我们应该谨慎推断尼安德特人和 AMH 之间的质的区别，前者被括为“古老”。 布须曼人和非布须曼人之间的差异远小于尼安德特人和 AMH 之间的差异，但这是倍数，而不是数量级。
最后，作者撇开混合对他们更广泛故事的边缘的影响。 他们声称要捕捉的是主要的人类叙事，即在过去 100,000 万年中边缘化和同化其他人类种群的非洲人。
*我假设基因调控和其他可能受到未在原始序列中捕获的生物物理特征的影响。
最后是一篇日期更合理的论文——尽管同样，只有给定时间间隔和方法内最古老的日期才有意义。使用最古老的人类泛分歧时间（7.6 Mya）导致非洲内部在 147-157 ka 发生分裂。
大约 140,000 年至 160,000 年之间，气候非常寒冷和干燥 *开始* 这一时期无疑是非洲分裂成两个孤立人口的合理时期。此外，在随后的115,000-130,000年的潮湿和温暖阶段（绿色撒哈拉和可能潮湿的南非），这些种群将经历单独的增长，从而修复它们的差异。
最古老的泛人类发散时间（7.6 Ma）也导致了比早期发散时间更可信的 ooA 时间（51 至 64 ka）。大约七万年前，气候相当温暖湿润；因此，间隔和方法中最古老的可能日期（可能加上 70,000-10%）是有一定意义的。
欧洲-亚洲分裂的最古老时间（从所有间隔和方法来看）是 44,000 年前，考虑到欧洲化石记录，这当然是完全合理的（考虑到人口在迁徙之前分裂，再次增加 10-20%） ，并考虑提前逃往东南亚）。
至于尼安德特人，我曾在很多场合说过，海德堡人和尼安德特人当然有相同的周期性（约 50,000 或 100,000 年）温暖/潮湿的气候机会，可以与黎凡特和北非的非洲人相遇并交换基因。因此，我发现过去几百万年中明显的“趋同进化”并不令人意外。然而，250,000万年前的事件异常短暂，可能没有帮助。之前的最后一次是 350,000 年——与所谓的尼安德特人-AMH 分裂完美匹配（好吧，又是该区间内最古老的分裂）。
我们应该谨慎推断尼安德特人和 AMH 之间的质的区别，前者被括为“古老”。
古风不是指时间段，而是指解剖学。尼安德特人和早期 AMH 共享地球的某些部分，正如我们这些天经常听到的那样。 🙂 这种时间顺序的交叉对他们的解剖结构没有影响。他们不同于 智人。事实上，尼安德特人在非洲以外的地方已经形成了许多这些差异。它们位于一条单独的支线上 智人 而不是他们的祖先。
最早的 AMH 正是如此，无论年龄多大。他们是 智人 在解剖学上和我们的祖先。
作为一个完全无知的人（但也是一个狂热的读者），我对欧洲和东亚人类之间 35,000 年“分裂”的影响有些好奇，那就是：虽然我们不知道是谁，但很明显 *一些* 一群人类在欧洲制作了洞穴壁画，这些壁画（在某些情况下）可以追溯到大约同一时期。如果大约在同一时间发生了某种人口分离，这是否意味着今天东亚人的祖先从陆地的另一端向东迁移？或者这是否意味着一个（可能相当分散的）遗传上一致的群体在某种程度上被（比如）气候变化强行分裂？
自从我开始阅读这个博客以来，我已经阅读了很多有关移民动态的文章（包括 Peter Heather 的“帝国与野蛮人”），但像这样的问题仍然让我摸不着头脑，寻求一些理解。当然，我意识到可能无法得出结论性的答案。