请忽略MtDNA和Y染色体单倍群
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这是一项公共服务公告。 如果您是直接面向消费者的个人基因组学服务的用户, 请不要对您的mtDNA和Y染色体单倍体组给予任何关注。 为什么? 因为他们几乎不告诉您有关您个人血统的任何信息。 我的意思是什么? 您的mtDNA来自母亲的母亲的母亲……如果您是男性,Y染色体谱系也是如此。 与不为您的mtDNA或Y谱系做出贡献的所有众多人群相比,这几个人对您的祖先贡献更大。 也就是您几乎所有的祖先! 您应该注意的是常染色体结果。 从您的大多数基因组得出的推论。 在这种情况下,这些结果可能更难解析,但是困难不是罪过,优雅的轻松也不是美德。 那是因为您对您的祖先感兴趣, 不是一个方便的可解释的故事.
我当然是 不能 说mtDNA和Y染色体单倍体是无用的。 它们对 人口规模 系谱学。 但请不要从一个数据点对自己进行推断。 至少在大多数情况下。
(从重新发布 探索/ GNXP 经作者或代表的许可)
关注@razibkhan
如果你对自己的健康或一般特征感兴趣,那么你会做得很好——在大多数情况下,而不是完全——忽略单亲标记——NRY 和 mtDNA。
但是,如果您对遗传谱系学(通过 DNA 追踪您的祖先)或某些祖先的种群水平历史感兴趣,那么 Y-DNA 至关重要,因为它形成了一条贯穿世代的不间断的踪迹。
例如,如果您的姓氏(又名姓氏)是“Smith”,它可以揭示同名人士之间的确切关系,并排除数百万的虚假线索——当您搜索您的直系男性祖先时。
同样,对于广泛分布的 Y-DNA 单倍群——如从苏格兰到孟加拉、穿越中亚、俄罗斯和中国西北部的 R1a1a——它可以揭示携带它的数百万男性体内的隐藏结构,基于 SNP 分析,并指出针对特定的人口历史、迁移、入侵等。
全面披露:
我最近创办了一家基因初创公司—— http://www.fullgenomes.com – 测试全 Y 染色体。 我们计划在未来几个月内推出一系列其他产品,敬请期待。
or 人口水平 你的一些祖先的历史,
我认为关键是人口水平。 大多数人不理解这一点,并认为单亲血统在个人规模上具有实质性相关性。 他们不是。 尽管它们可能与精神有关。
但是,如果您对遗传谱系学(通过 DNA 追踪您的祖先)或某些祖先的种群水平历史感兴趣,那么 Y-DNA 至关重要,因为它形成了一条贯穿世代的不间断的踪迹。
例如,如果您的姓氏(又名姓氏)是“Smith”,则它可以揭示同名人士之间的确切关系,并排除数百万错误线索 - 当您搜索您的直系男性祖先时。
同样,对于广泛分布的 Y-DNA 单倍群——如从苏格兰到孟加拉、穿越中亚、俄罗斯和中国西北部的 R1a1a——它可以揭示携带它的数百万男性体内的隐藏结构,基于 SNP 分析,并指出针对特定的人口历史、迁移、入侵等。
全面披露:
我最近推出了一家基因初创公司 - http://www.fullgenomes.com - 测试全 Y 染色体。 我们计划在未来几个月内推出一系列其他产品,敬请期待。
回复:@Razib Khan
or 人口水平 你的一些祖先的历史,
我认为关键是人口水平。 大多数人不理解这一点,并认为单亲血统在个人规模上具有实质性相关性。 他们不是。 尽管它们可能与精神有关。
一般来说,你是对的,但在某些特殊情况下,MtDNA 会告诉你一些事情。 我主要是欧洲血统,据说有 10-13% 的美洲印第安人血统。 23andMe 早些时候的估计说,这个比例更像是 6%。
知道我是 MtDNA 单倍群 A2 告诉我 *哪一个* 祖先是印度人。
真实的。
同样,我母亲的家人来自阿根廷,但家人对任何非欧洲祖先一无所知,23andMe 对美洲原住民血统的总体估计为 1.7%,这可能在误差范围内,但我的 MtDNA以单倍群 C 的形式回来,我得到了更好的证据,证明我在那条线上确实有一些血统。
回复:@Razib Khan
知道我是 MtDNA 单倍群 A2 告诉我*哪个*祖先是印度人。
回复:@Razib Khan,@hypnosifl
真实的。
遗传谱系社区是不同的,而且是极少数。 他们实际上知道他们在做什么,以及他们在做什么的相关性。 他们不是 100,000andMe 等的 23 多名普通客户,他们完全被这一切弄糊涂了。
我希望我不会误解您对 500andme、FTDNA、NG Geno 23、Ancestry.com 等“个人水平”近期血统目的(<2.0 YBP)的 DTC Y-DNA 和 mt-DNA DNA 测试的看法。
您现在似乎不赞成对 Y-DNA 和 mt-DNA 进行“个体水平”测试,以“更容易”确定一些主要和信息丰富的近期祖先起点,而是试图说服不知情(您的话 - “完全糊涂”)的消费者最初着手进行常染色体测试。 你说:“你应该注意的是你的常染色体结果。由你的大部分基因组做出的推论。”
马克·托马斯错误地将所有外行遗传系谱学家和 DTC DNA 祖先消费者描绘为“遗传占星家”。 现在你添加到混合中并说我们“完全困惑”并且 Y-DNA 和 mt-DNA 仅仅是“精神相关”。
您的论点没有提到消费者常染色体 DNA 分析存在许多弱或不存在的“参考人群组”。
关于“完全困惑”......我希望您能提供一些信息或研究来支持这一点,或者至少将 DTC 祖先检测与对我对 DS 和其他疾病的严重 DNA 产前检测感到困惑的父母进行比较。 http://online.wsj.com/article/SB10001424127887324883604578398791568615644.html
回复:@Andrew Lancaster
谢谢你的帖子。 我完全同意,天哪,如果一个人只是阅读 23andMe 的评论,很明显那里的普通人没有任何线索,而且有点被误导了。 99 美元,仍然物超所值,但这已经够糟糕了,我不得不停止接受分享邀请,并躲避那个相对的发现者的事情……我只是厌倦了向新手解释事情。
我对这种消费者级基因服务的东西有 3 种主要的不满。 1)你刚刚写的东西——人口研究数据的呈现与个体相关; 2) 没有分阶段导致大量误报,可能匹配的数量相对较少(如 0.1%); 3) 单个 SNP 的呈现作为建立多基因性状(记忆、身高、肌肉……)的表型。
这一切都被置若罔闻……一项服务将呈现出最能促进他们业务发展的一切。
回复:@Anonymous
我希望我不会误解您对 500andme、FTDNA、NG Geno 23、Ancestry.com 等“个人水平”近期血统目的(<2.0 YBP)的 DTC Y-DNA 和 mt-DNA DNA 测试的看法。
您现在似乎不赞成对 Y-DNA 和 mt-DNA 进行“个体水平”测试,以“更容易”确定一些主要且信息丰富的近期祖先起点,并试图说服不知情(您的话——“完全糊涂”)的消费者最初着手进行常染色体测试。 你说:“你应该注意的是你的常染色体结果。由你的大部分基因组做出的推论。”
马克·托马斯错误地将所有外行遗传系谱学家和 DTC DNA 祖先消费者描绘为“遗传占星家”。 现在你添加到混合中并说我们“完全困惑”并且 Y-DNA 和 mt-DNA 仅仅是“精神相关”。
您的论点没有提到消费者常染色体 DNA 分析存在许多弱或不存在的“参考人群组”。
关于“完全困惑”……我希望您能提供一些信息或研究来支持这一点,或者至少将 DTC 祖先检测与对我对 DS 和其他疾病的严重 DNA 产前检测感到困惑的父母进行比较。 http://online.wsj.com/article/SB10001424127887324883604578398791568615644.html
FWIW,作为遗传系谱学家:
1. 我同意 Y DNA(不是 mt DNA)在家谱中非常有用。 这无疑是值得一提的,它为 Razib 所说的话增添了一些东西。
2. OTOH,虽然我同意 Mark Thomas 过度概括,但我也不同意遗传系谱学家通常不会(当然不总是)误解单亲标记在确定“他们是谁”方面的重要性。 您不必长时间看GG论坛就可以看到一点“占星术”。 :D
我有点不同意,尤其是对于具有有效内婚史的人群……属于内婚家庭的个人更有可能在整个论文记录中找到他的单倍群。
例如,我有 101 个 J1e 表亲……这是我所有的 RF 比赛中最大的进化枝,也是我自己的单倍群,第二个最常见的是 E-M123,有 97 个表亲。
我认为你是对的,单亲标记可用于群体遗传学。 这是因为它们以非随机方式传播的方式与平均 DNA 块不同。 (想想在技术或政治变革时期 Y DNA 会以非随机方式传播,或者 mt DNA 将倾向于代表相反的更稳定的极端。)
也许 Razib 的帖子可以被视为不同意这一点,尽管我认为这不是他所写的。 无论如何,这似乎是一个值得提出的观点。
但是,作为数据库中的单一统计数据有用的东西,如果孤立地看待,可能毫无意义。 因此,查看整个国家的 Y DNA 可能很有用,但查看某个单倍群的单个案例可能根本没有用。
如果您进行过 Y-DNA 测试,请查看与您有共同男性祖先的人的姓氏。 您会注意到它们都是不同的,这是因为这些姓氏出现在生活在一个非常特定区域的一组相关男性中。 找出出现在您的 Y-DNA 结果中的姓氏起源于何处,您将揭示一个共同的关联领域,或者您的祖先在选择姓氏时居住的地方(通常是 1000 年前)
当然,这确实取决于一个地区何时采用姓氏,鉴于大多数爱尔兰姓氏以某种形式存在长达 1000 年,我们在爱尔兰的选择有点被宠坏了。
Razib 关于大规模人口研究,我看到法兰德斯研究发表了新报告,他们最终测试了他们上次遗漏的 R1b-L21。 他们还测试了 R1b-Z195。
“提高系统发育分辨率仍然为西欧人群的 Y 染色体研究提供信息”
http://www.fsigenetics.com/article/S1872-4973(13)00101-4/abstract
- 保罗
回复:@Tyrone Bowes
回复:@Paul Ó Dubhthaigh
当然,这确实取决于一个地区何时采用姓氏,鉴于大多数爱尔兰姓氏以某种形式存在长达 1000 年,我们在爱尔兰的选择有点被宠坏了。
Razib 关于大规模人口研究,我看到法兰德斯研究发表了新报告,他们最终测试了他们上次遗漏的 R1b-L21。 他们还测试了 R1b-Z195。
“提高系统发育分辨率仍然为西欧人群的 Y 染色体研究提供信息”
http://www.fsigenetics.com/article/S1872-4973(13)00101-4/abstract
- 保罗
是的,这取决于姓氏何时出现。 它对苏格兰人和爱尔兰人特别有效,它可以精确定位半径 5 英里内的区域 http://www.surnamedna.com/?articles=using-y-chromosome-dna-testing-to-pinpoint-a-爱尔兰的基因家园
当然,这确实取决于一个地区何时采用姓氏,鉴于大多数爱尔兰姓氏以某种形式存在长达 1000 年,我们在爱尔兰的选择有点被宠坏了。
Razib 关于大规模人口研究,我看到法兰德斯研究发表了新报告,他们最终测试了他们上次遗漏的 R1b-L21。 他们还测试了 R1b-Z195。
“提高系统发育分辨率仍然为西欧人群的 Y 染色体研究提供信息”
http://www.fsigenetics.com/article/S1872-4973(13)00101-4/abstract
- 保罗
回复:@Tyrone Bowes
是的,这取决于姓氏何时出现。 它对苏格兰人和爱尔兰人特别有效,它可以精确定位到半径 5 英里内的区域 http://www.surnamedna.com/?articles=using-y-chromosome-dna-testing-to-pinpoint-a-genetic-homeland-in-ireland
有可能我的祖先非常简单,以至于 Y 染色体(爱尔兰人)和 MtDNA(瑞典人)指定了我近 90% 的遗传遗传,假设自上一个冰河时代结束以来,爱尔兰人和瑞典人的种群已经相当孤立。
一个月左右从 23andme 得到结果时,可能会有一些惊喜,但我并不乐观。
例如,我有 101 个 J1e 表亲……这是我在 RF 上所有比赛中最大的进化枝,也是我自己的单倍群,第二常见的是 E-M123,有 97 个表亲。
回复:@Andrew Lancaster
我认为你是对的,单亲标记可用于群体遗传学。 这是因为它们以非随机方式传播的方式与平均 DNA 块不同。 (想想在技术或政治变革时期 Y DNA 会以非随机方式传播,或者 mt DNA 将倾向于代表相反的更稳定的极端。)
也许 Razib 的帖子可以被视为不同意这一点,尽管我认为这不是他所写的。 无论如何,这似乎是一个值得提出的观点。
但是,作为数据库中的单一统计数据有用的东西,如果孤立地看待,可能毫无意义。 因此,查看整个国家的 Y DNA 可能很有用,但查看某个单倍群的单个案例可能根本没有用。
我希望我不会误解您对 500andme、FTDNA、NG Geno 23、Ancestry.com 等“个人水平”近期血统目的(<2.0 YBP)的 DTC Y-DNA 和 mt-DNA DNA 测试的看法。
您现在似乎不赞成对 Y-DNA 和 mt-DNA 进行“个体水平”测试,以“更容易”确定一些主要和信息丰富的近期祖先起点,而是试图说服不知情(您的话 - “完全糊涂”)的消费者最初着手进行常染色体测试。 你说:“你应该注意的是你的常染色体结果。由你的大部分基因组做出的推论。”
马克·托马斯错误地将所有外行遗传系谱学家和 DTC DNA 祖先消费者描绘为“遗传占星家”。 现在你添加到混合中并说我们“完全困惑”并且 Y-DNA 和 mt-DNA 仅仅是“精神相关”。
您的论点没有提到消费者常染色体 DNA 分析存在许多弱或不存在的“参考人群组”。
关于“完全困惑”......我希望您能提供一些信息或研究来支持这一点,或者至少将 DTC 祖先检测与对我对 DS 和其他疾病的严重 DNA 产前检测感到困惑的父母进行比较。 http://online.wsj.com/article/SB10001424127887324883604578398791568615644.html
回复:@Andrew Lancaster
FWIW,作为遗传系谱学家:
1. 我同意 Y DNA(不是 mt DNA)在家谱中非常有用。 这无疑是值得一提的,它为 Razib 所说的话增添了一些东西。
2. OTOH,虽然我同意 Mark Thomas 过度概括,但我也不同意遗传系谱学家通常不会(当然不总是)误解单亲标记在确定“他们是谁”方面的重要性。 您不必长时间查看 GG 论坛即可看到一点“占星术”。 😀
知道我是 MtDNA 单倍群 A2 告诉我*哪个*祖先是印度人。
回复:@Razib Khan,@hypnosifl
同样,我母亲的家人来自阿根廷,但家人对任何非欧洲祖先一无所知,23andMe 对美洲原住民血统的总体估计为 1.7%,这可能在误差范围内,但我的 MtDNA以单倍群 C 的形式回来,我得到了更好的证据,证明我在那条线上确实有一些血统。
据我所知,1.7% 不在他们拥有的标记数量的误差范围内。 还有我自己的外加剂等,似乎表明 1%> 在欧洲人中是非常有用的。
同样,我母亲的家人来自阿根廷,但家人对任何非欧洲祖先一无所知,23andMe 对美洲原住民血统的总体估计为 1.7%,这可能在误差范围内,但我的 MtDNA以单倍群 C 的形式回来,我得到了更好的证据,证明我在那条线上确实有一些血统。
回复:@Razib Khan
据我所知,1.7% 不在他们拥有的标记数量的误差范围内。 还有我自己的外加剂等,似乎表明 1%> 在欧洲人中是非常有用的。