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信用: Sci Transl Med 3 年 2013 月 5 日:卷。 192,第 192 期,p. 86ra10.1126,科学。 翻译。 医学。 DOI:3006338/scitranslmed.XNUMX

就在我入睡之前,一位读者给我发送了一封电子邮件,其中指出了尼克·韦德(Nick Wade)的一本书。 纽约时报, 基因侦探发现如何自然抵抗霍乱。 这是关于 科学转化医学, 霍乱地方性恒河三角洲孟加拉国人口的自然选择。 作者使用“多种信号的复合”(CMS)测试以确定自然选择的基因组区域(寻找较长时间) 单倍型,高频衍生等位基因,以及具有 高跨人口频率差异)。 结果并不令人惊讶,我出生在孟加拉国,我可以证明这是细菌恐惧症的噩梦。 坦白地说,这是论文的次要和次要方面。 首先让我们引用韦德的治疗方法:

作为测试自然选择的必要先决条件,研究人员研究了孟加拉人口的种族构成,发现他们是印度人口,其中东亚基因的掺混率为9%, 可能是中国人。 根据统计计算,这种混合物几乎恰好发生在52代之前,或者大约在公元500年,假设每代29年。 印度的古普塔帝国此时正在衰落,但尚不清楚与东亚人的通婚是通过贸易还是征服进行的。 “我们现在可以回到历史学家那里,看看接下来发生了什么,”卡尔森博士说。

但是有时科学在传播中会出现混乱。 他们在报纸上怎么说? 同样,相关部分:



我们估计,印度和东亚人口之间的混合发生在52±2代前(一代= 29岁)…或大约在公元500年,这是基于连锁不平衡(LD)的指数下降以及使用ROLLOFF分析的距离得出的。合适的年龄估算大致对应于印度古普塔帝国的崩溃,中国唐朝的崛起以及孟加拉在单一统治者下(公元590年至625年)的短暂统一。 尽管可以使用其他历史记录,例如连续混合或多次混合事件,但单事件模型显示出非常适合我们的数据,并且我们没有发现对非常古老的流量的统计支持……使用基于最大似然的祖先估计软件ADMIXTURE( 32),我们在BEB中发现了9.3±2.6%的东亚血统。

如果您阅读了本文的其余部分,则可以看到Wade在哪里可以得到这种混合是“可能是中文”的想法,但是我认为它不会从文字或补充中跳出来。 也许他是从被引用的第一作者那里得到的。 我不知道。 这项工作的人口史组成部分对于理解通过疾病进行的选择并不是必不可少的,但是,当允许这种混淆出现时,问题在于它将成为巩固的传统智慧。 我以前已经看到过这种情况,因为可随意使用的线条具有持久性和扩散性。 此外,当遗传学家走出假定知识的狭窄领域时,这也使遗传学家显得肤浅。

实际上 这些补品清楚地表明了这些东亚人在孟加拉祖传基因库中的地位。 在K = 5时,您看到出现了一个类似马来人的祖先成分,并且孟加拉语的所有东亚祖先都被分配给了这个祖先。 您还可以将汉人和新加坡的华人数据集分为日文和马来文组成部分。 新加坡的华人更像马来人。 这是完全可以预料的,因为新加坡华裔人口不成比例地来自福建西南地区,其中少数是客家(据说是华南地区的北部移植),还有拥有马来血统的海峡巴巴华人。 汉族数据集来自HapMap,北京样本偏北。 总而言之,现代孟加拉语的东亚血统几乎可以肯定是由与东南亚亲缘关系最密切的一个群体衍生的, 不能,中文.

我长期以来一直对此感到怀疑,因为我有两个不相干的孟加拉人(我的父母)的基因型。 我已经说过了 before。 我对东亚航段的长度进行了一些初步调查,确实发现了大约1,000年前的混合事件,因此我可以相信ROLLOFF结果。 但是,将它们与不同的人群进行比较,很明显,东亚人血统对于他们两个人来说都是东南亚人。 这是我15分钟前使用133,000个LD修剪的SNP生成的MDS:

Chamar是北方邦(孟加拉北部和西部)的低种姓群体。 您会注意到我的父母(“ RazibFam”)都向 南部东亚团体。 完全不奇怪。 不管您如何分析结果,这都会跳出来(第二个维度从另一个东南亚群体中淘汰了一些近交个体)。

因此,假设发生一个混合事件(或主要事件),那么什么是好故事? 东孟加拉邦一直处于遥远的边缘 阿里亚瓦尔塔,是北印度平原的文化核心。 玛加达(Magadha)是比哈尔邦(Bihar)古普塔帝国(Gupta Empire)的心脏地带,长期以来是一片行军之地。 像中国西北部西安地区一样,玛加达人经常是古典伊斯兰前印度大政体的所在地,尽管(或也许是因为?)它与印度北部更广泛的印度-阿里扬文化有着密切的联系。上恒河平原。 随着Magadha的垮台,孟加拉国在诸如Pala之类的王朝时期崛起,在第一个千年后期,Indo-Aryan社会的疆界迅速向外和向东扩展。 但我怀疑孟加拉东部是空的。 很有可能是在某些时候从东南亚赶来的大刀阔斧的农业家。 这是 这些 我相信他们沉迷于孟加拉社会 在toto。

(从重新发布 探索/ GNXP 经作者或代表的许可)
 
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  1. 这篇论文的主要发现是惊人的! 我想我只知道常被引用的海拔高度、人类具有的疟疾免疫适应能力。 还有哪些?

    • 回复: @拉齐布·汗(Razib Khan)
    罗伯特·福特

    乳糖酶持久性。

  2. 回复:52 代:“这个非常接近的年龄估计大致对应于印度古普塔帝国的崩溃、中国唐朝的崛起,以及
    孟加拉在一个统治者的统治下短暂统一(公元 590 年至公元 625 年)。” 我绝对可以看出韦德会从论文中得到什么,如果没有你的帖子,我也会从我自己的阅读中得到同样的结果。 那谢谢啦!

  3. 罗伯特·福特
    这篇论文的主要发现是惊人的! 我想我只知道常被引用的海拔高度、人类具有的疟疾免疫适应能力。 还有哪些?

    回复:@Razib Khan

    乳糖酶持久性。

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