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拉齐布汗
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德系犹太人

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我知道我因这个愚蠢,无知或懒惰而对本博客的读者大加赞赏。 但是,这种持续不断的标记确实会导致准确而谨慎地表达真正有见地且重要的评论。 我把我的 仓促上一篇,当我发表这本书时,我并不完全满意作者认为阿什肯纳兹犹太人没有近亲繁殖的证据。 这是 为什么,来自评论: 按状态排列的置换测试不能反映出混合物与近交+漂移之间的平衡吗? 不仅是近交程度? 由于种群具有强烈的混合效应,所以IBS低并不排除近亲繁殖的能力,对吗?

根据我的个人经验,IBS并不是一个可以广泛推广的最佳统计数据,正如评论者所暗示的那样,IBS在混合个人中可能会极具误导性。 首先,由于我在上面已经说过,阿什肯纳兹犹太人 ,那恭喜你, 混在一起,让我深入探讨为什么阿什肯纳齐 ,那恭喜你, 混合了中东和西欧的人口,而不是相对不混合的古代东地中海群体,对这两个地区都具有亲和力。 以前的 上一篇论文 找到证据 连锁不平衡衰减。 这意味着过去的LD在混合个体中较高,并且随着时间的推移而下降。 为什么?

想象一个半黑半白的人。 有些特定的等位基因对黑人或白人祖先具有高度诊断性(例如, SLC24A5 或达菲(Duffy)。 在混合个体中,这些等位基因将与来自一位亲本的同一染色体片段相关。 他们将有线性的血统。 通俗地说,一对染色体来自一个种群,另一对来自另一种群。 现在,假设您有一群白人和黑人血统混杂的个体,他们在世代之间相互配对。 祖先的分数将保持大致相同 (假设有大量有效种群),但是特定种群的祖先的基因组片段将被分解 重组。 初始混合事件产生的代数越多,祖先段的块就越会被加扰。 LD是可以测量此数据的统计数据,因为我们正在谈论整个基因座上相关等位基因的模式。 给定足够长的时间,LD将收敛于您在随机交配种群中的期望值。 但是,如果混合事件发生的时间足够近,则LD将在一定间隔内升高,这可以使您对过去发生混合事件的时间有所了解。 Ashkenazi犹太人的LD形态是经过欧洲人和中东人混合而来的,而不仅仅是等位基因频率介于这两类人之间的人口。

关于方式,近交如何? 我会就近亲繁殖的意思发表后续文章,但这是一篇论文,可以使人们更好地了解阿什肯纳齐犹太人的生活, 基因组时代的亚伯拉罕的孩子–主要的犹太散居人口组成了具有共同中东祖先的独特遗传集群:

犹太人之间的IBD表现出较高的共享段频率...一个社区中的中位数对人群共有50 cM IBD(四分位数:23.0 cM和92.6 cM),预计该水平将由一个表亲中的第4或第5个表亲共享。完全纯种的种群。 但是,这些社区中的典型共享群体比第5个堂兄弟之间的共享群体要短(8.33 cM长), 表明大多数成对的犹太人之间有更远距离的亲戚关系s...。

在不同的犹太社区中,观察到三种不同的模式……希腊和土耳其犹太人的IBD水平相对适中,与法国HGDP样本中观察到的相似。 意大利,叙利亚,伊朗和伊拉克犹太人表现出很高的IBD水平,这是极度近交人群所期望的。 与其他人群不同 阿什肯纳兹犹太人展出 在范围较短的一端增加了细分受众群的份额 (即5 cM长度),但在较长的一端(即10 cM)减少了共享…。

另一张纸, 精细的种群结构和下一代测序时代:

可以容易地量化基因组共享的数量,并且可以估计种群中随机的一对个体之间的关系程度。 例如,在阿什肯纳兹犹太人口中,随机的一对个体在基因上平均与第四堂兄弟相似,这表明最近的族谱可能很重要。 近交对稀有疾病发生率的影响已在历史上的内配气种群中得到证实,例如阿什肯纳兹姆,哈特人和一些岛屿群……但是,如果世界上许多地理区域的结构都按逐代相同的精细结构( IBD)分析,那么这些地区的人群中稀有等位基因的发病率也可能升高,而相应的独特稀有疾病的发病率也相应上升。 实际上,就基因组片段的平均IBD量而言,Ashkenazim在上述全球样本中并不是异常值.

正如该文件所指出的 拉尔夫(Ralph)等。 等 许多欧洲人口共享IBD片段,表明在〜2,000年的时间范围内存在相当多的相关性。 许多短道的阿什肯纳兹(Ashkenazi)犹太模式是为什么服务喜欢 23andMe 对那个背景的个体产生了如此多的“相对”匹配。 这些人有很多相同的祖先,但是这些人通常回溯到很久以前。 因此,当考虑“近亲”为近亲表亲婚姻的产物时,阿什肯纳兹犹太人不是以这种方式近交的。 它们不会表现出异常长的IBD区域,这就是您在两个父母之间有很多非常共同的祖先的情况下在人群中流动的东西。 父母与子女之间的关系系数为50%。 表亲之间(在近亲交往中)为12.5%。 在四个表亲之间是0.2%。

仅仅因为阿什肯纳兹犹太人没有通过这种措施自交,并不意味着他们在基因上不是相对同质的人,并且表现出很大的独特性。 他们是这样。 但是正如我前面所说,这种独特性很可能是由于古老的世界主义混合,然后由于他们在伊斯兰和基督教文明中处于边缘化少数群体的地位而导致向相对严格的内婚制转变。

 

犹太人特别是阿什肯纳兹犹太人,在遗传上非常有特色。 考虑这一人口的一种简短而甜蜜的方法是,它们是中东人口和西欧人之间的中度融合,由于社会文化的力量,这些人相对偏僻。 至于他们的近亲繁殖,这是最近的一篇论文, 阿什肯纳兹犹太人口中创始人效应,混合和选择的特征: 为了探索AJ和欧洲人群中遗传变异的数量,我们首先测量了平均杂合度。 出乎意料的是,我们发现与欧洲人相比,AJ个体的杂合水平更高……证实了最近一份报告中的推测和另一份报告中呈现的趋势……尽管这种差异可能看起来很小,但由于人数众多且具有统计学意义,因此具有很高的统计学意义。即使在修剪高LD的SNP之后,也可以分析标记。 AJ种群较高的多样性与较低的近交系数F并存,这表明AJ种群比欧洲人更远亲,而不是近亲,正如长期以来所假设的那样…使用成对的国家身份(IBS)置换测试进一步证实了AJ人群中更大的遗传变异,这表明平均AJ个体对具有比EA或Euro个体对更少的全基因组IBS共享...因此,我们的结果表明,与欧洲人相比,AJ人群的遗传多样性更高。 Ashkenazi犹太人如何变得更加多样化? 看看我在上面写的内容以及大多数人的直觉假设:Ashkenazi犹太人是一个混杂的人群,因此他们可能携带西欧人和中东人民所独有的等位基因! 另一方面,阿什肯纳兹犹太人确实有很多基因组 血统相同符合长期内婚的人口,并且从较温和的基础开始进入最近的人口扩张。

图片来源: 乔治·比尔德.

 
拉齐布汗
关于拉齐卜·汗

“我拥有生物学和生物化学学位,对遗传学,历史和哲学充满热情,虾是我最喜欢的食物。如果您想了解更多信息,请访问http://www.razib.com上的链接”