在我之前 职位 在那里我简要介绍了使用 砰砰 我分发了一个名为 PHLYO 的数据集。 我没有提到的一件事是我也一直在运行它 混合物. 但这里有一个重要的点： 我从 K = 10 到 K = 2 运行了 15 次数据集。 为什么？ 因为算法在每次运行时都会产生一些不同的结果（如果你使用不同的种子，你应该这样做），我不想被一个特定的结果所偏见。 此外，我还 打开交叉验证错误，这让我更好地了解应该信任哪个 K。 但是在我选择了我想要可视化的 K 之后，我将使用哪个重复运行来生成条形图？ 我不会选择任何特定的。 相反，我将使用现成的算法将它们合并在一起。 此外，我还想按个体的模态种群集群对个体进行排序。

这听起来相当令人费解，而且确实有些令人费解。 我有一个我使用的管道，但它对用户不太友好。 我的一个项目是清理它、记录它并在线发布它。 但是，如果您已经准备好自己的管道，请将其发布在评论中并附上链接！ 对我来说一般步骤如下：

1) 将 Admixture Q 文件转换为 Structure 格式，将族标识转换为数值，生成带有族标识和数字对的文件

2）使用跨运行合并结果 克朗普

3）对种群内的个体结果进行排序

4) 用途 破坏 生成输出文件

在我向您展示结果条形图之前，以下是带有标准偏差刻度的交叉验证结果：