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在较早的讨论中,我一直对“设计婴儿”的想法持怀疑态度,因为许多特征我们可能会在选择方面引起兴趣。 例如,智力和身高。 为什么? 因为这些性状的变异似乎是高度多基因的,并且广泛分布在整个基因组中。 与囊性纤维化(Mendelian隐性)或蓝眼色(准Mendelian隐性)不同,您不能只关注一个基因组区域,然后高度确定性地预测表型。 相反,您需要了解成千上万的遗传变异,而我们只是不了解它们。

但是我只是意识到,即使没有这些特定信息,基因组学也可能使它变得更容易一些。


该方法依赖于亲属之间的表型相关性。 甚至在基因组学和遗传学之前,生物统计学家就可以基于父母的价值对表型价值做出粗略而现成的预测。 预测力的程度 取决于性状的遗传性。 像身高这样的特征可遗传〜80-90%。 这意味着该性状种群中约80-90%的变异归因于基因。 身高的期望值强烈取决于父母的身高。

这都是常识。 这与基因组学有什么关系? 简单的。 您与每个父母的血统相同程度为50%。 这意味着您的基因拷贝有一半来自母亲,一半来自父亲。 除非您是克隆人,否则您无法更改它。 但是,由于 种族隔离法重组 您从每个祖父母那里获得的血统不一定是25%! 期望您的相关系数为25%,但是周围存在差异。 给定的父母可以贡献自己的父亲或母亲 同源染色体。 您有50%的概率将以独立的概率在整个染色体上遗传一个或另一个。 您有22条常染色体染色体对(非性染色体),因此极有可能在异性父亲和母亲祖父母/外祖父母之间没有同等的平衡(例如,从祖父祖父母那里获得的基因更多,而父亲/祖父母之间没有相同的基因) *其次,重组也将产生新的组合。 在我们这一代中,我们担心通过交换来自父母母亲或父亲的同源染色体上的片段,这将与我们所依赖的动态相反。

这里的最终逻辑是选择合子或配子,这些合子或配子会偏向具有您感兴趣的表型值的祖父母。 举一个具体的例子,如果您有一个中等身高的父母,自己的父亲很高,而母亲则矮一些,并且您想要最高的孩子,那么您将要选择基因含量最高的合子与高大的祖父母血统相同。 关键不是要选择特定的遗传变异,您不需要知道这一点。 您所知道的是,这位高大的祖父可能拥有导致高大的倾向的基因。 因此,只要确保孙子在“他们”中拥有尽可能多的祖父母即可。

我仍然不知道这在短期内是否具有成本效益。 但我开始考虑到这一点,因为在不久的将来,我将检查一个孩子的基因型,该孩子的父母和祖父母的全血统为1,000,000个SNP。

*将其建模为二项式,大约每1例中有7例将有来自焦点祖父母的预期11条染色体。 标准偏差超过2条染色体。 您需要大约100个受精卵才能 期望 使任何与预期值相差5个染色体单位的个体(即,个体为10-15%,而不是25%的一个祖父母或35-40%)。 显然,您需要更多的保证才能得到这种价值的合子。 而且我忽略了通过交换基因组区域来进行重组的做法。

(从重新发布 探索/ GNXP 经作者或代表的许可)
 
• 类别: 科学 •标签: 生物伦理, 定量遗传学, 定量基因组学 
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  1. 这对父亲来说相对容易,但对母亲来说就不那么容易了。

  2. 30 多个性状的遗传力可以在以下位置找到: http://www.snpedia.com/index.php/Heritability 如果身高不是唯一感兴趣的特征。

  3. 迷人!我们可以称您为这个想法的创始人吗?

  4. #3, i can’t imagine someone hasn’t thought of this before, but sure.

  5. Can you define, or point me to a definition of, “quasi-Mendelian recessive” something that a lay reader can follow?

    When I google it, the entire first page of hits point to this post, with one exception, and that exception is above my head.

    谢谢

  6. It would be interesting to see some calculations on how much design or “optimization power” you could expect to get out of this methodology.

  7. Autosomes vary in length from 51 to 245 million base pairs (引用). This should make it somewhat easier to implement Razib’s plan (cf. autosomes of equal size).

  8. Razib, Can one use SNP test results from, say, 23AndMe to determine which chromosomes 2 siblings (or a grandchild and grandparent) share in common? Is it easy or hard to do that?

    In theory your idea should be testable given enough SNP test results across a few generations of enough different families.

    I’m also wondering how many functionally distinct versions of each chromosome exist in all of humanity. For example, how many unique (at least in areas which affect functionality) copies of the Y chromosome are there? Surely less than the number of human males in existence. But how much less?

  9. Razib, Can one use SNP test results from, say, 23AndMe to determine which chromosomes 2 siblings (or a grandchild and grandparent) share in common? Is it easy or hard to do that?

    yes. 23andme kind of provides this service already. and as i said in the end of the post i’m going to do with a soon-to-be-born child who has all their grandparents typed by 23andme.

    In theory your idea should be testable given enough SNP test results across a few generations of enough different families.

    yeah. also, you can probably infer the genotypes of the grandparents if you have enough siblings, as they will vary in their inheritances from their two putative parents. you could do it will cousins too, but then you have smaller and smaller blocks of potentially common inheritance.

    For example, how many unique (at least in areas which affect functionality) copies of the Y chromosome are there? Surely less than the number of human males in existence. But how much less?

    hm. i guess you’ve had to calculate mutation rates on genic regions, and then use an assumption that most mutants are recessive in effect, and then estimate the proportion which would segregate out the recessive effect?

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