我一直在玩 混合物 和 本征软件 与HapMap数据集以及一些朋友和家人一起合并到其中。 有趣的是，您从ADMIXTURE条形图得出的直觉推断与PCA散点图有所不同。 无论如何，我一直在Facebook上发布一些初步结果（部分原因是我的一个朋友在Facebook上，并对自己的遗传背景感到好奇），并且一个研究生的朋友指出了我的意思。 结构，这可以推断类别的最佳数量*（一个可以在ADMIXTURE中进行交叉验证）。 我回避了 结构 因为它在计算上更加密集。 还有其他建议吗？ 具体来说， 不能 被提及 二烯 or David .

折页下面是我的计算机经过一整夜都可以玩的游戏的味道。 K = ADMIXTURE中的5个祖先群体。 HapMap犹他州白人，托斯卡纳人，墨西哥人，北京中国人按此顺序排列。 最后的6个小节是：我的父亲，我的母亲，然后是四个欧洲血统的个人，分别为1欧元，2欧元，3欧元和4欧元。在合并文件和修剪创始人并细化标记以减少链接不平衡之后，我离开了具有120,000个SNP。 请注意，我在不同的K上使用了不同数量的SNP，并且有些非常小的差异令人惊讶。 我的母亲总是比我的父亲更“亚洲”。