我查看了三个数据集。 我将他们中的大多数从K = 2分配到K =12。这意味着我将所有个体都放入一个公共池中，并告诉ADMIXTURE程序来估算他们在K人口总数中的比例。 通过这种方式，我们可以大致了解人群之间的关系。 请记住，这些不一定是真实的总体，并且投入池中的变异的性质会极大地影响推断成分的性质。 我没有报告从数据集中提取的清晰、独特和客观的实体。 我们正在研究依赖于输入和参数的模式的人类可理解的解释。 他们告诉我们一些真实的事情，但这不像测量落球的加速度。 这就像描述球相对于一组不同的参考对象的位置。 有一个具有特定位置的真实球，但描述将根据您使用的引用而有所不同（例如，对象 A 的左侧和 B 的下方，对象 C 的右侧和对象 D 的上方等）。 ?

这是集合：

1）一个“大”集，其中包括大陆的泛亚人口，HapMap中的美国白人以及一些马来半岛群体。

2）一个“媒介”集，修剪了大多数北亚群体，马来西亚群体和美国白人。 因此主要是东南亚大陆，中国南部和印度。

3）一个“小”集合，该集合除去了许多东南亚人口，但保留了印度人口。 我故意让印度人重载这个场景，以研究在一些东南亚国家中印度人掺混的可能性。

一些注意事项。 泛亚数据集约有56,000个标记。 这是可以忍受的，但不是最佳的。 对于欧洲对印度对东亚对内格里托而言，这绝对足够了。 但对于区域内变化而言，最优值也不少。 因此，将其与一粒盐一起食用。 但是，由于我正在研究印度与东亚地区，因此我对与该数据集相关的发现颇有信心。 其次，白人美国人与泛亚人群的交汇点约为30,000个标记。 对于柬埔寨人来说，只有约22,000。 大约有100位美国白人，但只有11位柬埔寨人。 因此，请谨慎对待柬埔寨的结果。 最后， 请记住，祖先的成分是抽象的，可能暗示稳定和长时间混合的杂种种群是它们自己的独特成分，以及高度近交的分离株。

我将在下面显示三种分析和可视化。

1）ADMIXTURE条形图，显示特定祖先元素的组或个人的祖先比例。

2）跨祖先元素的Fst估计。 这是遗传距离的粗略总结。 我有时还会向您显示二维可视化，但是请记住，这会删除一些关系信息。 表格更准确，但可视化效果更易于阅读。

3）最后，我使用EIGENSOFT运行一些PCA。 这就是说，我采用了数据池，并允许程序提取出变化的独立维度。 我运行它，以便将其拉出前6个尺寸。 东西方始终是最大的倍数。 请记住，图未按比例绘制。

我还应该说，我所展示的K是在报告的种群中自交亚组开始分裂成自己的组成部分之前（在印度人中尤其如此）。

从头开始 我在泛亚数据集中注意到，某些团体，尤其是蒙斯和马来人，似乎显示出印度人的掺入。 我的问题是：这是真正的印度混合物，还是最近的欧洲混合物？ 这就是为什么我拥有白人美国人的大型数据集的原因。 结果如下：

因此，孟和马利与西方欧亚元素的混合物似乎不太可能来自欧洲人。 相反，这与印第安人是一致的。 实际上，我非常有信心，它也不是西亚人，马来人也有可能，因为在这个规模上，这一部分往往与欧洲人保持一致。 最后，我要告诉你，孟和马来人的混合物是 相对 甚至。 换句话说，该群体的估计并不会因为一两个高度混杂的印第安人而发生变化，这对于我们来说是一个很好的判断 最近 通婚。 不是闻所未闻的。 马哈蒂尔·穆罕默德（Mahathir Mohamad） 祖父是喀拉拉邦穆斯林。

现在让我们看一下PCA。 我将关注维度1、2和3。请记住，这是遗传变异等级排序的三个最大维度。 在这些图中，一维是迄今为止最大的维数，至少是五分之一。 这是西方对东方的欧亚维度。

我已经强调了重要的部分。 两个笔记。 首先，我认为您确实看到了有关孟＆马来人转向印度人而不是欧洲人的建议。 这与ADMIXTURE结果完全吻合。 其次，请注意，“印度新加坡人”的人口是异类的。 它主要是泰米尔人，但样本中显然还有其他印第安人，还有一些具有马来人或中国血统的人。

此外， 请注意，在ADMIXTURE结果中，泰族和壮族之间的相似性较高。 庄 是中国的第二大族裔，据说是泰族移民到东南亚大陆的原始人口。 在我继续之前，您应该对一些较晦涩的群体的位置和民族语言的亲近感有所了解：

地理位置	团队	语言组
泰国北部	锡	南亚
泰国北部	拉瓦	南亚
泰国北部	周一	南亚
泰国北部	帕隆	南亚
泰国北部	计画	南亚
中国南部	Wa	南亚
泰国北部	姚明	苗族（Mien）
华南和泰国北部	苗族	苗族
中国南部	庄	大
泰国北部	卡伦	藏缅人
中国南部	吉国	藏缅人

这里未列出的一个方面是其中一些人口是否归类为“山地部落”。 孟族和赫丁族都是南亚大陆的，但前者在某种程度上类似于东南亚大陆上的希腊人，而后者则是一个部落隔离区，在泰国北部的山丘中得以保留。 希腊人，我的意思是星期一被缅甸的Bamar和泰国的Tai所同化或统治，但在这两种情况下，孟族都被赋予了东南亚印度文化的精髓。 从缅甸南部的伊洛瓦底江下游到泰国的湄南河下游盆地，孟星期一曾一度上升。今天的终点是曼谷。 相比之下，像赫丁（H'tin）和拉瓦（Lawa）这样的团体可能相对不受印度的影响。 苗族是东南亚的相对较新来的人，例如，这解释了他们作为泛灵论者的地位。 最后，您有类似Wa的小组，从技术上讲，它们甚至都不是东南亚的，但 ，那恭喜你， 南亚。 他们应该给我们一种不带印度烙印的南亚文化氛围。

让我们继续第二步，中等数据集。 我要删除白人美国人，马来西亚人和北亚群体。 现在，我包括柬埔寨人。

同样，星期一有印度成分。 柬埔寨人也是如此。 请记住，虽然其他所有人都有56,000个SNP，但柬埔寨人只有22,000个SNP，因此我们需要小心。 尽管您看到HGDP中的这一元素也运行良好。 也就是说，是印度的附属机构。 它在柬埔寨人中分布相对均匀，因此您不能将它归结为几个混血儿。 同样，您会看到壮族和泰族之间的相似之处。 主要区别在于，泰族似乎与各种东南亚群体混在一起。 这是意料之中的。 然而，令我惊讶的是，从这些结果来看，泰族人的扩张似乎在人口上占主导地位，而不仅仅是语言上占主导地位。 即使是曼谷的样本，这一点也很明显。 稍后对此进行更多讨论。

以下是推断的祖先群体之间的遗传距离。 标签给出了模态填充，然后给出了语言族：

	吉诺·布尔曼	赫廷_奥地利	大	南亚人	帕隆_奥斯特罗	苗族
吉诺·布尔曼	0	0.073	0.057	0.115	0.092	0.085
赫廷_奥地利	0.073	0	0.03	0.088	0.065	0.06
大	0.057	0.03	0	0.09	0.064	0.047
南亚人	0.115	0.088	0.09	0	0.117	0.117
帕隆_奥斯特罗	0.092	0.065	0.064	0.117	0	0.09
苗族	0.085	0.06	0.047	0.117	0.09	0

以下是一些可视化效果：

这是PCA：

在此图中，您会看到星期一和柬埔寨人再次向印第安人转移。 另外，请注意壮族和泰族大部分重叠得相当好。 y轴由南亚的山地部落，然后是藏缅部落组成，还有一个间隙，直到您击中Tai集群为止，该集群最终与Hmong合并。 就瑶族在the族和苗族之间而言，这里有合理的语言家庭亲和力。

最后，我们转到以印度为中心的运行。 我现在已经删除了很多东南亚团体。 一些山地部落显然是相对孤立的，因此在PCA上抛出自己的集群或分歧很容易。 这是遗传差异的作用，如果您与基因流相对隔离，则会形成遗传差异。 因为我删除了这么多人口，所以我只剩下三个K，然后才能使Qasi-Family聚类显示为K。 另外，我将向您展示柬埔寨人和孟人的个别柱状图，以说明印度成分不仅是孤立的外加剂实例：

在这种情况下，Fst很简单：

	南亚	大	南亚
南亚	0	0.028	0.084
大	0.028	0	0.085
南亚	0.084	0.085	0

是PCA 真 在这个过程中很有趣。 第一个不太特殊：

好吧，首先，由于这是印度的重点设置，因此您会看到，它超出了标准的东西方尺寸。 您有几个较低阶的维度将印第安人分开！ 我以前曾假设，始终在HGDP中始终出现在柬埔寨人中的印度部分是具有深厚远古血统的“祖先南印第安人”的功能。 赖希等。 这个古老的人口可能与东南亚的许多族群有亲缘关系，因此柬埔寨人的残余集群可能已经是该族群深层冰河时期的一部分。 这些结果使我相信，这并不是那么简单的解释。 在此样本中，具有最高ASI的人群是部落人口Bhils。 在其中一个图中，您可以看到Bhils构成了分布的一端，而Gujarat Vaishyas则构成了分布的另一端。 显然，这是祖先北印度-祖先南印度的氏族。 星期一和柬埔寨人与市中心的偏离不大，向我暗示他们不太偏向ASI！ 此外，分布的“中心”偏重于种姓南印第安人。 那么这是一个不错的解决方案，因为它与历史早期时期南印度特定影响东南亚的历史证据完全吻合。

这不是灌篮。 自混合以来需要时间的估计。 它应将ANI-ASI混合事件的日期定为最新日期，并且应与维吾尔族人处于同一范围内。 不幸的是，只有56,000个SNP，我不确定这个估计是否可行，但我会仔细研究。 此外，在东南亚，还需要对Y和mtDNA谱系进行更深入的调查。 他们可能表现出性别偏见的迁移。 我确实在寻找西欧亚大陆特有的SLC24A5变种，在南印度，这种变种不低于〜50％，但这不在泛亚SNP数据集中。 它在HGDP中，而11个柬埔寨人中没有一个。 这将倾向于ASI假设，但可以看到，西欧亚变体可能只有大约50％，而柬埔寨人不到南亚的10％，因此不会出现在22个基因中是完全不可信的副本（使用现实的假设，我发现N = 50的柬埔寨人不会找到SLC24A5的西欧亚副本）的概率约为11％）。

在这篇博文中，我没有为太庄关系投入太多的空间，因为在情节中很明显。 泰族显然已经转向了亚洲国家组织，但远没有我预期的那样。 实际上，从字面上理解ADMIXTURE组件，您可能会推断，在星期一和高棉语中掺入的泰语掺混物比其他方法要多！ 当您认为泰国的人口几乎是柬埔寨的五倍时，这可能并不完全令人难以置信。 但是我读过的标准模型表明，泰族战士乐队征服了Mon-Khmer indigenes，并吸收了他们的许多高级文化。 就人口统计而言，这些结果很难与之相提并论。

我对发生的事情有一个可能的解释。 在过去的约1,000年之前，泰国大部分地区的人口可能并不太多，低地农业是由精英领导的。 大族可能带来了卓越的农业技术，因此进入了人口迅速向低地边界扩张的阶段，在孟买和高棉统治时期，低地边界是没有平行的。 换句话说，泰族的乐队很小，最初的数量是孟族和高棉族。 但是，通过有利的资源方向和将新的耕地优先分配给族裔群体，小的quickly族人口可能很快就会占领了先前的居民。 这是模型中概述的 伊斯兰教的兴起与孟加拉国的边界。 在其中，作者基本上认为，孟加拉东部人口稀少，直到大规模的穆斯林精英推动了开放农业疆界的项目。 被征召的农民要么是穆斯林，要么是改信伊斯兰教，因为与仍然是印度教徒的西孟加拉邦相比，农民的经济状况较为动荡，文化景观相对不稳定且动荡不安。 在这种模式下，孟加拉东部的伊斯兰化与当地部落的改建没有多大关系，而与孟加拉人的农业殖民地的人口快速增长有关，这是由农业项目，伊斯兰化的殖民地或从少数穆斯林那里获得的殖民地推动的。莫卧儿（Mughal）精英在西部地区进行农民耕作，目的是建立印度教上等种姓被边缘化的地区。 同样，泰族在东南亚的扩张可能已成为事实上的“空”态。 在孟和高棉的高级文化被吸收的时期，泰语在数量上可能是较小的元素。 当前比率是后来的社会和人口统计过程的函数。