干耳垢表型的表达取决于 AA 基因型，它具有隐性表达。 因此，在 A 等位基因频率约为 0.50 的人群中，干燥耳垢表型的频率约为 0.25。 在 A 等位基因频率约为 0.20 的人群中，干燥耳垢表型的频率约为 0.04。 在欧洲血统的人中，干燥耳垢表型的比例小于 5%。 由于隐性表达，大多数日本人和中国人应该表现出湿耳垢，尽管有趣的是 ALFRED 数据库表明韩国人的 A 等位基因是固定的。 相反，在非洲，G 等位基因似乎是固定的。

所以问题是：为什么？ 一份新的论文 分子生物学与进化 有人认为，自人类离开非洲大约100,000年前以来，等位基因频率差异是正向选择的函数。 自然选择对一个人的影响 ABCC11 SNP确定耳垢类型:

非同义单核苷酸多态性（SNP），rs17822931-G / A（538G> A; Gly180Arg） ABCC11 该基因决定人类耳垢的类型（即湿润或干燥），并且是东亚和非洲人群之间最有区别的非同义SNP之一。 最近对全基因组进行阳性选择的扫描显示，一个基因组区域跨越 ABCC11, 朗普2及 新加坡航空1 东亚人已经对这些基因进行了选择性扫描。 考虑到潜在的功能重要性以及位于该区域的SNP的种群分化，rs17822931是经过地理限制的正向选择的最合理的候选多态性。 在这项研究中，我们通过分析非洲（HapMap-YRI）和东亚（HapMap-JPT和HapMap-CHB）人群中位于rs17822931侧翼的两个微卫星基因座，估算了东亚人rs17822931-A的选择强度或选择系数。 假设采用隐性选择模型，基于聚结的模拟方法表明，rs17822931-A的选择系数在东亚人群中约为0.01。，以及使用伪采样变量进行的模拟实验显示，rs17822931-A的突变发生在2006年以前（95％可信区间，介于1023到3901代之间）。 此外，我们显示，绝对纬度与rs17822931-A在亚洲，美洲原住民和欧洲人口中的等位基因频率显着相关，这暗示rs17822931-A的选择性优势与对寒冷气候的适应性有关。 我们的结果提供了一个惊人的例子，说明本地适应如何在人类特征的多样化中发挥重要作用。

周围地区 ABCC11 随着对自然模式检验的预测，自然选择测试的出现正在受到审查。 连锁不平衡 （LD）。 LD基本上是在测量基因组中遗传变异与预期偏离的关联。 一种 选择性扫描 倾向于在自然选择的目标周围产生大量LD，因为当相关等位基因频率增加时，其邻居也会 搭便车 沿着。 搭便车的过程意味着，在一个种群中，您可能会看到基因组区域，这些区域显示出相关的长序列。 单核苷酸多态性 （SNP），单倍型。 最初的选择性事件可能会产生一个非常长的均质块，随着时间的推移，该变异会通过重组和突变而破裂，因为变异会被注入到基因组中。 LD的范围和衰减可以帮助我们评估选择事件的时间和强度。

但是LD可以通过自然选择以外的其他过程出现。 例如，想象一下，非洲人和欧洲人的人口在给定的一代中混合在一起。 平均而言，欧洲人和非洲人的基因组成不同，因此，由于重组只会缓慢地打破欧洲人和非洲人祖先的基因组区域之间的物理联系，因此第一代人的LD会比预期的多。 LD的衰减则可以使人感觉到 混合后的时间 以及选择。 不仅如此，随机的人口事件和过程也很重要，并且可能推动LD的出现。 考虑一个瓶颈，其中单基因型的频率仅由随机遗传漂移驱动。 这些替代方案的详细信息在2009年的论文中进行了探讨 地理在人类适应中的作用.

所有这些都是以下事实的序言： 周围有很多LD ABCC11。 以下是HapMap群体的可视化效果：

从左到右，您会看到中国和日本人，犹他州白人和尼日利亚的约鲁巴人。 的绝对值 D' 〜0表示存在连锁平衡； 在整个基因组中没有等位基因非典型过度相关的默认或无效状态。 这里的轴是周围的SNP的成对组合 ABCC11，重点关注rs17822931，这是一个非同义的SNP，似乎是耳垢和其他表型差异的可能功能来源。 就LD等级排序而言，结果并不令人惊讶，在整个基因组中，东亚人的LD往往比欧洲人多，而欧洲人的LD比约鲁巴人多。 部分原因可能是人口历史的函数，非洲以外的连续瓶颈模型将假定，漂移和其他随机作用力将对东亚人的基因组产生比欧洲人更强的影响。 但这似乎不可能是这里的全部。 注意新大陆以及大洋洲等位基因频率的变化。 一些美洲印第安人种群在rs17822931上祖先G等位基因的频率似乎更高。 上图更容易理解，Y轴显示给定位置的杂合程度。 GA是杂合的，GG是纯合的。 非洲人往往比非非洲人表现出更多的杂合性，但请注意，在17822931年rsXNUMX附近，东亚样本的杂合性急剧下降。 ABCC11。 请记住，在二元模型中，随机交配群体的杂合度往往不会超过0.50（尽管在选择性育种中，F0.50代的杂合度可能会超过1）。

本文的主要发现超出了以前的了解，似乎是：a）一个东亚人如何在rs17822931处以高频率的AA基因型到达的明确模型，以及b）气候与A频率之间的相关性我会稍等一下，但第一点呢？ 利用两种变化的性质 微卫星 在东亚人感兴趣的SNP的侧面，并采用隐性选择模型，作者认为A等位基因的频率开始升高，距今约50,000年前，并且选择系数为每代〜1％。 对于选择参数而言，这是一个重要的值，并且鉴于该时期前后将非非洲人分为西部和东部群体而定的时机是可能的。

但老实说，我对此表示怀疑。 置信区间不会激发信心，据我所知，对于隐性性状的选择应该表现出较少的连锁不平衡。 在低频情况下，自然选择对等位基因的影响很小，因为它在杂合子中主要被“掩盖”，因此在很长一段时间内其比例才开始更快地上升。 在这段时间内，重组将有时间在SNP周围切成单倍型，从而缩短了统计上相关的单倍型模块的长度。 而且，作者们自己似乎并不相信耳垢的表型本身就是选择的目标，因此从我的立场来看，耳垢的隐性表达模式应该不那么重要。

围绕着基因的想法 ABCC11 可能与适应寒冷有关，这是暗示性的，但人类人类学家认为，几乎每个东亚的显着特征都与寒冷有关。 您会发现，广东人居住在冰屋中，经历了各种各样的适应严酷条件的适应活动。 现实情况是，今天的中国，韩国和日本大部分地区都是亚热带的。 无论如何，最后一个图显示了多个谱系之间的相关性。 早些时候，他们发现，通过比较人类与其他灵长类动物在该区域周围的变异，非洲人似乎需要进行纯化选择。 这意味着存在约束，以使中性力不会改变功能上重要区域的频率。 众所周知，非洲人平均比非非洲人更具多样性，这可能是因为后者是前者的样本，但在少数基因上却是相反的。 这很可能是由于人类离开祖先非洲环境后功能约束的放松。 这对于rs17822931显然是正确的； 大多数非非洲人口都表现出一定的杂合性。 在这里，东亚人的等位基因频率几乎固定，这是个例外，而不是常规。 最后一个图中的回归线在统计上都是显着的。 有趣的是，欧洲人和美洲原住民中，得出的A等位基因的纬度和频率之间有特别强的相关性。 相反，亚洲人口之间的关系较弱。 亚洲ALFRED样本之间的纬度差异只能解释等位基因频率差异的17％。

但是，我们不应该仅凭此证据就允许假说上升或下降。 毕竟，在过去的10,000人中，可能有大量的人口流动。 也许 特别 在东亚，汉族南部的扩张可能触发了泰国和越南人民从华南地区迁移到东南亚大陆。 适应的最佳证据将出现在混合人群中。 推测那些高纬度地区的人比低纬度地区的人具有更高的AA基因型频率。 与其将种群分为三个粗略类别，不如使用从STRUCTURE或ADMIXTURE派生的祖先量子作为自变量的更复杂的处理方法，将很有用。 记住，适应应该显示出祖先与表型脱钩的证据。

最后，我必须指向讨论的这一部分：

rs17822931-A的选择优势的原因是什么？ 尽管人们对耳垢的生理功能了解甚少（Matsunaga 1962），但是干耳垢本身不太可能提供实质性的优势。 rs17822931-GG和GA基因型（湿耳垢）也 与腋臭渗透密切相关，表明ABCC11蛋白在腋生顶泌腺中具有排泄功能（Nakano等，2009）……，

我真的不知道这意味着什么。 所以我查了一下。 这是我发现的 腋臭与湿耳垢类型有很强的联系，通过对它们的基因分型来确定 ABCC11 基因:

人体中的分泌腺和/或内分泌腺会引起异味，尤其是来自腋生和耻骨顶腺的异味。 与其他哺乳动物一样，气味可能对异性有类似费洛蒙的作用。 尽管气味不会影响健康，但腋臭（AO）是一种状况，无论其强度如何，个人对其腋臭感到不舒服，并且可以去医院就诊。 可以根据需要进行去除腋窝的手术。 AO可能是一种寡聚性状，其中rs17822931占了大多数表型变异，而其他未知的功能性变异则占了其余部分。 然而，尚未开发出明确的诊断标准或客观的测量方法来表征气味，并且个人是否患有AO主要取决于他们的评估和/或检查者的判断。 人体气味可能是由于皮肤细菌将前体分解为刺激性气味而引起的。

也许该论文的标题应该是“为什么野蛮人闻起来不好”？ 无论如何，关于韩国遗传学的书名的想法是：“最不臭的种族。” *

引文： Ohashi J，Naka I和Tsuchiya N（2010）。 自然选择对确定耳垢类型的ABCC11 SNP的影响。 分子生物学与进化PMID： 20937735

*我指的是 最干净的比赛.