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自从我一直在推广 Dodecad祖先项目,这似乎很吸引您的注意 Eurogenes 500K SNP生物地理祖先项目。 样本总体与 多德卡德,但ADMIXTURE仍然是主要工具。 但是作者还求助于其他方法,以探索不仅仅是人口水平变化的方法。 例如,他最近的帖子是 在我们的基因组中定位和可视化少数非欧洲混合物:

例如,想象一下,一个白人美国人,身上有几小段西非血统,来自一个居住在250年前的祖先,以及一个在过去4000年或更长时间里没有亚洲祖先的东部芬兰人。 如果我们对这两者进行洲际ADMIXTURE分析,则很可能是美国人在欧洲获得100%的评分,而东部芬兰人则可能由于乌拉里语的真正影响而在北亚和东亚地区的得分大约为9%。

当比较人群的遗传结构时,这种事情并不是一个大问题。 显然,总体而言,东部芬兰人而不是白人美国人在遗传上更接近北亚人,这基本上就是ADMIXTURE的目标。 但是,如果重点也放在个人上,那么这肯定会成为一个问题。 我们假设的美国人可能知道那个非洲祖先,用扎实的文书工作来支持他们的家谱联系,但是他之所以拔头发是因为没有任何基因测试显示出来。

因此,让我们看一个真实的例子,RHHcounter可以如何挑选可能来自撒哈拉以南非洲地区的近期血统……

欧拉1
奥利维亚·蒙(Olivia Munn)和维吾尔族(Uyghur)女人

这里的基本问题是,就基因组变异而言,旧混合物看起来与新混合物不同。 第一代欧亚人,有中国和欧洲的父母,按比例可能与维吾尔族具有相同的祖先混合。 它们在结构上类似于维吾尔族,并放置在PCA图表上的该类中(这在23andMe中会发生)。 但是,在过去的1,000-2,000年间,维吾尔族的“东方”和“西方”遗传遗产在很大程度上被重组了。 相比之下,第一代欧亚人的基因组将是巨大的,在交替链(来自其各自的亲本)上是东方的或西方的。 在群体遗传语言中,一组第一代杂种会表现出很多 连锁不平衡 (LD)。 在一个 恐慌的 杂交种群LD将因重组而腐烂,从而打破了从亲本种群继承的独特等位基因关联。


这是区分旧的“亚洲”血统和近来的亚洲血统的关键,而以前的“亚洲”血统有时不属于芬兰人低频率的遗传变异。 例如古人类学家 万斯·海恩斯 显然是原始的“暹罗双胞胎”之一的曾孙, 张邦克. Chang Bunker 是泰国华人,所以大概 Vance Haynes 会成为约 10% 的亚洲人,并且与其他欧洲人相比,他会转向亚洲集群。 另一方面,仔细观察他的基因组会发现他与约 10% 的亚洲人的土耳其人存在差异,因为万斯·海恩斯的亚洲血统只有三代人进行重组,以打破从 Chang 传下来的原始等位基因关联。掩体。 仅仅在这几代之后,基因组仍然会显示出许多具有汉族特征的独特标记集的聚集祖先片段。

让我们更具体一点。 以下是23andMe的两幅“祖先绘画”。 一个是参考例子,维吾尔族妇女,另一个是欧亚个体。 区别非常明显:

欧亚人

23安德麦鲁斯记录在案的23andMe说,欧亚男人是50%亚洲人,50%欧洲人。 维吾尔族妇女中,欧洲人占52%,亚洲人占48%。 正如我上面指出的那样,被预测到HGDP样本变化的欧亚个体倾向于与维吾尔族聚在一起。 在左侧的图像中,黑色标记表示欧亚男人。 维吾尔族是绿色的。 紫色矩形是Hazaras。

但这显然是一个简单的例子。 在非欧洲血统为1)可见,以及2)最近和立即的个人中,非欧洲血统的嗅探的重点是什么。 不,这是一个更大的问题,一些美国白人声称他们具有重要的非欧洲血统。 通常这是美国原住民。 但是,对于其中一个欧洲来源的​​样本,“ Polako”( BGA项目)分析似乎 建议 西非血统。

丹东这个人是 基因组解压缩。 Polako特别发现 附近的两个路段 在两条染色体上显示出唐·康拉德博士基因组中的群体非典型杂合性模式。 看7号和13号染色体。 远亲的表亲, 丹尼尔·麦克阿瑟博士。 他还表现出杂合性,但它们随机分布在整个基因组中。 这是旧的混合物或只是噪音。

Polako并没有充分利用Don Conrad博士的研究成果,我也没有(大概是Don Don Conrad博士是该协会的成员) 基因组解压缩 谈论他的结果很容易,而没有任何关于机密性的道德或道德上的麻烦)。 另一方面,与丹·麦克阿瑟(Dan MacArthur)博士不同,对网络的力量的一点利用表明唐·康拉德(Don Conrad)博士是美国人。 特别是最近的中西部背景。 尽管我并不毛骨悚然,但我并没有开始四处张望 Ancestry.com。 但之后 皮克雷尔(Pickrell)恋情 我可能会更犹豫地嘲笑这些分析得出的特殊结果,就像简单的算法一样。Meshugana.

图片来源:Colegota

(从重新发布 探索/ GNXP 经作者或代表的许可)
 
• 类别: 科学 •标签: 混合物, 祖先, BGA, 基因, 基因组解压缩, 基因组学 
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  1. 这完全令人着迷——我热切地等待自己的结果!

    我还看到一个有点相关的帖子:
    http://bga101.blogspot.com/2010/11/genetic-structure-of-north-eurasians.html

    我的父母 IE6(爸爸)和 IE7(妈妈)在北欧亚分析中被列为爱尔兰样本的一部分,K=8:
    爸爸 = 1% Selkup(北欧亚)
    妈妈 = 1% Chukcki/Koryak(白令海)

    我只能说哇!

  2. 好吧,至少现在我们知道 DC 从哪里获得了他无可挑剔的时尚感。

  3. 也许维吾尔人看起来与混杂的美国人不同,还有另一个原因。 欧亚西部维吾尔人主要来自印度-伊朗和/或东欧人群,他们的身体(和遗传)特征与美国典型的西欧人有些不同。 此外,维吾尔族东部欧亚人的大部分成分可能来自蒙古人——在美国通常找不到蒙古人,而且从基因上讲,他们与农业家沿海东亚人有一定的距离。

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