藏族生活在世界上最高的高原上，他们目前的人口规模接近5万，其中大多数生活在3,500米以上的海拔高度。 因此，青藏高原是人类历史文化和生物学研究的重要领域。 然而，青藏高原殖民化的时间顺序仍然是人类史前尚未解决的问题。 为了重现青藏高原现代人类的史前殖民时期和人口统计历史， 我们系统地从青藏高原整个地区的6,109个地理种群中采样了41名藏族个体，并分析了父系（n = 2,354）和母系（n = 6,109）谱系以及全基因组SNP标记（n = 50）在藏族人群中。 我们发现，现代人类进入青藏高原有两种截然不同的主要史前迁徙。 第一次迁徙以约30,000万年前的古代藏族遗传特征为标志，这表明现代人类对青藏高原的最初人为发生在旧石器时代而不是新石器时代。 我们还发现了藏人和汉族人之间相对年轻（仅7万至10岁）共享Y染色体和线粒体DNA单倍型的证据，这表明在新石器时代初期出现了第二次移民潮。 总体而言，遗传数据表明，自上古石器时代初期青藏高原最初定殖，最后冰川期结束之前，西藏人已经适应了高原环境，随后人口迅速膨胀，同时建立了农业和牛。新石器时代早期高原上的牧民主义。

我认为需要强调的两个主要重点是：

1）大量的mtDNA样本量和较小程度的Y染色体线性

2）西藏人是到达高原超过10,000年的农民的复合体，而狩猎采集者的历史可追溯至旧石器时代

引文： 蔡晓云等“Y染色体揭示的末次盛冰期，人类通过瓶颈从东南亚迁移到东亚。” PloS 一 6.8 (2011): e24282.?

这篇论文有很多困扰我的问题。 我认为这是对他们论文的最广泛的解释，但是在细节上，我比起初时更加怀疑，困惑和好奇。 另外，我还要补充一点，我与在ASHG 2012上发表过这篇论文的海报的人进行了交谈，尽管我不知道他们是否是作者。 他们看起来不错，但也不一定完全专注于他们正在探索的问题，而不是获得大量样本并对其应用标准方法。 说到这，跳出来的第一件事就是他们的样本偏向今天的西藏自治区。 但是从历史上看，藏族一直居住到四川。 仅有50％的藏族人居住在自治区，但他们的样本中有90％以上来自这一地区。 就探索适应海拔高度而言，这很好，但是我想，如果您要进行系统地理学，则需要更好的地理覆盖范围。

但这只是一个未成年人。 本文的大部分内容由Y和mtDNA单体组的洗衣清单以及合并时间组成。 一些结果对我很有说服力。 有一些Y谱系表现出“星状”系统发育，通常意味着最近种群的快速增长。 作者使用其他方法推断，在引进农业超过10,000年前，人口确实在增加。 出于先前的理由，没有充分的理由对此发现表示怀疑。 尽管如此，进行钻探仍会造成很大的混乱，而且我不确定合并时间和系统发育实际上是否意味着作者所认为的意思。

例如，这是本文介绍的一种标准分析方法：

我们确定了新石器时代早期在父系（Y染色体D3a-P47和O3a3c1-M117）和母系（M9a1a和M9a1b1）（10-7 kya）谱系中最近种群扩展的分子特征（表1）。 对藏族和汉族之间的单倍型共享和分歧时间的详细分析表明，高原上的新石器时代人口的增长很可能是由于最早的新石器时代汉族农业人员的散布导致了大约10 kya在现在的中国西北地区。

O3a3c1-M117的出现频率约为30％，并且与中文（如上所示）相关。 这与其他最近的研究相吻合，这意味着藏人和中国人之间是相对较近的共同祖先。 通过混合种群将为您提供两个极端之间的平均结果，可以将此结果与旧石器时代根的存在相协调。 我的问题是，我怀疑汉人存在于10,000年前，就像我怀疑希腊人存在于10,000年前一样。

引文： 蔡晓云等“Y染色体揭示的末次盛冰期，人类通过瓶颈从东南亚迁移到东亚。” PloS 一 6.8 (2011): e24282.?

快速 文献检索 得出这样的事实，即M117是模态的，特别是居住在中国南部和东南亚北部的非汉族。 我不是在这里建议苗族向藏人介绍M117。 相反，我建议我们最好谨慎一点，前提是在给定地区有任何书面记录之前，我们已经知道遗传单倍群的种族分布有6,500年。！ 对我来说，有一个推定的事实 汉藏语 一组语言强烈地表明了> 10,000年的多样化，而不是大约10,000年前的汉族存在。 历史记录很清楚，大约3,000年前的长江（现在是华北和华南之间的非正式分界线）是汉族在人口统计学上占主导地位的区域的边界。 即便如此，在华北平原上显然仍然有“野蛮人”的腰包！ 正如我们所理解的那样，大约10,000年BP的农业扩张是汉人，这根本不符合基本合理性的考验。 东北亚的汉族在人口和文化上占主导地位是近3,000年的现象，可能是最慷慨的4,000年（华南在后汉王朝灭亡后大约在公元200年左右，尤其是唐朝时期被中国化） 600-950 AD）。

由于这些不合时宜的假设以及当代单倍频率的偶然推断又回到了古代的地理人口分布，因此很多争论都是令人发指的。 古代DNA突显了这种危险在欧洲的存在，这应该更新我们这种分析的稳健性的先验。 例如，作者对Y染色体谱系缺乏结构以及它们在西藏各地的深度聚结时间感到好奇。 为什么这是一个问题？ 因为如果这些Y染色体世系是旧石器时代的，那么分支上的深层会聚也应对应于地理差异。 但是他们没有。 对我来说，最简单的解释是，过去一万年来，人口大量流动。随着农业的开放，青藏高原地区的人口急剧分化。 尽管从现有的分布推断出古代的地理联系，但这却带来了一个问题，因为它打开了迁徙的可能性，并带来了巨大的遗传人口变化。

总的来说，我会说这篇文章很有趣并且很有用，但是您应该仔细阅读它，不要太在意作者的推论。 这些推论基于可能基于错误基础的假设。

附录： 而且，如文中所述，PCA图上的“空白”并不一定意味着长期孤立。 这可能仅仅是由于采样不足造成的。 看上面。 有许多这样的不受支持的断言。 但是，我想补充一点，作者在拉萨市内发现了大量“异国”单倍群，这与我们对西藏文化历史的了解相吻合。 实际上，藏传佛教受南亚（尤其是孟加拉）佛教绝种的影响，而不是中国佛教的影响。 尽管喜马拉雅边界的人口激增似乎是从高地到低地，但也有例外。 这些例外往往在拉萨发现。

引文： 蔡晓云等。 “人类在Y染色体揭示的最后一次冰河极大期期间通过瓶颈从东南亚迁移到东亚。” PloS one 6.8（2011）：e24282。