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人类基因组学

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“ ...对澳大利亚/新几内亚的占领是重要的,因为它要求使用船只,并提供了迄今为止有史以来最早使用它们的证据。直到大约30,000年后(13,000年前),仍然有强烈的证据表明该船只在使用在世界上,从地中海开始。考古学家最初考虑到殖民化的可能性。 了解更多
在人类基因组中大约 3 亿个碱基对中,存在相当多的变异。 这种变化可以分为不同的类别,有些是人类分类系统的人工构建,但仍然映射到特别重要的真实人口统计或生活史事件。 一些变异是特定于人群的,... 了解更多
由于对“遗传性缺失”的所有合理担忧,人类基因组学的时代并没有完全破产。 正如我之前在 2005 年的优秀著作《突变体》中所观察到的那样,进化遗传学家 Armand M. Leroi 断言我们确实对人类色素沉着的正常变异没有很好的理解。 当时我觉得... 了解更多
如果您对人类基因组学以及我经常在这个空间中回顾和讨论的论文类型感兴趣,您可能会对 Vogel 和 Motulsky 的《人类遗传学:问题和方法》中的一章感兴趣。而且,我刚刚注意到你可以在线获取它(如果你有学术访问权限)。标题是:遗传学... 了解更多
数字 1 比 -1 受到更多的关注,杂合性的概念比纯合性受到更多关注。具体来说,后两者之间的区别相当简单。在二倍体生物中,基因是重复的。如果等位基因相同,则它们是纯合的。如果它们不同,那么它们就是杂合子。性染色体... 了解更多
在我关于非洲农民的帖子中,有人回应:斜体是我的话,评论者强调。 粗体也是评论者的(我必须修复该评论中的一些 HTML,但我认为我根据评论者的意图进行了更正)。 我阅读(并写博客)
在左侧,您可以看到 Dienekes 为帖子制作的 PCA 的放大图,西亚印欧集团的结构。 该帖子的重点是库尔德人(讲伊朗语的人)与伊朗人以及亚美尼亚人(印欧人)和土耳其人(非印欧人)之间的特殊遗传关系。 正如你在... 了解更多
我在这个领域密切跟踪的两个主要研究途径是全基因组关联研究 (GWAS),它试图在性状/疾病和特定遗传标记之间建立联系,以及对塑造基因的进化参数的调查。人类基因组内变异的结构。 通常与...的特定关系 了解更多
核心:在这篇文章中,我研究了如何查看基因组数据可以准确地阐明兄弟姐妹之间的亲缘关系,而不是仅仅假设它们大约有 50% 的相似性。 我将兄弟姐妹之间的这种随机性与亲子继承的硬性和快速确定性进行了对比。 此外,我详细介绍了理想化的备用概念... 了解更多
上周大部分时间我都处于半离线状态,所以我只是随机从某人那里听说了 Molly Przeworski 是作者的“科学论文”。 终于有机会从头到尾阅读它,这似乎是对其他论文的补充,既针对人和野兽。 主要的“增值”似乎... 了解更多
图片来源 The Pith:在这篇文章中,我回顾了一篇涵盖人类分娩进化维度的论文。 具体来说,我们物种特有的特征和倾向,可能支持这些特征和倾向的基因,以及它们如何与更广泛的公共卫生考虑相关。 人类婴儿是特别的。 不像……的后代 了解更多
Zack Ajmal 一直带着他的 Reference 3 数据集去参观 Harappa Ancestry Project。 或者,更准确地说,他一直在开着他的电脑来处理 ADMIXTURE 结果上升到 K 的后面。 因为它是 Harappa Ancestry Project,所以 Zack 的人口超载了对南亚人的影响。 他... 了解更多
上周,我回顾了关于“外源冲击”对生物生态系统的影响的想法,以及它可能如何重塑它们的进化轨迹。 这类问题的普遍性是众所周知的。 它们具有从最广泛的宏观系统学到微观进化过程的意义。 冲击表明随着时间的推移而发生的变化... 了解更多
去年夏天,当读者问到一个问题时,我在人类人口历史模型方面犯了一个轻率而愚蠢的错误:“哪个人口与非洲人的亲缘关系最远?” 我认为所有非非洲人口的距离都相同。 如果你看一下,这从表面上看显然是错误的...... 了解更多
伊曼,索马里模特 自从我开始非洲血统项目以来,主要的兴趣来源之一就是来自东北非家庭冰雹的个人。 更具体地说,非洲之角、埃塞俄比亚、厄立特里亚和索马里。 问题似乎是23andMe的“祖先绘画”算法使用西非约鲁巴语作为... 了解更多
核心:你应该有 30 个新的突变,使你与你的父母区分开来。 但是,这个数字有回旋余地,你可能有更多或更少的空间。 这个数字可能因兄弟姐妹而异,并解释兄弟姐妹之间的差异。 此外,之前使用的突变率估计值可能过高…… 了解更多
核心:遗传变异越罕见,该变异就越有可能特定于不同的人群。 包括有关当前技术中遗漏的这些遗传变异分布的信息可以大大提高统计推断的精度。 几天前我在纽约通过一篇文章提到... 了解更多
核心:我们现在正从人类基因组计划转向人类基因组计划。 随着越来越多的不同人群的全基因组上线,新的方法将出现以利用数据过剩的优势。 在这篇论文中,作者对六个人的基因组进行了分析,以制作... 了解更多
标记显示由 HUGO 泛亚 SNP 联盟采样的人群 The Pith:东南亚由一系列不同的民族定居。 定居模式可以部分通过检查遗传变异的模式来辨别。 在……到来之前,南亚人口似乎在印度尼西亚西半部占主导地位。 了解更多
核心:人类 X 染色体受到来自自然选择的更多压力,导致遗传多样性减少。 但是,人类种群中 X 染色体多样性的差异似乎更多地是种群历史的函数,而不是这些种群之间自然选择能力的差异。 在过去的几年里... 了解更多
在 Daniel MacArthur 博士关于 Roots into the Future 的帖子中,Blaine Bettinger 留下了一个有趣的评论:看看 23andMe 如何处理响应 10,000 个免费套件的人群将会很有趣。 他们似乎无法预先筛选申请人,因为非裔美国人的传统有时比遗传更具社会学意义(基于... 了解更多
Dienekes Pontikos 刚刚发布了 DIY Dodecad,一个 DIY 外加剂分析程序。 您可以自行下载文件。 它可以在 Linux 和 Windows 上运行。 由于我已经在 Linux 中使用了工具,因此我决定尝试使用 Windows 版本,它似乎运行良好。 它在某种程度上受到限制,因为您开始... 了解更多
川菜和山东菜的代表 髓:汉族在遗传上是多样的,这是由于分布的地理范围、与其他人群的杂交以及可能的当地适应性。 在美国,我们常说“中国菜”。 这很奇怪,因为没有任何通用的“中国菜”。 相反,有地区美食,共享... 了解更多
我想放弃这个词,我正在为非洲血统项目寻找一个有马达加斯加血统的人。 据我所知,没有对马达加斯加人进行大量标记常染色体分析。 在我最近对东南亚遗传学的探索之后,我认为即使是一个人也会提供丰富的信息。 作为... 了解更多
上周我乞求马达加斯加基因型。 我不太明白,但我得到了第二好的东西:部分马达加斯加基因型。 我决定试一试。 但首先是一些预备知识。 以下是我们对这个人的了解(或这个人所知道的):这是一个非常复杂的人…… 了解更多
去年,一些读者给我转发了一个关于希特勒“犹太基因”的奇怪故事。 我没有多想,但有足够多的人问我认为我至少应该解决这个故事(或没有一个)。 今天,男孩法老图坦卡蒙的 Y 染色体谱系也发生了类似的事情。 一家瑞士公司... 了解更多
要点:自然选择是一个快速而肮脏的操作符。 当受到新环境的影响时,它可以迅速做出反应,带来好的和坏的。 成功适应的关键不是完美,而是比替代方案更好。 这可能意味着许多当代疾病是过去进化遗传妥协的副作用...... 了解更多
Steve Hsu 向我推荐了《纽约客》中关于 Svante Pääbo 的科学和个性的一篇文章。 个性部分包括对 Pääbo 的双性恋的引用,在我看来,这似乎是字面意义上的散文,以增添情趣。 当然,这是我觉得有趣的科学。 有许多... 了解更多
早在 1990 年代,围绕人类基因组多样性计划就有很多争议。 事实上,有整本书籍专门介绍该项目的社会学。 尽管该项目的批评者在某些细节上可能有道理,但他们拖延该领域科学调查的总体目标失败了…… 了解更多
The Pith: Evolution 是一个草率的艺术家。 在创造性能量适应的焦点区域上可以精确雕刻,但在遗传景观的边缘,可能会由于注意力不集中而爆发可怕的现象。 换句话说,适应往往有不利之处。 几周前,我审阅了一篇论文,该论文表明克罗恩的... 了解更多
我仍然对 Slate 中相当残暴的 Brian Palmer 的作品感到头疼,双重疯狂:双胞胎研究几乎毫无用处。 它的质量使其适合 WorldNetDaily。 以下是 Jason Collins、Daniel MacArthur 和 Alex Tabarrok 的回应。 Slate 上的评论也相当严厉。 我观察... 了解更多
在我下面的帖子中,图西族可能在基因上与胡图族不同,有很多评论。 有些我没有发布,因为他们很粗鲁,尽管他们确实提出了有效的问题。 我将解决这些问题,但让我引用一个评论:所以我像我一样为许多相同的人群复制了 ADMIXTURE 运行...... 了解更多
Dienekes 提醒我一个事实,即国际人类遗传学大会摘要在线。 我花了一个小时只使用了几个关键字,并想出了很多。 1)如果您有一个演示文稿并认为它可能会引起读者的兴趣,请随时放一个链接(我会看... 了解更多
有点和可能。 多年来我一直在谈论这个问题,Greg Cochran 向我指出了之前引用的人类遗传学会议上的摘要。 TYRP1 的新编码变异解释了所罗门群岛人头发颜色的很大一部分差异:所罗门群岛包括位于巴布亚东部的 1,000 多个岛屿...... 了解更多
“当那些日子,地上有巨人;之后,当上帝的儿子们与人类的女儿们交合,为她们生 [孩子] 时,这些 [成为] 强大的人 [是]老,有名望的人。” - 创世记 6:4 髓:俾格米人和科伊桑人混合了... 了解更多
2008 年末出现的一件事是,人们担心一直非常松懈的金融监管制度现在更加意识到前一个时代的过度行为。 问题是人们不一定为下一次危机做好准备。 同样,恐怖活动,例如…… 了解更多
克里希纳与挤奶女工 与某些亚洲社会不同,乳制品在南亚相对知名。 显然,在某个时候,我外祖母的家人经营着一家牛奶生产企业。 这一点值得注意,因为孟加拉并不是牧民之地。 在北印度的大部分地区,牛奶和奶制品显得更大,尤其是酥油…… 了解更多
一个月前,我要求提供马达加斯加基因型。 几乎立即我收到了来自 33% 马达加斯加人的回复。 最近,我向马达加斯加人发送了一个基​​因分型工具包。 这些结果应该会在一个月左右的时间内出来。 但是几天前我收到了一个来自... 了解更多
我将在这篇文章中解决两点。 获得欠采样人口的下一个可能目标,以及马达加斯加的结果。 首先,关于样本不足的人群有很多很好的提交。 其中一些实际上已经在数据集中。 例如,Burusho 和 Kalash 就在 HGDP 中。 那里... 了解更多
几天来,我一直在咀嚼现代人类将范围扩展到尼安德特人的领土纸上。 但我一直无法让自己多说。 有两个原因。 首先,这是一篇模拟论文,除了怀疑某些人的合理性之外,我不知道我还能说什么…… 了解更多
核心:人类家谱的布须曼人分支在大约 130,000 万年前就出现了分歧。 非非洲人大约在五万年前就从非洲人中分离出来。 欧洲人和东亚人在大约 50,000 年前就出现了分歧。 古人类学中可能令人困惑的术语之一是古代智人(AHS)。 这与解剖学上的相反...... 了解更多
今天有两篇有趣且相关的论文,我想快速回顾一下,特别是关于结果(而不是方法的本质)。 总的来说,它们确实改变了我们对解剖学上的现代人类如何解决世界的看法,如果发现这些发现...... 了解更多
才意识到。 科学论文有一些有趣的日期,这使我们能够做出上述推断。 - 25-38 千年前欧洲人和东亚人的分离。 - 原始东亚人和原始澳大利亚人之间的基因流动,在美洲原住民与现在之前的前一万五千年不同之前。 - 保守的第一... 了解更多
《麻省理工学院技术评论》有一篇关于已完成完全测序的人数呈指数级增长的文章。这部作品没有什么特别之处。您确实必须谨慎对待 10 年的预测,尤其是当它们呈指数增长时。但这部分引起了我的注意:“以这种指数级的速度,...... 了解更多
鉴于人类进化史上的最新成果,一些读者呼吁我创建某种更清晰的信息图表。 当涉及到新模型以及从统计推断得出的估计中的错误和不确定性时,您的头脑中有很多需要处理。 词并不总是最佳的,而且...... 了解更多
Rasmus Nielsen has a long response below to the issue of the getting some sort of consent from Aboriginals in the local region in regards to a specimen from a deceased individual. He has a full entry on this at the new weblog of his research group. As an aside, let me say that it... 了解更多
Lauryn Hill,图片来源:Lisa Lang 我今天收到一位朋友发来的一封电子邮件,内容涉及对头发质地遗传学的猜测。更具体地说,是卷发与直发。我知道有一些 SNP 与直发和卷发相关(23andMe 实际上已经参与其中),但架构还没有...... 了解更多
我今天被指向 BBC 的一篇文章,标题是什么使混血儿双胞胎是白色或黑色的?。 英国媒体似乎反复重温这个话题。 我可以为此提供三个原因。 首先,它倾向于耸人听闻。 尽管 BBC 相对稳重,但说到... 了解更多
冰人奥兹的基因组在某处漂浮,但现在我们只需要继续了解通过媒体泄漏的内容。 来自国家地理,冰人尸检:我猜我们在谈论来自撒丁岛和巴斯克人的 HGDP 样本,尽管这些巴斯克人来自边境的法国一侧...... 了解更多
最近,我和一些朋友讨论了当价格降到 1,000 美元时获得我直系亲属中每个人的完整基因组,就像我对我的直系亲属进行基因分型一样。您可以仅从基因型中找到一些有趣的东西,对于当前负担得起的平台来说,其目标是...... 了解更多
拉齐布汗
关于拉齐卜·汗

“我拥有生物学和生物化学学位,对遗传学,历史和哲学充满热情,虾是我最喜欢的食物。如果您想了解更多信息,请访问http://www.razib.com上的链接”