那么这些轮虫如何保留下来，知道我们对无性多细胞谱系的了解（它们在这个世界上不长）？ 本文中提出的两个主要答案似乎是 基因转换 和水平基因转移（例如，从细菌通过病毒）。 在基因转换过程中，可能有害的等位基因只是简单地恢复到野生状态。 同时，水平基因转移（例如来自细菌）可能会导致新变异持续注入物种，否则会导致克隆谱系的增殖。

上述两种现象似乎是轮虫可以避免其结构性强制无性行为陷阱的几乎平庸而明显的方式。 这促使我问为什么更多的生物没有表现出这种特征？ 许多谱系具有孤雌生殖分支。 但很少有它们能像 bdelloid 轮虫那样大获全胜。 很好奇如果其他 性 后生动物被发现具有 bdelloids 的基因组特征。 尽管 bdelloids 绕过了障碍，但仍有一些谱系设法进入减数分裂。 当然，为此我们需要更多的“基因组论文”。

在这一点上，我已经从最肤浅的角度勾勒出了一组命题，这些命题涵盖了DNA生化力学的具体物理领域以及抽象的正式进化遗传模型，该模型概述了等位基因频率在时间和空间上的轨迹。 但是，命题总是嵌入公理中，而这些公理可能并不总是字面真实的。。 例如，某些氨基酸在氨基酸产量方面名义上等价的密码子受到青睐 偏见 源自各种效率 平移机械 的细胞。 在时尚之后，这也是自然的选择，但它并不通过生命过程中某个阶段的个体有机体的适应性以直接的方式体现出来。 在某些情况下，同义突变会发生变化 监管途径 显着地等等。 尽管所有这些与理想的偏离都可能是大多数研究人员接受的，但对于同义突变的中性框架的实用性允许事先假设它们不受选择。

A 新文 in 公共科学遗传学, 在同义站点中进行强纯化选择 黑腹果蝇着重强调了许多公义位置在中的可能性，从而着眼于该公理的鲁棒性。 果蝇 受制于 强烈 净化选择。 即，推定的沉默转变产生明显的功能差异，这导致生物体的适应性大大降低，从而从多态性库中去除了突变等位基因。 注意这里的关键限定词是 强大。 诸如突变偏倚和调节差异之类的动态变化意味着，许多人甚至在同义的位点上都会承认选择的弱小而温和。 这些作者主张一些更为激进的观点。

图1C

坦率地说，该论文内容丰富，内容丰富，从统计遗传学到发育生物学的学科广度令人印象深刻。 但是核心结果可以归结为原始计数 单核苷酸多态性。 特别是他们比较了 内含子像同义位点一样，也被认为是中性的，因为它们不是产生蛋白质的最终RNA转录本的一部分，以此作为检查其感兴趣位点的参考。 尽管您可以在这篇文章顶部的面板中观察到一些微妙之处，但这似乎与4D（四倍简并）站点中的中立性有些偏离。 在上面的第二个面板中更清楚。 同义位点的遗传变异似乎比应有的少。 这是一种提纯选择的方法，它可以连续地从种群中去除低频有害突变。 但是为什么呢 强烈 选择？ 作者强调的问题是，先前研究的数据集根本不够密集和丰富，无法区分强纯化选择和弱纯化选择，因为在较粗略的分析范围内，效果会非常相似。 相反，在这里，作者使用了100多个果蝇品系，并装配了近1万个4D SNP。 通过对种群进行如此深入的采样，他们甚至能够探测到很小的差异，因为强选择在清除非常低频率的等位基因方面会明显更有​​效（考虑到在较小的样本中，很可能会遗漏低N变异体）。

成为论文 公共科学遗传学 它免费提供给所有人阅读，因此我将为您节省所有细节，包括如何校正GC含量的偏差，可能的选择性扫描以使来自侧面区域的信号失真等。他们能够使用重采样技术来确认尽管将数据划分为多个类别确实使我有些担心，但它们的推理的鲁棒性还是有一点。 此外，还提到了使用“简约性”，这有点令人担忧，特别是由于作者甚至承认这可能会得出错误的结论这一事实。 但是，即使细节中有许多令人生畏的运动部件，总体效果还是相当可观的。 我还应该提到，他们探讨了密码子偏倚可能在产生这种模式中可能发挥的作用，而且似乎不太可能（特别是因为纯化选择似乎会影响最佳和非最佳密码子）。 而且，还有一些相当奇怪的结果，例如他们发现纯化选择是 较弱 X染色体上的染色体比常染色体上的染色体（与我的相反，我认为是他们的期望）。

本文的“后端”有所不同，因为它分析了感兴趣的基因组区域（4D位点）的功能和发育方面。 他们报告说，例如，净化选择是在整个保护区进行的 果蝇 物种。 不奇怪。 但是，在整个血统中的站点上似乎也存在大量的取代和变化，这有待纯化血统。 这暗示着获得突变的功能，可以区分 果蝇 物种。 最后，关于基因表达的时间分布的广泛模式也涉及到4D位点，这些位点是高度保守的。 由于我对开发生物学并不精通，因此我会将其留给其他人使用，尽管结果对我来说是不透明的，但这似乎是暗示性的。

一篇论文并没有推翻40年的分子进化过程。 即使验证中立理论的一些主要假设和结果是错误的，也不会否定中立作为无效假设的效用。 但是，如果将同义位点作为中立性的基准，并且一直受到严格的纯化选择，那么这的确意味着我们对影响遗传进化史的力量平衡的理解。 果蝇 可能是完全错误的。 关于预选赛 果蝇 我认为这是有道理的，因为从我之前回忆的结果来看，该模型有机体普遍存在选择现象，而这可能并不适用于所有分类单元。 作者对结果的一般性进行了论证，他们也许是正确的，但我认为人们应该对这种说法更为谨慎。 这确实告诉我们的是 现代基因组学和数据的扩展并不能以更精细的规模揭示自然，但实际上可能是在抽烟长期隐藏在平原地区的结构和模式。

引文： Lawrie DS，Messer PW，Hershberg R和Petrov DA（2013） 黑腹果蝇。 PLoS Genet 9（5）：e1003527。 doi：10.1371 / journal.pgen.1003527

总的来说，这篇论文很重要，因为它在基因组（在同一推定标记上击中基因组超过 10 次）和种群（从类人猿中采样了广泛的亚种，N = 79）方面具有合理的覆盖率。 将来，这种分析可能会很无聊，使用统计基因组分析技术的瑞士军刀将丰富的数据集切开（参见 补充 PDF）。 如果您对黑猩猩复杂的种群历史感兴趣，本文适合您，因为它探讨了种群大小、混合物和基因流的变化。 对我来说，有两个特别重要的结果。

首先， 他们没有发现功能缺失替代在人类谱系中得到了丰富。 这很重要，因为遗传学家仍在寻找“使我们成为人类的基因”。 或者也许更仁慈的是我们物种特有的进化过程，这导致了我们的独特性。 我不否认我们是一个独特的物种，但似乎这个任务会持续一段时间。 那是因为 可能什么都没有 独一无二 关于我们的遗传学或我们的进化起源。 事实上，如果研究人员得出结论认为普遍趋势适用于所有 智人 在过去的 2 万年中，而不是 智人 谁是今天所有活着的人类的祖先（因为其他谱系已经灭绝）。

其次，注意其他人科的遗传多样性范围有多大。 一段时间以来，这已经为人们所熟知，但就类人猿而言，人类在基因上特别均一的智慧面临着聚合不同种群并取平均值的问题。 黑猩猩的杂合性范围很大。 一些人口实际上是 更多 与其他几个类人猿种群相比，基因多样性。 此外，请注意这些猿亚种相当深的种群差异。 倭黑猩猩与黑猩猩的分裂发生在 智人 出现了，但在普通黑猩猩亚种中，谱系开始分化，大约与古老的同时 智人 人口。 用简单的英语来说，在普通黑猩猩中似乎存在与尼安德特人和非洲人具有相同时间深度的种群结构。

在不久的将来，这种分析将扩展到其他哺乳动物类群。 但像往常一样，先是猿，然后是其他。

与其通过对Y的判断，不如说是更适当的调查范围。 由于其具有重复序列的丰富性（难以测序）和有趣的基因的稀缺性（因此为什么要打扰），在某种程度上它已经通过微卫星在分子标记之外发挥了短暂的作用（对于那些对特定基因感兴趣的人除外，例如 SRY 和 采风））。 中的新论文 基因组研究 试图对一些哺乳动物类群中Y染色体的进化史进行分类和调查。 哺乳动物Y染色体的比较分析阐明了祖先的结构和谱系特定的进化:

尽管已对三十多个哺乳动物基因组进行了测序以提高质量， 其中很少有Y染色体。 这限制了我们对基因持久性和丧失的进化动力学的了解，限制了我们识别保守调控元件的能力，以及我们对于不同类型的选择在这种独特的基因组环境中维持基因的作用程度的了解。 在这里，我们介绍了来自两个食肉动物（家养的狗和猫）的第一个MSY（Y染色体的男性特定区域）序列。 通过将这些数据与其他可用的MSY数据结合起来，我们的多方向比较可以使选择水平的首次考虑成为问题，而这些选择水平会限制Eutherian Y染色体的进化。 尽管整个系统发育过程中都有基因的得失，但我们显示，以太子祖先保留了15个MSY基因的核心集，其中大多数受到负选择的约束，持续了近100亿年（My）。 X简并和两性基因类别在大多数哺乳动物中被划分为不同的染色体结构域，但在人类谱系中进行了根本性的重组。 我们确定了多个保守的非编码元件，它们可能调节欧舒尔MSY基因。 新的两性基因家族的获得伴随着积极选择的特征，并已不同地影响了不同物种中MSY基因组成的退化和扩展。

毫不奇怪，与这些睾丸功能有关的基因似乎在这些生物体中受到约束或处于选择之下。 在某些方面，Y染色体的存在原因是睾丸。 并不是那么令人惊讶，但引人注目的是这些哺乳动物谱系中Y染色体的基因组结构发生了根本性的分歧。 图很好地说明了这一点：

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纵观这些结果，这些结果实际上是粗糙的（我想知道，与其他生物相比，人类Y染色体第一次脸红时更大的结构复杂性是否与分配给其测序的更大资源有关）。赛克斯错了的原因是 Y染色体上的进化过程不是线性进行的。 这些血统的轨迹大相径庭。 其中一些可能是由于沿袭特定的选择压力（例如，r与K选定的物种及其与精子竞争的关系）。 其他人可能只是随机的。 与较宽的基因组相比，Y染色体的漂移更大（有效种群较小）。 无论细节如何，都有一个更广泛的故事要讲。

新蛋白质功能进化的遗传和生物物理机制是研究的中心问题 进化生物学，生物化学和生物物理学。 特别令人感兴趣的是，蛋白质功能的重大转变是否是由 一些效果大的突变 以及，如果有的话，它们就是介导这些变化的机制。 在这里，我们将祖先的蛋白质重建与遗传操作相结合，并对蛋白质结构和动力学进行了明确的研究，以剖析类固醇受体（一种生物学上必不可少的激素控制的转录因子）中配体特异性的古老而离散的变化。 我们先前发现整个类固醇受体家族的祖先对雌激素具有高度特异性，但其直接的系统发育后代仅对雄激素，孕激素和皮质类固醇敏感。 在这里，我们表明功能的这种变化主要是由两个历史氨基酸变化引起的， 导致祖先蛋白的特异性发生了约70,000倍的变化。 这些替代物巧妙地改变了两种氨基酸的化学性质，但它们通过将过量的相互作用伴侣引入受体/雌激素复合物中而大大降低了雌激素敏感性，从而导致雌激素独有的次优氢键网络受挫。 这项工作表明了蛋白质的结构和动力学如何影响其进化，将一些生化微妙的突变放大为蛋白质的能量学和功能方面的重大转变.

这篇论文涵盖了多个领域，尽管可以理解（虽然我很早以前就研究过生物化学，所以我在化学领域有一定的背景），但我对生物物理学的评论也不过分。 简而言之，您具有这些受体的两个谱系，与调节与特定激素相关的特定基因的表达有关。 这通常是分子遗传学和生物化学的领域，因为您关注一系列级联中最接近的生物分子途径，这些途径通常通过特定组织和特定时间的基因调控来发挥作用。 本文有趣的方面是，它们融入了对进化和系统发育见解的解释和分析中，为生物物理学奠定了基础。 简而言之，似乎两个不同的受体谱系通过非常细微但在功能上非常重要的变化来区分。 为了测试进化重建的含义，他们使用了模拟和实验方法。

主要的优点是看起来很小的变化，导致氨基酸序列的变化很小，类固醇中几乎没有可见的结构变化，但是却从根本上扰乱了蛋白质的亲和力。 从理论上讲这不是不可行的，但是，从各个方向实际检查这种现象是非常好的。 本文的进化论只是骨架，真实的肉体从生物学上说明了取代是如何导致能量相互作用和分子相互作用的本质发生转变的。 当我们想到进化过程时，我们常常将注意力集中在人类可理解的粗糙形态上。 但是有人可能会说，生物体中如此根本的生化变化，超过两个数量级，本身就是宏观进化变化。.

这一结果的暗示可能是，由遗传变化介导的进化比我们想象的要光滑得多的现象。 在适应性方面（例如，适应气候或与种内竞争相关的大小和形状的变化），形态的变化相对于我们的直觉相对应。 它们不仅具有人类规模，而且经常通过化石保存，因此可用于古生物学研究。 相比之下，分子尺度上的进化变化仅在基因组中留下了我们必须推断的标志物。 蛋白质间相互作用的复杂性使得难以建立可靠的分析模型（至少我最后检查过）。 如果将来进化生物学的主要重点是改变大分子功能的大效应突变，那么我们可能会暂时失明。 但这没关系，科学是在漫长的爬回山顶之前因无知而承认的。

引文： Harms，Michael J.，等。 “类固醇激素受体进化中的大影响突变的生物物理机制。” 美国国家科学院院刊（2013）。

共有三个主要线程 我心爱的雷龙。 首先，是一个关于我们社会对恐龙的外观，生活方式和基本形态的认识的文化史。 其次，关于我们现在对恐龙的解剖学，行为和系统学的了解有最先进的科学。 第三，有Switek与恐龙有关的个人传记，以及他对在各个野外工作的经历的回忆。

信用： 伯爵夫人

我们对恐龙的认识与我们今天以科学的方式对它们的了解显然是相关的。 如果我们对自己的看法和先入之见不了解，那么Switek对最新同行评审文献的提炼将变得毫无意义。 在19世纪末和20世纪初，恐龙实际上是“可怕的蜥蜴”。 它们是绿色或灰色的爬行动物，顽固和冷血的生物，注定要成为历史的垃圾箱（因此，“他真是个恐龙！”）。 今天的观点完全不同。 恐龙是 不灭绝, 因为鸟类似乎是 兽脚亚目恐龙的衍生血统 （非禽类的灭绝只是为了流星的恩宠！）. 现在，大多数人认为，即使不是大多数，许多恐龙也都是热血的，并且羽毛。 它们不仅有羽毛，而且古生物学家已经能够重建某些恐龙的色素沉着。 您是否相信他们有如雨后春笋般的羽毛 喜鹊!

如果您想知道恐龙是否具有社交性，听起来像什么，以及为什么它们在三叠纪晚期已崛起， 我心爱的雷龙 你覆盖了吗？ Switek的知识范围很棒。 在杰里·科恩（Jerry Coyne）的作品中 为什么进化是真的 他被称为罗格斯大学的古生物学研究生。 现实情况是，写这些字时，Switek还是一个本科生。 但是，很容易看到一个人怎么可能只是假设他必须是一名研究生。 他在全国各地寻找博物馆和挖掘场所的经历反映出一种理想情况下会在研究生中找到的个性，但可惜的是，这种个性常常找不到。

本书中我想探讨的一点是关于恐龙灭绝的争议。 公众的看法是 KT边界 之所以存在是因为巨大的流星撞击。 但是几年前，我看到了一位古生物学家的采访 彼得沃德 他否认这是已经建立并接受的科学，这令我大吃一惊。 我很感兴趣地看到，在Switek的说法中，这似乎只是少数派，而且大多数学者仍然接受KT事件的最重要意义。 令人放心的是，因为历史学家经常将注意力集中在 独裁主义 几乎是非理性的。 在不到一百万年的时间里，世界各地大批具有超凡魅力的属种消失了，这确实是灾难性的。 与事件更平淡的汇合相反，否认发生重大外源性冲击的可能性是范式上的狭窄。 如果有的话 我心爱的雷龙 是为了防止我浪费我的时间阅读该领域的文献。

我希望Switek会继续跟进这些书籍。 这是书呆子风格的经典“您可以使用的新闻”。

不只是为了孔雀
信用： 乔治·比亚德

首先，对于那些不熟悉该主题的人，性选择理论有几种风格。 顾名思义，性别选择是由于个体对各种有利特质的偏好而从差异适应中产生的。 我将事先承认，我个人的偏爱是，性别选择不应与人为选择更人为地分开。，但是讨论的性质通常是做出如此强烈区分的地方。 因此，我不会对此大惊小怪。

也许最明显的区别是，存在某些形式的性选择，其中没有很强的外在适应性含义。 由此，我的意思是，对被选择的性状与其选择值成正比并没有很大的适应性价值（注意：该性状一开始不一定完全是中性的，人们可以想象非性偏好会触发随后的性动态）。 这是 渔夫失控 过程。 这里的基本原理是，如果某个特质与该特质之间存在相关性，并且对该特质具有偏爱，那么两者将相互扩大适应性，并迅速在人群中频频扫荡。 一个简单的例子就足够了。 想象一下，在鸟类种群中，有一部分雌性喜欢较长的喙。 种群中喙的长度存在正常变化，这意味着较短和较长喙的个体的适应度没有太大差异。 如果一部分雌性喜欢较长的喙，那么具有较长喙的雄性将具有较高的适应性，因为它们可以繁殖所有雌性，而具有较短喙的雄性仅能获得那些没有偏好的雌性。 在下一代中，长喙（来自父亲）和偏好长喙（来自母亲）之间将存在相关性。 由于相关性， 现在也将选择偏好作为长喙选择的副产品！ 这意味着对较长喙的选择更大，因此对偏好的选择也更大，依此类推。

信用： 道格·詹森（Doug Janson）.

这种动力是有性生殖固有的结构性因素的副产品。 尤其是两性之间的二态性，以及选择在伴侣选择中的重要性。 渔业过程是迅速的，它是任意的，并且由于受到其他进化力量的制约，它很可能会发生波动。 在上面的示例中，随着自然选择的开始，对长喙的持续选择显然会带来一些有害的后果。 在那个时候，无论长喙的儿子有多“性感”，如果他们甚至无法生存，那将是徒劳的。 这种类型的性选择预示着空间和时间上的形态多样性将持续不断地冒泡。

适应性是间接力量的结果的另一个性选择框架是感觉偏差。 同样，一个例子就足够了。 想象一下鸟是食肉动物。 在这种情况下，自然会偏爱明亮和鲜艳的颜色，因为这些是主要食品水果的颜色。 女性自然会偏爱与自己的主要食物具有相同鲜艳色彩的个体（这甚至可能有选择性地受益，因为这表明人们对优质食物的强烈偏好）。 就像上面的渔业过程一样，这显然是有代价的。 想吃鲜果。 聪明的动物没有。

信用： 帕维尔·里哈（Pavel Riha）

这再次凸显了这样一个事实，即在传统的适应性意义上，反复性选择的特质可能无益。 它们甚至可能有害健康！ 这也是对 差点原则，尽管在游戏结束时它反而改变了逻辑。 其违背直觉的论点是，实际上昂贵的信号表明一种生物非常适合。 根本原因是昂贵的信号从本质上讲是诚实的。 例如，大型鹿角在生产和维护过程中会消耗大量生物能量，而且还可能使它们更容易受到食肉动物的攻击。 只有最优秀的人才会招致此类费用！ 这里与索尔斯泰因·维布伦的思想有关 “炫耀性消费” 如此明显，我将不再赘述。 据我所知，让我感到有些疯狂的是，残障定律现在已经被许多生物学家所接受（例如理查德·道金斯（Richard Dawkins）在理论上做了大概的表象）。

障碍原则可以说是性选择的“好基因”的模型。 与费舍尔的失控或感官偏见不同，偏爱根植于个体的真正适应度，这是通过外部指标评估的（至少在遗传健康的间接意义上）。 进化心理学中的美丽理论通常隐含在该模型上，其中高度对称和极端的第二性征表明很少有有害突变会干扰个体的理想发育。 与费舍尔逃亡之类的东西相比，为什么男性大，乳房和臀部大可能表明身体健康的解释也是如此明显，以至于许多人发现直接收益模型也更合理。 也就是说，这些特征不仅标志着良好的基因，而且还为生存和功能带来了直接的好处。

但是合理性并不能使我们在所有情况下都朝向真理。 用言语表述的性选择模型往往会引起循环和混乱。 真正的思想实验可以像这样进行。 您的人口中，雌性偏爱具吸引力的雄性（例如，它们的羽毛更有活力）。 但是雌性的健康状况（尤其是其后代的生存能力）也取决于伴侣提供补充资源的情况。 可以很容易地想到这样一种情况：由于女性配偶选择的异质性，混杂的雄性和一夫一妻制的较弱的雄性趋于相同的均衡适应性。 一些雌性可能会选择“ cads”，尽管它们的后代具有很高的遗传素质，但他们对后代的流浪和投资很少。 其他雌性可能会选择“爸爸”，即那些遗传品质较低，但仍会更多地投资于其后代数量较少的雄性。 由于增加了投资，这些后代的存活率可能更高。 对性选择的口头表达似乎从来没有给出“最终答案”，因为总是存在“另一方面”。

这就是为什么我想回顾现有文献。 不幸的是，正如上面的形式主义所暗示的，我并没有获得更多的清晰度。 作者建议通过四种主要途径探索性选择： 种群遗传学，定量遗传学，入侵方法，基于个体的模拟。 我对“入侵方法”并不特别熟悉，尽管它的大致轮廓看起来与定量遗传方法相似。 群体遗传方法之所以强大，是因为它们从第一原理开始，并明确地对诸如链接之类的参数建模。 但是，诸如人口遗传模型中的性选择等复杂现象的分析可处理性受到限制，例如，多基因座方法往往很困难。 定量遗传方法是对海峡正态分布的标准假设，并且是基因盲的（他们看表型）。 它们似乎是种群遗传方法的很好的补充，通常在更实际的现场研究中很有用。 最后，该仿真方法由于缺乏探索整个参数空间的计算能力而受苦。

关于模拟方法，去年，一位系统进化学家告诉我，十五年前的研究人员认为他们永远无法实现 最大似然 一生中的模型。 今天当然 基于ML的软件包是相对较重的系统遗传学贝叶斯框架的“快速”策略。 我指出这一点是因为我相信，从长远来看，模拟可能是了解性选择的最终方法，辅之以其他方法，如支架，以减少参数空间。 我们可能无法探索可能性的整个空间，但这就是科学的本质。

我对审查中概述的正式模型的主要担心是 他们中的许多人选择不力。 这是许多人口遗传模型的特征（例如，请参见WD Hamilton的关于包容性适应性的原始著作）， 但是从进化基因组学的角度来看，进行性选择的一些最引人入胜的可能性受到了强烈的选择。 例如，许多研究人员呼吁通过性选择来解释欧洲人群的色素沉着，但是越来越多的证据表明，这些基因座受到了相对较强的选择。 这对进行性选择是否合理？ 我们甚至不知道有多强的性行为可能起作用？ 渔民失控显然是一个候选人，但是这个过程是如此迅速，如此千变万化，以至于似乎不太可能。

性选择理论的一个主要的长期问题是，当均衡更容易消化时，它们似乎暗示着振荡的动力（传统上，许多经典模型都以解决均衡为导向）。 这就是为什么积极自然选择模型如此简单明了，它们有开始和结束的原因。 对于更现实的性选择模型而言似乎并非如此。 而不是对给定生物学问题的具体答案 性选择理论作为解释进化过程中不断变化的背景通量的一种方法可能更为有用。 在这一点上，我不认为它足够强大，可以为我们提供良好的“粗糙和现成的”经验法则，我们可以将其作为筛选进化基因组结果的筛子。

但是正在取得进步，并且与博弈论和计算机科学等领域一起，我怀疑未来将是光明的。

就本文的受众特征而言，主要的收获是 情况很复杂。 作者推断，家犬过去曾经历过人口瓶颈，数量级为一到两个数量级。 其次，尽管温度较温和，但狼也经历了种群瓶颈。 在第一次阅读时，我对第二个发现感到惊讶， 但在与犬类遗传学家交谈后，我被告知这种狼瓶颈早已为人所知。 基因组学证实了先前的期望，而不是冒出新的推论。

也许更令人惊讶的发现是狗的祖先，是的，有一个祖先的种群来自灭绝的狼血统，但数量并不多。 他们的推论是基于以下事实：从假定的犬只驯养区域采样的三头狼都与犬具有相同的遗传距离。 先前的研究表明，狗可能起源于近东狼，而其他研究人员则主张东亚起源。 这里的结果支持以下命题： 这些建议误解了当地狼和狗之间真正的基因流动。 作者检测了西欧亚狼和西狗（巴辛吉和义和团）和东欧亚狼和东狗（丁哥）之间的基因流。

稍作说明的是，这些结果也证实了 农业前 狗的起源，在11％的置信区间内，BP约有16万年的差异。 这与中国人小组有些出入，但这可能只是变异率参数不同的产物。 无论哪种方式带回家的都是狗早于农业。

但这并不意味着农业无关紧要。 就适应性而言，这里有很多内容，我不确定本文在这一方面是否具有革命性意义。 首先，他们确认 人类 根据生活习惯，淀粉酶基因的拷贝数在犬科动物之间存在差异。 丁戈犬和阿拉斯加爱斯基摩犬的复制品很少，而古代西亚狗则有很多。 另外，作者发现狼具有该特性的正常变异，这表明淀粉酶多态性是常规遗传变异的一部分。

我将留给您调查有关狗的真实的字母基因汤，这些汤因进化而受到自然选择的影响。 我对变化更好奇 中 在这一点上，因为那里也应该有可遗传的变异。

引用： arXiv：1305.7390v2 [q-bio.GN]

引文： 约翰逊，沃伦E.，等。 “现代猫科动物的中新世晚期辐射：遗传学评估。” 科学311.5757（2006）：73-77。

从系统发育树的左侧可以看到 美洲豹谱系从 豹 大约一千万年前。 尽管对于这样的距离的哺乳动物来说杂交不是不可能的，但它使有关报道认为小鸭科动物的适应性低得多的报道更具说服力，因为它们普遍存在侏儒症并降低了预期寿命。 骆驼骆驼是一种可能会让很多人惊讶的真正证实的混合动力车 床，其父母的最后共同祖先之间的分歧约为BP 5万（假设美洲驼和骆驼的祖先已经在北美分化，而美洲驼谱系则在3万年前迁移到了南美）。